MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_009523	TCC	2	6	1201264	1201269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655131
28003	NC_009523	GA	3	6	1201280	1201285	50 %	0 %	50 %	0 %	148655131
28004	NC_009523	CA	3	6	1201309	1201314	50 %	0 %	0 %	50 %	148655131
28005	NC_009523	AGA	2	6	1201360	1201365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655131
28006	NC_009523	AGC	2	6	1201419	1201424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655131
28007	NC_009523	CAGG	2	8	1201443	1201450	25 %	0 %	50 %	25 %	148655131
28008	NC_009523	GGC	2	6	1201475	1201480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655131
28009	NC_009523	GT	3	6	1201547	1201552	0 %	50 %	50 %	0 %	148655131
28010	NC_009523	GCA	3	9	1201553	1201561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655131
28011	NC_009523	TCG	2	6	1201606	1201611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655131
28012	NC_009523	ACC	2	6	1201634	1201639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655131
28013	NC_009523	TCA	2	6	1201718	1201723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655131
28014	NC_009523	GAA	2	6	1201758	1201763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655131
28015	NC_009523	GCA	2	6	1201839	1201844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28016	NC_009523	TAT	2	6	1201851	1201856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28017	NC_009523	AAG	2	6	1201911	1201916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28018	NC_009523	AG	3	6	1201915	1201920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28019	NC_009523	TCT	2	6	1201966	1201971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28020	NC_009523	GCC	2	6	1201981	1201986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28021	NC_009523	T	6	6	1202016	1202021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28022	NC_009523	G	8	8	1202099	1202106	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28023	NC_009523	CAA	2	6	1202206	1202211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148655132
28024	NC_009523	C	6	6	1202249	1202254	0 %	0 %	0 %	100 %	148655132
28025	NC_009523	CGT	2	6	1202316	1202321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655132
28026	NC_009523	CGG	2	6	1202322	1202327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655132
28027	NC_009523	CGCC	2	8	1202328	1202335	0 %	0 %	25 %	75 %	148655132
28028	NC_009523	CTG	2	6	1202358	1202363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655132
28029	NC_009523	CCA	3	9	1202417	1202425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655132
28030	NC_009523	CG	3	6	1202551	1202556	0 %	0 %	50 %	50 %	148655132
28031	NC_009523	CGA	2	6	1202567	1202572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655132
28032	NC_009523	GCG	2	6	1202573	1202578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655132
28033	NC_009523	GTGC	2	8	1202639	1202646	0 %	25 %	50 %	25 %	148655132
28034	NC_009523	CCCA	2	8	1202665	1202672	25 %	0 %	0 %	75 %	148655132
28035	NC_009523	GCA	2	6	1202699	1202704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655132
28036	NC_009523	ATG	2	6	1202758	1202763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655132
28037	NC_009523	CTG	2	6	1202772	1202777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655132
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28039	NC_009523	CCT	2	6	1202837	1202842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655132
28040	NC_009523	GC	3	6	1202855	1202860	0 %	0 %	50 %	50 %	148655132
28041	NC_009523	GCA	2	6	1202873	1202878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655132
28042	NC_009523	GGTT	2	8	1202908	1202915	0 %	50 %	50 %	0 %	148655132
28043	NC_009523	GGCAG	2	10	1202941	1202950	20 %	0 %	60 %	20 %	148655132
28044	NC_009523	GCA	2	6	1202975	1202980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655132
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28047	NC_009523	CCG	2	6	1203031	1203036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655132
28048	NC_009523	GC	3	6	1203044	1203049	0 %	0 %	50 %	50 %	148655132
28049	NC_009523	ACC	2	6	1203091	1203096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655132
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28051	NC_009523	CGG	2	6	1203122	1203127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655132
28052	NC_009523	GCG	2	6	1203148	1203153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655132
28053	NC_009523	GGC	2	6	1203183	1203188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655132
28054	NC_009523	GCG	2	6	1203282	1203287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655132
28055	NC_009523	CTG	3	9	1203324	1203332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655132
28056	NC_009523	TCC	2	6	1203367	1203372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28057	NC_009523	CTGC	2	8	1203450	1203457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28058	NC_009523	C	8	8	1203462	1203469	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28059	NC_009523	G	6	6	1203498	1203503	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28060	NC_009523	TC	3	6	1203544	1203549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28061	NC_009523	CTG	2	6	1203645	1203650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28062	NC_009523	GC	4	8	1203719	1203726	0 %	0 %	50 %	50 %	148655133
