MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 82302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_009428	GCG	2	6	1643247	1643252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277638
42003	NC_009428	AGC	2	6	1643279	1643284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277638
42004	NC_009428	CGC	2	6	1643291	1643296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277638
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42011	NC_009428	CGG	2	6	1643646	1643651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42012	NC_009428	CGC	2	6	1643710	1643715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42013	NC_009428	CCCG	2	8	1643716	1643723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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42235	NC_009428	CTG	2	6	1652462	1652467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277647
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42343	NC_009428	CGT	2	6	1656217	1656222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277650
42344	NC_009428	CCACG	2	10	1656229	1656238	20 %	0 %	20 %	60 %	146277650
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42350	NC_009428	GGC	2	6	1656359	1656364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277650
42351	NC_009428	GCCGAT	2	12	1656386	1656397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146277650
42352	NC_009428	CGC	2	6	1656403	1656408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277650
42353	NC_009428	TGC	3	9	1656452	1656460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277650
42354	NC_009428	ACG	2	6	1656495	1656500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277650
42355	NC_009428	TCG	2	6	1656504	1656509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277650
42356	NC_009428	GAC	2	6	1656565	1656570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277650
42357	NC_009428	GTG	2	6	1656605	1656610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146277650
42358	NC_009428	CGC	2	6	1656648	1656653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277650
42359	NC_009428	CGG	2	6	1656675	1656680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277650
42360	NC_009428	CGG	2	6	1656685	1656690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277650
42361	NC_009428	CGC	2	6	1656702	1656707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277650
42362	NC_009428	TGA	2	6	1656741	1656746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146277650
42363	NC_009428	AGG	2	6	1656747	1656752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146277650
42364	NC_009428	CAT	2	6	1656775	1656780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146277650
42365	NC_009428	CGA	2	6	1656793	1656798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277650
42366	NC_009428	TGA	2	6	1656813	1656818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146277650
42367	NC_009428	GC	3	6	1656885	1656890	0 %	0 %	50 %	50 %	146277650
42368	NC_009428	CTG	2	6	1656946	1656951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277650
42369	NC_009428	GCGCG	2	10	1656973	1656982	0 %	0 %	60 %	40 %	146277650
42370	NC_009428	AAG	2	6	1657037	1657042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146277650
42371	NC_009428	CCG	2	6	1657082	1657087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277651
42372	NC_009428	GAA	2	6	1657146	1657151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146277651
42373	NC_009428	GCT	2	6	1657155	1657160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277651
42374	NC_009428	GGC	2	6	1657221	1657226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277651
42375	NC_009428	CCGAAC	2	12	1657261	1657272	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146277651
42376	NC_009428	CGC	2	6	1657296	1657301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277651
42377	NC_009428	GGCG	2	8	1657308	1657315	0 %	0 %	75 %	25 %	146277651
42378	NC_009428	CGG	3	9	1657338	1657346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277651
42379	NC_009428	GAT	2	6	1657368	1657373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146277651
42380	NC_009428	TGG	2	6	1657429	1657434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146277651
42381	NC_009428	CGA	2	6	1657478	1657483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277651
42382	NC_009428	GC	3	6	1657509	1657514	0 %	0 %	50 %	50 %	146277651
42383	NC_009428	AAG	3	9	1657543	1657551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146277651
42384	NC_009428	ATC	2	6	1657552	1657557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146277651
42385	NC_009428	GCT	2	6	1657569	1657574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277651
42386	NC_009428	GCCG	2	8	1657575	1657582	0 %	0 %	50 %	50 %	146277651
42387	NC_009428	TCA	2	6	1657625	1657630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146277651
42388	NC_009428	CCG	2	6	1657631	1657636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277651
42389	NC_009428	GATG	2	8	1657644	1657651	25 %	25 %	50 %	0 %	146277651
