MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA04

Total Repeats: 860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009432	CAG	2	6	49	54	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009432	TCC	2	6	80	85	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009432	CT	3	6	86	91	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009432	GCAA	2	8	148	155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009432	CTT	2	6	161	166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009432	G	6	6	178	183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009432	G	9	9	198	206	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009432	C	7	7	214	220	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_009432	GCTG	2	8	427	434	0 %	25 %	50 %	25 %	146280353
10	NC_009432	GCC	2	6	514	519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
11	NC_009432	GCT	2	6	520	525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280353
12	NC_009432	GCG	2	6	535	540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280353
13	NC_009432	GCC	2	6	566	571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
14	NC_009432	CGAC	2	8	580	587	25 %	0 %	25 %	50 %	146280353
15	NC_009432	GCG	3	9	632	640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280353
16	NC_009432	GCGCCC	2	12	648	659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
17	NC_009432	CCAG	2	8	670	677	25 %	0 %	25 %	50 %	146280353
18	NC_009432	GTGAAC	2	12	734	745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146280353
19	NC_009432	GAG	2	6	806	811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280353
20	NC_009432	CTGCG	2	10	837	846	0 %	20 %	40 %	40 %	146280353
21	NC_009432	TTC	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280353
22	NC_009432	CGC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
23	NC_009432	GCC	2	6	873	878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280353
24	NC_009432	AGG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280354
25	NC_009432	CTTGG	2	10	999	1008	0 %	40 %	40 %	20 %	146280354
26	NC_009432	AGGGG	2	10	1031	1040	20 %	0 %	80 %	0 %	146280354
27	NC_009432	G	6	6	1037	1042	0 %	0 %	100 %	0 %	146280354
28	NC_009432	CCTGT	2	10	1083	1092	0 %	40 %	20 %	40 %	146280354
29	NC_009432	CGC	2	6	1128	1133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
30	NC_009432	GC	3	6	1132	1137	0 %	0 %	50 %	50 %	146280354
31	NC_009432	GTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280354
32	NC_009432	GCCA	2	8	1163	1170	25 %	0 %	25 %	50 %	146280354
33	NC_009432	GGC	2	6	1229	1234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
34	NC_009432	AGCTGG	2	12	1264	1275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146280354
35	NC_009432	GCC	2	6	1314	1319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
36	NC_009432	TGGA	2	8	1335	1342	25 %	25 %	50 %	0 %	146280354
37	NC_009432	ACG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280354
38	NC_009432	ATGGC	2	10	1366	1375	20 %	20 %	40 %	20 %	146280354
39	NC_009432	TCT	2	6	1408	1413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280354
40	NC_009432	CG	3	6	1458	1463	0 %	0 %	50 %	50 %	146280354
41	NC_009432	GGC	2	6	1486	1491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
42	NC_009432	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280354
43	NC_009432	CGC	2	6	1689	1694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
44	NC_009432	CGG	2	6	1761	1766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
45	NC_009432	GCCG	2	8	1794	1801	0 %	0 %	50 %	50 %	146280354
46	NC_009432	AGC	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280354
47	NC_009432	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280354
48	NC_009432	GCC	2	6	1857	1862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280354
49	NC_009432	GCCGCG	2	12	1866	1877	0 %	0 %	50 %	50 %	146280354
50	NC_009432	GCTCTC	2	12	1985	1996	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	146280354
51	NC_009432	GGCCG	2	10	2092	2101	0 %	0 %	60 %	40 %	146280354
52	NC_009432	GCG	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009432	CTG	2	6	2150	2155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009432	CCAA	2	8	2220	2227	50 %	0 %	0 %	50 %	146280355
55	NC_009432	CAT	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280355
56	NC_009432	GA	6	12	2368	2379	50 %	0 %	50 %	0 %	146280355
57	NC_009432	TAGA	2	8	2485	2492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009432	ATC	2	6	2494	2499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009432	TGG	2	6	2505	2510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009432	GGA	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009432	GAC	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009432	AAGA	2	8	2669	2676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009432	CG	3	6	2703	2708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009432	GC	3	6	2726	2731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009432	CAG	2	6	2752	2757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009432	AG	3	6	2791	2796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009432	AAG	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009432	AAGG	2	8	2894	2901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009432	AAG	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009432	GGT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009432	CGA	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009432	CGA	2	6	3089	3094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009432	CG	3	6	3111	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009432	GC	3	6	3144	3149	0 %	0 %	50 %	50 %	146280356
