MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_009523	AGTTC	2	10	537393	537402	20 %	40 %	20 %	20 %	148654596
12503	NC_009523	GAA	2	6	537404	537409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654596
12504	NC_009523	A	6	6	537431	537436	100 %	0 %	0 %	0 %	148654596
12505	NC_009523	TCC	2	6	537493	537498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654596
12506	NC_009523	CGC	2	6	537691	537696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654596
12507	NC_009523	AGC	2	6	537703	537708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654596
12508	NC_009523	GAA	2	6	537763	537768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_009523	AC	3	6	537802	537807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12510	NC_009523	CGA	2	6	537844	537849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_009523	AGC	2	6	537905	537910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_009523	AGG	2	6	537911	537916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_009523	ATC	2	6	537949	537954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654597
12514	NC_009523	CA	3	6	538073	538078	50 %	0 %	0 %	50 %	148654597
12515	NC_009523	CGC	2	6	538142	538147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654597
12516	NC_009523	GGC	2	6	538173	538178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654597
12517	NC_009523	GTG	2	6	538221	538226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654597
12518	NC_009523	GAC	2	6	538263	538268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12519	NC_009523	CG	3	6	538276	538281	0 %	0 %	50 %	50 %	148654597
12520	NC_009523	GGC	2	6	538323	538328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654597
12521	NC_009523	CTG	2	6	538351	538356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12522	NC_009523	CAGTG	2	10	538367	538376	20 %	20 %	40 %	20 %	148654597
12523	NC_009523	AACC	2	8	538419	538426	50 %	0 %	0 %	50 %	148654597
12524	NC_009523	GGC	2	6	538473	538478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654597
12525	NC_009523	CTG	2	6	538501	538506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12526	NC_009523	GA	3	6	538532	538537	50 %	0 %	50 %	0 %	148654597
12527	NC_009523	GAC	2	6	538563	538568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12528	NC_009523	AGTG	2	8	538593	538600	25 %	25 %	50 %	0 %	148654597
12529	NC_009523	GGC	2	6	538623	538628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654597
12530	NC_009523	GTC	2	6	538634	538639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12531	NC_009523	GGGA	2	8	538680	538687	25 %	0 %	75 %	0 %	148654597
12532	NC_009523	GCC	2	6	538724	538729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654597
12533	NC_009523	GCA	2	6	538774	538779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12534	NC_009523	ACGGT	2	10	538816	538825	20 %	20 %	40 %	20 %	148654597
12535	NC_009523	GAC	2	6	538863	538868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12536	NC_009523	TGC	2	6	538952	538957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12537	NC_009523	CAGTG	2	10	538967	538976	20 %	20 %	40 %	20 %	148654597
12538	NC_009523	CTC	2	6	538989	538994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654597
12539	NC_009523	GAC	2	6	539013	539018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12540	NC_009523	GTG	2	6	539081	539086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654597
12541	NC_009523	CTG	2	6	539101	539106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654597
12542	NC_009523	GAC	2	6	539163	539168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654597
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12553	NC_009523	CTG	2	6	539701	539706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654597
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12558	NC_009523	GCG	2	6	539938	539943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654597
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12570	NC_009523	TGC	2	6	540496	540501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12571	NC_009523	GCAC	2	8	540584	540591	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12572	NC_009523	AAT	2	6	540599	540604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_009523	GAT	2	6	540631	540636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654598
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12578	NC_009523	GGAT	2	8	540799	540806	25 %	25 %	50 %	0 %	148654598
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12589	NC_009523	GCGTG	2	10	541298	541307	0 %	20 %	60 %	20 %	148654598
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12602	NC_009523	GGCG	2	8	541669	541676	0 %	0 %	75 %	25 %	148654599
12603	NC_009523	CTG	2	6	541741	541746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654599
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12605	NC_009523	GCC	2	6	541897	541902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654599
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12609	NC_009523	CGT	2	6	542176	542181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12610	NC_009523	CCG	2	6	542199	542204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12611	NC_009523	AATC	2	8	542253	542260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12612	NC_009523	G	6	6	542309	542314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_009523	T	6	6	542337	542342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_009523	CGG	2	6	542485	542490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654600
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12618	NC_009523	GATC	2	8	542608	542615	25 %	25 %	25 %	25 %	148654600
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12620	NC_009523	CACGGT	2	12	542830	542841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148654600
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12747	NC_009523	GTC	2	6	548865	548870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12866	NC_009523	GAT	2	6	553800	553805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654610
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12984	NC_009523	CGG	2	6	558038	558043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12989	NC_009523	GCA	2	6	558252	558257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654612
12990	NC_009523	GCG	2	6	558278	558283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654612
12991	NC_009523	GCG	2	6	558324	558329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654612
12992	NC_009523	CG	3	6	558328	558333	0 %	0 %	50 %	50 %	148654612
12993	NC_009523	TGC	2	6	558366	558371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654612
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12999	NC_009523	TCG	2	6	558611	558616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654612
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