MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 134693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_009767	GCA	2	6	533378	533383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740440
12502	NC_009767	CA	3	6	533495	533500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12503	NC_009767	TAC	2	6	533517	533522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_009767	CGC	2	6	533578	533583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740441
12505	NC_009767	GAT	2	6	533599	533604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740441
12506	NC_009767	GAA	2	6	533667	533672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740441
12507	NC_009767	ATG	2	6	533734	533739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740441
12508	NC_009767	ATC	3	9	533797	533805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740441
12509	NC_009767	CGA	2	6	533859	533864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740441
12510	NC_009767	CCG	2	6	533888	533893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740441
12511	NC_009767	GC	3	6	533902	533907	0 %	0 %	50 %	50 %	156740441
12512	NC_009767	GCC	2	6	533955	533960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740441
12513	NC_009767	CGA	2	6	533988	533993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740441
12514	NC_009767	GCC	2	6	534070	534075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740441
12515	NC_009767	TGG	2	6	534152	534157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740441
12516	NC_009767	TGCG	2	8	534163	534170	0 %	25 %	50 %	25 %	156740441
12517	NC_009767	CGCGTC	2	12	534203	534214	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	156740441
12518	NC_009767	GCG	2	6	534301	534306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_009767	AGCGA	2	10	534355	534364	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12520	NC_009767	CAA	2	6	534442	534447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156740442
12521	NC_009767	TTC	2	6	534479	534484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740442
12522	NC_009767	CGC	2	6	534547	534552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740442
12523	NC_009767	GCA	2	6	534558	534563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740442
12524	NC_009767	CGC	2	6	534609	534614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740442
12525	NC_009767	GTG	2	6	534821	534826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740442
12526	NC_009767	CT	3	6	534846	534851	0 %	50 %	0 %	50 %	156740442
12527	NC_009767	CAG	2	6	534919	534924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740442
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12529	NC_009767	GCT	2	6	534968	534973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740442
12530	NC_009767	GCG	2	6	534984	534989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740442
12531	NC_009767	TG	3	6	535014	535019	0 %	50 %	50 %	0 %	156740442
12532	NC_009767	ATC	2	6	535045	535050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740442
12533	NC_009767	GCGCA	2	10	535174	535183	20 %	0 %	40 %	40 %	156740442
12534	NC_009767	TGG	2	6	535194	535199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740442
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12537	NC_009767	ACC	2	6	535310	535315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740442
12538	NC_009767	ATG	2	6	535331	535336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740442
12539	NC_009767	GAC	2	6	535353	535358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740442
12540	NC_009767	TGA	2	6	535359	535364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740442
12541	NC_009767	CGC	2	6	535391	535396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740442
12542	NC_009767	CGC	2	6	535471	535476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740442
12543	NC_009767	AAG	2	6	535534	535539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740442
12544	NC_009767	CG	3	6	535590	535595	0 %	0 %	50 %	50 %	156740442
12545	NC_009767	GTGAT	2	10	535632	535641	20 %	40 %	40 %	0 %	156740442
12546	NC_009767	TCT	2	6	535685	535690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740442
12547	NC_009767	CG	4	8	535696	535703	0 %	0 %	50 %	50 %	156740442
12548	NC_009767	GGCT	2	8	535729	535736	0 %	25 %	50 %	25 %	156740442
12549	NC_009767	AGT	2	6	535812	535817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_009767	TCA	2	6	535852	535857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_009767	TGATA	2	10	535877	535886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_009767	AGC	2	6	535889	535894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_009767	CGT	2	6	535917	535922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_009767	AGG	2	6	535926	535931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_009767	CGTT	2	8	536012	536019	0 %	50 %	25 %	25 %	156740443
12556	NC_009767	ATC	2	6	536033	536038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740443
12557	NC_009767	ACTG	2	8	536060	536067	25 %	25 %	25 %	25 %	156740443
12558	NC_009767	ATT	2	6	536089	536094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156740443
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12560	NC_009767	GCA	2	6	536194	536199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740443
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12562	NC_009767	AGT	2	6	536267	536272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740443
12563	NC_009767	TCT	2	6	536350	536355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740443
12564	NC_009767	ATC	2	6	536382	536387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740443
12565	NC_009767	GGC	2	6	536421	536426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740443
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12568	NC_009767	GC	3	6	536626	536631	0 %	0 %	50 %	50 %	156740443
12569	NC_009767	TGGC	2	8	536762	536769	0 %	25 %	50 %	25 %	156740443
12570	NC_009767	TCG	3	9	536935	536943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740443
12571	NC_009767	GCG	2	6	537004	537009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740443
12572	NC_009767	ATT	2	6	537099	537104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156740443
12573	NC_009767	CGCCA	2	10	537212	537221	20 %	0 %	20 %	60 %	156740443
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12579	NC_009767	ACGGCG	2	12	537708	537719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156740443
12580	NC_009767	ACGGCG	2	12	537726	537737	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156740443
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12582	NC_009767	ACGGCG	3	18	537762	537779	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156740443
12583	NC_009767	GCGCG	2	10	537864	537873	0 %	0 %	60 %	40 %	156740443
12584	NC_009767	GA	3	6	537970	537975	50 %	0 %	50 %	0 %	156740443
12585	NC_009767	CGA	2	6	537988	537993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740443
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12588	NC_009767	TGG	2	6	538233	538238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740443
12589	NC_009767	GCCA	2	8	538273	538280	25 %	0 %	25 %	50 %	156740443
12590	NC_009767	GTC	2	6	538297	538302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740443
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12592	NC_009767	CGAC	2	8	538375	538382	25 %	0 %	25 %	50 %	156740443
12593	NC_009767	ACC	2	6	538425	538430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740444
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12599	NC_009767	GC	3	6	538760	538765	0 %	0 %	50 %	50 %	156740444
12600	NC_009767	CCA	3	9	538947	538955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156740444
12601	NC_009767	CCGC	2	8	538963	538970	0 %	0 %	25 %	75 %	156740444
12602	NC_009767	CG	3	6	538971	538976	0 %	0 %	50 %	50 %	156740444
12603	NC_009767	GC	3	6	538981	538986	0 %	0 %	50 %	50 %	156740444
12604	NC_009767	CAT	2	6	539037	539042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740444
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12609	NC_009767	CAG	2	6	539239	539244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740444
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12611	NC_009767	CGG	2	6	539288	539293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740444
12612	NC_009767	GC	5	10	539362	539371	0 %	0 %	50 %	50 %	156740444
12613	NC_009767	GCG	2	6	539391	539396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740444
12614	NC_009767	CAGC	2	8	539447	539454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12615	NC_009767	GC	4	8	539453	539460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12616	NC_009767	TTC	2	6	539573	539578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_009767	CACC	2	8	539579	539586	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12618	NC_009767	GT	3	6	539589	539594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_009767	ATAC	2	8	539595	539602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12621	NC_009767	GGCG	2	8	539685	539692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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12869	NC_009767	GTC	2	6	550036	550041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740456
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12871	NC_009767	AGGC	2	8	550094	550101	25 %	0 %	50 %	25 %	156740456
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12984	NC_009767	GGCGT	2	10	555863	555872	0 %	20 %	60 %	20 %	156740460
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