MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 21852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009429	GAA	2	6	512990	512995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279641
13002	NC_009429	CAG	2	6	513020	513025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279641
13003	NC_009429	GCC	4	12	513042	513053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279641
13004	NC_009429	CG	3	6	513115	513120	0 %	0 %	50 %	50 %	146279641
13005	NC_009429	GAT	2	6	513137	513142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279641
13006	NC_009429	CGC	2	6	513146	513151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279641
13007	NC_009429	CGC	2	6	513200	513205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279641
13008	NC_009429	GCG	2	6	513217	513222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279641
13009	NC_009429	TGG	2	6	513265	513270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279641
13010	NC_009429	CAG	2	6	513278	513283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279641
13011	NC_009429	CCGAG	2	10	513316	513325	20 %	0 %	40 %	40 %	146279641
13012	NC_009429	TGCCGG	2	12	513340	513351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146279641
13013	NC_009429	TCG	2	6	513430	513435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279641
13014	NC_009429	GCC	2	6	513468	513473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279641
13015	NC_009429	TCGCC	2	10	513577	513586	0 %	20 %	20 %	60 %	146279641
13016	NC_009429	AGC	2	6	513636	513641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279641
13017	NC_009429	CGC	2	6	513644	513649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279641
13018	NC_009429	AGG	2	6	513651	513656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279641
13019	NC_009429	C	6	6	513662	513667	0 %	0 %	0 %	100 %	146279641
13020	NC_009429	CAC	2	6	513677	513682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279641
13021	NC_009429	CCGT	2	8	513688	513695	0 %	25 %	25 %	50 %	146279641
13022	NC_009429	CG	3	6	513703	513708	0 %	0 %	50 %	50 %	146279641
13023	NC_009429	AGGA	2	8	513741	513748	50 %	0 %	50 %	0 %	146279641
13024	NC_009429	AGA	2	6	513769	513774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279641
13025	NC_009429	CCA	2	6	513775	513780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279641
13026	NC_009429	CAG	2	6	513800	513805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279641
13027	NC_009429	ATC	2	6	513813	513818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279641
13028	NC_009429	AGGA	2	8	513837	513844	50 %	0 %	50 %	0 %	146279641
13029	NC_009429	TAG	2	6	513879	513884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279641
13030	NC_009429	CAC	2	6	513896	513901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279641
13031	NC_009429	CCG	2	6	513906	513911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279641
13032	NC_009429	GCA	2	6	514006	514011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279641
13033	NC_009429	CCAGCA	2	12	514045	514056	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146279641
13034	NC_009429	C	6	6	514062	514067	0 %	0 %	0 %	100 %	146279641
13035	NC_009429	GCC	2	6	514089	514094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279641
13036	NC_009429	CGC	3	9	514121	514129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279641
13037	NC_009429	GC	3	6	514132	514137	0 %	0 %	50 %	50 %	146279641
13038	NC_009429	C	6	6	514199	514204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13039	NC_009429	ACC	2	6	514224	514229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13040	NC_009429	CAT	2	6	514371	514376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_009429	CGGTG	2	10	514442	514451	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13042	NC_009429	GCC	2	6	514452	514457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_009429	GCC	2	6	514482	514487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13044	NC_009429	GCC	2	6	514489	514494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_009429	AGC	2	6	514505	514510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_009429	CGGC	2	8	514637	514644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_009429	GGC	2	6	514732	514737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_009429	G	6	6	514753	514758	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_009429	GAA	2	6	514779	514784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_009429	GATCG	2	10	514788	514797	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13051	NC_009429	CCG	2	6	514838	514843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_009429	CGC	2	6	514853	514858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13053	NC_009429	CG	3	6	514865	514870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13054	NC_009429	GC	3	6	514936	514941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_009429	GGGC	2	8	514961	514968	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_009429	GATCG	2	10	514988	514997	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13057	NC_009429	GGT	2	6	515015	515020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_009429	CGA	2	6	515030	515035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_009429	CTC	2	6	515081	515086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_009429	TGG	2	6	515113	515118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_009429	CGGTCG	2	12	515122	515133	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_009429	AGC	2	6	515163	515168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_009429	TCCA	2	8	515259	515266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13064	NC_009429	GAC	2	6	515288	515293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_009429	GC	4	8	515349	515356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13066	NC_009429	G	7	7	515359	515365	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_009429	GC	3	6	515376	515381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_009429	CGGAT	2	10	515394	515403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13069	NC_009429	GGGC	2	8	515407	515414	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13070	NC_009429	GC	3	6	515525	515530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13071	NC_009429	TCGG	2	8	515532	515539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13072	NC_009429	GGT	2	6	515541	515546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_009429	GCC	2	6	515571	515576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13074	NC_009429	CG	3	6	515594	515599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13075	NC_009429	CGGCG	2	10	515674	515683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13076	NC_009429	GCC	2	6	515730	515735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13077	NC_009429	GAAG	2	8	515794	515801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_009429	CGCAGG	2	12	515832	515843	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_009429	CAC	2	6	515918	515923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13080	NC_009429	GCA	2	6	515941	515946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_009429	GCC	2	6	515962	515967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_009429	GAT	2	6	515978	515983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_009429	GCA	2	6	516034	516039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_009429	CG	3	6	516046	516051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_009429	CAG	3	9	516095	516103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_009429	TCG	2	6	516109	516114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_009429	CAG	2	6	516125	516130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_009429	GGCG	2	8	516154	516161	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13089	NC_009429	CAT	2	6	516233	516238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_009429	GGC	2	6	516289	516294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_009429	TCC	2	6	516326	516331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_009429	CGG	2	6	516332	516337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_009429	AGGAA	2	10	516404	516413	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_009429	GC	3	6	516463	516468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_009429	TCC	2	6	516556	516561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279642
