MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009900	A	8	8	509964	509971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_009900	TTTA	2	8	510027	510034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_009900	AGT	2	6	510119	510124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_009900	TAA	2	6	510162	510167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_009900	TGC	2	6	510168	510173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_009900	TA	3	6	510191	510196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_009900	TAGT	2	8	510341	510348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_009900	AGA	2	6	510356	510361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_009900	AT	3	6	510446	510451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_009900	TAT	2	6	510473	510478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_009900	TAA	2	6	510515	510520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_009900	TTA	2	6	510530	510535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_009900	TTA	2	6	510553	510558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_009900	TTC	2	6	510578	510583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_009900	TAA	2	6	510597	510602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_009900	GCT	2	6	510676	510681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_009900	TAA	2	6	510798	510803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_009900	TAT	2	6	510845	510850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_009900	AG	3	6	510955	510960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_009900	TTAT	2	8	510974	510981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_009900	AAAG	2	8	511008	511015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_009900	ACT	2	6	511038	511043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_009900	AGA	2	6	511058	511063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_009900	TGT	2	6	511067	511072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_009900	CTA	2	6	511138	511143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_009900	GT	3	6	511152	511157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_009900	AG	3	6	511235	511240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_009900	GTT	2	6	511325	511330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_009900	CGG	2	6	511394	511399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_009900	CTG	2	6	511416	511421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_009900	ATT	2	6	511451	511456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_009900	CTT	2	6	511492	511497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_009900	TGA	2	6	511504	511509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_009900	A	8	8	511509	511516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_009900	AGA	2	6	511572	511577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_009900	GTA	2	6	511624	511629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_009900	ACC	2	6	511644	511649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13038	NC_009900	AT	3	6	511799	511804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_009900	TAA	2	6	511805	511810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_009900	TAA	2	6	511857	511862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_009900	GT	3	6	511869	511874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_009900	T	6	6	511876	511881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_009900	CTT	2	6	511889	511894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_009900	TTG	2	6	511944	511949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_009900	T	7	7	512018	512024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_009900	TCTTT	2	10	512038	512047	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13047	NC_009900	CAC	2	6	512194	512199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13048	NC_009900	TTA	2	6	512223	512228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_009900	AAG	2	6	512235	512240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_009900	TAG	2	6	512276	512281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_009900	A	6	6	512289	512294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_009900	TAA	2	6	512342	512347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_009900	T	7	7	512433	512439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_009900	TTG	2	6	512465	512470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_009900	AT	3	6	512475	512480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_009900	TAA	2	6	512533	512538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_009900	AAT	2	6	512570	512575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_009900	ATT	2	6	512638	512643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_009900	ATA	2	6	512673	512678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_009900	TATT	2	8	512715	512722	25 %	75 %	0 %	0 %	157964446
13061	NC_009900	GAG	2	6	512744	512749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964446
13062	NC_009900	AGA	2	6	512760	512765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964446
13063	NC_009900	TTTG	2	8	512860	512867	0 %	75 %	25 %	0 %	157964446
