MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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119502	NC_009523	CGG	2	6	5137788	5137793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658185
119503	NC_009523	GC	3	6	5137832	5137837	0 %	0 %	50 %	50 %	148658185
119504	NC_009523	CTC	2	6	5138257	5138262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658186
119505	NC_009523	TCG	2	6	5138308	5138313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658186
119506	NC_009523	GA	3	6	5138324	5138329	50 %	0 %	50 %	0 %	148658186
119507	NC_009523	TCGGT	2	10	5138331	5138340	0 %	40 %	40 %	20 %	148658186
119508	NC_009523	TGA	2	6	5138379	5138384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658186
119509	NC_009523	CGG	2	6	5138391	5138396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658186
119510	NC_009523	TAG	2	6	5138405	5138410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658186
119511	NC_009523	ACCG	2	8	5138470	5138477	25 %	0 %	25 %	50 %	148658186
119512	NC_009523	CCG	2	6	5138502	5138507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658186
119513	NC_009523	AACC	2	8	5138544	5138551	50 %	0 %	0 %	50 %	148658186
119514	NC_009523	A	7	7	5138737	5138743	100 %	0 %	0 %	0 %	148658186
119515	NC_009523	GAT	3	9	5138773	5138781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658186
119516	NC_009523	TG	3	6	5138800	5138805	0 %	50 %	50 %	0 %	148658186
119517	NC_009523	TCC	2	6	5138871	5138876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119518	NC_009523	CGC	2	6	5139023	5139028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658187
119519	NC_009523	CTG	2	6	5139029	5139034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658187
119520	NC_009523	CTG	2	6	5139148	5139153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658187
119521	NC_009523	TGC	2	6	5139195	5139200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658187
119522	NC_009523	CAA	2	6	5139248	5139253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658187
119523	NC_009523	CGC	2	6	5139255	5139260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658187
119524	NC_009523	GCG	2	6	5139342	5139347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658188
119525	NC_009523	CAT	2	6	5139359	5139364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658188
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119527	NC_009523	CG	3	6	5139437	5139442	0 %	0 %	50 %	50 %	148658188
119528	NC_009523	GTCG	2	8	5139465	5139472	0 %	25 %	50 %	25 %	148658188
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119532	NC_009523	GC	3	6	5139600	5139605	0 %	0 %	50 %	50 %	148658188
119533	NC_009523	CG	4	8	5139611	5139618	0 %	0 %	50 %	50 %	148658188
119534	NC_009523	CA	3	6	5139631	5139636	50 %	0 %	0 %	50 %	148658188
119535	NC_009523	GT	3	6	5139649	5139654	0 %	50 %	50 %	0 %	148658188
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119537	NC_009523	CGC	2	6	5139713	5139718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119538	NC_009523	GC	4	8	5139743	5139750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119539	NC_009523	TTCAGC	2	12	5139759	5139770	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119540	NC_009523	GTCG	2	8	5139819	5139826	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119541	NC_009523	CGA	2	6	5139856	5139861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119542	NC_009523	CGG	2	6	5139866	5139871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119543	NC_009523	ATA	2	6	5139912	5139917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148658189
119544	NC_009523	ATCGAG	2	12	5139920	5139931	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148658189
119545	NC_009523	TGA	2	6	5140043	5140048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658189
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119548	NC_009523	AGC	2	6	5140192	5140197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658189
119549	NC_009523	TGC	2	6	5140203	5140208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658189
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119551	NC_009523	GACC	2	8	5140297	5140304	25 %	0 %	25 %	50 %	148658189
119552	NC_009523	GC	3	6	5140316	5140321	0 %	0 %	50 %	50 %	148658189
119553	NC_009523	CAGG	2	8	5140330	5140337	25 %	0 %	50 %	25 %	148658189
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119567	NC_009523	GT	3	6	5140943	5140948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119568	NC_009523	GCA	2	6	5140949	5140954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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119571	NC_009523	GCC	2	6	5141159	5141164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658190
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119583	NC_009523	CGA	2	6	5141566	5141571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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119585	NC_009523	CGCGC	2	10	5141610	5141619	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119586	NC_009523	CGG	2	6	5141636	5141641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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119589	NC_009523	GC	3	6	5141915	5141920	0 %	0 %	50 %	50 %	148658191
119590	NC_009523	GAC	2	6	5141969	5141974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658191
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119598	NC_009523	CAC	2	6	5142349	5142354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119599	NC_009523	AT	3	6	5142528	5142533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119600	NC_009523	GAA	2	6	5142609	5142614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658192
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119603	NC_009523	CAG	2	6	5142813	5142818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658192
119604	NC_009523	CG	3	6	5142841	5142846	0 %	0 %	50 %	50 %	148658192
119605	NC_009523	ATC	2	6	5143047	5143052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658192
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119607	NC_009523	GC	3	6	5143109	5143114	0 %	0 %	50 %	50 %	148658192
119608	NC_009523	CTA	2	6	5143205	5143210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658192
119609	NC_009523	GC	3	6	5143277	5143282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119610	NC_009523	GC	3	6	5143295	5143300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119611	NC_009523	CGC	2	6	5143325	5143330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119612	NC_009523	GCGGGC	2	12	5143337	5143348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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119614	NC_009523	ATG	2	6	5143509	5143514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119615	NC_009523	TC	3	6	5143570	5143575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119616	NC_009523	ATGC	2	8	5143588	5143595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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119618	NC_009523	GGCG	2	8	5143665	5143672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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119850	NC_009523	GCG	2	6	5154581	5154586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658202
119851	NC_009523	CGA	2	6	5154595	5154600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658202
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119853	NC_009523	GCT	2	6	5154619	5154624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658202
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119883	NC_009523	CTG	2	6	5155694	5155699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658203
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119893	NC_009523	GCG	2	6	5156024	5156029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658204
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