MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
130001	NC_009523	GC	3	6	5597808	5597813	0 %	0 %	50 %	50 %	148658537
130002	NC_009523	CCG	2	6	5597840	5597845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658537
130003	NC_009523	CCG	2	6	5597906	5597911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130004	NC_009523	CGTG	2	8	5597949	5597956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130005	NC_009523	GAC	2	6	5597999	5598004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658538
130006	NC_009523	GCC	2	6	5598042	5598047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658538
130007	NC_009523	C	6	6	5598046	5598051	0 %	0 %	0 %	100 %	148658538
130008	NC_009523	TCG	2	6	5598052	5598057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658538
130009	NC_009523	GCG	2	6	5598093	5598098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658538
130010	NC_009523	CGA	2	6	5598104	5598109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658538
130011	NC_009523	ATC	2	6	5598126	5598131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658538
130012	NC_009523	GCA	2	6	5598246	5598251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658538
130013	NC_009523	GC	3	6	5598352	5598357	0 %	0 %	50 %	50 %	148658538
130014	NC_009523	CGG	2	6	5598391	5598396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658538
130015	NC_009523	GCGG	2	8	5598431	5598438	0 %	0 %	75 %	25 %	148658538
130016	NC_009523	TCG	2	6	5598457	5598462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658538
130017	NC_009523	GC	3	6	5598469	5598474	0 %	0 %	50 %	50 %	148658538
130018	NC_009523	GC	3	6	5598540	5598545	0 %	0 %	50 %	50 %	148658538
130019	NC_009523	CGT	2	6	5598550	5598555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658538
130020	NC_009523	CTT	2	6	5598587	5598592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658538
130021	NC_009523	GGCGTC	2	12	5598694	5598705	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148658539
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130024	NC_009523	GCCA	2	8	5598769	5598776	25 %	0 %	25 %	50 %	148658539
130025	NC_009523	GC	3	6	5598886	5598891	0 %	0 %	50 %	50 %	148658539
130026	NC_009523	GAT	2	6	5598897	5598902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658539
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130032	NC_009523	GC	3	6	5599334	5599339	0 %	0 %	50 %	50 %	148658539
130033	NC_009523	ACCGG	2	10	5599393	5599402	20 %	0 %	40 %	40 %	148658539
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130039	NC_009523	CGA	2	6	5599611	5599616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658540
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130041	NC_009523	CG	3	6	5599662	5599667	0 %	0 %	50 %	50 %	148658540
130042	NC_009523	GCCA	2	8	5599691	5599698	25 %	0 %	25 %	50 %	148658540
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130047	NC_009523	CAC	2	6	5599928	5599933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130048	NC_009523	AGC	3	9	5599986	5599994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658541
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130050	NC_009523	GAA	2	6	5600133	5600138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658541
130051	NC_009523	ACC	3	9	5600181	5600189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658541
130052	NC_009523	GC	3	6	5600374	5600379	0 %	0 %	50 %	50 %	148658542
130053	NC_009523	CGTC	2	8	5600416	5600423	0 %	25 %	25 %	50 %	148658542
130054	NC_009523	GGCT	2	8	5600449	5600456	0 %	25 %	50 %	25 %	148658542
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130057	NC_009523	TCG	2	6	5600600	5600605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658542
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130066	NC_009523	CGC	2	6	5600969	5600974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658542
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130088	NC_009523	CGA	2	6	5602063	5602068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658545
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130090	NC_009523	CCG	2	6	5602188	5602193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658545
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130100	NC_009523	GGC	2	6	5602598	5602603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658545
130101	NC_009523	CTG	2	6	5602612	5602617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658545
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130105	NC_009523	AGC	2	6	5602907	5602912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658545
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130115	NC_009523	CG	3	6	5603428	5603433	0 %	0 %	50 %	50 %	148658545
130116	NC_009523	GC	3	6	5603471	5603476	0 %	0 %	50 %	50 %	148658545
130117	NC_009523	GTAT	2	8	5603480	5603487	25 %	50 %	25 %	0 %	148658545
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130119	NC_009523	GCCA	2	8	5603619	5603626	25 %	0 %	25 %	50 %	148658545
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130121	NC_009523	GC	3	6	5603710	5603715	0 %	0 %	50 %	50 %	148658545
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130125	NC_009523	GC	4	8	5603778	5603785	0 %	0 %	50 %	50 %	148658545
