MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_009881	TA	3	6	1218020	1218025	50 %	50 %	0 %	0 %	157826369
31003	NC_009881	TAG	2	6	1218098	1218103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826369
31004	NC_009881	TAT	3	9	1218188	1218196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826369
31005	NC_009881	T	6	6	1218196	1218201	0 %	100 %	0 %	0 %	157826369
31006	NC_009881	TATT	2	8	1218203	1218210	25 %	75 %	0 %	0 %	157826369
31007	NC_009881	CATGC	2	10	1218290	1218299	20 %	20 %	20 %	40 %	157826369
31008	NC_009881	CTA	2	6	1218314	1218319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826369
31009	NC_009881	AT	3	6	1218326	1218331	50 %	50 %	0 %	0 %	157826369
31010	NC_009881	TTA	2	6	1218350	1218355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826369
31011	NC_009881	AAT	2	6	1218356	1218361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826369
31012	NC_009881	ATTGC	2	10	1218532	1218541	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31013	NC_009881	CTAG	2	8	1218555	1218562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31014	NC_009881	A	7	7	1218577	1218583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31015	NC_009881	ATG	2	6	1218633	1218638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_009881	CTAG	2	8	1218649	1218656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31017	NC_009881	A	7	7	1218686	1218692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_009881	TGA	2	6	1218723	1218728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31019	NC_009881	AAAAG	2	10	1218790	1218799	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_009881	TG	3	6	1218801	1218806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31021	NC_009881	A	6	6	1218846	1218851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31022	NC_009881	CAT	2	6	1218966	1218971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31026	NC_009881	GCCAA	2	10	1219127	1219136	40 %	0 %	20 %	40 %	157826370
31027	NC_009881	T	7	7	1219151	1219157	0 %	100 %	0 %	0 %	157826370
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31033	NC_009881	ATT	2	6	1219331	1219336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826371
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31044	NC_009881	TTA	3	9	1219532	1219540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31045	NC_009881	AAT	2	6	1219587	1219592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31046	NC_009881	CATT	2	8	1219790	1219797	25 %	50 %	0 %	25 %	157826372
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31053	NC_009881	TGC	2	6	1220166	1220171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157826372
31054	NC_009881	TACTA	2	10	1220187	1220196	40 %	40 %	0 %	20 %	157826372
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31056	NC_009881	AGT	2	6	1220220	1220225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826372
31057	NC_009881	TGC	2	6	1220272	1220277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157826372
31058	NC_009881	CTT	2	6	1220300	1220305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826372
31059	NC_009881	TACT	2	8	1220429	1220436	25 %	50 %	0 %	25 %	157826372
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31061	NC_009881	TAG	3	9	1220492	1220500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826372
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31068	NC_009881	TAT	2	6	1220771	1220776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826372
31069	NC_009881	TA	3	6	1220829	1220834	50 %	50 %	0 %	0 %	157826372
31070	NC_009881	AGC	2	6	1220835	1220840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826372
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31079	NC_009881	ATACCG	2	12	1221322	1221333	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157826372
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31084	NC_009881	GCA	2	6	1221463	1221468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826372
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31086	NC_009881	TAC	2	6	1221532	1221537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826373
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31088	NC_009881	TATC	2	8	1221568	1221575	25 %	50 %	0 %	25 %	157826373
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31090	NC_009881	AGATAC	2	12	1221623	1221634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157826373
31091	NC_009881	ATT	2	6	1221669	1221674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_009881	TAAA	2	8	1221706	1221713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_009881	TAC	2	6	1221721	1221726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31097	NC_009881	AGG	2	6	1221902	1221907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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31099	NC_009881	TTA	2	6	1222003	1222008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31100	NC_009881	A	8	8	1222018	1222025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31101	NC_009881	GAA	2	6	1222108	1222113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31102	NC_009881	ATA	2	6	1222135	1222140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31103	NC_009881	AAT	2	6	1222171	1222176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31104	NC_009881	ATT	2	6	1222219	1222224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31105	NC_009881	TAC	2	6	1222315	1222320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31106	NC_009881	A	7	7	1222343	1222349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31107	NC_009881	AGC	2	6	1222421	1222426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31109	NC_009881	AC	3	6	1222519	1222524	50 %	0 %	0 %	50 %	157826375
31110	NC_009881	GAA	2	6	1222575	1222580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157826375
31111	NC_009881	A	6	6	1222620	1222625	100 %	0 %	0 %	0 %	157826375
31112	NC_009881	TGA	2	6	1222637	1222642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826375
31113	NC_009881	TGA	2	6	1222670	1222675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826375
31114	NC_009881	CAT	2	6	1222681	1222686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826375
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31116	NC_009881	AGT	2	6	1222732	1222737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826375
31117	NC_009881	GTTA	2	8	1222756	1222763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31118	NC_009881	TAAC	2	8	1222772	1222779	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31119	NC_009881	AATTT	2	10	1222799	1222808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31121	NC_009881	AGG	2	6	1222845	1222850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.