MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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122002	NC_009523	ATCG	2	8	5255120	5255127	25 %	25 %	25 %	25 %	148658283
122003	NC_009523	TGT	2	6	5255158	5255163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658283
122004	NC_009523	GAT	2	6	5255173	5255178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658283
122005	NC_009523	GACC	2	8	5255192	5255199	25 %	0 %	25 %	50 %	148658283
122006	NC_009523	GC	3	6	5255217	5255222	0 %	0 %	50 %	50 %	148658283
122007	NC_009523	CGACG	2	10	5255242	5255251	20 %	0 %	40 %	40 %	148658283
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122010	NC_009523	GCA	2	6	5255350	5255355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658283
122011	NC_009523	TC	3	6	5255365	5255370	0 %	50 %	0 %	50 %	148658283
122012	NC_009523	AGA	2	6	5255413	5255418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658283
122013	NC_009523	CAT	2	6	5255450	5255455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658283
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122015	NC_009523	GTG	2	6	5255564	5255569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122016	NC_009523	GTG	2	6	5255577	5255582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122017	NC_009523	GGA	2	6	5255637	5255642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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122019	NC_009523	TAT	2	6	5255686	5255691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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122022	NC_009523	CTG	2	6	5255811	5255816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658284
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122030	NC_009523	AT	3	6	5256301	5256306	50 %	50 %	0 %	0 %	148658285
122031	NC_009523	CGGG	2	8	5256422	5256429	0 %	0 %	75 %	25 %	148658285
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122114	NC_009523	AGC	2	6	5260242	5260247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658287
122115	NC_009523	AAGA	2	8	5260265	5260272	75 %	0 %	25 %	0 %	148658287
122116	NC_009523	GCC	2	6	5260311	5260316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658287
122117	NC_009523	GCTC	2	8	5260336	5260343	0 %	25 %	25 %	50 %	148658287
122118	NC_009523	ATT	2	6	5260437	5260442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148658287
122119	NC_009523	GCC	2	6	5260500	5260505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658287
122120	NC_009523	CTG	2	6	5260516	5260521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658287
122121	NC_009523	GGC	2	6	5260526	5260531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658287
122122	NC_009523	ACCG	2	8	5260575	5260582	25 %	0 %	25 %	50 %	148658287
122123	NC_009523	TCG	2	6	5260599	5260604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658287
122124	NC_009523	CGA	2	6	5260654	5260659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658287
122125	NC_009523	GC	3	6	5260701	5260706	0 %	0 %	50 %	50 %	148658287
122126	NC_009523	TTTCA	2	10	5260724	5260733	20 %	60 %	0 %	20 %	148658287
122127	NC_009523	CGTG	2	8	5260741	5260748	0 %	25 %	50 %	25 %	148658287
122128	NC_009523	ATC	2	6	5260778	5260783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658287
122129	NC_009523	AG	3	6	5260816	5260821	50 %	0 %	50 %	0 %	148658287
122130	NC_009523	TCC	2	6	5260848	5260853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658287
122131	NC_009523	ATC	2	6	5260913	5260918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658287
122132	NC_009523	CCTCT	2	10	5261151	5261160	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
122133	NC_009523	AGAA	2	8	5261196	5261203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122134	NC_009523	ATT	2	6	5261214	5261219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122135	NC_009523	TGC	2	6	5261251	5261256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122136	NC_009523	GA	3	6	5261267	5261272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122137	NC_009523	TG	3	6	5261282	5261287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122138	NC_009523	TCA	2	6	5261372	5261377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122139	NC_009523	GCGG	2	8	5261395	5261402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122140	NC_009523	GTG	2	6	5261428	5261433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122141	NC_009523	CG	3	6	5261492	5261497	0 %	0 %	50 %	50 %	148658288
122142	NC_009523	CG	3	6	5261502	5261507	0 %	0 %	50 %	50 %	148658288
122143	NC_009523	GCG	2	6	5261671	5261676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658288
122144	NC_009523	CCA	2	6	5261698	5261703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658288
122145	NC_009523	GCG	3	9	5261706	5261714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658288
122146	NC_009523	AGG	2	6	5261801	5261806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658288
122147	NC_009523	GGCGC	2	10	5261845	5261854	0 %	0 %	60 %	40 %	148658288
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122151	NC_009523	CGA	2	6	5262010	5262015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658288
122152	NC_009523	GTCG	2	8	5262107	5262114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122153	NC_009523	TAT	2	6	5262203	5262208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122154	NC_009523	CATC	2	8	5262308	5262315	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122155	NC_009523	CTG	2	6	5262335	5262340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658289
