MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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129003	NC_009523	CGG	2	6	5555432	5555437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658510
129004	NC_009523	CGG	2	6	5555448	5555453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658510
129005	NC_009523	GGC	2	6	5555502	5555507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658510
129006	NC_009523	GC	3	6	5555544	5555549	0 %	0 %	50 %	50 %	148658510
129007	NC_009523	CGG	2	6	5555554	5555559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658510
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129009	NC_009523	GCG	2	6	5555590	5555595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658510
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129017	NC_009523	CTGC	2	8	5555817	5555824	0 %	25 %	25 %	50 %	148658510
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129019	NC_009523	CG	3	6	5555856	5555861	0 %	0 %	50 %	50 %	148658510
129020	NC_009523	ATC	3	9	5555867	5555875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658510
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129035	NC_009523	GC	3	6	5556400	5556405	0 %	0 %	50 %	50 %	148658510
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129095	NC_009523	TGA	2	6	5559087	5559092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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129102	NC_009523	TGC	2	6	5559604	5559609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658513
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129112	NC_009523	GGC	2	6	5559919	5559924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658513
129113	NC_009523	TCCA	2	8	5559932	5559939	25 %	25 %	0 %	50 %	148658513
129114	NC_009523	CAGCGC	2	12	5559981	5559992	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148658513
129115	NC_009523	GGC	3	9	5560009	5560017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658513
129116	NC_009523	CTG	2	6	5560021	5560026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658513
129117	NC_009523	GAC	2	6	5560139	5560144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658513
129118	NC_009523	ATC	2	6	5560156	5560161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658513
129119	NC_009523	GC	3	6	5560209	5560214	0 %	0 %	50 %	50 %	148658513
129120	NC_009523	TCA	2	6	5560267	5560272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658513
129121	NC_009523	GTC	2	6	5560297	5560302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658513
129122	NC_009523	GT	3	6	5560382	5560387	0 %	50 %	50 %	0 %	148658513
129123	NC_009523	AACC	2	8	5560394	5560401	50 %	0 %	0 %	50 %	148658513
129124	NC_009523	TGCG	2	8	5560426	5560433	0 %	25 %	50 %	25 %	148658513
129125	NC_009523	AGAGAT	2	12	5560501	5560512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148658514
129126	NC_009523	TGA	2	6	5560632	5560637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658514
129127	NC_009523	CGA	2	6	5560641	5560646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658514
129128	NC_009523	GACTTT	2	12	5560688	5560699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148658514
129129	NC_009523	GCCA	2	8	5560756	5560763	25 %	0 %	25 %	50 %	148658514
129130	NC_009523	CATGC	2	10	5560767	5560776	20 %	20 %	20 %	40 %	148658514
129131	NC_009523	GTA	2	6	5560799	5560804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658514
129132	NC_009523	CCG	2	6	5560850	5560855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658514
129133	NC_009523	CCG	2	6	5560898	5560903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658514
129134	NC_009523	CG	3	6	5560905	5560910	0 %	0 %	50 %	50 %	148658514
129135	NC_009523	CTG	2	6	5560919	5560924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658514
129136	NC_009523	ACA	2	6	5560927	5560932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658514
129137	NC_009523	GTC	2	6	5560939	5560944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658514
129138	NC_009523	CGAT	2	8	5560966	5560973	25 %	25 %	25 %	25 %	148658514
129139	NC_009523	CTGC	2	8	5561020	5561027	0 %	25 %	25 %	50 %	148658514
129140	NC_009523	CATC	2	8	5561031	5561038	25 %	25 %	0 %	50 %	148658514
129141	NC_009523	ATG	2	6	5561071	5561076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658514
129142	NC_009523	AGT	2	6	5561097	5561102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658514
129143	NC_009523	ATT	2	6	5561135	5561140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148658514
129144	NC_009523	CATC	2	8	5561265	5561272	25 %	25 %	0 %	50 %	148658514
129145	NC_009523	CGG	2	6	5561348	5561353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658514
129146	NC_009523	CAT	2	6	5561449	5561454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129147	NC_009523	CGC	2	6	5561477	5561482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129148	NC_009523	CAC	2	6	5561486	5561491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129149	NC_009523	AGC	2	6	5561518	5561523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129150	NC_009523	CCA	2	6	5561623	5561628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658515
129151	NC_009523	CAC	2	6	5561674	5561679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658515
129152	NC_009523	CGC	2	6	5561682	5561687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658515
129153	NC_009523	AG	3	6	5561730	5561735	50 %	0 %	50 %	0 %	148658515
129154	NC_009523	CTGC	2	8	5561746	5561753	0 %	25 %	25 %	50 %	148658515
129155	NC_009523	CAA	2	6	5561812	5561817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658515
129156	NC_009523	AGC	2	6	5561844	5561849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
129157	NC_009523	GCCT	2	8	5561970	5561977	0 %	25 %	25 %	50 %	148658515
129158	NC_009523	AAT	2	6	5562104	5562109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148658515
129159	NC_009523	TCC	2	6	5562117	5562122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658515
129160	NC_009523	GAC	2	6	5562174	5562179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
