MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia bellii OSU 85-389 chromosome

Total Repeats: 40096

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_009883	AT	3	6	1525933	1525938	50 %	50 %	0 %	0 %	157827858
40002	NC_009883	TTA	2	6	1525966	1525971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827858
40003	NC_009883	T	7	7	1525980	1525986	0 %	100 %	0 %	0 %	157827858
40004	NC_009883	TAC	2	6	1526015	1526020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40005	NC_009883	TACTAT	2	12	1526038	1526049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40006	NC_009883	AT	3	6	1526048	1526053	50 %	50 %	0 %	0 %	157827859
40007	NC_009883	ATA	2	6	1526078	1526083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827859
40008	NC_009883	CAA	2	6	1526088	1526093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157827859
40009	NC_009883	TGAA	2	8	1526140	1526147	50 %	25 %	25 %	0 %	157827859
40010	NC_009883	GCA	2	6	1526252	1526257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157827859
40011	NC_009883	TTA	2	6	1526277	1526282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827859
40012	NC_009883	ATG	2	6	1526318	1526323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157827859
40013	NC_009883	ATT	2	6	1526345	1526350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827859
40014	NC_009883	CTAC	2	8	1526372	1526379	25 %	25 %	0 %	50 %	157827859
40015	NC_009883	AT	3	6	1526401	1526406	50 %	50 %	0 %	0 %	157827859
40016	NC_009883	ATA	2	6	1526418	1526423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827859
40017	NC_009883	GTA	2	6	1526476	1526481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157827859
40018	NC_009883	T	6	6	1526512	1526517	0 %	100 %	0 %	0 %	157827860
40019	NC_009883	TAC	2	6	1526599	1526604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827860
40020	NC_009883	CTA	2	6	1526608	1526613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827860
40021	NC_009883	A	6	6	1526613	1526618	100 %	0 %	0 %	0 %	157827860
40022	NC_009883	T	6	6	1526627	1526632	0 %	100 %	0 %	0 %	157827860
40023	NC_009883	TAA	2	6	1526635	1526640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827860
40024	NC_009883	TAA	2	6	1526645	1526650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827860
40025	NC_009883	TAA	2	6	1526668	1526673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827860
40026	NC_009883	TAT	2	6	1526704	1526709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827860
40027	NC_009883	ATTTT	2	10	1526710	1526719	20 %	80 %	0 %	0 %	157827860
40028	NC_009883	AATT	2	8	1526732	1526739	50 %	50 %	0 %	0 %	157827860
40029	NC_009883	ATT	2	6	1526802	1526807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827860
40030	NC_009883	CTATTT	2	12	1526830	1526841	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157827860
40031	NC_009883	CTACT	2	10	1526878	1526887	20 %	40 %	0 %	40 %	157827860
40032	NC_009883	ACT	2	6	1526934	1526939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827860
40033	NC_009883	TCT	2	6	1526952	1526957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827860
40034	NC_009883	TAT	2	6	1526987	1526992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827860
40035	NC_009883	T	6	6	1526992	1526997	0 %	100 %	0 %	0 %	157827860
40036	NC_009883	ATA	2	6	1527019	1527024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827860
40037	NC_009883	T	6	6	1527046	1527051	0 %	100 %	0 %	0 %	157827860
40038	NC_009883	TTA	2	6	1527055	1527060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827860
40039	NC_009883	TCT	2	6	1527087	1527092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827860
40040	NC_009883	AAC	2	6	1527100	1527105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157827860
40041	NC_009883	AAC	2	6	1527107	1527112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157827860
40042	NC_009883	AATATT	2	12	1527122	1527133	50 %	50 %	0 %	0 %	157827860
40043	NC_009883	A	6	6	1527144	1527149	100 %	0 %	0 %	0 %	157827860
40044	NC_009883	GTT	3	9	1527171	1527179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157827860
40045	NC_009883	TAA	2	6	1527200	1527205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827860
40046	NC_009883	TCT	2	6	1527249	1527254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827860
