MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_009523	GCC	2	6	514523	514528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654580
12005	NC_009523	GAA	3	9	514535	514543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654580
12006	NC_009523	ACTG	2	8	514567	514574	25 %	25 %	25 %	25 %	148654580
12007	NC_009523	CGA	2	6	514607	514612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654580
12008	NC_009523	GCC	2	6	514659	514664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654580
12009	NC_009523	CGC	2	6	514677	514682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654580
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12011	NC_009523	CGCGC	2	10	514757	514766	0 %	0 %	40 %	60 %	148654580
12012	NC_009523	TGA	2	6	514791	514796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654580
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12015	NC_009523	ACA	2	6	514937	514942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12016	NC_009523	AGCG	2	8	514960	514967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12017	NC_009523	GAAG	2	8	514975	514982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_009523	CTT	2	6	515020	515025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_009523	TGT	2	6	515066	515071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_009523	CAG	2	6	515143	515148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_009523	AAC	2	6	515160	515165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_009523	GCC	2	6	515313	515318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654581
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12030	NC_009523	CGC	2	6	515537	515542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654581
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12052	NC_009523	CGA	2	6	516656	516661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654582
12053	NC_009523	CGA	2	6	516709	516714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654582
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12088	NC_009523	CCGA	2	8	518495	518502	25 %	0 %	25 %	50 %	148654583
12089	NC_009523	GCCA	2	8	518507	518514	25 %	0 %	25 %	50 %	148654583
12090	NC_009523	TCA	2	6	518519	518524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654583
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12097	NC_009523	CAG	2	6	518848	518853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12099	NC_009523	TTTC	2	8	518973	518980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12102	NC_009523	GTTCG	2	10	519050	519059	0 %	40 %	40 %	20 %	148654584
12103	NC_009523	GAT	2	6	519092	519097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654584
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12108	NC_009523	ATCG	2	8	519347	519354	25 %	25 %	25 %	25 %	148654584
12109	NC_009523	CTG	2	6	519399	519404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654584
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12112	NC_009523	CCA	2	6	519469	519474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654584
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12115	NC_009523	CGA	2	6	519552	519557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12116	NC_009523	ATA	2	6	519561	519566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_009523	TCC	2	6	519749	519754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654585
12118	NC_009523	GT	3	6	519782	519787	0 %	50 %	50 %	0 %	148654585
12119	NC_009523	GC	3	6	519807	519812	0 %	0 %	50 %	50 %	148654585
12120	NC_009523	TGC	2	6	519875	519880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12121	NC_009523	TTGC	2	8	519937	519944	0 %	50 %	25 %	25 %	148654585
12122	NC_009523	GCG	2	6	520030	520035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654585
12123	NC_009523	CGGTCT	2	12	520080	520091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12124	NC_009523	CGG	2	6	520182	520187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654585
12125	NC_009523	CTTG	2	8	520188	520195	0 %	50 %	25 %	25 %	148654585
12126	NC_009523	CG	3	6	520224	520229	0 %	0 %	50 %	50 %	148654585
12127	NC_009523	CGG	2	6	520250	520255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654585
12128	NC_009523	GCA	2	6	520288	520293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12129	NC_009523	CTGG	2	8	520317	520324	0 %	25 %	50 %	25 %	148654585
12130	NC_009523	TGCGC	2	10	520410	520419	0 %	20 %	40 %	40 %	148654585
12131	NC_009523	CCG	2	6	520421	520426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654585
12132	NC_009523	GTG	2	6	520447	520452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654585
12133	NC_009523	ACG	2	6	520517	520522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12134	NC_009523	GAC	2	6	520530	520535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12135	NC_009523	GC	4	8	520552	520559	0 %	0 %	50 %	50 %	148654585
12136	NC_009523	GGA	2	6	520584	520589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654585
12137	NC_009523	GCG	2	6	520605	520610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654585
12138	NC_009523	GTGAGG	2	12	520619	520630	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	148654585
12139	NC_009523	TGC	2	6	520691	520696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12140	NC_009523	TCC	2	6	520697	520702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654585
12141	NC_009523	GAC	2	6	520710	520715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12142	NC_009523	AG	3	6	520727	520732	50 %	0 %	50 %	0 %	148654585
12143	NC_009523	GGC	2	6	520740	520745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654585