75	NC_009432	T	6	6	3171	3176	0 %	100 %	0 %	0 %	146280356
76	NC_009432	GC	3	6	3194	3199	0 %	0 %	50 %	50 %	146280356
77	NC_009432	CGA	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
78	NC_009432	GCG	2	6	3289	3294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280356
79	NC_009432	TGG	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280356
80	NC_009432	GAG	2	6	3543	3548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
81	NC_009432	AGC	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
82	NC_009432	TCT	2	6	3584	3589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
83	NC_009432	GCC	3	9	3604	3612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
84	NC_009432	GCT	2	6	3626	3631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
85	NC_009432	GC	3	6	3684	3689	0 %	0 %	50 %	50 %	146280356
86	NC_009432	AGC	2	6	3760	3765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
87	NC_009432	CAAG	2	8	3794	3801	50 %	0 %	25 %	25 %	146280356
88	NC_009432	AGC	2	6	3822	3827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
89	NC_009432	GCTA	2	8	3834	3841	25 %	25 %	25 %	25 %	146280356
90	NC_009432	GGC	2	6	3892	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280356
91	NC_009432	GCC	2	6	3963	3968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
92	NC_009432	CGC	2	6	3982	3987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
93	NC_009432	GGA	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
94	NC_009432	ATGG	2	8	4144	4151	25 %	25 %	50 %	0 %	146280356
95	NC_009432	CT	3	6	4178	4183	0 %	50 %	0 %	50 %	146280356
96	NC_009432	GCC	2	6	4233	4238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
97	NC_009432	TG	3	6	4258	4263	0 %	50 %	50 %	0 %	146280356
98	NC_009432	GGA	2	6	4277	4282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280356
99	NC_009432	GCT	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
100	NC_009432	ATG	2	6	4513	4518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280356
101	NC_009432	CTT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
102	NC_009432	TAG	2	6	4546	4551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280356
103	NC_009432	GACG	2	8	4734	4741	25 %	0 %	50 %	25 %	146280356
104	NC_009432	GC	3	6	4772	4777	0 %	0 %	50 %	50 %	146280356
105	NC_009432	CCG	2	6	4780	4785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280356
106	NC_009432	TAC	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280356
107	NC_009432	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
108	NC_009432	AT	3	6	4855	4860	50 %	50 %	0 %	0 %	146280356
109	NC_009432	CCT	2	6	4871	4876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280356
110	NC_009432	TCT	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280356
111	NC_009432	CTG	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
112	NC_009432	CAT	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280356
113	NC_009432	AAG	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280356
114	NC_009432	ACAG	2	8	5288	5295	50 %	0 %	25 %	25 %	146280356
115	NC_009432	CGA	3	9	5390	5398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280356
116	NC_009432	TCG	2	6	5428	5433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280356
117	NC_009432	CGGCT	2	10	5469	5478	0 %	20 %	40 %	40 %	146280356
118	NC_009432	GC	3	6	5900	5905	0 %	0 %	50 %	50 %	146280357
119	NC_009432	TCG	2	6	6096	6101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
120	NC_009432	GAA	2	6	6103	6108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280357
121	NC_009432	CGA	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280357
122	NC_009432	TCGA	2	8	6133	6140	25 %	25 %	25 %	25 %	146280357
123	NC_009432	GTC	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
124	NC_009432	GC	3	6	6161	6166	0 %	0 %	50 %	50 %	146280357
125	NC_009432	ACGA	2	8	6260	6267	50 %	0 %	25 %	25 %	146280357
126	NC_009432	GGC	2	6	6298	6303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280357
127	NC_009432	CAT	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280357
128	NC_009432	TGC	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280357
129	NC_009432	GCG	2	6	6349	6354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280357
130	NC_009432	ATC	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280357
131	NC_009432	GAG	2	6	6406	6411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280357
132	NC_009432	TGGT	2	8	6444	6451	0 %	50 %	50 %	0 %	146280357
133	NC_009432	GC	3	6	6493	6498	0 %	0 %	50 %	50 %	146280357
134	NC_009432	CCA	2	6	6519	6524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280357
135	NC_009432	TGAT	2	8	6551	6558	25 %	50 %	25 %	0 %	146280357
