MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 21852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009429	CGA	2	6	391584	391589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_009429	CGG	2	6	391735	391740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_009429	CG	3	6	391753	391758	0 %	0 %	50 %	50 %	146279527
10004	NC_009429	TTG	2	6	391792	391797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146279527
10005	NC_009429	GC	3	6	391818	391823	0 %	0 %	50 %	50 %	146279527
10006	NC_009429	ACG	2	6	391873	391878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279527
10007	NC_009429	CAG	2	6	391947	391952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279527
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10009	NC_009429	GCC	2	6	392005	392010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279527
10010	NC_009429	GTC	2	6	392076	392081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279527
10011	NC_009429	GAC	2	6	392082	392087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279527
10012	NC_009429	AG	3	6	392230	392235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_009429	CGG	2	6	392326	392331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_009429	CAG	2	6	392363	392368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_009429	TC	3	6	392388	392393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_009429	CGG	2	6	392401	392406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_009429	TGG	2	6	392440	392445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_009429	GCA	2	6	392464	392469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_009429	CAGCGC	2	12	392477	392488	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_009429	AAG	2	6	392501	392506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_009429	CG	3	6	392602	392607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_009429	AG	3	6	392639	392644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_009429	GCG	2	6	392687	392692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_009429	CG	3	6	392691	392696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_009429	TTC	2	6	392733	392738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_009429	CAG	2	6	392816	392821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10029	NC_009429	GAA	2	6	393038	393043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_009429	AGA	2	6	393087	393092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_009429	CGA	2	6	393109	393114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_009429	TCG	2	6	393156	393161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_009429	GAC	3	9	393167	393175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_009429	GCG	2	6	393215	393220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_009429	GTC	2	6	393293	393298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10038	NC_009429	TCC	2	6	393552	393557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_009429	CTC	2	6	393572	393577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10040	NC_009429	CGC	2	6	393581	393586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_009429	GTC	2	6	393663	393668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_009429	CG	3	6	393680	393685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_009429	CAG	2	6	393686	393691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_009429	CGT	2	6	393749	393754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10046	NC_009429	TGA	2	6	393784	393789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10050	NC_009429	CGG	2	6	393915	393920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_009429	GAC	2	6	394043	394048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10053	NC_009429	CGG	2	6	394127	394132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_009429	GCC	2	6	394148	394153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_009429	CAG	2	6	394190	394195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_009429	GCC	2	6	394343	394348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10057	NC_009429	CAG	2	6	394374	394379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_009429	CG	4	8	394401	394408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_009429	CGG	2	6	394413	394418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_009429	ATC	2	6	394447	394452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10062	NC_009429	CCGCGC	2	12	394563	394574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10063	NC_009429	GTCG	2	8	394593	394600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_009429	CAA	2	6	394736	394741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_009429	GAA	2	6	394791	394796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10068	NC_009429	CGG	2	6	394918	394923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_009429	CGC	2	6	395191	395196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10070	NC_009429	TCG	2	6	395203	395208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_009429	GCC	2	6	395244	395249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_009429	C	7	7	395261	395267	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10077	NC_009429	GC	3	6	395386	395391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10084	NC_009429	GAA	2	6	395622	395627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10092	NC_009429	GCTC	2	8	396011	396018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10095	NC_009429	CCG	2	6	396093	396098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_009429	GCT	2	6	396121	396126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_009429	CACGG	2	10	396143	396152	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10098	NC_009429	CGA	2	6	396166	396171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_009429	TGG	2	6	396228	396233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_009429	GGC	2	6	396234	396239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_009429	GCG	2	6	396245	396250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_009429	CT	3	6	396304	396309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_009429	CG	3	6	396319	396324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_009429	ATC	2	6	396329	396334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10107	NC_009429	GCG	2	6	396391	396396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_009429	GC	3	6	396401	396406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10109	NC_009429	CGG	4	12	396431	396442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10111	NC_009429	CGT	2	6	396518	396523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_009429	CG	3	6	396548	396553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_009429	CTG	2	6	396661	396666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279528
10114	NC_009429	GCT	2	6	396673	396678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279528
10115	NC_009429	CGG	2	6	396709	396714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279528
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10123	NC_009429	GAA	2	6	396940	396945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279528
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10128	NC_009429	ATC	2	6	397100	397105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279528
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10364	NC_009429	ACC	2	6	407012	407017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10365	NC_009429	AAGCT	2	10	407033	407042	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10366	NC_009429	GTCA	2	8	407062	407069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10367	NC_009429	TGC	2	6	407081	407086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10368	NC_009429	CAT	2	6	407126	407131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279540
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10372	NC_009429	CGC	2	6	407512	407517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279540
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10485	NC_009429	CG	3	6	413870	413875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10487	NC_009429	GCT	2	6	414050	414055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279544
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10493	NC_009429	AG	3	6	414427	414432	50 %	0 %	50 %	0 %	146279544
10494	NC_009429	CTT	2	6	414439	414444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279544
10495	NC_009429	ATG	2	6	414629	414634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279544
10496	NC_009429	TCA	2	6	414635	414640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279544
10497	NC_009429	CCA	2	6	414702	414707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279544
10498	NC_009429	CTTTG	2	10	414712	414721	0 %	60 %	20 %	20 %	146279544
10499	NC_009429	GC	3	6	414779	414784	0 %	0 %	50 %	50 %	146279544
10500	NC_009429	TCG	2	6	414828	414833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279544

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