MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009523	GC	3	6	558751	558756	0 %	0 %	50 %	50 %	148654612
13002	NC_009523	CGAG	2	8	558795	558802	25 %	0 %	50 %	25 %	148654612
13003	NC_009523	GCA	3	9	558822	558830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654612
13004	NC_009523	GTCG	2	8	558904	558911	0 %	25 %	50 %	25 %	148654612
13005	NC_009523	GGC	2	6	558913	558918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654612
13006	NC_009523	CGAG	2	8	558933	558940	25 %	0 %	50 %	25 %	148654612
13007	NC_009523	GAATG	2	10	558957	558966	40 %	20 %	40 %	0 %	148654612
13008	NC_009523	TCA	2	6	559159	559164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654613
13009	NC_009523	CCG	2	6	559263	559268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654613
13010	NC_009523	GC	3	6	559305	559310	0 %	0 %	50 %	50 %	148654613
13011	NC_009523	ATG	2	6	559369	559374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654613
13012	NC_009523	GC	3	6	559419	559424	0 %	0 %	50 %	50 %	148654613
13013	NC_009523	GCG	2	6	559445	559450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654613
13014	NC_009523	GC	3	6	559477	559482	0 %	0 %	50 %	50 %	148654613
13015	NC_009523	CGATG	2	10	559538	559547	20 %	20 %	40 %	20 %	148654613
13016	NC_009523	CGC	3	9	559556	559564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654613
13017	NC_009523	CCA	2	6	559583	559588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654613
13018	NC_009523	GC	3	6	559630	559635	0 %	0 %	50 %	50 %	148654613
13019	NC_009523	CGG	2	6	559718	559723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654613
13020	NC_009523	ACGC	2	8	559730	559737	25 %	0 %	25 %	50 %	148654613
13021	NC_009523	CG	3	6	559780	559785	0 %	0 %	50 %	50 %	148654613
13022	NC_009523	GTCG	2	8	559797	559804	0 %	25 %	50 %	25 %	148654613
13023	NC_009523	GAC	2	6	559809	559814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654613
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13026	NC_009523	CAA	2	6	559883	559888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654613
13027	NC_009523	CCGC	2	8	559890	559897	0 %	0 %	25 %	75 %	148654613
13028	NC_009523	GGC	2	6	559912	559917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654613
13029	NC_009523	TGG	2	6	559928	559933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654613
13030	NC_009523	GC	3	6	559964	559969	0 %	0 %	50 %	50 %	148654613
13031	NC_009523	GA	5	10	559998	560007	50 %	0 %	50 %	0 %	148654613
13032	NC_009523	GAT	2	6	560089	560094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_009523	GC	3	6	560102	560107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13034	NC_009523	ATGG	2	8	560124	560131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_009523	GCG	2	6	560174	560179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_009523	TCG	2	6	560243	560248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_009523	GCG	2	6	560273	560278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13038	NC_009523	GA	3	6	560320	560325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_009523	GC	3	6	560426	560431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_009523	GGA	2	6	560496	560501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_009523	GGTG	2	8	560544	560551	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_009523	G	9	9	560585	560593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_009523	CGGAG	2	10	560656	560665	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13044	NC_009523	TGCTA	2	10	560722	560731	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13045	NC_009523	CCTGC	2	10	560738	560747	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13046	NC_009523	GGC	2	6	560816	560821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_009523	GGC	2	6	560882	560887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_009523	TG	3	6	561051	561056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_009523	GAGC	2	8	561092	561099	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13050	NC_009523	CG	3	6	561114	561119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13051	NC_009523	AATA	2	8	561254	561261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_009523	AGG	2	6	561301	561306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_009523	GAG	2	6	561345	561350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654614
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13055	NC_009523	CGT	2	6	561449	561454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654614
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13081	NC_009523	GGGA	2	8	562643	562650	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_009523	AG	3	6	562678	562683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13084	NC_009523	TTG	2	6	562722	562727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13088	NC_009523	GAT	2	6	562888	562893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_009523	AAT	2	6	562900	562905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_009523	TCC	2	6	562973	562978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13091	NC_009523	GCG	2	6	562986	562991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_009523	CTT	3	9	563011	563019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_009523	CAGG	2	8	563040	563047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13094	NC_009523	TTGA	2	8	563071	563078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_009523	CG	3	6	563138	563143	0 %	0 %	50 %	50 %	148654615
13096	NC_009523	TCG	2	6	563151	563156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654615
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13099	NC_009523	GATG	2	8	563225	563232	25 %	25 %	50 %	0 %	148654615
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13106	NC_009523	TGGAT	2	10	563458	563467	20 %	40 %	40 %	0 %	148654615
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13108	NC_009523	TTGC	2	8	563617	563624	0 %	50 %	25 %	25 %	148654615
13109	NC_009523	CG	3	6	563648	563653	0 %	0 %	50 %	50 %	148654615
13110	NC_009523	CAT	2	6	563681	563686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654615
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13113	NC_009523	CAC	2	6	563796	563801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654615
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13120	NC_009523	GCA	2	6	564149	564154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654615
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13123	NC_009523	GGT	2	6	564301	564306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_009523	CTTC	2	8	564381	564388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_009523	GTAT	2	8	564389	564396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_009523	ACA	2	6	564429	564434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_009523	TCT	2	6	564460	564465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_009523	G	6	6	564543	564548	0 %	0 %	100 %	0 %	148654616
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13134	NC_009523	GTT	2	6	564773	564778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654616
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13139	NC_009523	TGA	2	6	565082	565087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13141	NC_009523	TCT	2	6	565225	565230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13150	NC_009523	GCGTG	2	10	565653	565662	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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13153	NC_009523	T	7	7	565766	565772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13228	NC_009523	TCCCC	2	10	568855	568864	0 %	20 %	0 %	80 %	148654622
13229	NC_009523	GC	3	6	568932	568937	0 %	0 %	50 %	50 %	148654622
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13234	NC_009523	CAGC	2	8	569072	569079	25 %	0 %	25 %	50 %	148654622
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13238	NC_009523	GA	3	6	569181	569186	50 %	0 %	50 %	0 %	148654622
13239	NC_009523	GGA	2	6	569196	569201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654622
13240	NC_009523	CTCA	2	8	569232	569239	25 %	25 %	0 %	50 %	148654622
13241	NC_009523	GC	3	6	569241	569246	0 %	0 %	50 %	50 %	148654622
13242	NC_009523	CGTG	2	8	569357	569364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13243	NC_009523	CGA	2	6	569411	569416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13244	NC_009523	GGC	2	6	569423	569428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13245	NC_009523	GC	3	6	569623	569628	0 %	0 %	50 %	50 %	148654623
13246	NC_009523	CCA	2	6	569644	569649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654623
13247	NC_009523	GGAA	2	8	569684	569691	50 %	0 %	50 %	0 %	148654623
13248	NC_009523	GCG	2	6	569738	569743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654623
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13250	NC_009523	GCGCC	2	10	569801	569810	0 %	0 %	40 %	60 %	148654623
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13494	NC_009523	GACG	2	8	578196	578203	25 %	0 %	50 %	25 %	148654629
13495	NC_009523	GCC	2	6	578245	578250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654629
13496	NC_009523	TTG	2	6	578252	578257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654629
13497	NC_009523	GAC	2	6	578275	578280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654629
13498	NC_009523	GCTC	2	8	578313	578320	0 %	25 %	25 %	50 %	148654629
13499	NC_009523	GTG	2	6	578359	578364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654629
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