MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009900	GATA	2	8	550003	550010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_009900	T	7	7	550022	550028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_009900	ATTTT	2	10	550037	550046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_009900	ATTT	2	8	550054	550061	25 %	75 %	0 %	0 %	157964475
14005	NC_009900	AAT	2	6	550126	550131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964475
14006	NC_009900	TTTA	2	8	550132	550139	25 %	75 %	0 %	0 %	157964475
14007	NC_009900	A	6	6	550224	550229	100 %	0 %	0 %	0 %	157964475
14008	NC_009900	TGT	2	6	550268	550273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964475
14009	NC_009900	CTTTTG	2	12	550275	550286	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157964475
14010	NC_009900	CAC	2	6	550347	550352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157964475
14011	NC_009900	ATA	2	6	550353	550358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964475
14012	NC_009900	CAT	2	6	550467	550472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964475
14013	NC_009900	ATA	2	6	550478	550483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964475
14014	NC_009900	TTA	2	6	550484	550489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964475
14015	NC_009900	TAT	2	6	550491	550496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964475
14016	NC_009900	AAT	2	6	550516	550521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964475
14017	NC_009900	CAT	2	6	550543	550548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964475
14018	NC_009900	ATT	2	6	550553	550558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964475
14019	NC_009900	AAG	2	6	550677	550682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964475
14020	NC_009900	A	6	6	550807	550812	100 %	0 %	0 %	0 %	157964475
14021	NC_009900	CTT	2	6	550821	550826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964475
14022	NC_009900	TTA	2	6	550842	550847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964475
14023	NC_009900	ATT	2	6	550903	550908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964475
14024	NC_009900	ATT	2	6	550939	550944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964475
14025	NC_009900	ATT	2	6	550972	550977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964475
14026	NC_009900	ATT	2	6	551030	551035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964475
14027	NC_009900	AT	4	8	551054	551061	50 %	50 %	0 %	0 %	157964475
14028	NC_009900	CAAT	2	8	551093	551100	50 %	25 %	0 %	25 %	157964475
14029	NC_009900	TAA	2	6	551105	551110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_009900	AAT	2	6	551126	551131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_009900	TAA	2	6	551137	551142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_009900	AAT	2	6	551144	551149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_009900	GTG	2	6	551185	551190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_009900	A	6	6	551198	551203	100 %	0 %	0 %	0 %	157964476
14035	NC_009900	T	6	6	551215	551220	0 %	100 %	0 %	0 %	157964476
14036	NC_009900	TGC	2	6	551245	551250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964476
14037	NC_009900	TAA	2	6	551266	551271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964476
14038	NC_009900	AT	3	6	551298	551303	50 %	50 %	0 %	0 %	157964476
14039	NC_009900	ACT	2	6	551333	551338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964476
14040	NC_009900	AAT	2	6	551339	551344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964476
14041	NC_009900	TTA	2	6	551345	551350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964476
14042	NC_009900	ATTA	2	8	551392	551399	50 %	50 %	0 %	0 %	157964476
14043	NC_009900	TTTA	2	8	551448	551455	25 %	75 %	0 %	0 %	157964476
14044	NC_009900	AGA	2	6	551516	551521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964476
14045	NC_009900	CTA	3	9	551565	551573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964476
14046	NC_009900	ATA	2	6	551574	551579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964476
14047	NC_009900	TTA	2	6	551595	551600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964476
14048	NC_009900	TCT	2	6	551618	551623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964476
14049	NC_009900	TAC	2	6	551668	551673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964476
14050	NC_009900	TG	3	6	551709	551714	0 %	50 %	50 %	0 %	157964476
14051	NC_009900	ATG	2	6	551715	551720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964476
14052	NC_009900	GTG	2	6	551724	551729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964476
14053	NC_009900	ACG	2	6	551801	551806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964476
14054	NC_009900	T	6	6	551954	551959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_009900	AATA	2	8	551993	552000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_009900	ATT	2	6	552021	552026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964477
14057	NC_009900	TAA	2	6	552046	552051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964477
14058	NC_009900	TAT	2	6	552064	552069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964477
14059	NC_009900	TAT	2	6	552078	552083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964477
14060	NC_009900	TAA	2	6	552087	552092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964477
14061	NC_009900	ATA	2	6	552174	552179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964477
