MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 21852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7123	NC_009429	GCC	2	6	278292	278297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279427
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7197	NC_009429	CG	4	8	281312	281319	0 %	0 %	50 %	50 %	146279429
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7219	NC_009429	GACA	2	8	281943	281950	50 %	0 %	25 %	25 %	146279429
7220	NC_009429	GGT	2	6	281952	281957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279429
7221	NC_009429	GAT	2	6	281973	281978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279429
7222	NC_009429	CGG	2	6	282014	282019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279429
7223	NC_009429	TGC	2	6	282023	282028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279429
7224	NC_009429	CCA	2	6	282047	282052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279429
7225	NC_009429	CGAT	2	8	282062	282069	25 %	25 %	25 %	25 %	146279429
7226	NC_009429	AGGGCG	2	12	282199	282210	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	146279429
7227	NC_009429	TGG	2	6	282294	282299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7228	NC_009429	GATCA	2	10	282324	282333	40 %	20 %	20 %	20 %	146279430
7229	NC_009429	TCA	2	6	282342	282347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279430
7230	NC_009429	CCG	2	6	282400	282405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279430
7231	NC_009429	TCG	3	9	282429	282437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279430
7232	NC_009429	CGCCA	2	10	282479	282488	20 %	0 %	20 %	60 %	146279430
7233	NC_009429	CAC	2	6	282503	282508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279430
7234	NC_009429	AGG	3	9	282522	282530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279430
7235	NC_009429	GCT	2	6	282559	282564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279430
7236	NC_009429	CTGG	2	8	282602	282609	0 %	25 %	50 %	25 %	146279430
7237	NC_009429	GAC	2	6	282646	282651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279430
7238	NC_009429	CGAG	2	8	282664	282671	25 %	0 %	50 %	25 %	146279430
7239	NC_009429	GCC	2	6	282675	282680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279430
7240	NC_009429	TCT	2	6	282736	282741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279430
7241	NC_009429	CGC	2	6	282746	282751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279430
7242	NC_009429	CGT	2	6	282772	282777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279430
7243	NC_009429	CCT	2	6	282838	282843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279430
7244	NC_009429	CGT	2	6	282847	282852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279430
7245	NC_009429	GGCTC	2	10	282877	282886	0 %	20 %	40 %	40 %	146279430
7246	NC_009429	CGG	2	6	282905	282910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279430
7247	NC_009429	CCGG	2	8	282918	282925	0 %	0 %	50 %	50 %	146279430
7248	NC_009429	ATG	2	6	282945	282950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279430
7249	NC_009429	GC	3	6	282953	282958	0 %	0 %	50 %	50 %	146279430
7250	NC_009429	TTC	2	6	283005	283010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279430
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7252	NC_009429	GTT	2	6	283058	283063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146279430
7253	NC_009429	GAT	2	6	283070	283075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279430
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7257	NC_009429	C	6	6	283134	283139	0 %	0 %	0 %	100 %	146279430
7258	NC_009429	CGA	2	6	283150	283155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279430
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7260	NC_009429	CGT	2	6	283291	283296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279430
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7263	NC_009429	GCC	2	6	283373	283378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279430
7264	NC_009429	GAT	2	6	283409	283414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279430
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7274	NC_009429	CGC	2	6	284091	284096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279431
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7276	NC_009429	CAG	2	6	284253	284258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279431
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7278	NC_009429	GAC	2	6	284304	284309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279431
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7281	NC_009429	CAG	2	6	284442	284447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279431
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7292	NC_009429	GC	3	6	284932	284937	0 %	0 %	50 %	50 %	146279431
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7298	NC_009429	AGA	2	6	285239	285244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279431
7299	NC_009429	TGG	2	6	285278	285283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279431
7300	NC_009429	GAA	3	9	285297	285305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279431
7301	NC_009429	GC	3	6	285336	285341	0 %	0 %	50 %	50 %	146279431
7302	NC_009429	CAG	2	6	285357	285362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279431
7303	NC_009429	GCC	2	6	285387	285392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279431
7304	NC_009429	GCA	2	6	285398	285403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279431
7305	NC_009429	CGA	2	6	285417	285422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279431
