MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19005	NC_009523	TCG	2	6	807844	807849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654817
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19012	NC_009523	T	7	7	808145	808151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19015	NC_009523	CGC	2	6	808250	808255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19017	NC_009523	GGT	2	6	808276	808281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19052	NC_009523	A	7	7	809611	809617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19125	NC_009523	GCC	2	6	812099	812104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654821
19126	NC_009523	GCC	2	6	812108	812113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654821
19127	NC_009523	GC	3	6	812114	812119	0 %	0 %	50 %	50 %	148654821
19128	NC_009523	CGC	2	6	812131	812136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654821
19129	NC_009523	GC	3	6	812135	812140	0 %	0 %	50 %	50 %	148654821
19130	NC_009523	CAC	2	6	812152	812157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654821
19131	NC_009523	TGACGA	2	12	812177	812188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148654821
19132	NC_009523	AGA	2	6	812189	812194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654821
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19134	NC_009523	CTG	2	6	812232	812237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654821
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19153	NC_009523	CGG	2	6	813015	813020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654822
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19158	NC_009523	CGA	2	6	813091	813096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654822
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19163	NC_009523	CTG	2	6	813173	813178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654822
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19165	NC_009523	GC	3	6	813192	813197	0 %	0 %	50 %	50 %	148654822
19166	NC_009523	TCG	2	6	813212	813217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654822
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19181	NC_009523	CGT	2	6	813655	813660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654822
19182	NC_009523	GCT	2	6	813662	813667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654822
19183	NC_009523	TCCC	2	8	813733	813740	0 %	25 %	0 %	75 %	148654822
19184	NC_009523	CCGCCA	2	12	813770	813781	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148654822
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19188	NC_009523	GACCA	2	10	813912	813921	40 %	0 %	20 %	40 %	148654822
19189	NC_009523	GCCA	2	8	813954	813961	25 %	0 %	25 %	50 %	148654822
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19192	NC_009523	AAT	2	6	814514	814519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19193	NC_009523	GAA	2	6	814577	814582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19194	NC_009523	GCA	2	6	814792	814797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19196	NC_009523	AATG	2	8	814826	814833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19197	NC_009523	CG	3	6	814834	814839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19198	NC_009523	GCTG	2	8	814968	814975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19199	NC_009523	CTG	2	6	814985	814990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
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19232	NC_009523	CTG	2	6	816206	816211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19233	NC_009523	CGG	2	6	816226	816231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654823
19234	NC_009523	GC	4	8	816295	816302	0 %	0 %	50 %	50 %	148654823
19235	NC_009523	GTC	2	6	816311	816316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19236	NC_009523	CGAT	2	8	816465	816472	25 %	25 %	25 %	25 %	148654823
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19240	NC_009523	TAC	3	9	816683	816691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654823
19241	NC_009523	GGA	2	6	816787	816792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654823
19242	NC_009523	CG	3	6	816852	816857	0 %	0 %	50 %	50 %	148654823
19243	NC_009523	GGC	2	6	816881	816886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654823
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19247	NC_009523	GCT	2	6	817090	817095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
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19249	NC_009523	GCT	2	6	817180	817185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
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19363	NC_009523	TGC	2	6	821310	821315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19364	NC_009523	TGC	2	6	821347	821352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19365	NC_009523	GCT	2	6	821440	821445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19366	NC_009523	GAC	2	6	821485	821490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19367	NC_009523	ATC	2	6	821525	821530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654823
19368	NC_009523	CGG	2	6	821551	821556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654823
19369	NC_009523	ACG	2	6	821624	821629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19370	NC_009523	CTG	2	6	821633	821638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19371	NC_009523	CGT	2	6	821640	821645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19372	NC_009523	GCG	2	6	821662	821667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654823