14062	NC_009900	T	8	8	552183	552190	0 %	100 %	0 %	0 %	157964477
14063	NC_009900	GAA	2	6	552194	552199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964477
14064	NC_009900	A	7	7	552198	552204	100 %	0 %	0 %	0 %	157964477
14065	NC_009900	AGA	2	6	552352	552357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964477
14066	NC_009900	ATT	2	6	552442	552447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964477
14067	NC_009900	GTT	2	6	552461	552466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964477
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14069	NC_009900	GAG	2	6	552729	552734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_009900	GAC	2	6	552778	552783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_009900	ATTAA	2	10	552813	552822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_009900	AATG	2	8	552837	552844	50 %	25 %	25 %	0 %	157964478
14073	NC_009900	TAAA	2	8	552848	552855	75 %	25 %	0 %	0 %	157964478
14074	NC_009900	ATA	2	6	552886	552891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964478
14075	NC_009900	ATT	2	6	552921	552926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964478
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14077	NC_009900	AGTA	2	8	552993	553000	50 %	25 %	25 %	0 %	157964478
14078	NC_009900	ATT	2	6	553087	553092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964478
14079	NC_009900	CGG	2	6	553101	553106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964478
14080	NC_009900	AAAAT	2	10	553160	553169	80 %	20 %	0 %	0 %	157964478
14081	NC_009900	GGC	2	6	553197	553202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157964478
14082	NC_009900	GCTT	2	8	553218	553225	0 %	50 %	25 %	25 %	157964478
14083	NC_009900	AT	3	6	553240	553245	50 %	50 %	0 %	0 %	157964478
14084	NC_009900	GTA	2	6	553268	553273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964478
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14087	NC_009900	AG	3	6	553329	553334	50 %	0 %	50 %	0 %	157964478
14088	NC_009900	TAA	2	6	553389	553394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964478
14089	NC_009900	GAT	2	6	553396	553401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964478
14090	NC_009900	AAG	2	6	553464	553469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964478
14091	NC_009900	TTTA	2	8	553500	553507	25 %	75 %	0 %	0 %	157964478
14092	NC_009900	GGGCA	2	10	553520	553529	20 %	0 %	60 %	20 %	157964478
14093	NC_009900	GAAA	2	8	553584	553591	75 %	0 %	25 %	0 %	157964478
14094	NC_009900	ATA	2	6	553601	553606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964478
14095	NC_009900	AAAAT	2	10	553715	553724	80 %	20 %	0 %	0 %	157964478
14096	NC_009900	ATA	2	6	553749	553754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964478
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14099	NC_009900	GGAT	2	8	553836	553843	25 %	25 %	50 %	0 %	157964479
14100	NC_009900	TTA	2	6	554046	554051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964479
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14102	NC_009900	GAT	2	6	554101	554106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964479
14103	NC_009900	TAT	2	6	554127	554132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964479
14104	NC_009900	GAA	2	6	554135	554140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964479
14105	NC_009900	AGT	3	9	554141	554149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964479
14106	NC_009900	A	6	6	554239	554244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_009900	T	6	6	554304	554309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_009900	AAC	2	6	554362	554367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_009900	TAG	2	6	554373	554378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_009900	CAA	2	6	554405	554410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_009900	ATT	2	6	554440	554445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964480
14112	NC_009900	TTA	2	6	554462	554467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964480
14113	NC_009900	A	7	7	554535	554541	100 %	0 %	0 %	0 %	157964480
14114	NC_009900	ATA	2	6	554577	554582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964480
14115	NC_009900	ATA	2	6	554622	554627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964480
14116	NC_009900	ATA	2	6	554637	554642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964480
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14118	NC_009900	GCT	2	6	554698	554703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964480
14119	NC_009900	GAA	2	6	554705	554710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964480
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14121	NC_009900	ATA	3	9	554730	554738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964480
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14123	NC_009900	TCC	2	6	554776	554781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157964480
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14496	NC_009900	T	7	7	567626	567632	0 %	100 %	0 %	0 %	157964488
14497	NC_009900	CTTA	2	8	567661	567668	25 %	50 %	0 %	25 %	157964488
14498	NC_009900	TTC	2	6	567694	567699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964488
14499	NC_009900	TA	3	6	567784	567789	50 %	50 %	0 %	0 %	157964488
14500	NC_009900	A	6	6	567907	567912	100 %	0 %	0 %	0 %	157964488

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