MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_009523	TGC	2	6	1240669	1240674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655167
29003	NC_009523	CCG	2	6	1240685	1240690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655167
29004	NC_009523	CCG	2	6	1240704	1240709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655167
29005	NC_009523	GAGGT	2	10	1240728	1240737	20 %	20 %	60 %	0 %	148655167
29006	NC_009523	GCC	2	6	1240744	1240749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655167
29007	NC_009523	GAT	2	6	1240763	1240768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655167
29008	NC_009523	GC	3	6	1240780	1240785	0 %	0 %	50 %	50 %	148655167
29009	NC_009523	TTC	2	6	1240805	1240810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148655167
29010	NC_009523	GC	3	6	1240856	1240861	0 %	0 %	50 %	50 %	148655167
29011	NC_009523	GTG	2	6	1240883	1240888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655167
29012	NC_009523	GC	3	6	1240981	1240986	0 %	0 %	50 %	50 %	148655167
29013	NC_009523	TGC	2	6	1240989	1240994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655167
29014	NC_009523	GCG	2	6	1241025	1241030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655167
29015	NC_009523	CGA	2	6	1241041	1241046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655167
29016	NC_009523	GATC	2	8	1241083	1241090	25 %	25 %	25 %	25 %	148655167
29017	NC_009523	ACG	2	6	1241118	1241123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655167
29018	NC_009523	GCCC	2	8	1241187	1241194	0 %	0 %	25 %	75 %	148655167
29019	NC_009523	TAC	2	6	1241195	1241200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655167
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29022	NC_009523	GCG	2	6	1241233	1241238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655167
29023	NC_009523	ATTG	2	8	1241248	1241255	25 %	50 %	25 %	0 %	148655167
29024	NC_009523	GAA	2	6	1241285	1241290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655167
29025	NC_009523	GC	3	6	1241297	1241302	0 %	0 %	50 %	50 %	148655167
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29032	NC_009523	GCG	2	6	1241604	1241609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29033	NC_009523	TCCC	2	8	1241668	1241675	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29034	NC_009523	GA	3	6	1241699	1241704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29035	NC_009523	TGC	2	6	1241714	1241719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29037	NC_009523	A	6	6	1241833	1241838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29038	NC_009523	CTC	2	6	1241876	1241881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655168
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29041	NC_009523	CG	4	8	1241979	1241986	0 %	0 %	50 %	50 %	148655168
29042	NC_009523	GC	3	6	1242008	1242013	0 %	0 %	50 %	50 %	148655168
29043	NC_009523	GACC	2	8	1242069	1242076	25 %	0 %	25 %	50 %	148655168
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29052	NC_009523	GTC	2	6	1242384	1242389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655168
29053	NC_009523	CTC	2	6	1242392	1242397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655168
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29058	NC_009523	GAC	2	6	1242635	1242640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655169
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29091	NC_009523	TCC	2	6	1243931	1243936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655169
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29103	NC_009523	TGC	2	6	1244370	1244375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655169
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29105	NC_009523	AGC	3	9	1244469	1244477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655169
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29113	NC_009523	GC	3	6	1244809	1244814	0 %	0 %	50 %	50 %	148655169
29114	NC_009523	TGC	2	6	1244817	1244822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655169
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29230	NC_009523	CGT	2	6	1250630	1250635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29231	NC_009523	CAA	2	6	1250641	1250646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29233	NC_009523	ATGC	2	8	1250844	1250851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29234	NC_009523	CAC	3	9	1250930	1250938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29235	NC_009523	GGA	2	6	1250941	1250946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29236	NC_009523	CCA	2	6	1250971	1250976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655172
29237	NC_009523	CGC	2	6	1251077	1251082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655172
29238	NC_009523	GGT	2	6	1251104	1251109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655172
29239	NC_009523	GCA	2	6	1251214	1251219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655172
29240	NC_009523	GCA	2	6	1251223	1251228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655172
29241	NC_009523	TCG	2	6	1251234	1251239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655172
29242	NC_009523	T	6	6	1251354	1251359	0 %	100 %	0 %	0 %	148655172
29243	NC_009523	CTG	2	6	1251402	1251407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655172
29244	NC_009523	G	7	7	1251412	1251418	0 %	0 %	100 %	0 %	148655172
29245	NC_009523	CAT	2	6	1251437	1251442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655172
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29247	NC_009523	CGG	2	6	1251450	1251455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655172
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29249	NC_009523	CCTG	2	8	1251518	1251525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29250	NC_009523	CGG	2	6	1251569	1251574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29251	NC_009523	GCT	2	6	1251575	1251580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29252	NC_009523	AGG	3	9	1251586	1251594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29254	NC_009523	C	6	6	1251662	1251667	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29255	NC_009523	ATG	2	6	1251818	1251823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29256	NC_009523	GGCA	2	8	1251920	1251927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29257	NC_009523	TGCG	2	8	1251960	1251967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29258	NC_009523	CGA	2	6	1252019	1252024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29260	NC_009523	TCG	2	6	1252176	1252181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655173
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29272	NC_009523	GCT	2	6	1252469	1252474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655173
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29338	NC_009523	CGGCG	2	10	1255657	1255666	0 %	0 %	60 %	40 %	148655174
29339	NC_009523	GC	3	6	1255669	1255674	0 %	0 %	50 %	50 %	148655174
29340	NC_009523	GCA	2	6	1255683	1255688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655174
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29344	NC_009523	AAT	2	6	1255831	1255836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29345	NC_009523	GCTT	2	8	1255938	1255945	0 %	50 %	25 %	25 %	148655175
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29350	NC_009523	CGGG	2	8	1256045	1256052	0 %	0 %	75 %	25 %	148655175
29351	NC_009523	CTG	2	6	1256067	1256072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655175
29352	NC_009523	GGC	2	6	1256076	1256081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655175
29353	NC_009523	TCC	2	6	1256098	1256103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655175
29354	NC_009523	GCC	2	6	1256105	1256110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655175
29355	NC_009523	GC	3	6	1256128	1256133	0 %	0 %	50 %	50 %	148655175
29356	NC_009523	GTT	2	6	1256148	1256153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148655175
29357	NC_009523	CGGG	2	8	1256180	1256187	0 %	0 %	75 %	25 %	148655175
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29465	NC_009523	GCGCT	2	10	1260564	1260573	0 %	20 %	40 %	40 %	148655178
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29467	NC_009523	TGC	2	6	1260628	1260633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655178
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29500	NC_009523	AGGCGG	2	12	1261897	1261908	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148655178

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