MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 134693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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121002	NC_009767	CTG	2	6	5138064	5138069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743859
121003	NC_009767	TGG	2	6	5138159	5138164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156743859
121004	NC_009767	GCC	2	6	5138181	5138186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121005	NC_009767	TCG	2	6	5138293	5138298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743860
121006	NC_009767	GCC	2	6	5138303	5138308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156743860
121007	NC_009767	GCG	2	6	5138325	5138330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156743860
121008	NC_009767	CCGGCG	2	12	5138362	5138373	0 %	0 %	50 %	50 %	156743860
121009	NC_009767	CGC	2	6	5138398	5138403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156743860
121010	NC_009767	GTC	2	6	5138450	5138455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743860
121011	NC_009767	TCG	2	6	5138496	5138501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743860
121012	NC_009767	CCCG	2	8	5138536	5138543	0 %	0 %	25 %	75 %	156743860
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121015	NC_009767	GCCGC	2	10	5138814	5138823	0 %	0 %	40 %	60 %	156743860
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121049	NC_009767	AG	3	6	5140123	5140128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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121051	NC_009767	TGCG	2	8	5140166	5140173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121052	NC_009767	TCTG	2	8	5140178	5140185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121053	NC_009767	CTTCG	2	10	5140314	5140323	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121054	NC_009767	CGAGG	2	10	5140469	5140478	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
121055	NC_009767	CTTCG	2	10	5140572	5140581	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121056	NC_009767	CGC	2	6	5140632	5140637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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121058	NC_009767	CG	3	6	5140843	5140848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121059	NC_009767	CG	3	6	5140926	5140931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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121091	NC_009767	GC	4	8	5142642	5142649	0 %	0 %	50 %	50 %	156743861
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121113	NC_009767	GC	3	6	5143359	5143364	0 %	0 %	50 %	50 %	156743861
121114	NC_009767	AGC	2	6	5143497	5143502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156743861
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121233	NC_009767	CCGA	2	8	5148482	5148489	25 %	0 %	25 %	50 %	156743864
121234	NC_009767	ATC	2	6	5148497	5148502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743864
121235	NC_009767	CAC	2	6	5148534	5148539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156743864
121236	NC_009767	CAC	2	6	5148634	5148639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156743864
121237	NC_009767	GTC	2	6	5148640	5148645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743864
121238	NC_009767	ATC	2	6	5148682	5148687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743864
121239	NC_009767	CGA	2	6	5148702	5148707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156743864
121240	NC_009767	CAA	2	6	5148709	5148714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156743864
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121246	NC_009767	GGGT	3	12	5148883	5148894	0 %	25 %	75 %	0 %	156743864
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121248	NC_009767	GC	4	8	5148921	5148928	0 %	0 %	50 %	50 %	156743864
121249	NC_009767	GCA	2	6	5148930	5148935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156743864
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121252	NC_009767	CGC	2	6	5148989	5148994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156743864
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121261	NC_009767	GAT	2	6	5149338	5149343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156743864
121262	NC_009767	GTG	2	6	5149355	5149360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156743864
121263	NC_009767	GCC	2	6	5149521	5149526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156743865
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121272	NC_009767	CG	3	6	5149851	5149856	0 %	0 %	50 %	50 %	156743865
121273	NC_009767	CCATT	2	10	5149860	5149869	20 %	40 %	0 %	40 %	156743865
121274	NC_009767	GAT	2	6	5149953	5149958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156743865
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121280	NC_009767	CGG	2	6	5150156	5150161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156743865
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121286	NC_009767	CAG	2	6	5150367	5150372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156743865
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121288	NC_009767	CAT	2	6	5150418	5150423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743865
121289	NC_009767	CAG	2	6	5150451	5150456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156743865
121290	NC_009767	AG	3	6	5150455	5150460	50 %	0 %	50 %	0 %	156743865
121291	NC_009767	ATC	2	6	5150467	5150472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743865
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121293	NC_009767	GCT	2	6	5150575	5150580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743865
121294	NC_009767	TAT	2	6	5150666	5150671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156743865
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121300	NC_009767	TGA	2	6	5150941	5150946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156743865
121301	NC_009767	CG	3	6	5150978	5150983	0 %	0 %	50 %	50 %	156743865
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121303	NC_009767	ATC	2	6	5151025	5151030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743865
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121306	NC_009767	TCG	2	6	5151158	5151163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743865
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121311	NC_009767	CGT	2	6	5151459	5151464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743865
121312	NC_009767	CGGAG	2	10	5151473	5151482	20 %	0 %	60 %	20 %	156743865
121313	NC_009767	TCA	2	6	5151515	5151520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743865
121314	NC_009767	GGC	2	6	5151522	5151527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121315	NC_009767	GAT	2	6	5151600	5151605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156743866
121316	NC_009767	GCT	2	6	5151639	5151644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743866
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121320	NC_009767	GCG	2	6	5151742	5151747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156743866
121321	NC_009767	GTGG	2	8	5151784	5151791	0 %	25 %	75 %	0 %	156743866
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121323	NC_009767	GCA	2	6	5151815	5151820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156743866
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121328	NC_009767	TCG	2	6	5151949	5151954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743866
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121330	NC_009767	CGT	2	6	5151996	5152001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743866
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121333	NC_009767	ATC	2	6	5152044	5152049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743866
121334	NC_009767	CTG	2	6	5152052	5152057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743866
121335	NC_009767	TCA	2	6	5152070	5152075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743866
121336	NC_009767	CTG	2	6	5152083	5152088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121337	NC_009767	CGA	2	6	5152100	5152105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121338	NC_009767	GT	3	6	5152154	5152159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121339	NC_009767	ACG	2	6	5152192	5152197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121340	NC_009767	CAT	2	6	5152346	5152351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156743867
121341	NC_009767	TCG	2	6	5152454	5152459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156743867
121342	NC_009767	GGC	2	6	5152481	5152486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156743867
121343	NC_009767	GGC	2	6	5152568	5152573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156743868
121344	NC_009767	GC	4	8	5152585	5152592	0 %	0 %	50 %	50 %	156743868
121345	NC_009767	CG	3	6	5152595	5152600	0 %	0 %	50 %	50 %	156743868
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121347	NC_009767	GCC	2	6	5152640	5152645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156743868
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