19373	NC_009523	TGCTG	2	10	821695	821704	0 %	40 %	40 %	20 %	148654823
19374	NC_009523	CGGTA	2	10	821743	821752	20 %	20 %	40 %	20 %	148654823
19375	NC_009523	CCG	2	6	821867	821872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654823
19376	NC_009523	ACG	2	6	821873	821878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19377	NC_009523	TGC	2	6	821883	821888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19378	NC_009523	CTACGA	2	12	821890	821901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148654823
19379	NC_009523	GAACA	2	10	821918	821927	60 %	0 %	20 %	20 %	148654823
19380	NC_009523	CGAC	2	8	822102	822109	25 %	0 %	25 %	50 %	148654823
19381	NC_009523	TC	3	6	822130	822135	0 %	50 %	0 %	50 %	148654823
19382	NC_009523	GTATGT	2	12	822151	822162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148654823
19383	NC_009523	GTT	2	6	822199	822204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654823
19384	NC_009523	CAG	2	6	822212	822217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19385	NC_009523	CCG	2	6	822308	822313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654823
19386	NC_009523	CGAC	2	8	822316	822323	25 %	0 %	25 %	50 %	148654823
19387	NC_009523	CGGCGC	2	12	822324	822335	0 %	0 %	50 %	50 %	148654823
19388	NC_009523	AGA	2	6	822358	822363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654823
19389	NC_009523	GCC	2	6	822400	822405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654823
19390	NC_009523	CCG	2	6	822426	822431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654823
19391	NC_009523	GCA	2	6	822451	822456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19392	NC_009523	GC	4	8	822557	822564	0 %	0 %	50 %	50 %	148654823
19393	NC_009523	CAT	2	6	822587	822592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654823
19394	NC_009523	CGA	2	6	822628	822633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19395	NC_009523	CGC	2	6	822652	822657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654823
19396	NC_009523	ACA	2	6	822687	822692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654823
19397	NC_009523	TTG	2	6	822707	822712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654823
19398	NC_009523	GAC	2	6	822720	822725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19399	NC_009523	GATC	2	8	822763	822770	25 %	25 %	25 %	25 %	148654823
19400	NC_009523	CGA	2	6	822823	822828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654823
19401	NC_009523	CG	3	6	822851	822856	0 %	0 %	50 %	50 %	148654823
19402	NC_009523	GC	3	6	822896	822901	0 %	0 %	50 %	50 %	148654823
19403	NC_009523	GCT	2	6	822935	822940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19404	NC_009523	AGC	2	6	823179	823184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19405	NC_009523	GC	3	6	823216	823221	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19406	NC_009523	CTG	3	9	823276	823284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19407	NC_009523	TGGC	2	8	823300	823307	0 %	25 %	50 %	25 %	148654824
19408	NC_009523	CAC	2	6	823337	823342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654824
19409	NC_009523	GGC	2	6	823350	823355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19410	NC_009523	G	6	6	823356	823361	0 %	0 %	100 %	0 %	148654824
19411	NC_009523	CGG	2	6	823374	823379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19412	NC_009523	GTT	2	6	823422	823427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654824
19413	NC_009523	TGC	2	6	823505	823510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19414	NC_009523	GC	4	8	823509	823516	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19415	NC_009523	TCG	2	6	823529	823534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19416	NC_009523	TTC	2	6	823576	823581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654824
19417	NC_009523	ATT	2	6	823646	823651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654824
19418	NC_009523	ACT	2	6	823652	823657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654824
19419	NC_009523	GGC	2	6	823674	823679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19420	NC_009523	GGCA	2	8	823764	823771	25 %	0 %	50 %	25 %	148654824
19421	NC_009523	GGC	2	6	823785	823790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19422	NC_009523	GCT	2	6	823885	823890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19423	NC_009523	TGC	2	6	823898	823903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19424	NC_009523	CCGGCG	2	12	823906	823917	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19425	NC_009523	CGG	2	6	823932	823937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19426	NC_009523	GCC	2	6	823948	823953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654824
19427	NC_009523	CGC	2	6	824021	824026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654824
19428	NC_009523	AGC	2	6	824034	824039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19429	NC_009523	AAC	2	6	824075	824080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654824
19430	NC_009523	GCG	2	6	824109	824114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19431	NC_009523	CGCTG	2	10	824139	824148	0 %	20 %	40 %	40 %	148654824
