MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA05

Total Repeats: 313

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009433	TTC	2	6	5	10	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009433	TGCC	2	8	49	56	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009433	CCG	2	6	164	169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280385
4	NC_009433	CGC	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280385
5	NC_009433	GC	3	6	224	229	0 %	0 %	50 %	50 %	146280385
6	NC_009433	CAC	2	6	273	278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280385
7	NC_009433	AGA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280385
8	NC_009433	T	6	6	344	349	0 %	100 %	0 %	0 %	146280385
9	NC_009433	CTA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280385
10	NC_009433	CGG	2	6	403	408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
11	NC_009433	TCG	2	6	425	430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280385
12	NC_009433	GAT	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280385
13	NC_009433	TGA	2	6	473	478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280385
14	NC_009433	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
15	NC_009433	TTC	2	6	496	501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280385
16	NC_009433	GCG	2	6	521	526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
17	NC_009433	CCGC	2	8	550	557	0 %	0 %	25 %	75 %	146280385
18	NC_009433	CG	3	6	704	709	0 %	0 %	50 %	50 %	146280385
19	NC_009433	GCG	2	6	727	732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280385
20	NC_009433	TTC	3	9	763	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280385
21	NC_009433	AGC	2	6	933	938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009433	CGC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009433	CGCGG	2	10	1077	1086	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_009433	CTC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009433	GCC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009433	CA	3	6	1209	1214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009433	GC	3	6	1226	1231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009433	AGT	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009433	TC	4	8	1261	1268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009433	T	6	6	1325	1330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009433	GA	3	6	1339	1344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009433	GTC	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009433	TC	3	6	1381	1386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009433	AGA	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009433	CAT	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009433	CCA	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009433	GA	3	6	1536	1541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009433	GAG	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009433	CG	3	6	1586	1591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009433	GCC	2	6	1626	1631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009433	AGT	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009433	AGA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009433	TCA	2	6	1693	1698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009433	GAT	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009433	CT	3	6	1892	1897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009433	CCT	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_009433	GCC	2	6	1930	1935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009433	TTC	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009433	GAA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009433	GAGG	2	8	2022	2029	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009433	CCCCT	2	10	2099	2108	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
52	NC_009433	AGGG	2	8	2121	2128	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009433	ATC	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280386
54	NC_009433	GGC	2	6	2231	2236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280386
55	NC_009433	GCC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280386
56	NC_009433	TCG	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280386
57	NC_009433	GAC	2	6	2291	2296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280386
58	NC_009433	GC	3	6	2318	2323	0 %	0 %	50 %	50 %	146280386
59	NC_009433	TGT	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280386
60	NC_009433	GGC	3	9	2358	2366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280386
61	NC_009433	G	6	6	2378	2383	0 %	0 %	100 %	0 %	146280386
62	NC_009433	GTC	2	6	2426	2431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280386
63	NC_009433	GGA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280386
64	NC_009433	A	7	7	2530	2536	100 %	0 %	0 %	0 %	146280386
65	NC_009433	CG	3	6	2548	2553	0 %	0 %	50 %	50 %	146280386
66	NC_009433	CGC	2	6	2556	2561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280386
67	NC_009433	GCAAG	2	10	2634	2643	40 %	0 %	40 %	20 %	146280387
68	NC_009433	CGG	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280387
69	NC_009433	GC	3	6	2716	2721	0 %	0 %	50 %	50 %	146280387
70	NC_009433	CGG	2	6	2737	2742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280387
71	NC_009433	CTG	3	9	2833	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280387
72	NC_009433	ACG	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280387
73	NC_009433	CTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280387
74	NC_009433	TCA	2	6	2972	2977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
75	NC_009433	ATC	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
76	NC_009433	GC	3	6	3009	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	146280387
77	NC_009433	GTG	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280387
78	NC_009433	CAT	2	6	3054	3059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280387
79	NC_009433	CGC	2	6	3076	3081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280387
80	NC_009433	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280387
81	NC_009433	CGCC	2	8	3165	3172	0 %	0 %	25 %	75 %	146280387
82	NC_009433	ACC	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280387
83	NC_009433	AACCGC	2	12	3396	3407	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146280387
84	NC_009433	A	6	6	3471	3476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009433	GA	3	6	3499	3504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009433	CAC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_009433	TCAC	2	8	3578	3585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009433	AACG	2	8	3586	3593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009433	GCAAC	2	10	3603	3612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_009433	GAG	2	6	3639	3644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009433	CAG	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009433	TCA	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009433	CATGG	2	10	3709	3718	20 %	20 %	40 %	20 %	146280388
94	NC_009433	GCG	2	6	3726	3731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280388
95	NC_009433	AGC	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
