MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_009523	AGC	3	9	1283434	1283442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655197
30002	NC_009523	CGG	2	6	1283462	1283467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655197
30003	NC_009523	GGT	2	6	1283528	1283533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655197
30004	NC_009523	TCG	3	9	1283570	1283578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30005	NC_009523	GCA	2	6	1283610	1283615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655198
30006	NC_009523	GATC	2	8	1283616	1283623	25 %	25 %	25 %	25 %	148655198
30007	NC_009523	TCCA	2	8	1283635	1283642	25 %	25 %	0 %	50 %	148655198
30008	NC_009523	GAT	2	6	1283695	1283700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655198
30009	NC_009523	CGC	2	6	1283751	1283756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655198
30010	NC_009523	CCT	2	6	1283865	1283870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655198
30011	NC_009523	TGA	2	6	1283898	1283903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655198
30012	NC_009523	CGA	2	6	1283919	1283924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655198
30013	NC_009523	CGA	4	12	1283931	1283942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655198
30014	NC_009523	CGA	2	6	1283990	1283995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655198
30015	NC_009523	TCC	2	6	1284011	1284016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655199
30016	NC_009523	CGACG	2	10	1284036	1284045	20 %	0 %	40 %	40 %	148655199
30017	NC_009523	GC	7	14	1284115	1284128	0 %	0 %	50 %	50 %	148655199
30018	NC_009523	CGT	3	9	1284158	1284166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655199
30019	NC_009523	AACGC	2	10	1284190	1284199	40 %	0 %	20 %	40 %	148655199
30020	NC_009523	TG	3	6	1284200	1284205	0 %	50 %	50 %	0 %	148655199
30021	NC_009523	GCT	2	6	1284207	1284212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655199
30022	NC_009523	CCT	2	6	1284254	1284259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655199
30023	NC_009523	GCC	2	6	1284262	1284267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655199
30024	NC_009523	GC	3	6	1284270	1284275	0 %	0 %	50 %	50 %	148655199
30025	NC_009523	CTGC	2	8	1284416	1284423	0 %	25 %	25 %	50 %	148655199
30026	NC_009523	GA	3	6	1284450	1284455	50 %	0 %	50 %	0 %	148655200
30027	NC_009523	CG	3	6	1284466	1284471	0 %	0 %	50 %	50 %	148655200
30028	NC_009523	CGT	2	6	1284517	1284522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655200
30029	NC_009523	TC	3	6	1284580	1284585	0 %	50 %	0 %	50 %	148655200
30030	NC_009523	CGC	2	6	1284610	1284615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655200
30031	NC_009523	CCT	2	6	1284646	1284651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655200
30032	NC_009523	TCGG	2	8	1284654	1284661	0 %	25 %	50 %	25 %	148655200
30033	NC_009523	TGG	2	6	1284664	1284669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655200
30034	NC_009523	GCACCC	2	12	1284742	1284753	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148655200
30035	NC_009523	CGG	2	6	1284846	1284851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655200
30036	NC_009523	GGC	2	6	1284904	1284909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655200
30037	NC_009523	GC	3	6	1285061	1285066	0 %	0 %	50 %	50 %	148655200
30038	NC_009523	GAG	2	6	1285079	1285084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148655200
30039	NC_009523	CGG	2	6	1285090	1285095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655200
30040	NC_009523	GAT	2	6	1285151	1285156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655200
30041	NC_009523	CCG	2	6	1285263	1285268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655200
30042	NC_009523	CCA	2	6	1285290	1285295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655200
30043	NC_009523	CGG	2	6	1285336	1285341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655200
30044	NC_009523	CTTC	2	8	1285539	1285546	0 %	50 %	0 %	50 %	148655200
30045	NC_009523	GGC	2	6	1285596	1285601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655200
30046	NC_009523	CG	3	6	1285633	1285638	0 %	0 %	50 %	50 %	148655200
30047	NC_009523	GCA	2	6	1285672	1285677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655200
30048	NC_009523	GTA	2	6	1285709	1285714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655200
30049	NC_009523	GAA	2	6	1285763	1285768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655200
30050	NC_009523	GTA	2	6	1285799	1285804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655200
30051	NC_009523	ACTG	2	8	1285909	1285916	25 %	25 %	25 %	25 %	148655201
30052	NC_009523	CTC	2	6	1286018	1286023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655201
30053	NC_009523	GCGCC	2	10	1286026	1286035	0 %	0 %	40 %	60 %	148655201
30054	NC_009523	GCA	2	6	1286047	1286052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655201
30055	NC_009523	CG	4	8	1286064	1286071	0 %	0 %	50 %	50 %	148655201
30056	NC_009523	CGG	3	9	1286102	1286110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655201
30057	NC_009523	CGCCAG	2	12	1286159	1286170	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148655201
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30059	NC_009523	GCGCA	2	10	1286193	1286202	20 %	0 %	40 %	40 %	148655201
30060	NC_009523	GC	3	6	1286260	1286265	0 %	0 %	50 %	50 %	148655201
30061	NC_009523	GCG	2	6	1286338	1286343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655201