19432	NC_009523	TGC	2	6	824165	824170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19433	NC_009523	ATC	2	6	824200	824205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654824
19434	NC_009523	TGA	2	6	824211	824216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654824
19435	NC_009523	GCG	2	6	824251	824256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19436	NC_009523	GC	3	6	824305	824310	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19437	NC_009523	TGG	3	9	824377	824385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654824
19438	NC_009523	CG	3	6	824390	824395	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19439	NC_009523	CAG	2	6	824434	824439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19440	NC_009523	CTT	2	6	824478	824483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654824
19441	NC_009523	GCTGGC	3	18	824538	824555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654824
19442	NC_009523	GC	3	6	824569	824574	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19443	NC_009523	CTG	2	6	824677	824682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19444	NC_009523	CA	3	6	824715	824720	50 %	0 %	0 %	50 %	148654824
19445	NC_009523	GCA	2	6	824743	824748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19446	NC_009523	TCA	2	6	824765	824770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654824
19447	NC_009523	GCT	2	6	824811	824816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19448	NC_009523	CAT	2	6	824817	824822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654824
19449	NC_009523	CTG	2	6	824836	824841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19450	NC_009523	CTG	2	6	824854	824859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19451	NC_009523	GGCG	2	8	824878	824885	0 %	0 %	75 %	25 %	148654824
19452	NC_009523	CG	3	6	824884	824889	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19453	NC_009523	GACAG	2	10	824947	824956	40 %	0 %	40 %	20 %	148654824
19454	NC_009523	ATC	2	6	824974	824979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654824
19455	NC_009523	CGC	2	6	824996	825001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654824
19456	NC_009523	GC	3	6	825025	825030	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19457	NC_009523	GTG	2	6	825073	825078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654824
19458	NC_009523	GGC	2	6	825102	825107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19459	NC_009523	GCT	2	6	825108	825113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19460	NC_009523	GGC	2	6	825126	825131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19461	NC_009523	CGG	2	6	825164	825169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19462	NC_009523	GGT	2	6	825225	825230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654824
19463	NC_009523	CTA	2	6	825279	825284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654824
19464	NC_009523	GGA	2	6	825313	825318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654824
19465	NC_009523	GCC	2	6	825322	825327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654824
19466	NC_009523	TGG	2	6	825392	825397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654824
19467	NC_009523	AGGC	2	8	825474	825481	25 %	0 %	50 %	25 %	148654824
19468	NC_009523	CCG	2	6	825608	825613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654824
19469	NC_009523	CGG	2	6	825624	825629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19470	NC_009523	GATGG	2	10	825660	825669	20 %	20 %	60 %	0 %	148654824
19471	NC_009523	CAG	2	6	825682	825687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654824
19472	NC_009523	GCG	3	9	825692	825700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19473	NC_009523	TTGC	2	8	825709	825716	0 %	50 %	25 %	25 %	148654824
19474	NC_009523	CG	3	6	825728	825733	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19475	NC_009523	CCG	2	6	825734	825739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654824
19476	NC_009523	GC	4	8	825778	825785	0 %	0 %	50 %	50 %	148654824
19477	NC_009523	CGG	2	6	825848	825853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654824
19478	NC_009523	GCA	2	6	825995	826000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654825
19479	NC_009523	CGG	2	6	826109	826114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654825
19480	NC_009523	CGGT	2	8	826169	826176	0 %	25 %	50 %	25 %	148654825
19481	NC_009523	CGAGCA	2	12	826181	826192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654825
19482	NC_009523	CCTCGC	2	12	826193	826204	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148654825
19483	NC_009523	GCCC	2	8	826241	826248	0 %	0 %	25 %	75 %	148654825
19484	NC_009523	CGG	2	6	826298	826303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654825
19485	NC_009523	GTC	2	6	826320	826325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654825
19486	NC_009523	GCC	2	6	826329	826334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654825
19487	NC_009523	GCC	2	6	826342	826347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654825
19488	NC_009523	TCG	2	6	826366	826371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654825
19489	NC_009523	CGAT	2	8	826375	826382	25 %	25 %	25 %	25 %	148654825
19490	NC_009523	CG	3	6	826403	826408	0 %	0 %	50 %	50 %	148654825
19491	NC_009523	CGA	2	6	826453	826458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654825
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