MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_009523	TGC	2	6	1261955	1261960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655178
29503	NC_009523	GCG	2	6	1261968	1261973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655178
29504	NC_009523	TGA	2	6	1262015	1262020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655178
29505	NC_009523	TGC	2	6	1262029	1262034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655178
29506	NC_009523	GC	3	6	1262084	1262089	0 %	0 %	50 %	50 %	148655178
29507	NC_009523	CG	3	6	1262111	1262116	0 %	0 %	50 %	50 %	148655178
29508	NC_009523	CGATCT	2	12	1262171	1262182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148655178
29509	NC_009523	TCG	2	6	1262229	1262234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655178
29510	NC_009523	TTG	2	6	1262281	1262286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148655178
29511	NC_009523	AGC	2	6	1262310	1262315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655179
29512	NC_009523	TGG	2	6	1262366	1262371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655179
29513	NC_009523	GCT	3	9	1262373	1262381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655179
29514	NC_009523	TCG	2	6	1262403	1262408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655179
29515	NC_009523	GTT	2	6	1262484	1262489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148655179
29516	NC_009523	TGCGC	2	10	1262490	1262499	0 %	20 %	40 %	40 %	148655179
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29519	NC_009523	TGG	2	6	1262567	1262572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655179
29520	NC_009523	GAA	2	6	1262575	1262580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655179
29521	NC_009523	GCC	2	6	1262649	1262654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655179
29522	NC_009523	GCT	3	9	1262655	1262663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655179
29523	NC_009523	GC	3	6	1262668	1262673	0 %	0 %	50 %	50 %	148655179
29524	NC_009523	CTG	2	6	1262707	1262712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655179
29525	NC_009523	TGT	2	6	1262756	1262761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148655179
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29527	NC_009523	GC	3	6	1262770	1262775	0 %	0 %	50 %	50 %	148655179
29528	NC_009523	CGG	2	6	1262786	1262791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655179
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29532	NC_009523	CTG	2	6	1263010	1263015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655179
29533	NC_009523	CGA	2	6	1263021	1263026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655179
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29535	NC_009523	GC	3	6	1263061	1263066	0 %	0 %	50 %	50 %	148655179
29536	NC_009523	CGC	2	6	1263117	1263122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655179
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29539	NC_009523	ATG	2	6	1263200	1263205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655179
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29562	NC_009523	TTG	2	6	1264585	1264590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148655179
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29580	NC_009523	GCGCCG	2	12	1265233	1265244	0 %	0 %	50 %	50 %	148655180
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29586	NC_009523	AGC	2	6	1265585	1265590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655180
29587	NC_009523	CGG	2	6	1265609	1265614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655180
29588	NC_009523	CAG	2	6	1265732	1265737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29589	NC_009523	CAT	2	6	1265783	1265788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29590	NC_009523	GT	3	6	1265985	1265990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29591	NC_009523	AAGG	2	8	1266104	1266111	50 %	0 %	50 %	0 %	148655181
29592	NC_009523	GCT	2	6	1266135	1266140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655181
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29594	NC_009523	ATC	2	6	1266225	1266230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655181
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29597	NC_009523	GC	3	6	1266305	1266310	0 %	0 %	50 %	50 %	148655181
29598	NC_009523	GCC	2	6	1266409	1266414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655181
29599	NC_009523	GC	3	6	1266415	1266420	0 %	0 %	50 %	50 %	148655181
29600	NC_009523	CGC	2	6	1266429	1266434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655181
29601	NC_009523	CTG	2	6	1266438	1266443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655181
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29603	NC_009523	GC	4	8	1266527	1266534	0 %	0 %	50 %	50 %	148655181
29604	NC_009523	GAAC	2	8	1266572	1266579	50 %	0 %	25 %	25 %	148655181
29605	NC_009523	GCG	2	6	1266588	1266593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655181
29606	NC_009523	CAT	2	6	1266599	1266604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655181
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29610	NC_009523	CCAGCA	2	12	1266821	1266832	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148655181
29611	NC_009523	GCGT	2	8	1266833	1266840	0 %	25 %	50 %	25 %	148655181
29612	NC_009523	GAA	2	6	1266906	1266911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655182
29613	NC_009523	GCG	2	6	1266921	1266926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655182
29614	NC_009523	GC	3	6	1267062	1267067	0 %	0 %	50 %	50 %	148655182
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29968	NC_009523	GGCG	2	8	1281547	1281554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29969	NC_009523	GCG	2	6	1281565	1281570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29970	NC_009523	GGC	2	6	1281571	1281576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29971	NC_009523	TGG	2	6	1281578	1281583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29972	NC_009523	CA	3	6	1281645	1281650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29973	NC_009523	GAA	2	6	1281652	1281657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29974	NC_009523	GGA	2	6	1281658	1281663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29975	NC_009523	CGG	2	6	1281898	1281903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655196
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29977	NC_009523	CAT	2	6	1282040	1282045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655196
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29987	NC_009523	GC	3	6	1282631	1282636	0 %	0 %	50 %	50 %	148655196
29988	NC_009523	GAT	2	6	1282689	1282694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29989	NC_009523	CGT	2	6	1282708	1282713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29990	NC_009523	ATC	3	9	1282716	1282724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29991	NC_009523	GAC	2	6	1282725	1282730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29992	NC_009523	TTGTA	2	10	1282759	1282768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29993	NC_009523	CGG	2	6	1282985	1282990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655197
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29996	NC_009523	CT	3	6	1283215	1283220	0 %	50 %	0 %	50 %	148655197
29997	NC_009523	TGC	2	6	1283257	1283262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655197
29998	NC_009523	CGA	2	6	1283285	1283290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655197
29999	NC_009523	CGC	3	9	1283318	1283326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655197
30000	NC_009523	CCG	2	6	1283369	1283374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655197

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