13064	NC_009900	TGT	2	6	512871	512876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964446
13065	NC_009900	TGA	2	6	512906	512911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964446
13066	NC_009900	ATA	2	6	512965	512970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964446
13067	NC_009900	GAAT	2	8	512995	513002	50 %	25 %	25 %	0 %	157964446
13068	NC_009900	TACT	2	8	513012	513019	25 %	50 %	0 %	25 %	157964446
13069	NC_009900	GAT	2	6	513029	513034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964446
13070	NC_009900	TCGT	2	8	513077	513084	0 %	50 %	25 %	25 %	157964446
13071	NC_009900	AT	4	8	513115	513122	50 %	50 %	0 %	0 %	157964446
13072	NC_009900	TAT	2	6	513149	513154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964446
13073	NC_009900	T	8	8	513235	513242	0 %	100 %	0 %	0 %	157964446
13074	NC_009900	TGA	2	6	513296	513301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_009900	TCGCT	2	10	513312	513321	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13076	NC_009900	ATG	2	6	513329	513334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_009900	AAAT	3	12	513356	513367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_009900	ATT	2	6	513385	513390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_009900	AAAT	2	8	513407	513414	75 %	25 %	0 %	0 %	157964447
13080	NC_009900	TTG	2	6	513459	513464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964447
13081	NC_009900	AAG	2	6	513470	513475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964447
13082	NC_009900	GTAT	2	8	513514	513521	25 %	50 %	25 %	0 %	157964447
13083	NC_009900	ACTAA	2	10	513632	513641	60 %	20 %	0 %	20 %	157964447
13084	NC_009900	GAT	2	6	513653	513658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964447
13085	NC_009900	TGG	2	6	513705	513710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157964447
13086	NC_009900	TGA	2	6	513871	513876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964447
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13088	NC_009900	AGGTA	2	10	513991	514000	40 %	20 %	40 %	0 %	157964447
13089	NC_009900	TA	3	6	514070	514075	50 %	50 %	0 %	0 %	157964447
13090	NC_009900	AGG	2	6	514222	514227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964447
13091	NC_009900	GCC	2	6	514231	514236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157964447
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13093	NC_009900	ATCAAA	2	12	514285	514296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157964447
13094	NC_009900	TGA	2	6	514315	514320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964447
13095	NC_009900	ATT	2	6	514354	514359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964447
13096	NC_009900	GTTT	2	8	514389	514396	0 %	75 %	25 %	0 %	157964447
13097	NC_009900	T	6	6	514394	514399	0 %	100 %	0 %	0 %	157964447
13098	NC_009900	AT	3	6	514426	514431	50 %	50 %	0 %	0 %	157964447
13099	NC_009900	AGA	2	6	514456	514461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964447
13100	NC_009900	CATC	2	8	514498	514505	25 %	25 %	0 %	50 %	157964447
13101	NC_009900	TG	3	6	514570	514575	0 %	50 %	50 %	0 %	157964447
13102	NC_009900	TTA	2	6	514608	514613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964447
13103	NC_009900	TTA	2	6	514698	514703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964447
13104	NC_009900	AT	3	6	514758	514763	50 %	50 %	0 %	0 %	157964447
13105	NC_009900	AT	3	6	514820	514825	50 %	50 %	0 %	0 %	157964447
13106	NC_009900	CGAA	3	12	515013	515024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13107	NC_009900	TCGCT	2	10	515066	515075	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13108	NC_009900	TAAAA	2	10	515090	515099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_009900	ATGA	2	8	515111	515118	50 %	25 %	25 %	0 %	157964448
13110	NC_009900	T	6	6	515121	515126	0 %	100 %	0 %	0 %	157964448
13111	NC_009900	GTA	2	6	515127	515132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964448
13112	NC_009900	T	7	7	515142	515148	0 %	100 %	0 %	0 %	157964448
13113	NC_009900	GCT	2	6	515155	515160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964448
13114	NC_009900	GTA	2	6	515163	515168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964448
13115	NC_009900	AAAT	2	8	515176	515183	75 %	25 %	0 %	0 %	157964448
13116	NC_009900	AGA	2	6	515194	515199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964448
13117	NC_009900	TAG	2	6	515304	515309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964448
13118	NC_009900	TTA	2	6	515316	515321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964448
13119	NC_009900	A	8	8	515361	515368	100 %	0 %	0 %	0 %	157964448
13120	NC_009900	ACA	2	6	515370	515375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964448
13121	NC_009900	T	8	8	515433	515440	0 %	100 %	0 %	0 %	157964448
13122	NC_009900	CTTG	2	8	515455	515462	0 %	50 %	25 %	25 %	157964448
13123	NC_009900	TCT	2	6	515495	515500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964448
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13125	NC_009900	TTA	2	6	515545	515550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964448
13126	NC_009900	TAA	2	6	515557	515562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964448
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