MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133001	NC_009523	GAA	2	6	5728549	5728554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658646
133002	NC_009523	TGG	2	6	5728595	5728600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658646
133003	NC_009523	CGC	2	6	5728623	5728628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658646
133004	NC_009523	TCA	2	6	5728631	5728636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658646
133005	NC_009523	AGG	2	6	5728656	5728661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658646
133006	NC_009523	CGC	2	6	5728673	5728678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658646
133007	NC_009523	GC	3	6	5728677	5728682	0 %	0 %	50 %	50 %	148658646
133008	NC_009523	CGA	2	6	5728737	5728742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658646
133009	NC_009523	CGG	2	6	5728896	5728901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658646
133010	NC_009523	GGC	2	6	5728906	5728911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658646
133011	NC_009523	GGC	2	6	5728918	5728923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658646
133012	NC_009523	GCGT	2	8	5728933	5728940	0 %	25 %	50 %	25 %	148658646
133013	NC_009523	TGC	2	6	5728941	5728946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658646
133014	NC_009523	ATG	2	6	5728970	5728975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658646
133015	NC_009523	CTG	2	6	5728981	5728986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658646
133016	NC_009523	ATCGG	2	10	5728997	5729006	20 %	20 %	40 %	20 %	148658646
133017	NC_009523	G	6	6	5729024	5729029	0 %	0 %	100 %	0 %	148658646
133018	NC_009523	GAT	2	6	5729082	5729087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658646
133019	NC_009523	ACG	2	6	5729113	5729118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658646
133020	NC_009523	CG	3	6	5729117	5729122	0 %	0 %	50 %	50 %	148658646
133021	NC_009523	CGA	2	6	5729133	5729138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658646
133022	NC_009523	GGT	2	6	5729148	5729153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658646
133023	NC_009523	CTG	2	6	5729218	5729223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658646
133024	NC_009523	TCA	2	6	5729234	5729239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658646
133025	NC_009523	CGA	2	6	5729241	5729246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658646
133026	NC_009523	GCGCT	2	10	5729296	5729305	0 %	20 %	40 %	40 %	148658646
133027	NC_009523	AGG	2	6	5729319	5729324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133028	NC_009523	CTA	2	6	5729498	5729503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658647
133029	NC_009523	GAA	2	6	5729505	5729510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658647
133030	NC_009523	CGT	2	6	5729525	5729530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658647
133031	NC_009523	GCG	2	6	5729573	5729578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658647
133032	NC_009523	GAA	2	6	5729595	5729600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658647
133033	NC_009523	CGT	2	6	5729615	5729620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658647
133034	NC_009523	GGA	2	6	5729651	5729656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658647
133035	NC_009523	CAA	2	6	5729663	5729668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658647
133036	NC_009523	GCT	2	6	5729684	5729689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658647
133037	NC_009523	GCC	2	6	5729738	5729743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658647
133038	NC_009523	GCG	2	6	5729778	5729783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658647
133039	NC_009523	TGA	2	6	5729843	5729848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658647
133040	NC_009523	GCGG	2	8	5729878	5729885	0 %	0 %	75 %	25 %	148658647
133041	NC_009523	TGC	2	6	5729917	5729922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658647
133042	NC_009523	CGC	2	6	5729990	5729995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658647
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133044	NC_009523	GAA	2	6	5730057	5730062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658647
133045	NC_009523	CGC	2	6	5730090	5730095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658647
133046	NC_009523	GC	3	6	5730119	5730124	0 %	0 %	50 %	50 %	148658647
133047	NC_009523	GTG	2	6	5730142	5730147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658647
133048	NC_009523	TGAG	2	8	5730153	5730160	25 %	25 %	50 %	0 %	148658647
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133050	NC_009523	AGC	2	6	5730338	5730343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658648
133051	NC_009523	CAG	2	6	5730355	5730360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658648
133052	NC_009523	TCG	2	6	5730396	5730401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658648
133053	NC_009523	ACCA	2	8	5730416	5730423	50 %	0 %	0 %	50 %	148658648
133054	NC_009523	CGG	3	9	5730556	5730564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658648
133055	NC_009523	GAT	2	6	5730565	5730570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658648
133056	NC_009523	GCT	2	6	5730629	5730634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658648
133057	NC_009523	CGC	2	6	5730660	5730665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658648
133058	NC_009523	GC	3	6	5730670	5730675	0 %	0 %	50 %	50 %	148658648