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130129	NC_009523	TCG	2	6	5603886	5603891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658545
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130159	NC_009523	CTCG	2	8	5605392	5605399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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130162	NC_009523	GCC	2	6	5605494	5605499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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130229	NC_009523	CAG	2	6	5608202	5608207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658549
130230	NC_009523	GA	3	6	5608225	5608230	50 %	0 %	50 %	0 %	148658549
130231	NC_009523	GC	3	6	5608261	5608266	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
130232	NC_009523	GC	3	6	5608304	5608309	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
130233	NC_009523	GAA	2	6	5608368	5608373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658549
130234	NC_009523	GC	3	6	5608399	5608404	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
130235	NC_009523	GC	3	6	5608421	5608426	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
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130261	NC_009523	CGCGCC	2	12	5609133	5609144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
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130269	NC_009523	GTA	2	6	5609435	5609440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130270	NC_009523	CGTG	2	8	5609537	5609544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130271	NC_009523	GC	3	6	5609569	5609574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130272	NC_009523	GT	3	6	5609587	5609592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130273	NC_009523	GTGC	2	8	5609595	5609602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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130335	NC_009523	TGCG	2	8	5612290	5612297	0 %	25 %	50 %	25 %	148658551
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130341	NC_009523	GA	3	6	5612598	5612603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130342	NC_009523	CTG	2	6	5612718	5612723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130343	NC_009523	AGG	2	6	5612768	5612773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130344	NC_009523	TGC	2	6	5612780	5612785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658552
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130348	NC_009523	GC	3	6	5613025	5613030	0 %	0 %	50 %	50 %	148658552
130349	NC_009523	CAT	2	6	5613054	5613059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658552
130350	NC_009523	CG	3	6	5613065	5613070	0 %	0 %	50 %	50 %	148658552
130351	NC_009523	CCG	2	6	5613118	5613123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658552
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130360	NC_009523	GC	3	6	5613457	5613462	0 %	0 %	50 %	50 %	148658552
130361	NC_009523	CTG	2	6	5613472	5613477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658552
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130366	NC_009523	CG	3	6	5613875	5613880	0 %	0 %	50 %	50 %	148658553
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130380	NC_009523	GAT	2	6	5614612	5614617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658554
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130387	NC_009523	ATG	2	6	5614846	5614851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658554
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130435	NC_009523	ATT	2	6	5617143	5617148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130460	NC_009523	CA	3	6	5618145	5618150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130461	NC_009523	TCC	2	6	5618169	5618174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130462	NC_009523	CCGA	2	8	5618176	5618183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130463	NC_009523	CAA	2	6	5618186	5618191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130464	NC_009523	GTT	2	6	5618275	5618280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130465	NC_009523	CAG	2	6	5618303	5618308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130466	NC_009523	GT	3	6	5618329	5618334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130467	NC_009523	GC	3	6	5618368	5618373	0 %	0 %	50 %	50 %	148658557
130468	NC_009523	CAA	2	6	5618427	5618432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658557
130469	NC_009523	AAT	2	6	5618463	5618468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148658557
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130473	NC_009523	ATC	2	6	5618571	5618576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658557
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130480	NC_009523	GATA	2	8	5618856	5618863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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130491	NC_009523	TCA	2	6	5619505	5619510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658558
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130493	NC_009523	TGCCG	2	10	5619627	5619636	0 %	20 %	40 %	40 %	148658558
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130500	NC_009523	AGA	2	6	5620110	5620115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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