MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_009523	GC	3	6	1067974	1067979	0 %	0 %	50 %	50 %	148655014
25003	NC_009523	GAT	2	6	1068002	1068007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655014
25004	NC_009523	ACCA	2	8	1068074	1068081	50 %	0 %	0 %	50 %	148655014
25005	NC_009523	GC	3	6	1068085	1068090	0 %	0 %	50 %	50 %	148655014
25006	NC_009523	GCG	2	6	1068165	1068170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655014
25007	NC_009523	TAA	2	6	1068184	1068189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148655014
25008	NC_009523	CGC	2	6	1068253	1068258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655014
25009	NC_009523	GCA	2	6	1068389	1068394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655014
25010	NC_009523	TGC	2	6	1068396	1068401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655014
25011	NC_009523	GC	3	6	1068422	1068427	0 %	0 %	50 %	50 %	148655014
25012	NC_009523	CAG	2	6	1068485	1068490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655014
25013	NC_009523	CGC	2	6	1068514	1068519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655014
25014	NC_009523	TGA	2	6	1068577	1068582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655014
25015	NC_009523	CAA	2	6	1068607	1068612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148655014
25016	NC_009523	GCC	2	6	1068619	1068624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655014
25017	NC_009523	CTG	3	9	1068635	1068643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655014
25018	NC_009523	GCG	2	6	1068685	1068690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655014
25019	NC_009523	CTT	2	6	1068703	1068708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148655014
25020	NC_009523	CAC	2	6	1068709	1068714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655014
25021	NC_009523	CGGG	2	8	1068724	1068731	0 %	0 %	75 %	25 %	148655014
25022	NC_009523	CCA	2	6	1068769	1068774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655014
25023	NC_009523	AAC	2	6	1068811	1068816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148655014
25024	NC_009523	CCG	2	6	1068833	1068838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655014
25025	NC_009523	CCT	2	6	1068887	1068892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148655014
25026	NC_009523	GTC	2	6	1068914	1068919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655014
25027	NC_009523	TGCG	2	8	1069042	1069049	0 %	25 %	50 %	25 %	148655014
25028	NC_009523	ACC	2	6	1069088	1069093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655014
25029	NC_009523	GC	4	8	1069105	1069112	0 %	0 %	50 %	50 %	148655014
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25031	NC_009523	TGC	2	6	1069378	1069383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655015
25032	NC_009523	TCA	2	6	1069462	1069467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655015
25033	NC_009523	GAT	2	6	1069500	1069505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655015
25034	NC_009523	CAG	2	6	1069530	1069535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655015
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25038	NC_009523	GCCGC	2	10	1069732	1069741	0 %	0 %	40 %	60 %	148655015
25039	NC_009523	CG	3	6	1069803	1069808	0 %	0 %	50 %	50 %	148655015
25040	NC_009523	CG	3	6	1069830	1069835	0 %	0 %	50 %	50 %	148655015
25041	NC_009523	CAGC	2	8	1069871	1069878	25 %	0 %	25 %	50 %	148655015
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25043	NC_009523	CGATC	2	10	1070018	1070027	20 %	20 %	20 %	40 %	148655015
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25052	NC_009523	CTG	2	6	1070363	1070368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655015
25053	NC_009523	GCGTT	2	10	1070402	1070411	0 %	40 %	40 %	20 %	148655015
25054	NC_009523	CGT	2	6	1070424	1070429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655015
25055	NC_009523	TCG	3	9	1070474	1070482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655015
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25058	NC_009523	TCT	2	6	1070604	1070609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25059	NC_009523	ATG	2	6	1070610	1070615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25061	NC_009523	CCAC	2	8	1070660	1070667	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25062	NC_009523	ATG	2	6	1070669	1070674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25088	NC_009523	GT	3	6	1071976	1071981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25089	NC_009523	GTG	2	6	1072044	1072049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25090	NC_009523	AACCGT	2	12	1072055	1072066	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25091	NC_009523	TTC	2	6	1072081	1072086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25102	NC_009523	TGA	2	6	1072579	1072584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655017
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25117	NC_009523	GCG	2	6	1073163	1073168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655018
25118	NC_009523	CGGA	2	8	1073231	1073238	25 %	0 %	50 %	25 %	148655018
25119	NC_009523	ACC	2	6	1073421	1073426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148655018
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25133	NC_009523	GAG	2	6	1074133	1074138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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25231	NC_009523	TCAT	2	8	1078549	1078556	25 %	50 %	0 %	25 %	148655021
25232	NC_009523	CA	3	6	1078587	1078592	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25233	NC_009523	ACA	2	6	1078641	1078646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25234	NC_009523	GT	3	6	1078694	1078699	0 %	50 %	50 %	0 %	148655022
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25353	NC_009523	AGAT	2	8	1083833	1083840	50 %	25 %	25 %	0 %	148655025
25354	NC_009523	GCT	2	6	1083884	1083889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655025
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25472	NC_009523	CCG	2	6	1088662	1088667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655030
25473	NC_009523	GTC	2	6	1088723	1088728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655030
25474	NC_009523	TTGC	2	8	1088764	1088771	0 %	50 %	25 %	25 %	148655030
25475	NC_009523	TCA	2	6	1088813	1088818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655030
25476	NC_009523	CCGC	2	8	1088823	1088830	0 %	0 %	25 %	75 %	148655030
25477	NC_009523	TGC	2	6	1088862	1088867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655030
25478	NC_009523	CAGT	2	8	1088871	1088878	25 %	25 %	25 %	25 %	148655030
25479	NC_009523	CGC	2	6	1088895	1088900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655030
25480	NC_009523	GC	3	6	1088944	1088949	0 %	0 %	50 %	50 %	148655030
25481	NC_009523	GA	3	6	1088960	1088965	50 %	0 %	50 %	0 %	148655030
25482	NC_009523	GACG	2	8	1089001	1089008	25 %	0 %	50 %	25 %	148655030
25483	NC_009523	GAT	2	6	1089021	1089026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655030
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25486	NC_009523	GCT	2	6	1089136	1089141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655030
25487	NC_009523	GCA	2	6	1089177	1089182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655030
25488	NC_009523	GAC	2	6	1089233	1089238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655031
25489	NC_009523	TGA	2	6	1089254	1089259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655031
25490	NC_009523	AGT	2	6	1089319	1089324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148655031
25491	NC_009523	CCG	2	6	1089332	1089337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655031
25492	NC_009523	GTT	2	6	1089339	1089344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148655031
25493	NC_009523	CCG	2	6	1089380	1089385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148655031
25494	NC_009523	TGG	2	6	1089410	1089415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148655031
25495	NC_009523	GC	3	6	1089467	1089472	0 %	0 %	50 %	50 %	148655031
25496	NC_009523	CAT	2	6	1089594	1089599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148655031
25497	NC_009523	CGA	2	6	1089606	1089611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655031
25498	NC_009523	GCG	2	6	1089665	1089670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148655031
25499	NC_009523	CTG	2	6	1089679	1089684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148655031
25500	NC_009523	CGA	2	6	1089708	1089713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148655031

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