13096	NC_009429	TCG	2	6	516592	516597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279642
13097	NC_009429	CGAG	2	8	516656	516663	25 %	0 %	50 %	25 %	146279642
13098	NC_009429	ATC	2	6	516664	516669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279642
13099	NC_009429	TCG	2	6	516682	516687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279642
13100	NC_009429	CGA	2	6	516710	516715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279642
13101	NC_009429	GTC	2	6	516849	516854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279642
13102	NC_009429	TCG	2	6	516902	516907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279642
13103	NC_009429	CAT	2	6	516945	516950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279642
13104	NC_009429	GTC	2	6	517156	517161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_009429	AGT	2	6	517186	517191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_009429	TTC	2	6	517259	517264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_009429	CGC	2	6	517295	517300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279643
13108	NC_009429	GCCGTG	2	12	517304	517315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146279643
13109	NC_009429	CGG	2	6	517317	517322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279643
13110	NC_009429	CCG	2	6	517395	517400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279643
13111	NC_009429	CCG	2	6	517420	517425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279643
13112	NC_009429	CCG	2	6	517428	517433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279643
13113	NC_009429	CCA	2	6	517443	517448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279643
13114	NC_009429	GCA	2	6	517449	517454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279643
13115	NC_009429	CCG	2	6	517479	517484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279643
13116	NC_009429	GGC	2	6	517516	517521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279643
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13118	NC_009429	GCG	3	9	517533	517541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279643
13119	NC_009429	CCA	2	6	517560	517565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279643
13120	NC_009429	GCA	2	6	517602	517607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279643
13121	NC_009429	CGC	2	6	517636	517641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279643
13122	NC_009429	CAGGCA	2	12	517654	517665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279643
13123	NC_009429	TGA	2	6	517780	517785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279644
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13125	NC_009429	ATGC	2	8	517926	517933	25 %	25 %	25 %	25 %	146279644
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13128	NC_009429	GACC	2	8	517967	517974	25 %	0 %	25 %	50 %	146279644
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13233	NC_009429	ACG	2	6	521525	521530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279649
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13237	NC_009429	CAG	2	6	521719	521724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279649
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13239	NC_009429	CGA	2	6	521801	521806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279650
13240	NC_009429	CAG	2	6	521844	521849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279650
13241	NC_009429	GGCCGA	2	12	521862	521873	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146279650
13242	NC_009429	GCA	2	6	521882	521887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279650
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13245	NC_009429	TGA	2	6	521954	521959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279650
13246	NC_009429	TGA	2	6	521978	521983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279650
13247	NC_009429	ATG	2	6	522001	522006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279650
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13263	NC_009429	CCG	2	6	522672	522677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13264	NC_009429	G	6	6	522689	522694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13265	NC_009429	GGC	2	6	522727	522732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279651
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13269	NC_009429	CGGC	2	8	522888	522895	0 %	0 %	50 %	50 %	146279651
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13352	NC_009429	GGT	2	6	526070	526075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279654
13353	NC_009429	GGCGCG	2	12	526129	526140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279654
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13355	NC_009429	GGC	2	6	526211	526216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279654
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13357	NC_009429	CGGG	2	8	526236	526243	0 %	0 %	75 %	25 %	146279654
13358	NC_009429	GCGG	2	8	526250	526257	0 %	0 %	75 %	25 %	146279654
13359	NC_009429	GCG	2	6	526344	526349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279654
13360	NC_009429	CGC	2	6	526376	526381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279654
13361	NC_009429	CCG	2	6	526403	526408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279654
13362	NC_009429	CCGG	2	8	526438	526445	0 %	0 %	50 %	50 %	146279654
13363	NC_009429	AG	3	6	526453	526458	50 %	0 %	50 %	0 %	146279654
13364	NC_009429	GCC	3	9	526521	526529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279654
13365	NC_009429	GAG	2	6	526542	526547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279654
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13368	NC_009429	CG	3	6	526726	526731	0 %	0 %	50 %	50 %	146279655
13369	NC_009429	CGC	2	6	526738	526743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279655
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13488	NC_009429	GCT	2	6	531802	531807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279658
13489	NC_009429	GCG	3	9	531861	531869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279658
13490	NC_009429	GCC	2	6	531896	531901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279658
13491	NC_009429	GC	3	6	531907	531912	0 %	0 %	50 %	50 %	146279658
13492	NC_009429	GCGG	2	8	531989	531996	0 %	0 %	75 %	25 %	146279658
13493	NC_009429	GTC	2	6	532001	532006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279658
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13495	NC_009429	GGT	2	6	532030	532035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279658
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13498	NC_009429	GCT	2	6	532102	532107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279658
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13500	NC_009429	GAT	2	6	532246	532251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279659

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