42390	NC_009428	ATG	2	6	1657795	1657800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146277651
42391	NC_009428	GCG	3	9	1657801	1657809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277651
42392	NC_009428	ACA	2	6	1657883	1657888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146277651
42393	NC_009428	CAC	2	6	1657891	1657896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146277651
42394	NC_009428	ACG	2	6	1657900	1657905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277651
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42396	NC_009428	CG	3	6	1657942	1657947	0 %	0 %	50 %	50 %	146277651
42397	NC_009428	GAA	2	6	1657954	1657959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146277651
42398	NC_009428	A	6	6	1657958	1657963	100 %	0 %	0 %	0 %	146277651
42399	NC_009428	CGC	2	6	1657971	1657976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277651
42400	NC_009428	GCA	2	6	1658015	1658020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277651
42401	NC_009428	CG	3	6	1658085	1658090	0 %	0 %	50 %	50 %	146277651
42402	NC_009428	GGA	2	6	1658118	1658123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146277651
42403	NC_009428	GCG	2	6	1658132	1658137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277651
42404	NC_009428	CG	3	6	1658156	1658161	0 %	0 %	50 %	50 %	146277651
42405	NC_009428	CG	4	8	1658168	1658175	0 %	0 %	50 %	50 %	146277651
42406	NC_009428	GCCT	2	8	1658185	1658192	0 %	25 %	25 %	50 %	146277651
42407	NC_009428	GGCG	2	8	1658202	1658209	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42408	NC_009428	GAT	2	6	1658213	1658218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146277652
42409	NC_009428	TCA	2	6	1658242	1658247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146277652
42410	NC_009428	CGG	2	6	1658249	1658254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277652
42411	NC_009428	GTG	2	6	1658259	1658264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146277652
42412	NC_009428	GCC	2	6	1658296	1658301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277652
42413	NC_009428	CCT	2	6	1658344	1658349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146277652
42414	NC_009428	TGC	2	6	1658383	1658388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277652
42415	NC_009428	CGC	2	6	1658446	1658451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277652
42416	NC_009428	GCCCGC	2	12	1658519	1658530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277652
42417	NC_009428	GCTCG	2	10	1658561	1658570	0 %	20 %	40 %	40 %	146277652
42418	NC_009428	GGA	2	6	1658585	1658590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146277652
42419	NC_009428	CGG	2	6	1658606	1658611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277652
42420	NC_009428	GGC	2	6	1658672	1658677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277652
42421	NC_009428	CCG	2	6	1658696	1658701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277652
42422	NC_009428	CTG	2	6	1658724	1658729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277652
42423	NC_009428	GCG	2	6	1658745	1658750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277652
42424	NC_009428	CTG	2	6	1658763	1658768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277652
42425	NC_009428	CTT	2	6	1658786	1658791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146277652
42426	NC_009428	CG	3	6	1658849	1658854	0 %	0 %	50 %	50 %	146277652
42427	NC_009428	GC	5	10	1658880	1658889	0 %	0 %	50 %	50 %	146277652
42428	NC_009428	GCG	2	6	1658900	1658905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277652
42429	NC_009428	GCG	2	6	1658951	1658956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277652
42430	NC_009428	GGT	2	6	1658957	1658962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146277652
42431	NC_009428	CGG	2	6	1658968	1658973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277652
42432	NC_009428	GCGCTG	2	12	1658988	1658999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146277652
42433	NC_009428	CG	4	8	1659095	1659102	0 %	0 %	50 %	50 %	146277652
42434	NC_009428	GGC	2	6	1659159	1659164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277652
42435	NC_009428	CCGCC	2	10	1659169	1659178	0 %	0 %	20 %	80 %	146277652
42436	NC_009428	CGC	2	6	1659181	1659186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277652
42437	NC_009428	CG	3	6	1659194	1659199	0 %	0 %	50 %	50 %	146277652
42438	NC_009428	TCG	2	6	1659202	1659207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277652
42439	NC_009428	CG	3	6	1659307	1659312	0 %	0 %	50 %	50 %	146277652
42440	NC_009428	TCC	2	6	1659325	1659330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146277652
42441	NC_009428	ATC	2	6	1659384	1659389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146277652
42442	NC_009428	CTG	2	6	1659396	1659401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277652
42443	NC_009428	GCC	2	6	1659410	1659415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277652
