MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009523	GAT	2	6	683189	683194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654712
16002	NC_009523	GCA	2	6	683307	683312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654712
16003	NC_009523	GAG	2	6	683342	683347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654713
16004	NC_009523	GGT	2	6	683365	683370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654713
16005	NC_009523	ACG	2	6	683391	683396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654713
16006	NC_009523	CAG	2	6	683408	683413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654713
16007	NC_009523	GC	3	6	683418	683423	0 %	0 %	50 %	50 %	148654713
16008	NC_009523	GCC	3	9	683431	683439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654713
16009	NC_009523	CGT	2	6	683441	683446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654713
16010	NC_009523	GCG	2	6	683487	683492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654713
16011	NC_009523	GC	4	8	683507	683514	0 %	0 %	50 %	50 %	148654713
16012	NC_009523	TGGCGC	2	12	683550	683561	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654713
16013	NC_009523	AGG	2	6	683562	683567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654713
16014	NC_009523	CTG	2	6	683579	683584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654713
16015	NC_009523	GGC	2	6	683594	683599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654713
16016	NC_009523	CG	3	6	683730	683735	0 %	0 %	50 %	50 %	148654713
16017	NC_009523	GCA	2	6	683736	683741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654713
16018	NC_009523	GC	3	6	683774	683779	0 %	0 %	50 %	50 %	148654713
16019	NC_009523	GC	3	6	683834	683839	0 %	0 %	50 %	50 %	148654713
16020	NC_009523	CTC	2	6	683855	683860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654713
16021	NC_009523	CAT	2	6	683884	683889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654713
16022	NC_009523	TTTC	2	8	683947	683954	0 %	75 %	0 %	25 %	148654713
16023	NC_009523	CTC	2	6	683957	683962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654713
16024	NC_009523	AAG	2	6	683999	684004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654713
16025	NC_009523	GCT	2	6	684028	684033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654713
16026	NC_009523	CG	4	8	684063	684070	0 %	0 %	50 %	50 %	148654713
16027	NC_009523	GGC	2	6	684073	684078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654713
16028	NC_009523	AC	3	6	684090	684095	50 %	0 %	0 %	50 %	148654713
16029	NC_009523	CG	3	6	684138	684143	0 %	0 %	50 %	50 %	148654713
16030	NC_009523	GA	3	6	684192	684197	50 %	0 %	50 %	0 %	148654713
16031	NC_009523	CGA	2	6	684211	684216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654713
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16033	NC_009523	GC	3	6	684260	684265	0 %	0 %	50 %	50 %	148654713
16034	NC_009523	CTT	2	6	684307	684312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654713
16035	NC_009523	GTC	2	6	684359	684364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654713
16036	NC_009523	GAC	2	6	684382	684387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654713
16037	NC_009523	GGA	2	6	684433	684438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654713
16038	NC_009523	CTG	2	6	684465	684470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_009523	AGA	2	6	684547	684552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_009523	AAC	2	6	684700	684705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_009523	ACCA	2	8	684826	684833	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16042	NC_009523	GAG	2	6	684884	684889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_009523	GATG	2	8	684901	684908	25 %	25 %	50 %	0 %	148654714
16044	NC_009523	A	6	6	684917	684922	100 %	0 %	0 %	0 %	148654714
16045	NC_009523	GGT	2	6	685003	685008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654714
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16047	NC_009523	CCT	2	6	685042	685047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654714
16048	NC_009523	GGT	2	6	685171	685176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654714
16049	NC_009523	GGAAGC	2	12	685177	685188	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148654714
16050	NC_009523	ATC	2	6	685332	685337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654715
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16052	NC_009523	CTT	2	6	685494	685499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654715
16053	NC_009523	AG	3	6	685589	685594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_009523	CAAA	2	8	685690	685697	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16055	NC_009523	TGC	2	6	685710	685715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_009523	GGCA	2	8	685740	685747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16057	NC_009523	GCA	2	6	685867	685872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654716
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16060	NC_009523	CCG	2	6	685991	685996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654716
16061	NC_009523	GCA	2	6	686055	686060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654716
16062	NC_009523	GGC	2	6	686315	686320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654716
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16064	NC_009523	GAC	2	6	686340	686345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654716
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16067	NC_009523	GAG	2	6	686664	686669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654717
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16069	NC_009523	AGA	2	6	686741	686746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654717
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16073	NC_009523	TCT	3	9	686859	686867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654717
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16075	NC_009523	GCG	2	6	686943	686948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654717
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16081	NC_009523	TGA	2	6	687254	687259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654718
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16086	NC_009523	GCCT	2	8	687357	687364	0 %	25 %	25 %	50 %	148654718
16087	NC_009523	GTC	2	6	687372	687377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654718
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16089	NC_009523	CGC	4	12	687423	687434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654718
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16095	NC_009523	CGC	4	12	687564	687575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654718
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16099	NC_009523	TTTC	2	8	687687	687694	0 %	75 %	0 %	25 %	148654718
16100	NC_009523	TG	3	6	687703	687708	0 %	50 %	50 %	0 %	148654718
16101	NC_009523	GGC	2	6	687892	687897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654719
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16107	NC_009523	GTCG	2	8	688198	688205	0 %	25 %	50 %	25 %	148654720
16108	NC_009523	TCG	2	6	688287	688292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654720
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16121	NC_009523	GCTG	2	8	688972	688979	0 %	25 %	50 %	25 %	148654722
16122	NC_009523	GCT	2	6	689009	689014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16123	NC_009523	TGC	2	6	689048	689053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16124	NC_009523	GAT	2	6	689097	689102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654722
