MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
130501	NC_009523	TGA	2	6	5620134	5620139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130502	NC_009523	CCG	2	6	5620261	5620266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658559
130503	NC_009523	CGA	2	6	5620274	5620279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130504	NC_009523	CTG	2	6	5620281	5620286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130505	NC_009523	CCAGAC	2	12	5620295	5620306	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148658559
130506	NC_009523	TTG	2	6	5620312	5620317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658559
130507	NC_009523	GCC	2	6	5620458	5620463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658559
130508	NC_009523	TGAC	2	8	5620558	5620565	25 %	25 %	25 %	25 %	148658559
130509	NC_009523	GCT	4	12	5620574	5620585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130510	NC_009523	AGC	2	6	5620624	5620629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130511	NC_009523	GTT	2	6	5620715	5620720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658559
130512	NC_009523	CTG	2	6	5620752	5620757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130513	NC_009523	ACG	2	6	5620760	5620765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130514	NC_009523	TTC	2	6	5620875	5620880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658559
130515	NC_009523	GCA	2	6	5620904	5620909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130516	NC_009523	ATC	3	9	5620932	5620940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658559
130517	NC_009523	CTT	2	6	5620982	5620987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658559
130518	NC_009523	GAC	2	6	5621030	5621035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130519	NC_009523	GGC	2	6	5621048	5621053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658559
130520	NC_009523	CCAG	2	8	5621075	5621082	25 %	0 %	25 %	50 %	148658559
130521	NC_009523	GCG	2	6	5621087	5621092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658559
130522	NC_009523	GAG	2	6	5621106	5621111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658559
130523	NC_009523	CTG	3	9	5621205	5621213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130524	NC_009523	GCG	2	6	5621266	5621271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658559
130525	NC_009523	CGC	2	6	5621274	5621279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658559
130526	NC_009523	GCT	2	6	5621295	5621300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130527	NC_009523	GCA	2	6	5621308	5621313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130528	NC_009523	CAC	2	6	5621325	5621330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658559
130529	NC_009523	CGG	2	6	5621346	5621351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658559
130530	NC_009523	CGA	2	6	5621360	5621365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130531	NC_009523	CA	3	6	5621373	5621378	50 %	0 %	0 %	50 %	148658559
130532	NC_009523	GGC	2	6	5621430	5621435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658559
130533	NC_009523	CAA	2	6	5621441	5621446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658559
130534	NC_009523	CGA	2	6	5621473	5621478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130535	NC_009523	AC	3	6	5621525	5621530	50 %	0 %	0 %	50 %	148658559
130536	NC_009523	CG	3	6	5621658	5621663	0 %	0 %	50 %	50 %	148658559
130537	NC_009523	CTT	2	6	5621669	5621674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658559
130538	NC_009523	GTTC	2	8	5621708	5621715	0 %	50 %	25 %	25 %	148658559
130539	NC_009523	TTC	2	6	5621730	5621735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658559
130540	NC_009523	GTT	2	6	5621798	5621803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658559
130541	NC_009523	CG	3	6	5621806	5621811	0 %	0 %	50 %	50 %	148658559
130542	NC_009523	CGA	2	6	5621825	5621830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130543	NC_009523	CTGC	2	8	5621845	5621852	0 %	25 %	25 %	50 %	148658559
130544	NC_009523	CGC	2	6	5621862	5621867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658559
130545	NC_009523	CCG	2	6	5621882	5621887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658559
130546	NC_009523	CG	3	6	5621904	5621909	0 %	0 %	50 %	50 %	148658559
130547	NC_009523	CAG	2	6	5621913	5621918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130548	NC_009523	AGC	2	6	5621964	5621969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130549	NC_009523	GC	3	6	5621995	5622000	0 %	0 %	50 %	50 %	148658559
130550	NC_009523	CAC	2	6	5622054	5622059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658559
130551	NC_009523	CAG	2	6	5622069	5622074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130552	NC_009523	CAACC	2	10	5622092	5622101	40 %	0 %	0 %	60 %	148658559
130553	NC_009523	GAT	3	9	5622134	5622142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658559
130554	NC_009523	AGG	2	6	5622207	5622212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658559