28063	NC_009523	ACG	2	6	1203728	1203733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655133
28064	NC_009523	GC	3	6	1203740	1203745	0 %	0 %	50 %	50 %	148655133
28065	NC_009523	TCG	2	6	1203810	1203815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655133
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28078	NC_009523	CTA	2	6	1204447	1204452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655133
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28087	NC_009523	CG	3	6	1204895	1204900	0 %	0 %	50 %	50 %	148655134
28088	NC_009523	CGG	3	9	1204936	1204944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655134
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28101	NC_009523	CGTG	2	8	1205426	1205433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28102	NC_009523	CAG	2	6	1205444	1205449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655135
28103	NC_009523	GTCG	2	8	1205450	1205457	0 %	25 %	50 %	25 %	148655135
28104	NC_009523	CCG	2	6	1205532	1205537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655135
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28106	NC_009523	CGG	3	9	1205599	1205607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655135
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28108	NC_009523	CGT	2	6	1205699	1205704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655135
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28112	NC_009523	CA	3	6	1205819	1205824	50 %	0 %	0 %	50 %	148655135
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28119	NC_009523	GAT	2	6	1206212	1206217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655136
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28236	NC_009523	TTG	2	6	1210353	1210358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148655142
28237	NC_009523	GTA	2	6	1210361	1210366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655142
28238	NC_009523	GCC	2	6	1210436	1210441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655142
28239	NC_009523	GCT	2	6	1210444	1210449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655142
28240	NC_009523	AGA	2	6	1210516	1210521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655142
28241	NC_009523	GAA	2	6	1210538	1210543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655142
28242	NC_009523	CGG	2	6	1210571	1210576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655142
28243	NC_009523	TGCC	2	8	1210594	1210601	0 %	25 %	25 %	50 %	148655142
28244	NC_009523	CCA	2	6	1210654	1210659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655142
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28246	NC_009523	TGCC	2	8	1210750	1210757	0 %	25 %	25 %	50 %	148655142
28247	NC_009523	GTGA	2	8	1210782	1210789	25 %	25 %	50 %	0 %	148655142
28248	NC_009523	GCC	2	6	1210805	1210810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655142
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28255	NC_009523	CG	3	6	1211130	1211135	0 %	0 %	50 %	50 %	148655143
28256	NC_009523	CGC	2	6	1211217	1211222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655143
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28262	NC_009523	GT	3	6	1211376	1211381	0 %	50 %	50 %	0 %	148655143
28263	NC_009523	TTCCT	2	10	1211451	1211460	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28264	NC_009523	CGA	2	6	1211462	1211467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28265	NC_009523	GGAA	2	8	1211502	1211509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28266	NC_009523	CCG	2	6	1211511	1211516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28267	NC_009523	GCT	2	6	1211529	1211534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28268	NC_009523	GTG	3	9	1211540	1211548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28269	NC_009523	GACG	2	8	1211558	1211565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28270	NC_009523	GAC	2	6	1211617	1211622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28271	NC_009523	TG	3	6	1211656	1211661	0 %	50 %	50 %	0 %	148655144
28272	NC_009523	GGA	2	6	1211665	1211670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148655144
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28275	NC_009523	GGGA	2	8	1211792	1211799	25 %	0 %	75 %	0 %	148655144
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28313	NC_009523	GC	3	6	1213671	1213676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28314	NC_009523	ATTT	2	8	1213737	1213744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28315	NC_009523	CCGTCA	2	12	1213767	1213778	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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28318	NC_009523	CAGCA	2	10	1213878	1213887	40 %	0 %	20 %	40 %	148655145
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28332	NC_009523	TGC	2	6	1214442	1214447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655145
