MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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128502	NC_009523	GAA	2	6	5533160	5533165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658491
128503	NC_009523	GCT	3	9	5533166	5533174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658491
128504	NC_009523	TGA	2	6	5533231	5533236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658491
128505	NC_009523	GAA	2	6	5533239	5533244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658491
128506	NC_009523	TAA	2	6	5533348	5533353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148658491
128507	NC_009523	AT	3	6	5533359	5533364	50 %	50 %	0 %	0 %	148658491
128508	NC_009523	CCAT	2	8	5533383	5533390	25 %	25 %	0 %	50 %	148658491
128509	NC_009523	ATC	2	6	5533414	5533419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658491
128510	NC_009523	CAA	2	6	5533447	5533452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658491
128511	NC_009523	T	7	7	5533491	5533497	0 %	100 %	0 %	0 %	148658491
128512	NC_009523	TGA	2	6	5533518	5533523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128513	NC_009523	AGAA	2	8	5533550	5533557	75 %	0 %	25 %	0 %	148658492
128514	NC_009523	CGT	2	6	5533561	5533566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658492
128515	NC_009523	AT	3	6	5533567	5533572	50 %	50 %	0 %	0 %	148658492
128516	NC_009523	TC	3	6	5533581	5533586	0 %	50 %	0 %	50 %	148658492
128517	NC_009523	GC	3	6	5533617	5533622	0 %	0 %	50 %	50 %	148658492
128518	NC_009523	GATCG	2	10	5533642	5533651	20 %	20 %	40 %	20 %	148658492
128519	NC_009523	TTCC	2	8	5533813	5533820	0 %	50 %	0 %	50 %	148658492
128520	NC_009523	TGC	2	6	5533871	5533876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658492
128521	NC_009523	AAAC	2	8	5533902	5533909	75 %	0 %	0 %	25 %	148658492
128522	NC_009523	TG	3	6	5533930	5533935	0 %	50 %	50 %	0 %	148658492
128523	NC_009523	GTA	2	6	5533946	5533951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658492
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128526	NC_009523	ATC	2	6	5534114	5534119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658492
128527	NC_009523	T	6	6	5534129	5534134	0 %	100 %	0 %	0 %	148658492
128528	NC_009523	TCT	2	6	5534266	5534271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658492
128529	NC_009523	CAAG	2	8	5534362	5534369	50 %	0 %	25 %	25 %	148658492
128530	NC_009523	TG	3	6	5534440	5534445	0 %	50 %	50 %	0 %	148658492
128531	NC_009523	ATC	2	6	5534478	5534483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658492
128532	NC_009523	CTG	2	6	5534521	5534526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658492
128533	NC_009523	GGA	2	6	5534550	5534555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658492
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128537	NC_009523	TGC	2	6	5535011	5535016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658493
128538	NC_009523	CGAGT	2	10	5535034	5535043	20 %	20 %	40 %	20 %	148658493
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128549	NC_009523	GC	3	6	5535468	5535473	0 %	0 %	50 %	50 %	148658493
128550	NC_009523	CGG	2	6	5535485	5535490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658493
128551	NC_009523	GCC	2	6	5535496	5535501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658493
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128554	NC_009523	CGCGC	2	10	5535548	5535557	0 %	0 %	40 %	60 %	148658493
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128558	NC_009523	CAC	3	9	5535699	5535707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658493
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128560	NC_009523	CGT	2	6	5535728	5535733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658493
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128569	NC_009523	CAG	2	6	5536289	5536294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658494
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128589	NC_009523	CA	3	6	5536727	5536732	50 %	0 %	0 %	50 %	148658494
128590	NC_009523	CAG	2	6	5536760	5536765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658494
128591	NC_009523	AG	3	6	5536813	5536818	50 %	0 %	50 %	0 %	148658494
128592	NC_009523	GCA	3	9	5536903	5536911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658494
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128597	NC_009523	GATC	2	8	5537100	5537107	25 %	25 %	25 %	25 %	148658494
128598	NC_009523	GTCG	2	8	5537117	5537124	0 %	25 %	50 %	25 %	148658494
128599	NC_009523	TCT	2	6	5537286	5537291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128600	NC_009523	GCC	2	6	5537294	5537299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128601	NC_009523	TTG	2	6	5537317	5537322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128602	NC_009523	GTT	2	6	5537345	5537350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128603	NC_009523	CAT	2	6	5537400	5537405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128604	NC_009523	CGT	2	6	5537452	5537457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128605	NC_009523	GATC	2	8	5537507	5537514	25 %	25 %	25 %	25 %	148658495
128606	NC_009523	TCG	2	6	5537553	5537558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658495
128607	NC_009523	ATC	2	6	5537637	5537642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658495
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128613	NC_009523	CG	4	8	5538126	5538133	0 %	0 %	50 %	50 %	148658496
128614	NC_009523	CT	3	6	5538208	5538213	0 %	50 %	0 %	50 %	148658496
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128933	NC_009523	CGA	2	6	5552732	5552737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658508
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128995	NC_009523	CGG	2	6	5555123	5555128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658509
128996	NC_009523	TGT	2	6	5555135	5555140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658509
128997	NC_009523	AGT	2	6	5555150	5555155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658509
128998	NC_009523	CGC	2	6	5555212	5555217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128999	NC_009523	CGC	2	6	5555318	5555323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658510
129000	NC_009523	CAC	2	6	5555333	5555338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658510

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