12144	NC_009523	GAA	2	6	520762	520767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654585
12145	NC_009523	CGCT	2	8	520786	520793	0 %	25 %	25 %	50 %	148654585
12146	NC_009523	GAT	2	6	520818	520823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654585
12147	NC_009523	GCT	3	9	520923	520931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12148	NC_009523	ACG	2	6	520947	520952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12149	NC_009523	CG	3	6	520951	520956	0 %	0 %	50 %	50 %	148654585
12150	NC_009523	TGC	2	6	520964	520969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654585
12151	NC_009523	GCG	2	6	521069	521074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654585
12152	NC_009523	CTG	2	6	521226	521231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12153	NC_009523	GCGCA	2	10	521260	521269	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12154	NC_009523	AGC	2	6	521323	521328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12155	NC_009523	GCG	2	6	521360	521365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654586
12156	NC_009523	TGC	2	6	521454	521459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12157	NC_009523	CTG	2	6	521485	521490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12158	NC_009523	GCTGGC	2	12	521508	521519	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654586
12159	NC_009523	CTGGCG	2	12	521527	521538	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654586
12160	NC_009523	GCG	2	6	521546	521551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654586
12161	NC_009523	GCC	2	6	521563	521568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654586
12162	NC_009523	GGT	2	6	521628	521633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654586
12163	NC_009523	GCGCTG	2	12	521683	521694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654586
12164	NC_009523	TGA	2	6	521745	521750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654586
12165	NC_009523	CGA	2	6	521763	521768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12166	NC_009523	TGC	2	6	521780	521785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12167	NC_009523	GC	4	8	521938	521945	0 %	0 %	50 %	50 %	148654586
12168	NC_009523	CTG	2	6	522025	522030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12169	NC_009523	TGGC	2	8	522062	522069	0 %	25 %	50 %	25 %	148654586
12170	NC_009523	GAC	2	6	522084	522089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654586
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12172	NC_009523	CTG	2	6	522115	522120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12173	NC_009523	ACG	2	6	522161	522166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12174	NC_009523	G	6	6	522166	522171	0 %	0 %	100 %	0 %	148654586
12175	NC_009523	CGCTGG	2	12	522191	522202	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148654586
12176	NC_009523	GCT	2	6	522273	522278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
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12179	NC_009523	TCC	2	6	522424	522429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654586
12180	NC_009523	CGC	2	6	522561	522566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654586
12181	NC_009523	CTG	2	6	522580	522585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12182	NC_009523	TGG	2	6	522718	522723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654586
12183	NC_009523	GCT	2	6	522744	522749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12184	NC_009523	TTC	2	6	522868	522873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654586
12185	NC_009523	GCT	2	6	522888	522893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
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12189	NC_009523	TTCG	2	8	523012	523019	0 %	50 %	25 %	25 %	148654586
12190	NC_009523	CGC	2	6	523059	523064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654586
12191	NC_009523	GCT	2	6	523065	523070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12192	NC_009523	ACG	2	6	523100	523105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12193	NC_009523	CGA	2	6	523124	523129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654586
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12195	NC_009523	CTGG	2	8	523185	523192	0 %	25 %	50 %	25 %	148654586
12196	NC_009523	GC	3	6	523224	523229	0 %	0 %	50 %	50 %	148654586
12197	NC_009523	GGC	2	6	523234	523239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654586
12198	NC_009523	TGG	2	6	523295	523300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654586
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12200	NC_009523	CGG	2	6	523352	523357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654586
12201	NC_009523	CAGG	2	8	523513	523520	25 %	0 %	50 %	25 %	148654586
12202	NC_009523	GC	3	6	523548	523553	0 %	0 %	50 %	50 %	148654586
12203	NC_009523	CCCGCT	2	12	523560	523571	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148654586
12204	NC_009523	TCG	2	6	523595	523600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
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12208	NC_009523	CTG	2	6	523744	523749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654586
12209	NC_009523	ATG	2	6	523787	523792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654586
12210	NC_009523	CGAT	2	8	523799	523806	25 %	25 %	25 %	25 %	148654586
12211	NC_009523	GGT	2	6	523812	523817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654586