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28336	NC_009523	GC	3	6	1214548	1214553	0 %	0 %	50 %	50 %	148655145
28337	NC_009523	CGGT	2	8	1214616	1214623	0 %	25 %	50 %	25 %	148655145
28338	NC_009523	CGG	2	6	1214645	1214650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655145
28339	NC_009523	GTC	2	6	1214654	1214659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655145
28340	NC_009523	CG	4	8	1214678	1214685	0 %	0 %	50 %	50 %	148655145
28341	NC_009523	GGAC	2	8	1214727	1214734	25 %	0 %	50 %	25 %	148655145
28342	NC_009523	GC	3	6	1214737	1214742	0 %	0 %	50 %	50 %	148655145
28343	NC_009523	CGG	2	6	1214743	1214748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655145
28344	NC_009523	CAC	2	6	1214766	1214771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655145
28345	NC_009523	CGC	3	9	1214782	1214790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655145
28346	NC_009523	CGC	2	6	1214802	1214807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655145
28347	NC_009523	CCA	2	6	1214827	1214832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655145
28348	NC_009523	TGA	2	6	1214932	1214937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655145
28349	NC_009523	GCGCT	2	10	1215030	1215039	0 %	20 %	40 %	40 %	148655145
28350	NC_009523	GC	3	6	1215054	1215059	0 %	0 %	50 %	50 %	148655145
28351	NC_009523	AAGG	2	8	1215071	1215078	50 %	0 %	50 %	0 %	148655145
28352	NC_009523	ACC	2	6	1215133	1215138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655145
28353	NC_009523	AAG	2	6	1215267	1215272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148655145
28354	NC_009523	GTA	2	6	1215299	1215304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655145
28355	NC_009523	GCC	2	6	1215326	1215331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655145
28356	NC_009523	CGCCT	2	10	1215335	1215344	0 %	20 %	20 %	60 %	148655145
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28359	NC_009523	GC	3	6	1215479	1215484	0 %	0 %	50 %	50 %	148655145
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28361	NC_009523	GGTC	2	8	1215532	1215539	0 %	25 %	50 %	25 %	148655145
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28365	NC_009523	GCA	2	6	1215775	1215780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655145
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28374	NC_009523	GTCGG	2	10	1215992	1216001	0 %	20 %	60 %	20 %	148655145
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28388	NC_009523	GC	3	6	1216869	1216874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28389	NC_009523	G	6	6	1216940	1216945	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28390	NC_009523	TCG	2	6	1216999	1217004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28395	NC_009523	CGG	2	6	1217187	1217192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655146
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28470	NC_009523	GC	3	6	1220197	1220202	0 %	0 %	50 %	50 %	148655148
28471	NC_009523	CCA	2	6	1220219	1220224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655148
28472	NC_009523	GCA	2	6	1220225	1220230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655148
28473	NC_009523	CGC	2	6	1220244	1220249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655148
28474	NC_009523	GTT	2	6	1220305	1220310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148655149
28475	NC_009523	GATG	2	8	1220314	1220321	25 %	25 %	50 %	0 %	148655149
28476	NC_009523	AG	3	6	1220332	1220337	50 %	0 %	50 %	0 %	148655149
28477	NC_009523	GGAT	2	8	1220361	1220368	25 %	25 %	50 %	0 %	148655149
28478	NC_009523	CGA	2	6	1220372	1220377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655149
28479	NC_009523	TGC	2	6	1220382	1220387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655149
28480	NC_009523	TCG	2	6	1220403	1220408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655149
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28482	NC_009523	TCG	2	6	1220445	1220450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655149
28483	NC_009523	TGGT	2	8	1220466	1220473	0 %	50 %	50 %	0 %	148655149
28484	NC_009523	CGT	2	6	1220476	1220481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655149
28485	NC_009523	GCG	2	6	1220485	1220490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655149
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28487	NC_009523	CGG	2	6	1220581	1220586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655149
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28491	NC_009523	GGCC	2	8	1220736	1220743	0 %	0 %	50 %	50 %	148655150
28492	NC_009523	TCG	2	6	1220751	1220756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655150
28493	NC_009523	GT	3	6	1220791	1220796	0 %	50 %	50 %	0 %	148655150
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28497	NC_009523	CG	3	6	1220927	1220932	0 %	0 %	50 %	50 %	148655150
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28499	NC_009523	TG	3	6	1221075	1221080	0 %	50 %	50 %	0 %	148655150
28500	NC_009523	AC	3	6	1221107	1221112	50 %	0 %	0 %	50 %	148655151

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