133059	NC_009523	TTC	2	6	5730779	5730784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133060	NC_009523	GAC	2	6	5730834	5730839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133061	NC_009523	TTGC	2	8	5730878	5730885	0 %	50 %	25 %	25 %	148658649
133062	NC_009523	ATTG	2	8	5730928	5730935	25 %	50 %	25 %	0 %	148658649
133063	NC_009523	CTG	2	6	5730953	5730958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658649
133064	NC_009523	TGC	2	6	5730963	5730968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658649
133065	NC_009523	GCT	2	6	5731000	5731005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658649
133066	NC_009523	CGCTG	2	10	5731056	5731065	0 %	20 %	40 %	40 %	148658649
133067	NC_009523	GAC	2	6	5731114	5731119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658649
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133069	NC_009523	TCG	2	6	5731158	5731163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658649
133070	NC_009523	CTG	3	9	5731203	5731211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133071	NC_009523	TTC	2	6	5731308	5731313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133072	NC_009523	TGC	2	6	5731324	5731329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133073	NC_009523	CTT	2	6	5731344	5731349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133074	NC_009523	CCTG	2	8	5731402	5731409	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133075	NC_009523	GCAG	2	8	5731540	5731547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133076	NC_009523	CACG	2	8	5731594	5731601	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133077	NC_009523	CA	3	6	5731606	5731611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133078	NC_009523	ATC	2	6	5731662	5731667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658650
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133080	NC_009523	ATC	2	6	5731697	5731702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658650
133081	NC_009523	CGTC	2	8	5731713	5731720	0 %	25 %	25 %	50 %	148658650
133082	NC_009523	GTC	2	6	5731757	5731762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658650
133083	NC_009523	CGA	2	6	5731795	5731800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658650
133084	NC_009523	CTG	2	6	5731907	5731912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658650
133085	NC_009523	GGC	2	6	5731920	5731925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658650
133086	NC_009523	GATATC	2	12	5731997	5732008	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148658650
133087	NC_009523	CGC	2	6	5732022	5732027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658650
133088	NC_009523	GGC	2	6	5732123	5732128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658650
133089	NC_009523	GC	3	6	5732132	5732137	0 %	0 %	50 %	50 %	148658650
133090	NC_009523	TGC	2	6	5732155	5732160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658650
133091	NC_009523	GGCG	2	8	5732161	5732168	0 %	0 %	75 %	25 %	148658650
133092	NC_009523	GCG	2	6	5732238	5732243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658650
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133094	NC_009523	TGA	2	6	5732299	5732304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658650
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133096	NC_009523	CG	3	6	5732393	5732398	0 %	0 %	50 %	50 %	148658650
133097	NC_009523	GAA	2	6	5732411	5732416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658650
133098	NC_009523	GCGCC	2	10	5732429	5732438	0 %	0 %	40 %	60 %	148658650
133099	NC_009523	GC	3	6	5732441	5732446	0 %	0 %	50 %	50 %	148658650
133100	NC_009523	TAC	2	6	5732456	5732461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658650
133101	NC_009523	CCG	2	6	5732495	5732500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658650
133102	NC_009523	GCT	2	6	5732509	5732514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658650
133103	NC_009523	GGC	2	6	5732516	5732521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658650
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133105	NC_009523	AAC	2	6	5732775	5732780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658650
133106	NC_009523	CGA	2	6	5732830	5732835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658650
133107	NC_009523	GC	3	6	5732840	5732845	0 %	0 %	50 %	50 %	148658650
133108	NC_009523	GCG	2	6	5732874	5732879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658650
133109	NC_009523	CAG	2	6	5732882	5732887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658650
133110	NC_009523	GCCA	2	8	5732909	5732916	25 %	0 %	25 %	50 %	148658650
133111	NC_009523	CTT	2	6	5732991	5732996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658650
133112	NC_009523	CAG	2	6	5733032	5733037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658651
133113	NC_009523	GCG	2	6	5733052	5733057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658651
133114	NC_009523	GGC	2	6	5733065	5733070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658651
133115	NC_009523	GGC	2	6	5733086	5733091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658651
133116	NC_009523	AAG	2	6	5733129	5733134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658651
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133154	NC_009523	CCTG	2	8	5734715	5734722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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133217	NC_009523	TC	3	6	5737222	5737227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133218	NC_009523	TATTG	2	10	5737276	5737285	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133219	NC_009523	GC	3	6	5737337	5737342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133220	NC_009523	GAAA	2	8	5737364	5737371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133221	NC_009523	TAG	2	6	5737386	5737391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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133225	NC_009523	GC	3	6	5737687	5737692	0 %	0 %	50 %	50 %	148658654