7306	NC_009429	GCA	3	9	285448	285456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7307	NC_009429	CAG	2	6	285577	285582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279432
7308	NC_009429	GAT	2	6	285592	285597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279432
7309	NC_009429	GCC	2	6	285608	285613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279432
7310	NC_009429	GGCATA	2	12	285622	285633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146279432
7311	NC_009429	CG	5	10	285666	285675	0 %	0 %	50 %	50 %	146279432
7312	NC_009429	CCCG	2	8	285685	285692	0 %	0 %	25 %	75 %	146279432
7313	NC_009429	TGA	2	6	285882	285887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279432
7314	NC_009429	AG	3	6	285982	285987	50 %	0 %	50 %	0 %	146279432
7315	NC_009429	GCG	2	6	286018	286023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279432
7316	NC_009429	GTT	2	6	286033	286038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146279432
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7319	NC_009429	GGC	2	6	286156	286161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279432
7320	NC_009429	CGC	2	6	286203	286208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279432
7321	NC_009429	GCC	2	6	286322	286327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279432
7322	NC_009429	GCG	2	6	286328	286333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279432
7323	NC_009429	AGG	2	6	286427	286432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279432
7324	NC_009429	GCGA	2	8	286433	286440	25 %	0 %	50 %	25 %	146279432
7325	NC_009429	AAG	2	6	286477	286482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279432
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7328	NC_009429	CG	3	6	286617	286622	0 %	0 %	50 %	50 %	146279432
7329	NC_009429	T	6	6	286623	286628	0 %	100 %	0 %	0 %	146279432
7330	NC_009429	TGG	2	6	286665	286670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279432
7331	NC_009429	CCG	2	6	286734	286739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7332	NC_009429	TCA	2	6	286755	286760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7333	NC_009429	GCAT	2	8	287202	287209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7334	NC_009429	CGG	2	6	287224	287229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7335	NC_009429	GGC	2	6	287316	287321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279433
7336	NC_009429	CGG	2	6	287330	287335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279433
7337	NC_009429	AG	3	6	287413	287418	50 %	0 %	50 %	0 %	146279433
7338	NC_009429	GCG	2	6	287419	287424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279433
7339	NC_009429	CGC	2	6	287432	287437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279433
7340	NC_009429	GGC	2	6	287442	287447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279433
7341	NC_009429	AGCC	2	8	287488	287495	25 %	0 %	25 %	50 %	146279433
7342	NC_009429	GCGCC	2	10	287542	287551	0 %	0 %	40 %	60 %	146279433
7343	NC_009429	AGC	2	6	287570	287575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279433
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7345	NC_009429	CGGC	2	8	287615	287622	0 %	0 %	50 %	50 %	146279433
7346	NC_009429	CG	3	6	287629	287634	0 %	0 %	50 %	50 %	146279434
7347	NC_009429	CGT	2	6	287638	287643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279434
7348	NC_009429	TCG	2	6	287658	287663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279434
7349	NC_009429	GCA	2	6	287671	287676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279434
7350	NC_009429	ATC	2	6	287724	287729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279434
7351	NC_009429	CGAT	2	8	287760	287767	25 %	25 %	25 %	25 %	146279434
7352	NC_009429	GC	3	6	287768	287773	0 %	0 %	50 %	50 %	146279434
7353	NC_009429	AG	3	6	287840	287845	50 %	0 %	50 %	0 %	146279434
7354	NC_009429	CG	4	8	287887	287894	0 %	0 %	50 %	50 %	146279434
7355	NC_009429	GGC	2	6	287911	287916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279434
7356	NC_009429	GCG	2	6	287936	287941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279434
7357	NC_009429	ATA	2	6	287990	287995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146279434
7358	NC_009429	TCC	2	6	288061	288066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7359	NC_009429	CGG	2	6	288111	288116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7360	NC_009429	CCGA	2	8	288155	288162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7361	NC_009429	AAC	2	6	288202	288207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146279435
7362	NC_009429	GCG	2	6	288235	288240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279435
7363	NC_009429	GCGGT	2	10	288259	288268	0 %	20 %	60 %	20 %	146279435
7364	NC_009429	GATGTC	2	12	288291	288302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146279435
7365	NC_009429	GCG	2	6	288379	288384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279435
7366	NC_009429	CG	3	6	288430	288435	0 %	0 %	50 %	50 %	146279435
7367	NC_009429	GGC	2	6	288479	288484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279435
7368	NC_009429	GCCGGA	2	12	288485	288496	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146279435
7369	NC_009429	GCC	2	6	288553	288558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279435
7370	NC_009429	CGG	2	6	288586	288591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279435
7371	NC_009429	CCTG	2	8	288665	288672	0 %	25 %	25 %	50 %	146279435
7372	NC_009429	GC	3	6	288680	288685	0 %	0 %	50 %	50 %	146279435
7373	NC_009429	TGA	2	6	288730	288735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279435
