MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009881	TC	4	8	548631	548638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14002	NC_009881	AAAT	2	8	548656	548663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_009881	A	6	6	548709	548714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_009881	TAT	2	6	548720	548725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_009881	TTA	2	6	548835	548840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_009881	T	6	6	548884	548889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_009881	TTCCCA	2	12	548978	548989	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
14008	NC_009881	T	6	6	549006	549011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_009881	TA	3	6	549060	549065	50 %	50 %	0 %	0 %	157825682
14010	NC_009881	GCT	2	6	549082	549087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825682
14011	NC_009881	ATTT	2	8	549090	549097	25 %	75 %	0 %	0 %	157825682
14012	NC_009881	TCATTT	2	12	549100	549111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157825682
14013	NC_009881	T	6	6	549109	549114	0 %	100 %	0 %	0 %	157825682
14014	NC_009881	AAAC	2	8	549127	549134	75 %	0 %	0 %	25 %	157825682
14015	NC_009881	T	7	7	549188	549194	0 %	100 %	0 %	0 %	157825682
14016	NC_009881	CTT	2	6	549195	549200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825682
14017	NC_009881	ATTT	2	8	549202	549209	25 %	75 %	0 %	0 %	157825682
14018	NC_009881	AGA	2	6	549212	549217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825683
14019	NC_009881	T	6	6	549240	549245	0 %	100 %	0 %	0 %	157825683
14020	NC_009881	T	6	6	549248	549253	0 %	100 %	0 %	0 %	157825683
14021	NC_009881	A	7	7	549260	549266	100 %	0 %	0 %	0 %	157825683
14022	NC_009881	TAAA	2	8	549290	549297	75 %	25 %	0 %	0 %	157825683
14023	NC_009881	TAC	2	6	549371	549376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_009881	ATA	2	6	549392	549397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_009881	CAT	3	9	549464	549472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14027	NC_009881	ATG	2	6	549542	549547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_009881	TTA	2	6	549564	549569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_009881	TTAG	2	8	549578	549585	25 %	50 %	25 %	0 %	157825684
14030	NC_009881	CTT	2	6	549617	549622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825684
14031	NC_009881	CTTG	2	8	549626	549633	0 %	50 %	25 %	25 %	157825684
14032	NC_009881	TACT	2	8	549658	549665	25 %	50 %	0 %	25 %	157825684
14033	NC_009881	TGAT	2	8	549693	549700	25 %	50 %	25 %	0 %	157825684
14034	NC_009881	T	6	6	549737	549742	0 %	100 %	0 %	0 %	157825684
14035	NC_009881	ATA	2	6	549873	549878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825684
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14039	NC_009881	CTA	2	6	550003	550008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825684
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14041	NC_009881	AAT	2	6	550076	550081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825684
14042	NC_009881	ATT	2	6	550113	550118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825684
14043	NC_009881	T	6	6	550161	550166	0 %	100 %	0 %	0 %	157825684
14044	NC_009881	ATAC	2	8	550179	550186	50 %	25 %	0 %	25 %	157825684
14045	NC_009881	CAA	2	6	550204	550209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825684
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14048	NC_009881	TAC	2	6	550333	550338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825684
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14052	NC_009881	AT	3	6	550525	550530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_009881	TA	4	8	550541	550548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_009881	AT	4	8	550549	550556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_009881	TA	3	6	550558	550563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_009881	TTA	2	6	550569	550574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_009881	TAA	2	6	550615	550620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_009881	TATT	2	8	550687	550694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_009881	TTTA	2	8	550712	550719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_009881	CAA	2	6	550829	550834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14062	NC_009881	TAA	2	6	550901	550906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_009881	TA	3	6	550972	550977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_009881	GTAAT	2	10	550983	550992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_009881	AAC	2	6	551000	551005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_009881	CTA	2	6	551009	551014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14098	NC_009881	ATA	2	6	551930	551935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825685
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14105	NC_009881	AT	4	8	552107	552114	50 %	50 %	0 %	0 %	157825685
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14109	NC_009881	AGA	2	6	552159	552164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825685
14110	NC_009881	CTTA	2	8	552186	552193	25 %	50 %	0 %	25 %	157825685
14111	NC_009881	TTC	2	6	552219	552224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825685
14112	NC_009881	TA	3	6	552309	552314	50 %	50 %	0 %	0 %	157825685
14113	NC_009881	A	6	6	552432	552437	100 %	0 %	0 %	0 %	157825685
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14120	NC_009881	TTG	2	6	552771	552776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_009881	T	6	6	552787	552792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_009881	ATT	2	6	552841	552846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_009881	T	7	7	552860	552866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_009881	T	6	6	552905	552910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_009881	A	7	7	553001	553007	100 %	0 %	0 %	0 %	157825686
14126	NC_009881	GTA	2	6	553027	553032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825686
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