16125	NC_009523	TTG	2	6	689116	689121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654722
16126	NC_009523	CA	3	6	689142	689147	50 %	0 %	0 %	50 %	148654722
16127	NC_009523	CGT	2	6	689166	689171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16128	NC_009523	CT	3	6	689191	689196	0 %	50 %	0 %	50 %	148654722
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16130	NC_009523	GCTG	2	8	689227	689234	0 %	25 %	50 %	25 %	148654722
16131	NC_009523	GTG	2	6	689265	689270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654722
16132	NC_009523	ACC	2	6	689280	689285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654722
16133	NC_009523	TGC	2	6	689291	689296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16134	NC_009523	GT	3	6	689320	689325	0 %	50 %	50 %	0 %	148654722
16135	NC_009523	CGGTC	2	10	689330	689339	0 %	20 %	40 %	40 %	148654722
16136	NC_009523	GCT	2	6	689357	689362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
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16138	NC_009523	GCT	2	6	689399	689404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16139	NC_009523	TGC	2	6	689455	689460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16140	NC_009523	GCT	2	6	689483	689488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16141	NC_009523	GC	4	8	689508	689515	0 %	0 %	50 %	50 %	148654722
16142	NC_009523	GC	4	8	689540	689547	0 %	0 %	50 %	50 %	148654722
16143	NC_009523	GAT	2	6	689576	689581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654722
16144	NC_009523	GTC	2	6	689635	689640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16145	NC_009523	CTG	2	6	689661	689666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16146	NC_009523	GC	3	6	689686	689691	0 %	0 %	50 %	50 %	148654722
16147	NC_009523	CAGGT	2	10	689740	689749	20 %	20 %	40 %	20 %	148654722
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16149	NC_009523	TGC	2	6	689803	689808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654722
16150	NC_009523	CCG	2	6	689822	689827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654722
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16152	NC_009523	GCC	2	6	689858	689863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654722
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16154	NC_009523	GGC	2	6	689893	689898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654722
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16176	NC_009523	GCGAG	2	10	690600	690609	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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16178	NC_009523	CGAGG	2	10	690688	690697	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16179	NC_009523	GC	3	6	690823	690828	0 %	0 %	50 %	50 %	148654723
16180	NC_009523	GTC	2	6	690862	690867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654723
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16184	NC_009523	GCG	2	6	690990	690995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16185	NC_009523	AC	3	6	691019	691024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16186	NC_009523	TCG	2	6	691049	691054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16187	NC_009523	CGTT	3	12	691101	691112	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16188	NC_009523	TGCC	2	8	691345	691352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16189	NC_009523	ATGT	2	8	691356	691363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16190	NC_009523	AGGG	2	8	691384	691391	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16191	NC_009523	TTGG	2	8	691464	691471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16192	NC_009523	GT	3	6	691534	691539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16193	NC_009523	GAA	2	6	691596	691601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654724
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16197	NC_009523	GCG	2	6	691715	691720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654724
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16204	NC_009523	CTG	2	6	692043	692048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654724
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16211	NC_009523	GGC	2	6	692277	692282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16212	NC_009523	GTT	2	6	692330	692335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16213	NC_009523	CTG	2	6	692345	692350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16214	NC_009523	AAGG	2	8	692351	692358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16215	NC_009523	GC	4	8	692423	692430	0 %	0 %	50 %	50 %	148654725
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16222	NC_009523	TCAC	2	8	692776	692783	25 %	25 %	0 %	50 %	148654725
16223	NC_009523	GCCA	2	8	692802	692809	25 %	0 %	25 %	50 %	148654725
16224	NC_009523	CCT	2	6	692853	692858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654725
16225	NC_009523	GCT	2	6	692880	692885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654725
16226	NC_009523	GCGG	2	8	692907	692914	0 %	0 %	75 %	25 %	148654725
16227	NC_009523	CCT	2	6	692955	692960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654725
16228	NC_009523	CG	3	6	692994	692999	0 %	0 %	50 %	50 %	148654725
16229	NC_009523	CGG	2	6	693063	693068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654725
16230	NC_009523	CCG	2	6	693086	693091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654725
16231	NC_009523	CGG	2	6	693174	693179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654725
16232	NC_009523	CCT	2	6	693222	693227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654725
16233	NC_009523	AC	3	6	693281	693286	50 %	0 %	0 %	50 %	148654725
16234	NC_009523	TCG	2	6	693295	693300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654725
16235	NC_009523	TGC	2	6	693301	693306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654725
16236	NC_009523	TGA	2	6	693318	693323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654725
16237	NC_009523	TA	3	6	693440	693445	50 %	50 %	0 %	0 %	148654725
16238	NC_009523	TGG	2	6	693468	693473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654725
16239	NC_009523	CGT	2	6	693522	693527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654725
16240	NC_009523	AGC	2	6	693613	693618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654725
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16363	NC_009523	CTG	3	9	698937	698945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654728
16364	NC_009523	GTC	2	6	698946	698951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654728
16365	NC_009523	GTT	2	6	698972	698977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654728
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16367	NC_009523	GCTT	2	8	699103	699110	0 %	50 %	25 %	25 %	148654728
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16470	NC_009523	TGC	2	6	703122	703127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654732
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16482	NC_009523	TGC	2	6	703694	703699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654733
16483	NC_009523	GAT	2	6	703719	703724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654733
16484	NC_009523	CGA	2	6	703748	703753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654733
16485	NC_009523	TAC	2	6	703771	703776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654733
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