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7378	NC_009429	GCT	2	6	288815	288820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279435
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7380	NC_009429	CGA	2	6	289019	289024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279435
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7382	NC_009429	GCT	2	6	289106	289111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279435
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7386	NC_009429	CCGA	2	8	289197	289204	25 %	0 %	25 %	50 %	146279435
7387	NC_009429	GTC	2	6	289245	289250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279435
7388	NC_009429	TGG	2	6	289264	289269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279435
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7391	NC_009429	GGCGCT	2	12	289322	289333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146279435
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7402	NC_009429	CGG	2	6	289658	289663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279435
7403	NC_009429	AGCGC	2	10	289744	289753	20 %	0 %	40 %	40 %	146279435
7404	NC_009429	GGC	2	6	289781	289786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279435
7405	NC_009429	GGT	2	6	289808	289813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279435
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7422	NC_009429	GCC	2	6	290523	290528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279435
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7424	NC_009429	GAC	2	6	290585	290590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279435
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7428	NC_009429	CGA	3	9	290740	290748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279436
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7431	NC_009429	GAAG	2	8	290788	290795	50 %	0 %	50 %	0 %	146279436
7432	NC_009429	CGG	2	6	290839	290844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279436
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7434	NC_009429	TGC	2	6	290877	290882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279436
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7438	NC_009429	CCG	2	6	290976	290981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279436
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7444	NC_009429	GCGG	2	8	291248	291255	0 %	0 %	75 %	25 %	146279436
7445	NC_009429	GTG	2	6	291338	291343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279436
7446	NC_009429	GCA	2	6	291382	291387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279436
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7450	NC_009429	TTGCC	2	10	291520	291529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7451	NC_009429	CG	3	6	291652	291657	0 %	0 %	50 %	50 %	146279437
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7456	NC_009429	GAC	3	9	291816	291824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279437
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7463	NC_009429	AGG	2	6	292229	292234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279438
7464	NC_009429	GAG	2	6	292285	292290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279438
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7469	NC_009429	TCC	2	6	292658	292663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279438
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7472	NC_009429	GGC	2	6	292755	292760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279438
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7474	NC_009429	GGC	2	6	292801	292806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7475	NC_009429	TTCG	2	8	292894	292901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7476	NC_009429	TCT	2	6	292943	292948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7477	NC_009429	CGG	2	6	292951	292956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7482	NC_009429	TGT	2	6	293429	293434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146279439
7483	NC_009429	CGT	2	6	293455	293460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279439
7484	NC_009429	CAGC	2	8	293461	293468	25 %	0 %	25 %	50 %	146279439
7485	NC_009429	CTT	2	6	293491	293496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279439
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7487	NC_009429	GC	3	6	293545	293550	0 %	0 %	50 %	50 %	146279439
7488	NC_009429	CCG	2	6	293568	293573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279439
7489	NC_009429	CGCC	2	8	293698	293705	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7490	NC_009429	GTCGC	2	10	293727	293736	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7491	NC_009429	CGGT	2	8	293739	293746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7492	NC_009429	CGCC	2	8	293758	293765	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7493	NC_009429	CGA	2	6	293788	293793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7494	NC_009429	GCC	2	6	293864	293869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279440
7495	NC_009429	TCG	2	6	293984	293989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279440
7496	NC_009429	TC	3	6	294034	294039	0 %	50 %	0 %	50 %	146279440
7497	NC_009429	CGC	2	6	294093	294098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279440
7498	NC_009429	GGTCA	2	10	294117	294126	20 %	20 %	40 %	20 %	146279440
7499	NC_009429	CAG	2	6	294158	294163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279441
7500	NC_009429	AGC	2	6	294174	294179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279441

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