MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA03

Total Repeats: 3116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009431	GGC	3	9	118604	118612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
3002	NC_009431	GGC	3	9	118616	118624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
3003	NC_009431	GCG	2	6	118635	118640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
3004	NC_009431	ACG	2	6	118650	118655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280349
3005	NC_009431	CTG	2	6	118662	118667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
3006	NC_009431	GCCC	2	8	118677	118684	0 %	0 %	25 %	75 %	146280349
3007	NC_009431	CGC	2	6	118697	118702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
3008	NC_009431	GGA	2	6	118706	118711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280349
3009	NC_009431	GAC	2	6	118712	118717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280349
3010	NC_009431	CGC	2	6	118727	118732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
3011	NC_009431	GC	4	8	118748	118755	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
3012	NC_009431	CGG	2	6	118762	118767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
3013	NC_009431	CGG	2	6	118777	118782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
3014	NC_009431	CGGG	2	8	118794	118801	0 %	0 %	75 %	25 %	146280349
3015	NC_009431	GCT	2	6	118808	118813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
3016	NC_009431	CTG	2	6	118827	118832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
3017	NC_009431	GC	3	6	118927	118932	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
3018	NC_009431	TGC	2	6	118942	118947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
3019	NC_009431	CG	3	6	118957	118962	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
3020	NC_009431	GGC	2	6	118973	118978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
3021	NC_009431	CGCC	2	8	119057	119064	0 %	0 %	25 %	75 %	146280349
3022	NC_009431	GCT	2	6	119075	119080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
3023	NC_009431	GCC	2	6	119098	119103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
3024	NC_009431	C	8	8	119125	119132	0 %	0 %	0 %	100 %	146280349
3025	NC_009431	GCG	2	6	119138	119143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
3026	NC_009431	CTG	2	6	119226	119231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
3027	NC_009431	GC	3	6	119327	119332	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3028	NC_009431	CTGG	2	8	119353	119360	0 %	25 %	50 %	25 %	146280350
3029	NC_009431	GC	3	6	119364	119369	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3030	NC_009431	CTGCGC	2	12	119384	119395	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146280350
3031	NC_009431	CG	3	6	119414	119419	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3032	NC_009431	GCCGAG	2	12	119471	119482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280350
3033	NC_009431	CGGG	2	8	119520	119527	0 %	0 %	75 %	25 %	146280350
3034	NC_009431	GGC	2	6	119551	119556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280350
3035	NC_009431	GCC	2	6	119570	119575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3036	NC_009431	GCC	2	6	119580	119585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3037	NC_009431	GGCCGA	2	12	119632	119643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280350
3038	NC_009431	CTG	2	6	119651	119656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3039	NC_009431	CGGCGC	2	12	119667	119678	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3040	NC_009431	CGC	2	6	119729	119734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3041	NC_009431	GCT	2	6	119761	119766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3042	NC_009431	CGC	2	6	119812	119817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3043	NC_009431	GCT	2	6	119836	119841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3044	NC_009431	CGA	2	6	119887	119892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3045	NC_009431	GGT	2	6	119896	119901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280350
3046	NC_009431	CTG	3	9	119906	119914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3047	NC_009431	GC	3	6	119916	119921	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3048	NC_009431	GCC	2	6	119929	119934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3049	NC_009431	TGC	2	6	119943	119948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3050	NC_009431	G	6	6	119959	119964	0 %	0 %	100 %	0 %	146280350
3051	NC_009431	CCG	2	6	120015	120020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3052	NC_009431	GC	3	6	120038	120043	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3053	NC_009431	CTG	2	6	120059	120064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3054	NC_009431	CGGC	2	8	120073	120080	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3055	NC_009431	CTG	2	6	120086	120091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3056	NC_009431	CCGCG	2	10	120103	120112	0 %	0 %	40 %	60 %	146280350
3057	NC_009431	GTG	2	6	120134	120139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280350
