MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009523	GTC	2	6	641447	641452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654675
15002	NC_009523	GCA	2	6	641471	641476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654675
15003	NC_009523	GCG	2	6	641477	641482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654675
15004	NC_009523	GTC	2	6	641632	641637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654675
15005	NC_009523	GCC	2	6	641661	641666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654675
15006	NC_009523	GAC	2	6	641685	641690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654675
15007	NC_009523	GC	3	6	641691	641696	0 %	0 %	50 %	50 %	148654675
15008	NC_009523	GCCGC	2	10	641805	641814	0 %	0 %	40 %	60 %	148654676
15009	NC_009523	CCG	2	6	641829	641834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
15010	NC_009523	TGA	2	6	641886	641891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654676
15011	NC_009523	GATC	2	8	641964	641971	25 %	25 %	25 %	25 %	148654676
15012	NC_009523	CCG	2	6	641996	642001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
15013	NC_009523	CGA	2	6	642018	642023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654676
15014	NC_009523	GC	3	6	642060	642065	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
15015	NC_009523	GTC	2	6	642094	642099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654676
15016	NC_009523	GCC	2	6	642142	642147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
15017	NC_009523	CAT	2	6	642177	642182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654676
15018	NC_009523	GC	3	6	642201	642206	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
15019	NC_009523	TCGC	2	8	642220	642227	0 %	25 %	25 %	50 %	148654676
15020	NC_009523	GC	3	6	642244	642249	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
15021	NC_009523	GATC	2	8	642288	642295	25 %	25 %	25 %	25 %	148654676
15022	NC_009523	CGC	2	6	642321	642326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
15023	NC_009523	CG	3	6	642355	642360	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
15024	NC_009523	TGC	3	9	642375	642383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654676
15025	NC_009523	GTA	2	6	642385	642390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654676
15026	NC_009523	CGC	2	6	642486	642491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
15027	NC_009523	GT	3	6	642504	642509	0 %	50 %	50 %	0 %	148654676
15028	NC_009523	TTC	2	6	642535	642540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654676
15029	NC_009523	AGA	2	6	642567	642572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654676
15030	NC_009523	GCA	2	6	642584	642589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654676
15031	NC_009523	GC	3	6	642607	642612	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
15032	NC_009523	GC	3	6	642627	642632	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
15033	NC_009523	TGG	2	6	642645	642650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654676
15034	NC_009523	GAAG	2	8	642653	642660	50 %	0 %	50 %	0 %	148654676
15035	NC_009523	CCG	2	6	642723	642728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
15036	NC_009523	GAC	2	6	642745	642750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654676
15037	NC_009523	GCA	2	6	642795	642800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654676
15038	NC_009523	GCAT	2	8	642815	642822	25 %	25 %	25 %	25 %	148654676
15039	NC_009523	AACC	2	8	642840	642847	50 %	0 %	0 %	50 %	148654676
15040	NC_009523	G	6	6	642882	642887	0 %	0 %	100 %	0 %	148654677
15041	NC_009523	TTC	2	6	642915	642920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654677
15042	NC_009523	GCG	2	6	642925	642930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654677
15043	NC_009523	GCA	3	9	642934	642942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654677
15044	NC_009523	CG	3	6	642971	642976	0 %	0 %	50 %	50 %	148654677
15045	NC_009523	CCG	2	6	643019	643024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654677
15046	NC_009523	AGATCG	2	12	643033	643044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148654677
15047	NC_009523	CTG	2	6	643069	643074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654677
15048	NC_009523	GAA	2	6	643176	643181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654677
15049	NC_009523	GAT	2	6	643226	643231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654677
15050	NC_009523	CA	3	6	643234	643239	50 %	0 %	0 %	50 %	148654677
15051	NC_009523	GC	3	6	643240	643245	0 %	0 %	50 %	50 %	148654677
15052	NC_009523	GCA	2	6	643445	643450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654678
15053	NC_009523	CGA	2	6	643453	643458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654678
15054	NC_009523	AAAC	2	8	643509	643516	75 %	0 %	0 %	25 %	148654678
15055	NC_009523	GCA	2	6	643526	643531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654678
15056	NC_009523	GCG	2	6	643586	643591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654678
15057	NC_009523	ATG	2	6	643592	643597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654678
15058	NC_009523	AGA	2	6	643646	643651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654678
15059	NC_009523	A	6	6	643672	643677	100 %	0 %	0 %	0 %	148654678
15060	NC_009523	AAC	2	6	643711	643716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654678
15061	NC_009523	AAAC	2	8	643803	643810	75 %	0 %	0 %	25 %	148654678
15062	NC_009523	CGC	2	6	643858	643863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654678
15063	NC_009523	CGG	2	6	643868	643873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654678
15064	NC_009523	ACC	2	6	643987	643992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654678
15065	NC_009523	CGC	2	6	643997	644002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654678
15066	NC_009523	CGC	2	6	644069	644074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654678
15067	NC_009523	GCC	2	6	644144	644149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15068	NC_009523	TCG	2	6	644256	644261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654679
15069	NC_009523	AT	3	6	644289	644294	50 %	50 %	0 %	0 %	148654679
15070	NC_009523	GCG	2	6	644390	644395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654679
15071	NC_009523	CCG	3	9	644406	644414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654679
15072	NC_009523	AAT	2	6	644435	644440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654679
