MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 134769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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100003	NC_009523	TGC	2	6	4303012	4303017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657533
100004	NC_009523	CG	3	6	4303072	4303077	0 %	0 %	50 %	50 %	148657533
100005	NC_009523	GC	3	6	4303113	4303118	0 %	0 %	50 %	50 %	148657533
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100100	NC_009523	TTGCA	2	10	4307273	4307282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100101	NC_009523	CCGT	2	8	4307332	4307339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100102	NC_009523	TCG	2	6	4307368	4307373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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100114	NC_009523	GCC	2	6	4308126	4308131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148657537
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100233	NC_009523	GCA	2	6	4313513	4313518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148657541
100234	NC_009523	CGCGC	2	10	4313564	4313573	0 %	0 %	40 %	60 %	148657541
100235	NC_009523	CGT	2	6	4313574	4313579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657541
100236	NC_009523	CTCGAA	2	12	4313622	4313633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148657541
100237	NC_009523	AAT	2	6	4313646	4313651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148657541
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100239	NC_009523	ATC	2	6	4313723	4313728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148657541
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100245	NC_009523	CGA	2	6	4314262	4314267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148657541
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100248	NC_009523	TGC	2	6	4314403	4314408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657541
100249	NC_009523	ATC	2	6	4314483	4314488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148657541
100250	NC_009523	GGC	2	6	4314504	4314509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148657541
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100255	NC_009523	TGTCG	2	10	4314696	4314705	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100256	NC_009523	G	9	9	4314728	4314736	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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100258	NC_009523	AAT	2	6	4314785	4314790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100259	NC_009523	CCG	2	6	4315096	4315101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100260	NC_009523	CCG	2	6	4315202	4315207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100261	NC_009523	GCC	2	6	4315276	4315281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100262	NC_009523	CCG	2	6	4315375	4315380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100263	NC_009523	CCG	2	6	4315442	4315447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100264	NC_009523	CCG	2	6	4315509	4315514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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100297	NC_009523	GCA	2	6	4316649	4316654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148657542
100298	NC_009523	CAG	2	6	4316700	4316705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148657542
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100300	NC_009523	CGA	2	6	4316836	4316841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148657542
100301	NC_009523	ATC	2	6	4316933	4316938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148657542
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100312	NC_009523	GCG	2	6	4317344	4317349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148657542
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100315	NC_009523	TCGG	2	8	4317566	4317573	0 %	25 %	50 %	25 %	148657542
100316	NC_009523	CAT	2	6	4317660	4317665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148657542
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100321	NC_009523	CTC	2	6	4317877	4317882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148657542
100322	NC_009523	TCGT	2	8	4317917	4317924	0 %	50 %	25 %	25 %	148657542
100323	NC_009523	GGC	2	6	4317952	4317957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148657542
100324	NC_009523	TGC	2	6	4317966	4317971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657542
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100326	NC_009523	CGA	2	6	4318094	4318099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100327	NC_009523	CATCA	2	10	4318130	4318139	40 %	20 %	0 %	40 %	148657543
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100329	NC_009523	TGC	2	6	4318176	4318181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657543
100330	NC_009523	CGA	2	6	4318197	4318202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148657543
100331	NC_009523	CCG	2	6	4318211	4318216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148657543
100332	NC_009523	GC	3	6	4318233	4318238	0 %	0 %	50 %	50 %	148657543
100333	NC_009523	GGAT	2	8	4318243	4318250	25 %	25 %	50 %	0 %	148657543
100334	NC_009523	TCC	2	6	4318261	4318266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148657543
100335	NC_009523	GTC	2	6	4318282	4318287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657543
100336	NC_009523	CGG	2	6	4318307	4318312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148657543
100337	NC_009523	CCCG	2	8	4318386	4318393	0 %	0 %	25 %	75 %	148657543
100338	NC_009523	GCA	2	6	4318394	4318399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148657543
100339	NC_009523	ACG	2	6	4318468	4318473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148657543
100340	NC_009523	CTG	2	6	4318499	4318504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657543
100341	NC_009523	AGA	2	6	4318526	4318531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148657543
100342	NC_009523	TCT	2	6	4318541	4318546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148657543
100343	NC_009523	GGC	2	6	4318638	4318643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148657543
100344	NC_009523	TGC	2	6	4318652	4318657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657543
100345	NC_009523	CGAT	2	8	4318670	4318677	25 %	25 %	25 %	25 %	148657543
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100462	NC_009523	GC	3	6	4323547	4323552	0 %	0 %	50 %	50 %	148657548
100463	NC_009523	TCC	2	6	4323553	4323558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148657548
100464	NC_009523	GCC	2	6	4323571	4323576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148657548
100465	NC_009523	CTG	2	6	4323584	4323589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148657548
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