MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_009900	TAC	2	6	1189739	1189744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30502	NC_009900	TAA	2	6	1189802	1189807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30503	NC_009900	TAC	2	6	1189885	1189890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30504	NC_009900	TTA	2	6	1189897	1189902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30505	NC_009900	TGTCT	2	10	1189935	1189944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30506	NC_009900	AGT	2	6	1190016	1190021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30507	NC_009900	CAT	2	6	1190035	1190040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30508	NC_009900	ACA	2	6	1190049	1190054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30509	NC_009900	GAA	2	6	1190080	1190085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30510	NC_009900	CGGT	2	8	1190150	1190157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30511	NC_009900	GGA	2	6	1190223	1190228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30512	NC_009900	CAA	2	6	1190271	1190276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30513	NC_009900	ATAG	2	8	1190279	1190286	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30514	NC_009900	GCT	2	6	1190291	1190296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30515	NC_009900	TAG	2	6	1190325	1190330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30516	NC_009900	GAA	2	6	1190484	1190489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30517	NC_009900	TTA	2	6	1190490	1190495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30518	NC_009900	A	6	6	1190526	1190531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30519	NC_009900	CTT	2	6	1190535	1190540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30520	NC_009900	AT	3	6	1190598	1190603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30521	NC_009900	ATTT	2	8	1190623	1190630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30522	NC_009900	ATT	2	6	1190645	1190650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30523	NC_009900	TAGT	2	8	1190667	1190674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30524	NC_009900	ATAA	2	8	1190694	1190701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30525	NC_009900	AAGCAA	2	12	1190842	1190853	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30526	NC_009900	GCTCA	2	10	1190908	1190917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30527	NC_009900	A	6	6	1190969	1190974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30528	NC_009900	ATGG	2	8	1190987	1190994	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30529	NC_009900	ACC	2	6	1191050	1191055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30530	NC_009900	A	7	7	1191068	1191074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30531	NC_009900	A	6	6	1191082	1191087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30532	NC_009900	AT	3	6	1191099	1191104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30533	NC_009900	CTA	2	6	1191153	1191158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30534	NC_009900	TCT	2	6	1191188	1191193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30535	NC_009900	A	6	6	1191205	1191210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30536	NC_009900	TA	5	10	1191217	1191226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30537	NC_009900	AAAT	2	8	1191293	1191300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30538	NC_009900	AAG	2	6	1191315	1191320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30539	NC_009900	TAT	2	6	1191398	1191403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30540	NC_009900	ATA	2	6	1191434	1191439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30541	NC_009900	TTA	2	6	1191470	1191475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30542	NC_009900	GTA	2	6	1191527	1191532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30543	NC_009900	AT	3	6	1191589	1191594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30544	NC_009900	TTA	2	6	1191599	1191604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30545	NC_009900	ATA	2	6	1191625	1191630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30546	NC_009900	A	7	7	1191650	1191656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30547	NC_009900	TAA	2	6	1191683	1191688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30548	NC_009900	CTT	2	6	1191713	1191718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30549	NC_009900	CTA	2	6	1191741	1191746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30550	NC_009900	AAAAG	2	10	1191776	1191785	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30551	NC_009900	TAA	2	6	1191791	1191796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30552	NC_009900	GAA	2	6	1191804	1191809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30553	NC_009900	TAG	2	6	1191838	1191843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30554	NC_009900	T	6	6	1191845	1191850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30555	NC_009900	A	7	7	1191962	1191968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30556	NC_009900	TA	3	6	1191988	1191993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30557	NC_009900	CAA	2	6	1192119	1192124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30558	NC_009900	GAA	2	6	1192167	1192172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30559	NC_009900	GAT	2	6	1192185	1192190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30560	NC_009900	AAAT	2	8	1192283	1192290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30561	NC_009900	AATA	2	8	1192297	1192304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30562	NC_009900	TAG	2	6	1192327	1192332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30564	NC_009900	GA	3	6	1192366	1192371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30565	NC_009900	A	6	6	1192403	1192408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30566	NC_009900	ACT	2	6	1192448	1192453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30567	NC_009900	ATACA	2	10	1192467	1192476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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30569	NC_009900	AGA	2	6	1192520	1192525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30570	NC_009900	AAAAT	2	10	1192526	1192535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30573	NC_009900	TAA	2	6	1192577	1192582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30574	NC_009900	AGA	2	6	1192595	1192600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30582	NC_009900	AAG	2	6	1192789	1192794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30585	NC_009900	ATA	2	6	1192855	1192860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30586	NC_009900	A	7	7	1192878	1192884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30594	NC_009900	GCAA	2	8	1193159	1193166	50 %	0 %	25 %	25 %	157964927
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30605	NC_009900	TTAA	2	8	1193675	1193682	50 %	50 %	0 %	0 %	157964927
30606	NC_009900	AAT	2	6	1193753	1193758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964927
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