MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 21852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009429	CCGGA	2	10	638325	638334	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16002	NC_009429	GAGC	2	8	638338	638345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16003	NC_009429	TCC	2	6	638361	638366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16004	NC_009429	TCT	2	6	638388	638393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_009429	ATG	2	6	638443	638448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_009429	GCG	2	6	638449	638454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_009429	GGC	2	6	638457	638462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_009429	GCC	2	6	638511	638516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16009	NC_009429	CTG	2	6	638540	638545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_009429	GC	4	8	638558	638565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16011	NC_009429	CTG	2	6	638651	638656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_009429	TCG	2	6	638709	638714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_009429	CCG	2	6	638716	638721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16014	NC_009429	CG	3	6	638840	638845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16015	NC_009429	CGG	3	9	638857	638865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_009429	CCT	2	6	638887	638892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16017	NC_009429	GAAG	2	8	638899	638906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_009429	CGT	2	6	638914	638919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_009429	TCC	2	6	638973	638978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16020	NC_009429	TCC	2	6	638997	639002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_009429	GCC	2	6	639081	639086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_009429	GTT	2	6	639104	639109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_009429	CGC	2	6	639163	639168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16024	NC_009429	AGGC	2	8	639197	639204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16025	NC_009429	CGC	2	6	639230	639235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16026	NC_009429	GAG	2	6	639272	639277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_009429	TGT	2	6	639298	639303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_009429	GCG	2	6	639334	639339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16029	NC_009429	GGC	2	6	639566	639571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_009429	CCG	2	6	639684	639689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16031	NC_009429	CGC	2	6	639703	639708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16032	NC_009429	GCC	3	9	639723	639731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16033	NC_009429	ACG	2	6	639767	639772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_009429	GCA	2	6	639904	639909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_009429	TGA	2	6	639985	639990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_009429	CAG	2	6	640019	640024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_009429	GTC	2	6	640028	640033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_009429	TGT	2	6	640064	640069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_009429	CCT	2	6	640258	640263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16040	NC_009429	CAG	2	6	640307	640312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_009429	TCG	2	6	640401	640406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_009429	GGAC	2	8	640426	640433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16043	NC_009429	GGA	2	6	640442	640447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_009429	CCT	2	6	640531	640536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16045	NC_009429	TGC	2	6	640596	640601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_009429	CGA	2	6	640663	640668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_009429	TCGCGG	2	12	640674	640685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_009429	TTC	2	6	640689	640694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_009429	TCC	2	6	640743	640748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16050	NC_009429	GCG	2	6	640779	640784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_009429	CAG	2	6	640796	640801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_009429	GCG	2	6	640802	640807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_009429	CCG	2	6	640828	640833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16054	NC_009429	CGA	2	6	640909	640914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_009429	CTG	2	6	640928	640933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_009429	TCA	2	6	641005	641010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_009429	TCG	2	6	641043	641048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_009429	CGAT	2	8	641082	641089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16059	NC_009429	TCGA	2	8	641118	641125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16060	NC_009429	CG	3	6	641193	641198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16061	NC_009429	CAG	2	6	641225	641230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_009429	TCG	2	6	641313	641318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_009429	TGG	2	6	641343	641348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_009429	TCG	2	6	641374	641379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_009429	AGC	2	6	641401	641406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_009429	CGT	2	6	641414	641419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_009429	CAG	2	6	641577	641582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16068	NC_009429	CAG	2	6	641598	641603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_009429	GAA	2	6	641622	641627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_009429	GTT	2	6	641661	641666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_009429	TCG	2	6	641722	641727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_009429	TGA	2	6	641762	641767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_009429	GTA	2	6	641863	641868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279748
16074	NC_009429	GTC	2	6	641872	641877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279748
16075	NC_009429	TGCGG	2	10	642053	642062	0 %	20 %	60 %	20 %	146279748
16076	NC_009429	CGAG	2	8	642204	642211	25 %	0 %	50 %	25 %	146279748
16077	NC_009429	CTT	2	6	642300	642305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279748
16078	NC_009429	GAA	2	6	642325	642330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279748
16079	NC_009429	GCTG	2	8	642369	642376	0 %	25 %	50 %	25 %	146279748
16080	NC_009429	GAC	2	6	642379	642384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279748
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16082	NC_009429	TCG	2	6	642544	642549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279749
16083	NC_009429	CG	3	6	642600	642605	0 %	0 %	50 %	50 %	146279749
16084	NC_009429	GAAA	2	8	642700	642707	75 %	0 %	25 %	0 %	146279749
16085	NC_009429	AAG	2	6	642814	642819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279749
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16089	NC_009429	TCC	2	6	642913	642918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279749
16090	NC_009429	GC	3	6	642922	642927	0 %	0 %	50 %	50 %	146279749
16091	NC_009429	AGC	2	6	642994	642999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279749
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16094	NC_009429	CTG	2	6	643103	643108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279750
16095	NC_009429	GCG	2	6	643125	643130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279750
16096	NC_009429	GCC	2	6	643150	643155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279750
16097	NC_009429	CAG	2	6	643361	643366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279750
16098	NC_009429	CG	3	6	643400	643405	0 %	0 %	50 %	50 %	146279750
16099	NC_009429	GCG	2	6	643441	643446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279750
16100	NC_009429	CGG	2	6	643512	643517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279750
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16102	NC_009429	TCG	2	6	643611	643616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279750
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16105	NC_009429	CAC	2	6	643916	643921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279750
16106	NC_009429	GC	3	6	643958	643963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16107	NC_009429	TTC	2	6	643978	643983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_009429	CG	3	6	643993	643998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16109	NC_009429	AAGGG	2	10	644019	644028	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_009429	GCC	2	6	644080	644085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279751
16111	NC_009429	CCG	2	6	644099	644104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279751
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16114	NC_009429	CTGG	2	8	644366	644373	0 %	25 %	50 %	25 %	146279751
16115	NC_009429	GAC	2	6	644382	644387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279751
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16118	NC_009429	GC	3	6	644499	644504	0 %	0 %	50 %	50 %	146279751
16119	NC_009429	GCA	2	6	644552	644557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279751
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16121	NC_009429	GGGC	2	8	644798	644805	0 %	0 %	75 %	25 %	146279751
16122	NC_009429	GC	3	6	644958	644963	0 %	0 %	50 %	50 %	146279751
16123	NC_009429	GCG	2	6	644965	644970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279751
16124	NC_009429	GC	3	6	644991	644996	0 %	0 %	50 %	50 %	146279751
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16491	NC_009429	CAG	2	6	661111	661116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279766
16492	NC_009429	CCA	2	6	661134	661139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279766
16493	NC_009429	GGC	3	9	661219	661227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279766
16494	NC_009429	CTGC	2	8	661290	661297	0 %	25 %	25 %	50 %	146279766
16495	NC_009429	CAG	2	6	661366	661371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279766
16496	NC_009429	CCAGCA	2	12	661377	661388	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146279766
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16498	NC_009429	CAG	2	6	661417	661422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279766
16499	NC_009429	GCG	2	6	661423	661428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279766
16500	NC_009429	GGC	2	6	661450	661455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279766

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