122156	NC_009523	TTG	2	6	5262421	5262426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658289
122157	NC_009523	GCG	2	6	5262439	5262444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658289
122158	NC_009523	CAT	2	6	5262446	5262451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658289
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122173	NC_009523	GAT	2	6	5262969	5262974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658290
122174	NC_009523	CGG	2	6	5263049	5263054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658290
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122190	NC_009523	GAT	2	6	5263647	5263652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658291
122191	NC_009523	CCCAGC	2	12	5263663	5263674	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148658291
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122207	NC_009523	CGCC	2	8	5264108	5264115	0 %	0 %	25 %	75 %	148658291
122208	NC_009523	TGC	2	6	5264171	5264176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658291
122209	NC_009523	GCCAGC	2	12	5264203	5264214	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148658291
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122212	NC_009523	TGT	2	6	5264285	5264290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658291
122213	NC_009523	TC	3	6	5264300	5264305	0 %	50 %	0 %	50 %	148658291
122214	NC_009523	CCT	2	6	5264353	5264358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658292
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122216	NC_009523	TCC	2	6	5264520	5264525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658292
122217	NC_009523	CCG	2	6	5264554	5264559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658292
122218	NC_009523	CAG	2	6	5264572	5264577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658292
122219	NC_009523	CTG	2	6	5264588	5264593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658292
122220	NC_009523	CAG	2	6	5264624	5264629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658292
122221	NC_009523	GCCA	2	8	5264676	5264683	25 %	0 %	25 %	50 %	148658292
122222	NC_009523	TGC	2	6	5264694	5264699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658292
122223	NC_009523	GCG	2	6	5264818	5264823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658292
122224	NC_009523	GCG	2	6	5264860	5264865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658292
122225	NC_009523	CGG	2	6	5264867	5264872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658292
122226	NC_009523	CAA	2	6	5264876	5264881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658292
122227	NC_009523	CG	3	6	5264934	5264939	0 %	0 %	50 %	50 %	148658292
122228	NC_009523	CGCAG	2	10	5264955	5264964	20 %	0 %	40 %	40 %	148658292
122229	NC_009523	CGG	2	6	5265148	5265153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658292
122230	NC_009523	TGA	2	6	5265187	5265192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658292
122231	NC_009523	CGCC	2	8	5265243	5265250	0 %	0 %	25 %	75 %	148658292
122232	NC_009523	ATC	2	6	5265279	5265284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658292
122233	NC_009523	GTC	2	6	5265292	5265297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658292
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122237	NC_009523	GGT	2	6	5265553	5265558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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122239	NC_009523	AGC	2	6	5265693	5265698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658293
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122283	NC_009523	TGC	2	6	5268234	5268239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658296
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122345	NC_009523	GAT	2	6	5270873	5270878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658297
122346	NC_009523	CAT	2	6	5270944	5270949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658297
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122452	NC_009523	CGG	2	6	5275783	5275788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658301
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122458	NC_009523	CGCCAG	2	12	5276213	5276224	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148658301
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122461	NC_009523	CAGCA	2	10	5276381	5276390	40 %	0 %	20 %	40 %	148658301
122462	NC_009523	TCGA	2	8	5276397	5276404	25 %	25 %	25 %	25 %	148658301
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122464	NC_009523	CTGG	2	8	5276496	5276503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122465	NC_009523	GCG	2	6	5276505	5276510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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122468	NC_009523	GCAGA	2	10	5276658	5276667	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122469	NC_009523	GTC	2	6	5276687	5276692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658302
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122496	NC_009523	TCT	2	6	5278010	5278015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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