15073	NC_009523	CGA	2	6	644444	644449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654679
15074	NC_009523	CGG	2	6	644456	644461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654679
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15077	NC_009523	GAC	2	6	644747	644752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654679
15078	NC_009523	GCC	3	9	644789	644797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654679
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15080	NC_009523	CGC	3	9	644852	644860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654679
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15082	NC_009523	CCG	2	6	644905	644910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654679
15083	NC_009523	GC	3	6	644922	644927	0 %	0 %	50 %	50 %	148654679
15084	NC_009523	ACTGAA	2	12	644978	644989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148654679
15085	NC_009523	GCA	2	6	645019	645024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654679
15086	NC_009523	TTC	2	6	645246	645251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654679
15087	NC_009523	TCCG	2	8	645262	645269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15088	NC_009523	GCA	2	6	645311	645316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_009523	ATC	2	6	645356	645361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_009523	GAC	2	6	645364	645369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_009523	TTC	2	6	645400	645405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654680
15092	NC_009523	GC	3	6	645431	645436	0 %	0 %	50 %	50 %	148654680
15093	NC_009523	GCT	2	6	645494	645499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654680
15094	NC_009523	CAG	2	6	645500	645505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654680
15095	NC_009523	GC	4	8	645523	645530	0 %	0 %	50 %	50 %	148654680
15096	NC_009523	TCA	2	6	645532	645537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654680
15097	NC_009523	GC	3	6	645547	645552	0 %	0 %	50 %	50 %	148654680
15098	NC_009523	CGG	2	6	645554	645559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654680
15099	NC_009523	GCA	2	6	645587	645592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654680
15100	NC_009523	CCCG	2	8	645603	645610	0 %	0 %	25 %	75 %	148654680
15101	NC_009523	CGT	2	6	645624	645629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654680
15102	NC_009523	GCG	2	6	645680	645685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654680
15103	NC_009523	TCG	2	6	645719	645724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654680
15104	NC_009523	TCG	2	6	645745	645750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654680
15105	NC_009523	ACG	2	6	645757	645762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654680
15106	NC_009523	CCG	2	6	645767	645772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654680
15107	NC_009523	CAT	2	6	645836	645841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654681
15108	NC_009523	GAA	2	6	645861	645866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654681
15109	NC_009523	CAG	2	6	645897	645902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654681
15110	NC_009523	GC	3	6	645903	645908	0 %	0 %	50 %	50 %	148654681
15111	NC_009523	CTG	2	6	645963	645968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654681
15112	NC_009523	GAA	2	6	645990	645995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654681
15113	NC_009523	GC	6	12	646008	646019	0 %	0 %	50 %	50 %	148654681
15114	NC_009523	GTC	2	6	646032	646037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654681
15115	NC_009523	ATG	2	6	646069	646074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654681
15116	NC_009523	CG	3	6	646115	646120	0 %	0 %	50 %	50 %	148654681
15117	NC_009523	CGA	2	6	646142	646147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654681
15118	NC_009523	CCG	2	6	646190	646195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654681
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15120	NC_009523	TCG	2	6	646235	646240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654681
15121	NC_009523	GTC	2	6	646284	646289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654681
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15228	NC_009523	GC	3	6	650959	650964	0 %	0 %	50 %	50 %	148654686
15229	NC_009523	TCC	2	6	651067	651072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15230	NC_009523	AAT	2	6	651105	651110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15231	NC_009523	CCG	2	6	651170	651175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654687
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15234	NC_009523	GCA	2	6	651276	651281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654687
15235	NC_009523	AAC	2	6	651304	651309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654687
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15238	NC_009523	GAA	2	6	651475	651480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654687
15239	NC_009523	CGG	2	6	651531	651536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654687
15240	NC_009523	GC	4	8	651540	651547	0 %	0 %	50 %	50 %	148654687
15241	NC_009523	GGT	2	6	651562	651567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654687
15242	NC_009523	CAA	2	6	651654	651659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654687
15243	NC_009523	CGC	2	6	651661	651666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654687
15244	NC_009523	CA	4	8	651682	651689	50 %	0 %	0 %	50 %	148654687
15245	NC_009523	TGC	2	6	651696	651701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654687
15246	NC_009523	AATC	2	8	651712	651719	50 %	25 %	0 %	25 %	148654687
15247	NC_009523	AGA	2	6	651744	651749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654687
15248	NC_009523	CG	3	6	651855	651860	0 %	0 %	50 %	50 %	148654687
15249	NC_009523	GAC	2	6	651862	651867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654687
15250	NC_009523	GCCA	2	8	651883	651890	25 %	0 %	25 %	50 %	148654687
15251	NC_009523	GC	3	6	651980	651985	0 %	0 %	50 %	50 %	148654687
15252	NC_009523	CGC	2	6	651987	651992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654687
15253	NC_009523	GCG	2	6	652013	652018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654687
15254	NC_009523	GAT	2	6	652051	652056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654687
