MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_009881	A	6	6	412911	412916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_009881	AT	3	6	412943	412948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_009881	TGAG	2	8	412985	412992	25 %	25 %	50 %	0 %	157825542
10504	NC_009881	TA	3	6	412999	413004	50 %	50 %	0 %	0 %	157825542
10505	NC_009881	TACTAT	2	12	413010	413021	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157825542
10506	NC_009881	AATA	2	8	413053	413060	75 %	25 %	0 %	0 %	157825542
10507	NC_009881	GCT	2	6	413075	413080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825542
10508	NC_009881	TAA	2	6	413098	413103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825542
10509	NC_009881	CTG	2	6	413121	413126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825542
10510	NC_009881	ATG	2	6	413142	413147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825542
10511	NC_009881	TCT	2	6	413201	413206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825542
10512	NC_009881	AGA	2	6	413218	413223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825542
10513	NC_009881	GAATA	2	10	413232	413241	60 %	20 %	20 %	0 %	157825542
10514	NC_009881	TGC	2	6	413254	413259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825542
10515	NC_009881	A	6	6	413303	413308	100 %	0 %	0 %	0 %	157825542
10516	NC_009881	TAT	2	6	413340	413345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825542
10517	NC_009881	AGC	2	6	413413	413418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825542
10518	NC_009881	A	6	6	413445	413450	100 %	0 %	0 %	0 %	157825542
10519	NC_009881	GTAT	2	8	413488	413495	25 %	50 %	25 %	0 %	157825542
10520	NC_009881	CTT	2	6	413505	413510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825542
10521	NC_009881	TAA	3	9	413554	413562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825542
10522	NC_009881	T	6	6	413625	413630	0 %	100 %	0 %	0 %	157825542
10523	NC_009881	AGA	2	6	413651	413656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825542
10524	NC_009881	AAAG	2	8	413690	413697	75 %	0 %	25 %	0 %	157825542
10525	NC_009881	GTA	2	6	413699	413704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825542
10526	NC_009881	CTA	2	6	413814	413819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825542
10527	NC_009881	A	7	7	413885	413891	100 %	0 %	0 %	0 %	157825542
10528	NC_009881	TA	3	6	413895	413900	50 %	50 %	0 %	0 %	157825542
10529	NC_009881	TA	3	6	413928	413933	50 %	50 %	0 %	0 %	157825542
10530	NC_009881	CGGA	2	8	413943	413950	25 %	0 %	50 %	25 %	157825542
10531	NC_009881	TA	3	6	414020	414025	50 %	50 %	0 %	0 %	157825542
10532	NC_009881	ATT	2	6	414038	414043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825542
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10535	NC_009881	TTG	2	6	414151	414156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825542
10536	NC_009881	GGA	2	6	414280	414285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825542
10537	NC_009881	CTA	2	6	414471	414476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825543
10538	NC_009881	CTT	2	6	414491	414496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825543
10539	NC_009881	T	6	6	414499	414504	0 %	100 %	0 %	0 %	157825543
10540	NC_009881	TAA	2	6	414653	414658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825543
10541	NC_009881	TTA	2	6	414684	414689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825543
10542	NC_009881	TGC	2	6	414749	414754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825543
10543	NC_009881	ATC	2	6	414755	414760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825543
10544	NC_009881	ATC	2	6	414866	414871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825543
10545	NC_009881	GTA	2	6	414873	414878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825543
10546	NC_009881	TTA	2	6	414918	414923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825543
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10548	NC_009881	T	8	8	414938	414945	0 %	100 %	0 %	0 %	157825543
10549	NC_009881	GTT	2	6	414954	414959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825543
10550	NC_009881	AT	4	8	414988	414995	50 %	50 %	0 %	0 %	157825543
10551	NC_009881	GCT	2	6	415005	415010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825543
10552	NC_009881	CCA	2	6	415016	415021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825543
10553	NC_009881	T	7	7	415064	415070	0 %	100 %	0 %	0 %	157825543
10554	NC_009881	CTGC	2	8	415072	415079	0 %	25 %	25 %	50 %	157825543
10555	NC_009881	TCT	2	6	415209	415214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825543
10556	NC_009881	TAA	2	6	415229	415234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825543
10557	NC_009881	CTT	3	9	415240	415248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825543
10558	NC_009881	TTA	2	6	415266	415271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825543
10559	NC_009881	AGT	2	6	415282	415287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825543
10560	NC_009881	ATT	2	6	415328	415333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825543
10561	NC_009881	AT	3	6	415372	415377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_009881	TAAA	2	8	415409	415416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_009881	A	6	6	415431	415436	100 %	0 %	0 %	0 %	157825544
10564	NC_009881	CTTG	2	8	415460	415467	0 %	50 %	25 %	25 %	157825544
10565	NC_009881	TAA	2	6	415471	415476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825544
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10567	NC_009881	TAC	2	6	415550	415555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825544
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10571	NC_009881	TTGTTT	2	12	415805	415816	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	157825544
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10575	NC_009881	CTTAT	2	10	415925	415934	20 %	60 %	0 %	20 %	157825544
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10577	NC_009881	AG	3	6	415950	415955	50 %	0 %	50 %	0 %	157825544
10578	NC_009881	TA	3	6	415957	415962	50 %	50 %	0 %	0 %	157825544
10579	NC_009881	CGT	2	6	415988	415993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10581	NC_009881	CAT	2	6	416181	416186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825545
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10588	NC_009881	CAA	2	6	416569	416574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825545
10589	NC_009881	TTC	2	6	416609	416614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825545
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10594	NC_009881	TATAA	2	10	416807	416816	60 %	40 %	0 %	0 %	157825545
10595	NC_009881	TCCATA	2	12	416821	416832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825545
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10597	NC_009881	TTA	2	6	416931	416936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825545
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10601	NC_009881	AAAT	2	8	417108	417115	75 %	25 %	0 %	0 %	157825545
10602	NC_009881	TAA	2	6	417127	417132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825545
10603	NC_009881	TA	3	6	417139	417144	50 %	50 %	0 %	0 %	157825545
10604	NC_009881	AGG	2	6	417195	417200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_009881	A	6	6	417218	417223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_009881	AAT	2	6	417253	417258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_009881	AATC	2	8	417270	417277	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10608	NC_009881	AAT	2	6	417316	417321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_009881	ATA	2	6	417327	417332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_009881	AT	3	6	417341	417346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_009881	TAATT	2	10	417362	417371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_009881	GTTT	2	8	417393	417400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_009881	CTA	2	6	417435	417440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825546
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10618	NC_009881	TGT	2	6	417572	417577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825546
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10621	NC_009881	TAA	2	6	417733	417738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825546
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10994	NC_009881	ATT	3	9	432191	432199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825558
10995	NC_009881	TAT	2	6	432202	432207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825558
10996	NC_009881	TTATA	2	10	432217	432226	40 %	60 %	0 %	0 %	157825558
10997	NC_009881	AAT	2	6	432227	432232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825558
10998	NC_009881	ATTA	2	8	432234	432241	50 %	50 %	0 %	0 %	157825558
10999	NC_009881	GCT	2	6	432271	432276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825559
11000	NC_009881	TTAC	2	8	432325	432332	25 %	50 %	0 %	25 %	157825559

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