MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_009881	T	6	6	1121862	1121867	0 %	100 %	0 %	0 %	157826265
28503	NC_009881	CTT	2	6	1121896	1121901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826265
28504	NC_009881	CATTT	2	10	1121905	1121914	20 %	60 %	0 %	20 %	157826265
28505	NC_009881	TTA	2	6	1121935	1121940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826265
28506	NC_009881	GGA	2	6	1122016	1122021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157826265
28507	NC_009881	T	7	7	1122030	1122036	0 %	100 %	0 %	0 %	157826265
28508	NC_009881	TCT	2	6	1122093	1122098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826265
28509	NC_009881	TGC	2	6	1122142	1122147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157826265
28510	NC_009881	TAA	2	6	1122167	1122172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826265
28511	NC_009881	TTC	2	6	1122195	1122200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826265
28512	NC_009881	CTT	2	6	1122224	1122229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826265
28513	NC_009881	ATA	2	6	1122246	1122251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826265
28514	NC_009881	TCT	2	6	1122268	1122273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826265
28515	NC_009881	CTT	2	6	1122311	1122316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826265
28516	NC_009881	GCA	2	6	1122319	1122324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826265
28517	NC_009881	TA	3	6	1122333	1122338	50 %	50 %	0 %	0 %	157826265
28518	NC_009881	ACG	2	6	1122372	1122377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826265
28519	NC_009881	TGC	2	6	1122435	1122440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157826265
28520	NC_009881	TTA	2	6	1122481	1122486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826265
28521	NC_009881	AAT	2	6	1122488	1122493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826265
28522	NC_009881	GCC	2	6	1122502	1122507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157826265
28523	NC_009881	CAC	2	6	1122521	1122526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157826265
28524	NC_009881	AAGA	2	8	1122596	1122603	75 %	0 %	25 %	0 %	157826265
28525	NC_009881	CTT	2	6	1122608	1122613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826265
28526	NC_009881	TTAG	2	8	1122640	1122647	25 %	50 %	25 %	0 %	157826265
28527	NC_009881	TAG	2	6	1122677	1122682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826265
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28531	NC_009881	AATA	2	8	1122893	1122900	75 %	25 %	0 %	0 %	157826265
28532	NC_009881	ATA	2	6	1122918	1122923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826265
28533	NC_009881	AT	3	6	1122966	1122971	50 %	50 %	0 %	0 %	157826265
28534	NC_009881	TA	3	6	1122972	1122977	50 %	50 %	0 %	0 %	157826265
28535	NC_009881	CA	3	6	1122979	1122984	50 %	0 %	0 %	50 %	157826265
28536	NC_009881	A	7	7	1123028	1123034	100 %	0 %	0 %	0 %	157826265
28537	NC_009881	TTA	2	6	1123129	1123134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826266
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28539	NC_009881	AT	4	8	1123159	1123166	50 %	50 %	0 %	0 %	157826266
28540	NC_009881	TAT	2	6	1123176	1123181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826266
28541	NC_009881	ATC	2	6	1123185	1123190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826266
28542	NC_009881	TAC	2	6	1123226	1123231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826266
28543	NC_009881	TC	3	6	1123293	1123298	0 %	50 %	0 %	50 %	157826266
28544	NC_009881	ATTA	2	8	1123503	1123510	50 %	50 %	0 %	0 %	157826266
28545	NC_009881	ATA	2	6	1123518	1123523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826266
28546	NC_009881	ATC	2	6	1123635	1123640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826266
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28548	NC_009881	CTAAA	2	10	1123721	1123730	60 %	20 %	0 %	20 %	157826266
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28552	NC_009881	TAC	2	6	1123878	1123883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826266
28553	NC_009881	CTA	2	6	1123930	1123935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826266
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28588	NC_009881	AC	3	6	1125104	1125109	50 %	0 %	0 %	50 %	157826268
28589	NC_009881	TAA	2	6	1125110	1125115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28590	NC_009881	TGA	2	6	1125144	1125149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28591	NC_009881	AGT	2	6	1125191	1125196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28593	NC_009881	T	7	7	1125331	1125337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28594	NC_009881	TATT	2	8	1125378	1125385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28595	NC_009881	TTA	2	6	1125430	1125435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28597	NC_009881	TA	3	6	1125457	1125462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28601	NC_009881	AAC	2	6	1125673	1125678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28602	NC_009881	TA	3	6	1125733	1125738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28603	NC_009881	CTT	2	6	1125779	1125784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28604	NC_009881	AGT	2	6	1125814	1125819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28606	NC_009881	AG	3	6	1125866	1125871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28607	NC_009881	TTA	2	6	1125882	1125887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28609	NC_009881	CAT	2	6	1125924	1125929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28610	NC_009881	AAT	2	6	1125956	1125961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28611	NC_009881	AT	3	6	1125972	1125977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28612	NC_009881	TA	3	6	1125981	1125986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28613	NC_009881	GTA	2	6	1126004	1126009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28614	NC_009881	ACT	2	6	1126011	1126016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28615	NC_009881	CTTAT	2	10	1126054	1126063	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28616	NC_009881	TA	3	6	1126102	1126107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28617	NC_009881	AAG	2	6	1126167	1126172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28618	NC_009881	CTTT	2	8	1126220	1126227	0 %	75 %	0 %	25 %	157826269
28619	NC_009881	ATCC	2	8	1126231	1126238	25 %	25 %	0 %	50 %	157826269
28620	NC_009881	T	7	7	1126281	1126287	0 %	100 %	0 %	0 %	157826269
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