42444	NC_009428	CTGC	2	8	1659434	1659441	0 %	25 %	25 %	50 %	146277652
42445	NC_009428	GTCG	2	8	1659518	1659525	0 %	25 %	50 %	25 %	146277653
42446	NC_009428	CCCG	2	8	1659546	1659553	0 %	0 %	25 %	75 %	146277653
42447	NC_009428	TCG	3	9	1659576	1659584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277653
42448	NC_009428	GGC	2	6	1659647	1659652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277653
42449	NC_009428	GATGG	2	10	1659653	1659662	20 %	20 %	60 %	0 %	146277653
42450	NC_009428	AGC	2	6	1659676	1659681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277653
42451	NC_009428	ACGAGG	2	12	1659723	1659734	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146277653
42452	NC_009428	ACAAGG	2	12	1659735	1659746	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	146277653
42453	NC_009428	TGC	2	6	1659768	1659773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277653
42454	NC_009428	GCC	2	6	1659809	1659814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42455	NC_009428	GCCA	2	8	1659823	1659830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42456	NC_009428	GCG	2	6	1659912	1659917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277654
42457	NC_009428	GGC	2	6	1659920	1659925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277654
42458	NC_009428	TCGAAG	2	12	1659945	1659956	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146277654
42459	NC_009428	CGG	2	6	1659984	1659989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277654
42460	NC_009428	AGC	2	6	1660009	1660014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277654
42461	NC_009428	GCA	2	6	1660033	1660038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277654
42462	NC_009428	GC	3	6	1660161	1660166	0 %	0 %	50 %	50 %	146277654
42463	NC_009428	CTG	2	6	1660175	1660180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277654
42464	NC_009428	CGG	2	6	1660231	1660236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277654
42465	NC_009428	TCG	2	6	1660296	1660301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277654
42466	NC_009428	GC	4	8	1660315	1660322	0 %	0 %	50 %	50 %	146277654
42467	NC_009428	CGATCC	2	12	1660387	1660398	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146277654
42468	NC_009428	CGT	2	6	1660447	1660452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277654
42469	NC_009428	TGG	2	6	1660462	1660467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146277654
42470	NC_009428	TCA	2	6	1660479	1660484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146277654
42471	NC_009428	GGCC	2	8	1660519	1660526	0 %	0 %	50 %	50 %	146277654
42472	NC_009428	CGC	2	6	1660541	1660546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277654
42473	NC_009428	CGT	2	6	1660654	1660659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277654
42474	NC_009428	CCT	2	6	1660688	1660693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42475	NC_009428	GGT	2	6	1660712	1660717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42476	NC_009428	CCGGG	2	10	1660718	1660727	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42477	NC_009428	CGC	2	6	1660800	1660805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277655
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42479	NC_009428	GGT	2	6	1660830	1660835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146277655
42480	NC_009428	CGA	2	6	1660877	1660882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277655
42481	NC_009428	GCA	3	9	1660892	1660900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146277655
42482	NC_009428	AGG	2	6	1660939	1660944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146277655
42483	NC_009428	GTC	2	6	1661013	1661018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277655
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42486	NC_009428	GCC	2	6	1661104	1661109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146277655
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42489	NC_009428	TCG	2	6	1661189	1661194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277655
42490	NC_009428	GGA	2	6	1661219	1661224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146277655
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42492	NC_009428	GGC	2	6	1661262	1661267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277655
42493	NC_009428	GCG	2	6	1661295	1661300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146277655
42494	NC_009428	CCA	2	6	1661309	1661314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146277655
42495	NC_009428	GTC	2	6	1661340	1661345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146277655
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42497	NC_009428	GC	4	8	1661411	1661418	0 %	0 %	50 %	50 %	146277655
42498	NC_009428	CG	3	6	1661456	1661461	0 %	0 %	50 %	50 %	146277655
42499	NC_009428	CCA	2	6	1661548	1661553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146277656
42500	NC_009428	C	6	6	1661561	1661566	0 %	0 %	0 %	100 %	146277656

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