96	NC_009433	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280388
97	NC_009433	GGA	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280388
98	NC_009433	GCC	2	6	3818	3823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280388
99	NC_009433	CTG	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280388
100	NC_009433	GAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
101	NC_009433	AGC	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280388
102	NC_009433	CGG	2	6	4089	4094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280388
103	NC_009433	GCGG	2	8	4185	4192	0 %	0 %	75 %	25 %	146280388
104	NC_009433	TC	3	6	4280	4285	0 %	50 %	0 %	50 %	146280388
105	NC_009433	TTTG	2	8	4361	4368	0 %	75 %	25 %	0 %	146280389
106	NC_009433	CTT	3	9	4378	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280389
107	NC_009433	GGC	2	6	4404	4409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280389
108	NC_009433	GGA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280389
109	NC_009433	TTGC	2	8	4474	4481	0 %	50 %	25 %	25 %	146280389
110	NC_009433	CCG	2	6	4505	4510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280389
111	NC_009433	CTGG	2	8	4518	4525	0 %	25 %	50 %	25 %	146280389
112	NC_009433	GAT	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280389
113	NC_009433	GCAGGT	2	12	4579	4590	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146280389
114	NC_009433	TTG	2	6	4622	4627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280389
115	NC_009433	AAG	2	6	4696	4701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009433	GCCG	2	8	4748	4755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009433	TC	3	6	4757	4762	0 %	50 %	0 %	50 %	146280390
118	NC_009433	CTG	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
119	NC_009433	TTC	2	6	4810	4815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280390
120	NC_009433	CGT	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
121	NC_009433	GCC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280390
122	NC_009433	CAT	2	6	4890	4895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280390
123	NC_009433	C	6	6	4960	4965	0 %	0 %	0 %	100 %	146280390
124	NC_009433	GGA	2	6	4975	4980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280390
125	NC_009433	CGT	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
126	NC_009433	TCT	2	6	5039	5044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280390
127	NC_009433	CGT	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280390
128	NC_009433	CCT	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280390
129	NC_009433	GGC	2	6	5244	5249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280390
130	NC_009433	GCG	2	6	5301	5306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280390
131	NC_009433	GGCG	2	8	5345	5352	0 %	0 %	75 %	25 %	146280390
132	NC_009433	GCG	2	6	5364	5369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
133	NC_009433	GCA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280391
134	NC_009433	GGC	2	6	5522	5527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
135	NC_009433	GC	3	6	5526	5531	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
136	NC_009433	CCG	2	6	5535	5540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
137	NC_009433	GC	3	6	5722	5727	0 %	0 %	50 %	50 %	146280391
138	NC_009433	TGC	2	6	5786	5791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280391
139	NC_009433	GCG	2	6	5799	5804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280391
140	NC_009433	GAA	2	6	5936	5941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280391
141	NC_009433	CAA	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280391
142	NC_009433	CGC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280391
143	NC_009433	CCCGG	2	10	6083	6092	0 %	0 %	40 %	60 %	146280391
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275	NC_009433	CGC	2	6	11722	11727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280395
276	NC_009433	GCTC	2	8	11736	11743	0 %	25 %	25 %	50 %	146280395
277	NC_009433	GCA	3	9	11757	11765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280395
278	NC_009433	CGGCTC	2	12	11805	11816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146280395
279	NC_009433	ATC	2	6	11851	11856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280395
280	NC_009433	GAT	3	9	11857	11865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280395
281	NC_009433	GCA	2	6	11868	11873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280395
282	NC_009433	GTCC	2	8	11923	11930	0 %	25 %	25 %	50 %	146280395
283	NC_009433	GAA	2	6	11931	11936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280395
284	NC_009433	GGC	2	6	11940	11945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280395
285	NC_009433	CAAGG	2	10	12006	12015	40 %	0 %	40 %	20 %	146280395
286	NC_009433	AAG	2	6	12127	12132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280395
287	NC_009433	CATG	3	12	12193	12204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
288	NC_009433	GAG	2	6	12254	12259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009433	ATG	2	6	12333	12338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280396
290	NC_009433	CGG	2	6	12356	12361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280396
291	NC_009433	CAG	3	9	12393	12401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280396
292	NC_009433	CGG	2	6	12423	12428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280396
293	NC_009433	CGC	2	6	12497	12502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280396
294	NC_009433	GC	3	6	12501	12506	0 %	0 %	50 %	50 %	146280396
295	NC_009433	GAT	2	6	12609	12614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280396
296	NC_009433	CGT	2	6	12626	12631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280396
297	NC_009433	GAC	2	6	12695	12700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280396
298	NC_009433	GCG	2	6	12723	12728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280396
299	NC_009433	CGC	3	9	12963	12971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_009433	CG	3	6	13006	13011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
301	NC_009433	GAA	2	6	13120	13125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_009433	GAA	3	9	13226	13234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_009433	GTT	2	6	13246	13251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_009433	GCC	2	6	13269	13274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
305	NC_009433	CCA	2	6	13333	13338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
306	NC_009433	ACC	2	6	13391	13396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
307	NC_009433	TCC	2	6	13415	13420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
308	NC_009433	TC	3	6	13464	13469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_009433	ATC	2	6	13498	13503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_009433	TCA	2	6	13588	13593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
311	NC_009433	CAG	3	9	13676	13684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_009433	GAC	2	6	13687	13692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_009433	GCGT	2	8	13708	13715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.