12212	NC_009523	TGC	2	6	524021	524026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654587
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12218	NC_009523	CTG	2	6	524452	524457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654587
12219	NC_009523	CGG	2	6	524556	524561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654587
12220	NC_009523	CGC	2	6	524586	524591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654587
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12222	NC_009523	GGC	2	6	524681	524686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654587
12223	NC_009523	GC	3	6	524798	524803	0 %	0 %	50 %	50 %	148654587
12224	NC_009523	TCC	2	6	524819	524824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654587
12225	NC_009523	TCG	2	6	524853	524858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654587
12226	NC_009523	CCT	2	6	524904	524909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654587
12227	NC_009523	AGGT	2	8	524972	524979	25 %	25 %	50 %	0 %	148654587
12228	NC_009523	TTC	2	6	524992	524997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12229	NC_009523	C	6	6	525024	525029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12230	NC_009523	TGC	2	6	525083	525088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654588
12231	NC_009523	TTG	2	6	525091	525096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654588
12232	NC_009523	C	6	6	525120	525125	0 %	0 %	0 %	100 %	148654588
12233	NC_009523	CCA	2	6	525134	525139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654588
12234	NC_009523	GCC	2	6	525171	525176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654588
12235	NC_009523	GCG	2	6	525180	525185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654588
12236	NC_009523	CG	3	6	525290	525295	0 %	0 %	50 %	50 %	148654588
12237	NC_009523	CGGG	2	8	525302	525309	0 %	0 %	75 %	25 %	148654588
12238	NC_009523	CGC	2	6	525344	525349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654588
12239	NC_009523	GGC	2	6	525427	525432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654588
12240	NC_009523	GCG	2	6	525437	525442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654588
12241	NC_009523	CTGAT	2	10	525472	525481	20 %	40 %	20 %	20 %	148654588
12242	NC_009523	CGA	2	6	525587	525592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654588
12243	NC_009523	GAT	2	6	525602	525607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654588
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12245	NC_009523	CAG	2	6	525669	525674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654588
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12281	NC_009523	AGC	2	6	527217	527222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12284	NC_009523	CGC	2	6	527325	527330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12359	NC_009523	CTG	2	6	531299	531304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654591
12360	NC_009523	ATC	2	6	531359	531364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654591
12361	NC_009523	GC	4	8	531518	531525	0 %	0 %	50 %	50 %	148654591
12362	NC_009523	CGG	2	6	531529	531534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654591
12363	NC_009523	CGC	2	6	531582	531587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654591
12364	NC_009523	GC	3	6	531618	531623	0 %	0 %	50 %	50 %	148654591
12365	NC_009523	ATG	2	6	531692	531697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654591
12366	NC_009523	ATC	2	6	531723	531728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654591
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12368	NC_009523	GAC	2	6	531855	531860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654592
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12374	NC_009523	GTG	2	6	532007	532012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654592
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12395	NC_009523	GGCG	2	8	532837	532844	0 %	0 %	75 %	25 %	148654592
12396	NC_009523	GGTGC	2	10	532848	532857	0 %	20 %	60 %	20 %	148654592
12397	NC_009523	CCT	2	6	532883	532888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654592
12398	NC_009523	ACA	2	6	532911	532916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12399	NC_009523	GCT	2	6	532946	532951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654593
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12404	NC_009523	CAGT	2	8	533189	533196	25 %	25 %	25 %	25 %	148654593
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12452	NC_009523	GAT	3	9	534954	534962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12465	NC_009523	GGT	2	6	535695	535700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654595
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12471	NC_009523	TCG	2	6	535946	535951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654595
12472	NC_009523	CTG	2	6	535953	535958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654595
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12474	NC_009523	GC	3	6	535999	536004	0 %	0 %	50 %	50 %	148654595
12475	NC_009523	TGA	2	6	536047	536052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654595
12476	NC_009523	CG	3	6	536207	536212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12477	NC_009523	TGA	2	6	536224	536229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12480	NC_009523	ATT	2	6	536390	536395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12481	NC_009523	ATT	2	6	536458	536463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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