133226	NC_009523	CG	5	10	5737697	5737706	0 %	0 %	50 %	50 %	148658654
133227	NC_009523	TCG	2	6	5737817	5737822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658654
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133229	NC_009523	GATC	2	8	5737872	5737879	25 %	25 %	25 %	25 %	148658654
133230	NC_009523	ACGC	2	8	5737936	5737943	25 %	0 %	25 %	50 %	148658654
133231	NC_009523	TGC	2	6	5737952	5737957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658654
133232	NC_009523	TGG	2	6	5737982	5737987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658654
133233	NC_009523	GTC	2	6	5738020	5738025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658654
133234	NC_009523	TCG	2	6	5738033	5738038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658654
133235	NC_009523	TG	3	6	5738061	5738066	0 %	50 %	50 %	0 %	148658654
133236	NC_009523	GCC	2	6	5738097	5738102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658654
133237	NC_009523	CTG	2	6	5738110	5738115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658654
133238	NC_009523	GC	3	6	5738157	5738162	0 %	0 %	50 %	50 %	148658654
133239	NC_009523	CGCC	2	8	5738181	5738188	0 %	0 %	25 %	75 %	148658654
133240	NC_009523	GC	3	6	5738243	5738248	0 %	0 %	50 %	50 %	148658654
133241	NC_009523	GCGGG	2	10	5738262	5738271	0 %	0 %	80 %	20 %	148658654
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133264	NC_009523	CGA	2	6	5738744	5738749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658654
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133305	NC_009523	CAG	2	6	5740219	5740224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658655
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133321	NC_009523	TGA	2	6	5740863	5740868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658655
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133328	NC_009523	GC	3	6	5741103	5741108	0 %	0 %	50 %	50 %	148658655
133329	NC_009523	CGTT	2	8	5741192	5741199	0 %	50 %	25 %	25 %	148658655
133330	NC_009523	GCG	2	6	5741209	5741214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658655
133331	NC_009523	GA	3	6	5741238	5741243	50 %	0 %	50 %	0 %	148658655
133332	NC_009523	CCTG	2	8	5741342	5741349	0 %	25 %	25 %	50 %	148658656
133333	NC_009523	GAT	2	6	5741387	5741392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658656
133334	NC_009523	CTTG	2	8	5741399	5741406	0 %	50 %	25 %	25 %	148658656
133335	NC_009523	TCG	2	6	5741413	5741418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658656
133336	NC_009523	TGGC	2	8	5741430	5741437	0 %	25 %	50 %	25 %	148658656
133337	NC_009523	CAA	2	6	5741440	5741445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658656
133338	NC_009523	ATC	2	6	5741451	5741456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658656
133339	NC_009523	TGC	2	6	5741533	5741538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658656
133340	NC_009523	TCA	2	6	5741549	5741554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658656
133341	NC_009523	GCG	2	6	5741562	5741567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658656
133342	NC_009523	GTT	2	6	5741624	5741629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658656
133343	NC_009523	GCGCTG	2	12	5741655	5741666	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148658656
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133345	NC_009523	TTC	2	6	5741727	5741732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658656
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133460	NC_009523	GC	3	6	5746637	5746642	0 %	0 %	50 %	50 %	148658663
133461	NC_009523	TTC	2	6	5746698	5746703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658663
133462	NC_009523	CTT	2	6	5746712	5746717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658663
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133481	NC_009523	TGC	2	6	5747458	5747463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658663
133482	NC_009523	CGA	2	6	5747480	5747485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658663
133483	NC_009523	GCT	2	6	5747508	5747513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658663
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133486	NC_009523	GGA	2	6	5747611	5747616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133487	NC_009523	CTG	2	6	5747663	5747668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658664
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133489	NC_009523	CTT	2	6	5747781	5747786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658664
133490	NC_009523	GCG	2	6	5747801	5747806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658664
133491	NC_009523	CCT	2	6	5747853	5747858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658664
133492	NC_009523	CTC	2	6	5747890	5747895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658664
133493	NC_009523	GT	3	6	5747915	5747920	0 %	50 %	50 %	0 %	148658664
133494	NC_009523	CGG	2	6	5747934	5747939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658664
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133500	NC_009523	CGG	2	6	5748216	5748221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658664

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