3058	NC_009431	GC	3	6	120156	120161	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3059	NC_009431	GC	3	6	120166	120171	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3060	NC_009431	CGC	2	6	120180	120185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3061	NC_009431	AGG	2	6	120234	120239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280350
3062	NC_009431	GCGG	2	8	120247	120254	0 %	0 %	75 %	25 %	146280350
3063	NC_009431	GCT	2	6	120307	120312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3064	NC_009431	GC	3	6	120335	120340	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3065	NC_009431	GC	3	6	120374	120379	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3066	NC_009431	CCG	2	6	120426	120431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3067	NC_009431	GCA	2	6	120439	120444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3068	NC_009431	CGG	2	6	120449	120454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280350
3069	NC_009431	GGA	2	6	120475	120480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280350
3070	NC_009431	TGC	2	6	120486	120491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3071	NC_009431	CG	4	8	120501	120508	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3072	NC_009431	GGC	3	9	120643	120651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280350
3073	NC_009431	GAA	2	6	120733	120738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280350
3074	NC_009431	GCC	2	6	120758	120763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3075	NC_009431	GCT	2	6	120778	120783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3076	NC_009431	TTC	2	6	120785	120790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280350
3077	NC_009431	CTG	2	6	120872	120877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3078	NC_009431	CCA	2	6	120915	120920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280350
3079	NC_009431	GCG	2	6	120952	120957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280350
3080	NC_009431	CG	3	6	121004	121009	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3081	NC_009431	TCG	2	6	121031	121036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3082	NC_009431	GC	3	6	121065	121070	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3083	NC_009431	CTG	2	6	121111	121116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3084	NC_009431	CGC	2	6	121123	121128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
3085	NC_009431	CG	4	8	121141	121148	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
3086	NC_009431	GGC	2	6	121186	121191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280350
3087	NC_009431	GCT	2	6	121195	121200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
3088	NC_009431	GAA	2	6	121219	121224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280350
3089	NC_009431	GAT	2	6	121290	121295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280351
3090	NC_009431	GCC	2	6	121308	121313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280351
3091	NC_009431	AG	3	6	121333	121338	50 %	0 %	50 %	0 %	146280351
3092	NC_009431	TGC	2	6	121361	121366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280351
3093	NC_009431	CCG	2	6	121367	121372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280351
3094	NC_009431	GGC	2	6	121386	121391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280351
3095	NC_009431	GCG	2	6	121399	121404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280351
3096	NC_009431	CG	4	8	121437	121444	0 %	0 %	50 %	50 %	146280351
3097	NC_009431	CGG	2	6	121466	121471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280351
3098	NC_009431	CGG	2	6	121484	121489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280351
3099	NC_009431	GGCA	2	8	121499	121506	25 %	0 %	50 %	25 %	146280351
3100	NC_009431	GGCA	2	8	121535	121542	25 %	0 %	50 %	25 %	146280351
3101	NC_009431	GGC	2	6	121571	121576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280351
3102	NC_009431	GGCCGA	2	12	121599	121610	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280351
3103	NC_009431	GGCGC	2	10	121611	121620	0 %	0 %	60 %	40 %	146280351
3104	NC_009431	CGG	2	6	121621	121626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280351
3105	NC_009431	GC	3	6	121643	121648	0 %	0 %	50 %	50 %	146280351
3106	NC_009431	GGC	2	6	121710	121715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280351
3107	NC_009431	GCC	2	6	121738	121743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280351
3108	NC_009431	TGG	2	6	121751	121756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280351
3109	NC_009431	GC	3	6	121821	121826	0 %	0 %	50 %	50 %	146280351
3110	NC_009431	CG	3	6	121849	121854	0 %	0 %	50 %	50 %	146280351
3111	NC_009431	GCG	2	6	121891	121896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280351
3112	NC_009431	CCG	2	6	121897	121902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280351
3113	NC_009431	CGC	2	6	121907	121912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280351
3114	NC_009431	C	6	6	121915	121920	0 %	0 %	0 %	100 %	146280351
3115	NC_009431	CCG	2	6	121924	121929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280351
3116	NC_009431	GC	3	6	121948	121953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.