30062	NC_009523	CG	3	6	1286362	1286367	0 %	0 %	50 %	50 %	148655201
30063	NC_009523	GAA	2	6	1286435	1286440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655201
30064	NC_009523	GCTG	2	8	1286453	1286460	0 %	25 %	50 %	25 %	148655201
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30070	NC_009523	GC	3	6	1286644	1286649	0 %	0 %	50 %	50 %	148655201
30071	NC_009523	CG	3	6	1286693	1286698	0 %	0 %	50 %	50 %	148655201
30072	NC_009523	CGG	2	6	1286709	1286714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655201
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30078	NC_009523	AGAA	2	8	1286805	1286812	75 %	0 %	25 %	0 %	148655201
30079	NC_009523	GACC	2	8	1286824	1286831	25 %	0 %	25 %	50 %	148655201
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30081	NC_009523	GC	3	6	1286939	1286944	0 %	0 %	50 %	50 %	148655201
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30086	NC_009523	TTC	2	6	1287215	1287220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148655202
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30088	NC_009523	CG	3	6	1287257	1287262	0 %	0 %	50 %	50 %	148655202
30089	NC_009523	GCA	2	6	1287285	1287290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655202
30090	NC_009523	TCG	2	6	1287299	1287304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655202
30091	NC_009523	GAC	2	6	1287342	1287347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655202
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30093	NC_009523	CTG	2	6	1287406	1287411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655202
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30095	NC_009523	TCG	2	6	1287616	1287621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655202
30096	NC_009523	CT	3	6	1287645	1287650	0 %	50 %	0 %	50 %	148655202
30097	NC_009523	ATC	2	6	1287670	1287675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655203
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30099	NC_009523	AAC	2	6	1287876	1287881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148655204
30100	NC_009523	TCT	2	6	1287925	1287930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148655204
30101	NC_009523	CCT	2	6	1287990	1287995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655204
30102	NC_009523	AC	3	6	1288069	1288074	50 %	0 %	0 %	50 %	148655204
30103	NC_009523	CAG	2	6	1288103	1288108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655204
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30105	NC_009523	GTTT	2	8	1288178	1288185	0 %	75 %	25 %	0 %	148655204
30106	NC_009523	CGG	2	6	1288201	1288206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655204
30107	NC_009523	GAT	2	6	1288211	1288216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655204
30108	NC_009523	CAT	2	6	1288255	1288260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655204
30109	NC_009523	ACC	2	6	1288263	1288268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655204
30110	NC_009523	CGC	2	6	1288346	1288351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655204
30111	NC_009523	CAG	2	6	1288376	1288381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655204
30112	NC_009523	TTC	2	6	1288401	1288406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148655204
30113	NC_009523	GTC	2	6	1288434	1288439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655204
30114	NC_009523	ACC	2	6	1288461	1288466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655204
30115	NC_009523	GC	3	6	1288481	1288486	0 %	0 %	50 %	50 %	148655204
30116	NC_009523	GTTCCT	2	12	1288504	1288515	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148655204
30117	NC_009523	CG	3	6	1288549	1288554	0 %	0 %	50 %	50 %	148655204
30118	NC_009523	CG	3	6	1288558	1288563	0 %	0 %	50 %	50 %	148655204
30119	NC_009523	TCG	2	6	1288618	1288623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655204
30120	NC_009523	ATC	2	6	1288676	1288681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655204
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30137	NC_009523	CCCT	2	8	1289672	1289679	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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30142	NC_009523	CCCT	2	8	1289917	1289924	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30143	NC_009523	GC	3	6	1289927	1289932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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30146	NC_009523	GCG	2	6	1290160	1290165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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30225	NC_009523	CG	3	6	1293389	1293394	0 %	0 %	50 %	50 %	148655209
30226	NC_009523	CCTG	2	8	1293405	1293412	0 %	25 %	25 %	50 %	148655209
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30236	NC_009523	CAGG	2	8	1293719	1293726	25 %	0 %	50 %	25 %	148655209
30237	NC_009523	ATA	2	6	1293744	1293749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148655209
30238	NC_009523	GCA	2	6	1293766	1293771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655209
30239	NC_009523	CAA	2	6	1293810	1293815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148655209
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30241	NC_009523	CGG	2	6	1293826	1293831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655209
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30243	NC_009523	CGG	2	6	1293913	1293918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655209
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30248	NC_009523	GGC	3	9	1294153	1294161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655209
