MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009900	AGCA	2	8	587971	587978	50 %	0 %	25 %	25 %	157964501
15002	NC_009900	ATG	2	6	587985	587990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964501
15003	NC_009900	GTA	2	6	587993	587998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964501
15004	NC_009900	AGT	2	6	588014	588019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964501
15005	NC_009900	GTT	2	6	588031	588036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964501
15006	NC_009900	AGA	2	6	588049	588054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964501
15007	NC_009900	CTA	2	6	588102	588107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964501
15008	NC_009900	AGTA	2	8	588130	588137	50 %	25 %	25 %	0 %	157964501
15009	NC_009900	T	7	7	588169	588175	0 %	100 %	0 %	0 %	157964501
15010	NC_009900	ATA	3	9	588246	588254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964501
15011	NC_009900	CTAT	2	8	588335	588342	25 %	50 %	0 %	25 %	157964501
15012	NC_009900	CAA	2	6	588357	588362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964501
15013	NC_009900	ATC	2	6	588387	588392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964501
15014	NC_009900	TTA	2	6	588428	588433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964501
15015	NC_009900	TTG	2	6	588606	588611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964501
15016	NC_009900	ATA	2	6	588635	588640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964501
15017	NC_009900	AT	3	6	588643	588648	50 %	50 %	0 %	0 %	157964501
15018	NC_009900	TAA	2	6	588658	588663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964501
15019	NC_009900	TAT	2	6	588684	588689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964501
15020	NC_009900	A	6	6	588725	588730	100 %	0 %	0 %	0 %	157964501
15021	NC_009900	GAT	2	6	588761	588766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964501
15022	NC_009900	GTT	2	6	588921	588926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964502
15023	NC_009900	GTAAT	2	10	588934	588943	40 %	40 %	20 %	0 %	157964502
15024	NC_009900	CTA	2	6	589000	589005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964502
15025	NC_009900	A	6	6	589027	589032	100 %	0 %	0 %	0 %	157964502
15026	NC_009900	GTA	2	6	589044	589049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964502
15027	NC_009900	A	6	6	589163	589168	100 %	0 %	0 %	0 %	157964502
15028	NC_009900	ATTTA	2	10	589175	589184	40 %	60 %	0 %	0 %	157964502
15029	NC_009900	AATCG	2	10	589274	589283	40 %	20 %	20 %	20 %	157964502
15030	NC_009900	TTTA	2	8	589333	589340	25 %	75 %	0 %	0 %	157964502
15031	NC_009900	A	6	6	589450	589455	100 %	0 %	0 %	0 %	157964502
15032	NC_009900	TTA	2	6	589518	589523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964502
15033	NC_009900	TAT	2	6	589562	589567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964502
15034	NC_009900	AGC	3	9	589623	589631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964502
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15036	NC_009900	ATA	2	6	589686	589691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964502
15037	NC_009900	TTATCG	2	12	589719	589730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157964502
15038	NC_009900	TTA	2	6	589786	589791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964502
15039	NC_009900	TTC	2	6	589793	589798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964502
15040	NC_009900	ATA	2	6	589825	589830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964502
15041	NC_009900	TGA	2	6	589832	589837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964502
15042	NC_009900	TAG	2	6	589903	589908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964502
15043	NC_009900	TTA	2	6	589942	589947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964502
15044	NC_009900	GTC	2	6	589977	589982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964502
15045	NC_009900	AT	3	6	590018	590023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_009900	AGT	2	6	590092	590097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_009900	TAT	2	6	590106	590111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_009900	TTA	2	6	590165	590170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_009900	ATTT	2	8	590197	590204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_009900	AAT	2	6	590211	590216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_009900	T	6	6	590267	590272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_009900	GAA	2	6	590303	590308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_009900	TAT	2	6	590339	590344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_009900	GAA	2	6	590378	590383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964503
15055	NC_009900	ATT	2	6	590393	590398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964503
15056	NC_009900	T	6	6	590397	590402	0 %	100 %	0 %	0 %	157964503
15057	NC_009900	GAA	2	6	590502	590507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964503
15058	NC_009900	GAAT	2	8	590537	590544	50 %	25 %	25 %	0 %	157964503
15059	NC_009900	CTA	2	6	590545	590550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964503
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15062	NC_009900	AGC	2	6	590588	590593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964503
15063	NC_009900	CTC	2	6	590614	590619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157964503
15064	NC_009900	CGG	2	6	590639	590644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964503
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15067	NC_009900	TTA	2	6	590710	590715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964503
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15070	NC_009900	AT	5	10	590854	590863	50 %	50 %	0 %	0 %	157964503
15071	NC_009900	TAA	2	6	590877	590882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964503
15072	NC_009900	TGA	2	6	590943	590948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_009900	TA	3	6	590990	590995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_009900	A	7	7	591000	591006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_009900	GCA	2	6	591031	591036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964504
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15079	NC_009900	A	7	7	591280	591286	100 %	0 %	0 %	0 %	157964504
15080	NC_009900	AGC	2	6	591318	591323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964504
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15089	NC_009900	ATA	2	6	591791	591796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964504
15090	NC_009900	AAGG	2	8	591887	591894	50 %	0 %	50 %	0 %	157964504
15091	NC_009900	TTA	3	9	591951	591959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964504
15092	NC_009900	AAG	2	6	592170	592175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964504
15093	NC_009900	TCCTAT	2	12	592270	592281	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157964504
15094	NC_009900	TGA	2	6	592345	592350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964504
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15097	NC_009900	ATC	2	6	592471	592476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964504
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15100	NC_009900	GGC	2	6	592568	592573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964504
15101	NC_009900	TAT	2	6	592596	592601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964504
15102	NC_009900	GAAC	2	8	592627	592634	50 %	0 %	25 %	25 %	157964504
15103	NC_009900	TGC	2	6	592689	592694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964504
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15105	NC_009900	GAA	2	6	592736	592741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964504
15106	NC_009900	T	6	6	592763	592768	0 %	100 %	0 %	0 %	157964504
15107	NC_009900	AAAG	2	8	592772	592779	75 %	0 %	25 %	0 %	157964504
15108	NC_009900	AAT	2	6	592781	592786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964504
15109	NC_009900	AGT	2	6	592789	592794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964504
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15112	NC_009900	GAT	2	6	593009	593014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964504
15113	NC_009900	TAA	2	6	593029	593034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964504
15114	NC_009900	TCG	2	6	593070	593075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964504
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15116	NC_009900	CTA	2	6	593213	593218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964504
15117	NC_009900	GAA	2	6	593243	593248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964504
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15119	NC_009900	TGA	2	6	593305	593310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964504
15120	NC_009900	AT	3	6	593332	593337	50 %	50 %	0 %	0 %	157964504
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15494	NC_009900	CGT	2	6	608368	608373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964518
15495	NC_009900	ATT	2	6	608427	608432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964518
15496	NC_009900	CGTTTG	2	12	608450	608461	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	157964518
15497	NC_009900	TTA	3	9	608482	608490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964518
15498	NC_009900	CT	3	6	608617	608622	0 %	50 %	0 %	50 %	157964519
15499	NC_009900	CTT	2	6	608647	608652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964519
15500	NC_009900	TTC	2	6	608681	608686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964519

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