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15256	NC_009523	GACC	2	8	652341	652348	25 %	0 %	25 %	50 %	148654688
15257	NC_009523	GAT	2	6	652459	652464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654688
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15264	NC_009523	CCG	2	6	652745	652750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654688
15265	NC_009523	CG	3	6	652749	652754	0 %	0 %	50 %	50 %	148654688
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15270	NC_009523	CGG	2	6	652863	652868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654688
15271	NC_009523	CGC	2	6	652893	652898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654688
15272	NC_009523	AGATC	2	10	652916	652925	40 %	20 %	20 %	20 %	148654688
15273	NC_009523	GAT	2	6	653106	653111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654688
15274	NC_009523	GC	3	6	653206	653211	0 %	0 %	50 %	50 %	148654688
15275	NC_009523	AAC	2	6	653232	653237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654688
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15281	NC_009523	CGTT	2	8	653456	653463	0 %	50 %	25 %	25 %	148654689
15282	NC_009523	TGA	2	6	653542	653547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654689
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15284	NC_009523	TGC	2	6	653616	653621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654689
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15297	NC_009523	CAGC	2	8	654295	654302	25 %	0 %	25 %	50 %	148654689
15298	NC_009523	GC	3	6	654301	654306	0 %	0 %	50 %	50 %	148654689
15299	NC_009523	TCG	2	6	654312	654317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654689
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15309	NC_009523	CAG	3	9	654743	654751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654689
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15313	NC_009523	CGT	2	6	654814	654819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654689
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15321	NC_009523	CGG	2	6	655181	655186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654690
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15339	NC_009523	ATC	2	6	655921	655926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654690
15340	NC_009523	CG	4	8	655929	655936	0 %	0 %	50 %	50 %	148654690
15341	NC_009523	GCG	2	6	655952	655957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654690
15342	NC_009523	GAAC	2	8	655964	655971	50 %	0 %	25 %	25 %	148654690
15343	NC_009523	CGT	2	6	655985	655990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654690
15344	NC_009523	AAC	3	9	656016	656024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654690
15345	NC_009523	GC	3	6	656055	656060	0 %	0 %	50 %	50 %	148654690
15346	NC_009523	TG	3	6	656162	656167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15347	NC_009523	CCT	2	6	656178	656183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15348	NC_009523	AGAA	2	8	656227	656234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15349	NC_009523	TCA	2	6	656244	656249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15350	NC_009523	CAT	2	6	656266	656271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654691
15351	NC_009523	GTC	2	6	656301	656306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654691
15352	NC_009523	ACG	2	6	656307	656312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654691
15353	NC_009523	GAT	2	6	656314	656319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654691
15354	NC_009523	TTG	2	6	656385	656390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654691
15355	NC_009523	TGC	2	6	656415	656420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654691
15356	NC_009523	GCG	2	6	656502	656507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654691
15357	NC_009523	TCG	2	6	656600	656605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654691
15358	NC_009523	ATT	2	6	656636	656641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654691
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15360	NC_009523	TCG	2	6	656724	656729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654691
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15464	NC_009523	CGCC	2	8	661504	661511	0 %	0 %	25 %	75 %	148654696
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15477	NC_009523	CGA	2	6	661936	661941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15479	NC_009523	TAC	2	6	662036	662041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15480	NC_009523	TCA	2	6	662074	662079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15481	NC_009523	GCA	2	6	662116	662121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15482	NC_009523	TTGCA	2	10	662153	662162	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15483	NC_009523	ATG	2	6	662276	662281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654697
15484	NC_009523	TGG	2	6	662304	662309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654697
15485	NC_009523	CAC	2	6	662355	662360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654697
15486	NC_009523	CGCCC	2	10	662394	662403	0 %	0 %	20 %	80 %	148654697
15487	NC_009523	CCCG	2	8	662415	662422	0 %	0 %	25 %	75 %	148654697
15488	NC_009523	GCAACC	2	12	662458	662469	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148654697
15489	NC_009523	GTT	2	6	662531	662536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654697
15490	NC_009523	TGC	2	6	662653	662658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654697
15491	NC_009523	ATC	2	6	662672	662677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654697
15492	NC_009523	TGG	2	6	662721	662726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654697
15493	NC_009523	CCG	2	6	662783	662788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654697
15494	NC_009523	GCG	3	9	662802	662810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654697
15495	NC_009523	ATC	2	6	662816	662821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654697
15496	NC_009523	GCG	2	6	662844	662849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654697
15497	NC_009523	GA	3	6	662929	662934	50 %	0 %	50 %	0 %	148654697
15498	NC_009523	CGA	2	6	662941	662946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654697
15499	NC_009523	GATC	2	8	662986	662993	25 %	25 %	25 %	25 %	148654697
15500	NC_009523	CCG	2	6	662994	662999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654697

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