MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 31337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009881	AAT	2	6	236244	236249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825359
6002	NC_009881	ATG	2	6	236263	236268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825359
6003	NC_009881	TTAA	2	8	236380	236387	50 %	50 %	0 %	0 %	157825359
6004	NC_009881	ATCT	2	8	236401	236408	25 %	50 %	0 %	25 %	157825359
6005	NC_009881	ATTA	2	8	236451	236458	50 %	50 %	0 %	0 %	157825359
6006	NC_009881	ATT	2	6	236466	236471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_009881	ATT	2	6	236493	236498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_009881	ACG	2	6	236543	236548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_009881	TAT	2	6	236581	236586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_009881	AT	3	6	236645	236650	50 %	50 %	0 %	0 %	157825360
6011	NC_009881	TAA	2	6	236653	236658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825360
6012	NC_009881	AAT	2	6	236659	236664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825360
6013	NC_009881	ACA	2	6	236730	236735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825360
6014	NC_009881	AT	4	8	236753	236760	50 %	50 %	0 %	0 %	157825360
6015	NC_009881	TTTA	2	8	236798	236805	25 %	75 %	0 %	0 %	157825360
6016	NC_009881	CTG	2	6	236812	236817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825360
6017	NC_009881	CTA	2	6	236878	236883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825360
6018	NC_009881	TGT	2	6	236893	236898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825360
6019	NC_009881	TAC	2	6	236950	236955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825360
6020	NC_009881	AT	3	6	236992	236997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_009881	AT	4	8	237009	237016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_009881	TAAA	2	8	237059	237066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_009881	GCA	2	6	237111	237116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_009881	CATT	2	8	237159	237166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_009881	TGC	2	6	237185	237190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_009881	TAA	2	6	237196	237201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_009881	TAATA	2	10	237220	237229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_009881	ATTAT	2	10	237312	237321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_009881	T	7	7	237324	237330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_009881	ATT	3	9	237362	237370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_009881	T	7	7	237407	237413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_009881	A	6	6	237416	237421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_009881	A	6	6	237427	237432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_009881	TATTAA	2	12	237482	237493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_009881	T	6	6	237496	237501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_009881	TAA	2	6	237518	237523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_009881	T	6	6	237547	237552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_009881	TAA	2	6	237581	237586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_009881	TA	4	8	237609	237616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_009881	T	7	7	237630	237636	0 %	100 %	0 %	0 %	157825361
6041	NC_009881	TAAT	2	8	237649	237656	50 %	50 %	0 %	0 %	157825361
6042	NC_009881	T	6	6	237700	237705	0 %	100 %	0 %	0 %	157825361
6043	NC_009881	TCC	2	6	237718	237723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825361
6044	NC_009881	CAT	2	6	237727	237732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825361
6045	NC_009881	ATT	2	6	237740	237745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825361
6046	NC_009881	ATG	2	6	237768	237773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825361
6047	NC_009881	AAT	2	6	237775	237780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825361
6048	NC_009881	T	6	6	237785	237790	0 %	100 %	0 %	0 %	157825361
6049	NC_009881	ATT	2	6	237797	237802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825361
6050	NC_009881	TCT	2	6	237843	237848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_009881	T	6	6	237880	237885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_009881	ATTCT	2	10	237931	237940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6053	NC_009881	TAAA	2	8	237998	238005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_009881	TTGT	2	8	238017	238024	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_009881	TAG	2	6	238083	238088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_009881	GTA	2	6	238091	238096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_009881	ATA	2	6	238118	238123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_009881	ATG	2	6	238169	238174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_009881	TTG	2	6	238284	238289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825362
6060	NC_009881	TAG	2	6	238308	238313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825362
6061	NC_009881	AAT	2	6	238348	238353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825362
6062	NC_009881	GAA	2	6	238382	238387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825362
6063	NC_009881	CCG	2	6	238433	238438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825362
6064	NC_009881	AAT	2	6	238462	238467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825362
6065	NC_009881	GAG	2	6	238482	238487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825362
6066	NC_009881	CAT	2	6	238501	238506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825362
6067	NC_009881	TAG	2	6	238521	238526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825362
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6069	NC_009881	TAG	2	6	238635	238640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825362
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6071	NC_009881	ACA	2	6	238793	238798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825362
6072	NC_009881	CCAG	2	8	238846	238853	25 %	0 %	25 %	50 %	157825362
6073	NC_009881	AAAGCA	2	12	238856	238867	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157825362
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6076	NC_009881	A	7	7	239065	239071	100 %	0 %	0 %	0 %	157825362
6077	NC_009881	TATG	2	8	239124	239131	25 %	50 %	25 %	0 %	157825362
6078	NC_009881	A	7	7	239182	239188	100 %	0 %	0 %	0 %	157825362
6079	NC_009881	GTA	2	6	239189	239194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825362
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6081	NC_009881	TCAT	2	8	239246	239253	25 %	50 %	0 %	25 %	157825362
6082	NC_009881	TAAC	2	8	239345	239352	50 %	25 %	0 %	25 %	157825362
6083	NC_009881	TA	3	6	239366	239371	50 %	50 %	0 %	0 %	157825362
6084	NC_009881	ATA	2	6	239378	239383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825362
6085	NC_009881	TACT	2	8	239429	239436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6086	NC_009881	ATTT	2	8	239446	239453	25 %	75 %	0 %	0 %	157825363
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6091	NC_009881	TAG	2	6	239729	239734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825363
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6095	NC_009881	T	6	6	239911	239916	0 %	100 %	0 %	0 %	157825364
6096	NC_009881	TGC	2	6	239937	239942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825364
6097	NC_009881	T	6	6	240002	240007	0 %	100 %	0 %	0 %	157825364
6098	NC_009881	TTAA	2	8	240018	240025	50 %	50 %	0 %	0 %	157825364
6099	NC_009881	CTA	2	6	240034	240039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825364
6100	NC_009881	ATTT	2	8	240115	240122	25 %	75 %	0 %	0 %	157825364
6101	NC_009881	ACG	2	6	240161	240166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825364
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6105	NC_009881	AGT	2	6	240328	240333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825365
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6109	NC_009881	TA	3	6	240426	240431	50 %	50 %	0 %	0 %	157825365
6110	NC_009881	CAT	2	6	240432	240437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825365
6111	NC_009881	GAG	2	6	240512	240517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825365
6112	NC_009881	TAA	2	6	240521	240526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825365
6113	NC_009881	ATA	2	6	240536	240541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825365
6114	NC_009881	T	6	6	240621	240626	0 %	100 %	0 %	0 %	157825365
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6117	NC_009881	TA	3	6	240746	240751	50 %	50 %	0 %	0 %	157825365
6118	NC_009881	ATC	2	6	240756	240761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825365
6119	NC_009881	TTG	2	6	240809	240814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825365
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6121	NC_009881	GCAAT	2	10	240887	240896	40 %	20 %	20 %	20 %	157825365
6122	NC_009881	AGT	2	6	240924	240929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825365
6123	NC_009881	GCT	2	6	240937	240942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825365
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6125	NC_009881	GTA	2	6	241036	241041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825365
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