40047	NC_009883	TTC	2	6	1527353	1527358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827860
40048	NC_009883	T	6	6	1527394	1527399	0 %	100 %	0 %	0 %	157827860
40049	NC_009883	TTTCT	2	10	1527404	1527413	0 %	80 %	0 %	20 %	157827860
40050	NC_009883	AAT	2	6	1527437	1527442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827860
40051	NC_009883	TAA	2	6	1527466	1527471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827860
40052	NC_009883	CCT	2	6	1527531	1527536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157827860
40053	NC_009883	T	7	7	1527562	1527568	0 %	100 %	0 %	0 %	157827860
40054	NC_009883	TGG	2	6	1527618	1527623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157827861
40055	NC_009883	AAAAT	2	10	1527655	1527664	80 %	20 %	0 %	0 %	157827861
40056	NC_009883	ATT	2	6	1527676	1527681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827861
40057	NC_009883	T	6	6	1527698	1527703	0 %	100 %	0 %	0 %	157827861
40058	NC_009883	TAT	2	6	1527708	1527713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827861
40059	NC_009883	T	7	7	1527713	1527719	0 %	100 %	0 %	0 %	157827861
40060	NC_009883	TTA	2	6	1527766	1527771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827861
40061	NC_009883	CTT	2	6	1527833	1527838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827861
40062	NC_009883	TAA	2	6	1527881	1527886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827861
40063	NC_009883	TAT	2	6	1527921	1527926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827861
40064	NC_009883	TTC	2	6	1527928	1527933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827861
40065	NC_009883	T	6	6	1527951	1527956	0 %	100 %	0 %	0 %	157827861
40066	NC_009883	TTC	3	9	1527960	1527968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827861
40067	NC_009883	TAT	2	6	1528002	1528007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827861
40068	NC_009883	GAT	2	6	1528037	1528042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157827861
40069	NC_009883	T	6	6	1528049	1528054	0 %	100 %	0 %	0 %	157827861
40070	NC_009883	TAA	2	6	1528058	1528063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827861
40071	NC_009883	ATAA	2	8	1528098	1528105	75 %	25 %	0 %	0 %	157827861
40072	NC_009883	T	6	6	1528107	1528112	0 %	100 %	0 %	0 %	157827861
40073	NC_009883	T	7	7	1528224	1528230	0 %	100 %	0 %	0 %	157827861
40074	NC_009883	TCT	2	6	1528288	1528293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827861
40075	NC_009883	CCAA	2	8	1528347	1528354	50 %	0 %	0 %	50 %	157827861
40076	NC_009883	AT	3	6	1528373	1528378	50 %	50 %	0 %	0 %	157827861
40077	NC_009883	A	6	6	1528382	1528387	100 %	0 %	0 %	0 %	157827861
40078	NC_009883	CAT	2	6	1528451	1528456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827861
40079	NC_009883	A	6	6	1528468	1528473	100 %	0 %	0 %	0 %	157827861
40080	NC_009883	AT	3	6	1528498	1528503	50 %	50 %	0 %	0 %	157827861
40081	NC_009883	TACC	2	8	1528513	1528520	25 %	25 %	0 %	50 %	157827861
40082	NC_009883	TTA	2	6	1528591	1528596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40083	NC_009883	TAA	2	6	1528598	1528603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40084	NC_009883	AT	3	6	1528614	1528619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40085	NC_009883	TGT	2	6	1528628	1528633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40086	NC_009883	CAA	2	6	1528680	1528685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40087	NC_009883	AT	4	8	1528687	1528694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40088	NC_009883	A	6	6	1528695	1528700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40089	NC_009883	TAA	2	6	1528724	1528729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40090	NC_009883	TTA	2	6	1528788	1528793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40091	NC_009883	TGTT	2	8	1528854	1528861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40092	NC_009883	TAA	2	6	1528892	1528897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40093	NC_009883	T	6	6	1528910	1528915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40094	NC_009883	A	6	6	1528916	1528921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40095	NC_009883	TAA	2	6	1528925	1528930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40096	NC_009883	ATA	2	6	1528936	1528941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.