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30256	NC_009523	GGTCT	2	10	1294392	1294401	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30257	NC_009523	CAC	2	6	1294418	1294423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30258	NC_009523	CAC	2	6	1294520	1294525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30259	NC_009523	TCGCC	2	10	1294612	1294621	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30260	NC_009523	CG	3	6	1294719	1294724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30261	NC_009523	TCA	2	6	1294845	1294850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30264	NC_009523	CG	3	6	1295109	1295114	0 %	0 %	50 %	50 %	148655210
30265	NC_009523	CGC	2	6	1295121	1295126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655210
30266	NC_009523	CGC	2	6	1295163	1295168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655210
30267	NC_009523	GC	3	6	1295174	1295179	0 %	0 %	50 %	50 %	148655210
30268	NC_009523	GGA	2	6	1295245	1295250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148655210
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30272	NC_009523	CGG	3	9	1295477	1295485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655211
30273	NC_009523	GC	3	6	1295496	1295501	0 %	0 %	50 %	50 %	148655211
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30285	NC_009523	GC	4	8	1295879	1295886	0 %	0 %	50 %	50 %	148655211
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30287	NC_009523	GC	3	6	1295929	1295934	0 %	0 %	50 %	50 %	148655211
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30296	NC_009523	GC	3	6	1296408	1296413	0 %	0 %	50 %	50 %	148655211
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30298	NC_009523	G	7	7	1296438	1296444	0 %	0 %	100 %	0 %	148655211
30299	NC_009523	TAT	2	6	1296476	1296481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148655211
30300	NC_009523	CAC	2	6	1296492	1296497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655211
30301	NC_009523	CGTG	2	8	1296517	1296524	0 %	25 %	50 %	25 %	148655212
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30307	NC_009523	CGA	3	9	1296781	1296789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655213
30308	NC_009523	ACG	2	6	1296828	1296833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655213
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30322	NC_009523	ATC	2	6	1297499	1297504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655213
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30325	NC_009523	GAG	2	6	1297542	1297547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30326	NC_009523	TCG	2	6	1297574	1297579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655214
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30328	NC_009523	CTG	2	6	1297606	1297611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655214
30329	NC_009523	CTC	2	6	1297618	1297623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655214
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30331	NC_009523	CCG	2	6	1297853	1297858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655214
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30333	NC_009523	CAAC	2	8	1298018	1298025	50 %	0 %	0 %	50 %	148655214
30334	NC_009523	TGC	2	6	1298033	1298038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655214
30335	NC_009523	CG	3	6	1298069	1298074	0 %	0 %	50 %	50 %	148655214
30336	NC_009523	TCG	2	6	1298101	1298106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655214
30337	NC_009523	GTG	2	6	1298111	1298116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655214
30338	NC_009523	ATC	2	6	1298130	1298135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655214
30339	NC_009523	CAC	2	6	1298137	1298142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655214
30340	NC_009523	CGGAG	2	10	1298144	1298153	20 %	0 %	60 %	20 %	148655214
30341	NC_009523	GTG	2	6	1298264	1298269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655214
30342	NC_009523	GC	3	6	1298325	1298330	0 %	0 %	50 %	50 %	148655214
30343	NC_009523	CGGA	2	8	1298466	1298473	25 %	0 %	50 %	25 %	148655214
30344	NC_009523	TGA	2	6	1298501	1298506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655214
30345	NC_009523	GAG	2	6	1298557	1298562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148655214
30346	NC_009523	TGT	2	6	1298773	1298778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30347	NC_009523	TGA	2	6	1298810	1298815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30348	NC_009523	AGGCG	2	10	1299084	1299093	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30349	NC_009523	G	6	6	1299387	1299392	0 %	0 %	100 %	0 %	148655215
30350	NC_009523	CTCG	2	8	1299502	1299509	0 %	25 %	25 %	50 %	148655215
30351	NC_009523	CCG	2	6	1299548	1299553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655215
30352	NC_009523	CCG	2	6	1299568	1299573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655215
30353	NC_009523	CTG	2	6	1299575	1299580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655215
30354	NC_009523	GC	3	6	1299583	1299588	0 %	0 %	50 %	50 %	148655215
30355	NC_009523	GAC	3	9	1299604	1299612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655215
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30361	NC_009523	GC	3	6	1299776	1299781	0 %	0 %	50 %	50 %	148655215
30362	NC_009523	TG	3	6	1299797	1299802	0 %	50 %	50 %	0 %	148655215
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