129161	NC_009523	AGG	2	6	5562215	5562220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658515
129162	NC_009523	GCA	2	6	5562246	5562251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
129163	NC_009523	CGA	2	6	5562255	5562260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
129164	NC_009523	GAC	2	6	5562269	5562274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
129165	NC_009523	TCG	2	6	5562292	5562297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658515
129166	NC_009523	AG	3	6	5562319	5562324	50 %	0 %	50 %	0 %	148658515
129167	NC_009523	GC	3	6	5562338	5562343	0 %	0 %	50 %	50 %	148658515
129168	NC_009523	TGA	2	6	5562350	5562355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658515
129169	NC_009523	AGA	2	6	5562412	5562417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658515
129170	NC_009523	GCC	2	6	5562482	5562487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658515
129171	NC_009523	TGCCT	2	10	5562497	5562506	0 %	40 %	20 %	40 %	148658515
129172	NC_009523	GGC	2	6	5562595	5562600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658515
129173	NC_009523	ATCGG	2	10	5562647	5562656	20 %	20 %	40 %	20 %	148658515
129174	NC_009523	GGT	2	6	5562658	5562663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658515
129175	NC_009523	A	6	6	5562670	5562675	100 %	0 %	0 %	0 %	148658515
129176	NC_009523	C	6	6	5562713	5562718	0 %	0 %	0 %	100 %	148658516
129177	NC_009523	GCA	2	6	5562824	5562829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129178	NC_009523	CAG	2	6	5562840	5562845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129179	NC_009523	GC	3	6	5562862	5562867	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
129180	NC_009523	CGC	2	6	5562872	5562877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
129181	NC_009523	CG	3	6	5562917	5562922	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
129182	NC_009523	GCGG	2	8	5562931	5562938	0 %	0 %	75 %	25 %	148658516
129183	NC_009523	TGCC	2	8	5562979	5562986	0 %	25 %	25 %	50 %	148658516
129184	NC_009523	TCA	2	6	5563036	5563041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658516
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129186	NC_009523	CGGT	2	8	5563084	5563091	0 %	25 %	50 %	25 %	148658516
129187	NC_009523	CGCC	2	8	5563106	5563113	0 %	0 %	25 %	75 %	148658516
129188	NC_009523	GCA	2	6	5563159	5563164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129189	NC_009523	TCG	2	6	5563171	5563176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129190	NC_009523	TCG	2	6	5563304	5563309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129191	NC_009523	TCC	2	6	5563354	5563359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658516
129192	NC_009523	GCT	2	6	5563393	5563398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129193	NC_009523	GCA	2	6	5563445	5563450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129194	NC_009523	CGC	2	6	5563493	5563498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
129195	NC_009523	CGC	2	6	5563502	5563507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
129196	NC_009523	GCC	2	6	5563564	5563569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
129197	NC_009523	CGG	2	6	5563628	5563633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658516
129198	NC_009523	GGTC	2	8	5563655	5563662	0 %	25 %	50 %	25 %	148658516
129199	NC_009523	GC	4	8	5563681	5563688	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
129200	NC_009523	GC	3	6	5563745	5563750	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
129201	NC_009523	GAT	2	6	5563776	5563781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658516
129202	NC_009523	GCC	2	6	5563794	5563799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
129203	NC_009523	GC	3	6	5563866	5563871	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
129204	NC_009523	CCA	2	6	5563926	5563931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658516
129205	NC_009523	GCG	2	6	5563943	5563948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658516
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129207	NC_009523	GAT	2	6	5564138	5564143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658516
129208	NC_009523	CCA	2	6	5564145	5564150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658516
129209	NC_009523	TTC	2	6	5564161	5564166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658516
129210	NC_009523	CG	4	8	5564177	5564184	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
129211	NC_009523	AGC	2	6	5564185	5564190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129212	NC_009523	CAT	2	6	5564252	5564257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658516
129213	NC_009523	GCT	2	6	5564324	5564329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129214	NC_009523	CTG	2	6	5564401	5564406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129215	NC_009523	CGC	2	6	5564420	5564425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
129216	NC_009523	GAT	2	6	5564433	5564438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658516
129217	NC_009523	ATGA	2	8	5564505	5564512	50 %	25 %	25 %	0 %	148658516
129218	NC_009523	GC	3	6	5564514	5564519	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
129219	NC_009523	GCA	2	6	5564531	5564536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
129220	NC_009523	GC	4	8	5564638	5564645	0 %	0 %	50 %	50 %	148658517
129221	NC_009523	CCGC	2	8	5564665	5564672	0 %	0 %	25 %	75 %	148658517
129222	NC_009523	GCTC	2	8	5564673	5564680	0 %	25 %	25 %	50 %	148658517
129223	NC_009523	CCGC	2	8	5564686	5564693	0 %	0 %	25 %	75 %	148658517
129224	NC_009523	CCGCT	2	10	5564696	5564705	0 %	20 %	20 %	60 %	148658517
129225	NC_009523	TCCC	2	8	5564789	5564796	0 %	25 %	0 %	75 %	148658517
129226	NC_009523	TCC	2	6	5564820	5564825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658517
129227	NC_009523	AGCC	2	8	5564826	5564833	25 %	0 %	25 %	50 %	148658517
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129229	NC_009523	CCGC	2	8	5564855	5564862	0 %	0 %	25 %	75 %	148658517
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