130555	NC_009523	GCA	2	6	5622214	5622219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658559
130556	NC_009523	GGCGCC	2	12	5622250	5622261	0 %	0 %	50 %	50 %	148658559
130557	NC_009523	GCT	2	6	5622340	5622345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130558	NC_009523	CA	3	6	5622361	5622366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130559	NC_009523	CA	3	6	5622382	5622387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130560	NC_009523	TTC	2	6	5622580	5622585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658560
130561	NC_009523	TAG	2	6	5622592	5622597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658560
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130565	NC_009523	GCGA	2	8	5622836	5622843	25 %	0 %	50 %	25 %	148658560
130566	NC_009523	GAAA	2	8	5622847	5622854	75 %	0 %	25 %	0 %	148658560
130567	NC_009523	CAT	2	6	5622918	5622923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658560
130568	NC_009523	CTT	2	6	5623013	5623018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658560
130569	NC_009523	TCA	3	9	5623054	5623062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658560
130570	NC_009523	CAA	2	6	5623096	5623101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130571	NC_009523	CAA	2	6	5623118	5623123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130572	NC_009523	CTC	2	6	5623138	5623143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130573	NC_009523	TC	3	6	5623183	5623188	0 %	50 %	0 %	50 %	148658561
130574	NC_009523	A	6	6	5623214	5623219	100 %	0 %	0 %	0 %	148658561
130575	NC_009523	CGG	2	6	5623226	5623231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658561
130576	NC_009523	ACG	2	6	5623293	5623298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658561
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130578	NC_009523	ATG	2	6	5623345	5623350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658561
130579	NC_009523	ATG	2	6	5623357	5623362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658561
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130581	NC_009523	TCA	2	6	5623551	5623556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658561
130582	NC_009523	CGTT	2	8	5623567	5623574	0 %	50 %	25 %	25 %	148658561
130583	NC_009523	CGG	2	6	5623626	5623631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658561
130584	NC_009523	TCG	2	6	5623640	5623645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658561
130585	NC_009523	CGT	2	6	5623659	5623664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658561
130586	NC_009523	TCCG	2	8	5623676	5623683	0 %	25 %	25 %	50 %	148658561
130587	NC_009523	GC	3	6	5623700	5623705	0 %	0 %	50 %	50 %	148658561
130588	NC_009523	ATC	2	6	5623744	5623749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658561
130589	NC_009523	TGGC	2	8	5623767	5623774	0 %	25 %	50 %	25 %	148658561
130590	NC_009523	CGG	2	6	5623779	5623784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658561
130591	NC_009523	CGA	2	6	5623785	5623790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658561
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130595	NC_009523	CA	3	6	5623930	5623935	50 %	0 %	0 %	50 %	148658562
130596	NC_009523	CGG	2	6	5623940	5623945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658562
130597	NC_009523	GCG	2	6	5623955	5623960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658562
130598	NC_009523	GCG	2	6	5624011	5624016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658562
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130600	NC_009523	CCG	2	6	5624064	5624069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658562
130601	NC_009523	GAT	2	6	5624090	5624095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658562
130602	NC_009523	CGG	2	6	5624102	5624107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658562
130603	NC_009523	CGC	2	6	5624172	5624177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658562
130604	NC_009523	GTG	2	6	5624202	5624207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658562
130605	NC_009523	GTG	2	6	5624225	5624230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658562
130606	NC_009523	GAG	2	6	5624241	5624246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658562
130607	NC_009523	CG	3	6	5624273	5624278	0 %	0 %	50 %	50 %	148658562
130608	NC_009523	TGA	2	6	5624279	5624284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658562
130609	NC_009523	TGG	2	6	5624287	5624292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658562
130610	NC_009523	TCA	2	6	5624326	5624331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658562
130611	NC_009523	ATCA	2	8	5624454	5624461	50 %	25 %	0 %	25 %	148658562
130612	NC_009523	CAT	2	6	5624474	5624479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658562
130613	NC_009523	GAT	2	6	5624489	5624494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658562
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130615	NC_009523	ATC	2	6	5624556	5624561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658563
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