136	NC_009432	ATT	2	6	6606	6611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009432	GCT	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009432	CTG	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009432	TGG	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009432	TC	3	6	6815	6820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009432	TTA	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146280358
142	NC_009432	TAT	2	6	6878	6883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146280358
143	NC_009432	TCG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280358
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147	NC_009432	GAG	2	6	7101	7106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280358
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149	NC_009432	T	6	6	7154	7159	0 %	100 %	0 %	0 %	146280358
150	NC_009432	GATC	2	8	7184	7191	25 %	25 %	25 %	25 %	146280358
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174	NC_009432	GCA	2	6	8312	8317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280359
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258	NC_009432	GCTCC	2	10	12156	12165	0 %	20 %	20 %	60 %	146280363
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266	NC_009432	CAG	2	6	12330	12335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280363
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268	NC_009432	AGGC	2	8	12563	12570	25 %	0 %	50 %	25 %	146280363
269	NC_009432	CCG	2	6	12581	12586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280363
270	NC_009432	GAA	2	6	12675	12680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280363
271	NC_009432	GTT	2	6	12711	12716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146280363
272	NC_009432	CGG	2	6	12751	12756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280363
273	NC_009432	CGAAGT	2	12	12764	12775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146280363
274	NC_009432	GAG	2	6	12798	12803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280363
275	NC_009432	GCC	2	6	12917	12922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280363
276	NC_009432	TCG	2	6	12937	12942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280363
277	NC_009432	GTCAGC	2	12	12976	12987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146280363
278	NC_009432	CGA	2	6	13052	13057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280363
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283	NC_009432	CCT	2	6	13229	13234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280363
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286	NC_009432	CTT	2	6	13278	13283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280363
287	NC_009432	GAC	2	6	13293	13298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280363
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290	NC_009432	C	6	6	13389	13394	0 %	0 %	0 %	100 %	146280363
291	NC_009432	CTT	2	6	13428	13433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280363
292	NC_009432	GCG	2	6	13499	13504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280363
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294	NC_009432	GCCG	2	8	13554	13561	0 %	0 %	50 %	50 %	146280363
295	NC_009432	CG	3	6	13579	13584	0 %	0 %	50 %	50 %	146280363
296	NC_009432	GCC	2	6	13588	13593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280363
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304	NC_009432	CGA	2	6	13886	13891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280363
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311	NC_009432	CGGC	2	8	14046	14053	0 %	0 %	50 %	50 %	146280364
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396	NC_009432	GCAG	2	8	16882	16889	25 %	0 %	50 %	25 %	146280366
397	NC_009432	AGA	2	6	16893	16898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280366
398	NC_009432	CAT	2	6	16910	16915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280366
399	NC_009432	ACC	2	6	16919	16924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280367
400	NC_009432	TCGAAC	2	12	17006	17017	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	146280367
401	NC_009432	TCG	2	6	17022	17027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280367
402	NC_009432	CTT	2	6	17044	17049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280367
403	NC_009432	CGGATG	2	12	17126	17137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146280367
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417	NC_009432	TCG	2	6	17678	17683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_009432	GGA	2	6	17700	17705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_009432	GCT	2	6	17733	17738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_009432	GCC	2	6	17743	17748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
422	NC_009432	AGA	2	6	17767	17772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_009432	ATG	2	6	17773	17778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_009432	GGCC	2	8	17821	17828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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440	NC_009432	CAC	2	6	18256	18261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280368
441	NC_009432	ACC	2	6	18299	18304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280368
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