MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 82302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009428	GCG	2	6	508621	508626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276562
13002	NC_009428	GAT	2	6	508672	508677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276562
13003	NC_009428	GGCGA	2	10	508682	508691	20 %	0 %	60 %	20 %	146276562
13004	NC_009428	CTC	2	6	508738	508743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276562
13005	NC_009428	TCA	2	6	508761	508766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276562
13006	NC_009428	CAC	2	6	508816	508821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276562
13007	NC_009428	CCCG	2	8	508914	508921	0 %	0 %	25 %	75 %	146276562
13008	NC_009428	AGT	2	6	508929	508934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276562
13009	NC_009428	CGG	2	6	508949	508954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276562
13010	NC_009428	AGT	2	6	508971	508976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276562
13011	NC_009428	GTCG	2	8	509107	509114	0 %	25 %	50 %	25 %	146276562
13012	NC_009428	CAC	2	6	509122	509127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276562
13013	NC_009428	GAA	2	6	509140	509145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276562
13014	NC_009428	GCG	2	6	509190	509195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276562
13015	NC_009428	GCC	2	6	509206	509211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276562
13016	NC_009428	CGA	2	6	509235	509240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276562
13017	NC_009428	CCGA	2	8	509306	509313	25 %	0 %	25 %	50 %	146276562
13018	NC_009428	AGC	2	6	509318	509323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276562
13019	NC_009428	CGA	2	6	509329	509334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276562
13020	NC_009428	AGCG	2	8	509375	509382	25 %	0 %	50 %	25 %	146276562
13021	NC_009428	GTG	2	6	509486	509491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276562
13022	NC_009428	CCG	2	6	509550	509555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276562
13023	NC_009428	AGA	2	6	509562	509567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276562
13024	NC_009428	CGT	2	6	509574	509579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276562
13025	NC_009428	CGC	2	6	509608	509613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276562
13026	NC_009428	CCCG	2	8	509626	509633	0 %	0 %	25 %	75 %	146276562
13027	NC_009428	GAC	2	6	509641	509646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276562
13028	NC_009428	CAT	2	6	509743	509748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276562
13029	NC_009428	TCCA	2	8	509774	509781	25 %	25 %	0 %	50 %	146276562
13030	NC_009428	CAC	2	6	509806	509811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276562
13031	NC_009428	GCA	2	6	509838	509843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276562
13032	NC_009428	GCG	2	6	509846	509851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276562
13033	NC_009428	GCG	2	6	509868	509873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276562
13034	NC_009428	GCC	2	6	509877	509882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276562
13035	NC_009428	CGC	2	6	509883	509888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276562
13036	NC_009428	GCG	2	6	509889	509894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276562
13037	NC_009428	CGG	2	6	509901	509906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276562
13038	NC_009428	CAC	2	6	509911	509916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276562
13039	NC_009428	GAC	2	6	509974	509979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276562
13040	NC_009428	CG	3	6	509999	510004	0 %	0 %	50 %	50 %	146276562
13041	NC_009428	GCC	2	6	510023	510028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276562
13042	NC_009428	ATC	2	6	510035	510040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276562
13043	NC_009428	CAC	2	6	510052	510057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276562
13044	NC_009428	ATC	2	6	510160	510165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276562
13045	NC_009428	GAT	2	6	510175	510180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276562
13046	NC_009428	CTGG	2	8	510187	510194	0 %	25 %	50 %	25 %	146276562
13047	NC_009428	GCA	2	6	510374	510379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276562
13048	NC_009428	CGG	2	6	510396	510401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276562
13049	NC_009428	CTC	2	6	510477	510482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13050	NC_009428	CTC	2	6	510533	510538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_009428	TGCC	2	8	510732	510739	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_009428	CGCC	2	8	510847	510854	0 %	0 %	25 %	75 %	146276563
13053	NC_009428	CAG	2	6	510899	510904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13054	NC_009428	GCC	2	6	510947	510952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276563
13055	NC_009428	GCG	2	6	510953	510958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276563
13056	NC_009428	GC	3	6	511041	511046	0 %	0 %	50 %	50 %	146276563
13057	NC_009428	GCC	2	6	511086	511091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276563
13058	NC_009428	GAA	2	6	511097	511102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276563
13059	NC_009428	GCG	2	6	511199	511204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276563
13060	NC_009428	ACG	2	6	511236	511241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13061	NC_009428	GGTCA	2	10	511250	511259	20 %	20 %	40 %	20 %	146276563
13062	NC_009428	GAC	2	6	511265	511270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13063	NC_009428	CAC	2	6	511289	511294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276563
13064	NC_009428	CG	3	6	511306	511311	0 %	0 %	50 %	50 %	146276563
13065	NC_009428	TCC	2	6	511335	511340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276563
13066	NC_009428	CGA	2	6	511360	511365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13067	NC_009428	CAG	2	6	511370	511375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13068	NC_009428	GCC	2	6	511386	511391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276563
13069	NC_009428	GGC	2	6	511403	511408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276563
13070	NC_009428	CAT	2	6	511424	511429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276563
13071	NC_009428	GCCC	2	8	511481	511488	0 %	0 %	25 %	75 %	146276563
13072	NC_009428	TGG	2	6	511495	511500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276563
13073	NC_009428	CCA	2	6	511621	511626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276563
13074	NC_009428	CCG	2	6	511627	511632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276563
13075	NC_009428	CAG	2	6	511655	511660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13076	NC_009428	ACG	2	6	511812	511817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13077	NC_009428	CAG	2	6	511826	511831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13078	NC_009428	CGG	2	6	511904	511909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276563
13079	NC_009428	CG	5	10	511919	511928	0 %	0 %	50 %	50 %	146276563
13080	NC_009428	CTGG	2	8	512006	512013	0 %	25 %	50 %	25 %	146276563
13081	NC_009428	GAT	2	6	512018	512023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276563
13082	NC_009428	TGCC	2	8	512032	512039	0 %	25 %	25 %	50 %	146276563
13083	NC_009428	CAG	2	6	512111	512116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13084	NC_009428	GCC	2	6	512175	512180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276563
13085	NC_009428	CGG	2	6	512200	512205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276563
13086	NC_009428	CCG	2	6	512208	512213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276563
13087	NC_009428	C	6	6	512229	512234	0 %	0 %	0 %	100 %	146276563
13088	NC_009428	C	6	6	512253	512258	0 %	0 %	0 %	100 %	146276563
13089	NC_009428	CGATG	2	10	512297	512306	20 %	20 %	40 %	20 %	146276563
13090	NC_009428	GCA	2	6	512398	512403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276563
13091	NC_009428	CGCAT	2	10	512454	512463	20 %	20 %	20 %	40 %	146276563
13092	NC_009428	GAT	2	6	512526	512531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276564
13093	NC_009428	GAC	2	6	512566	512571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276564
13094	NC_009428	GGC	2	6	512730	512735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276564
13095	NC_009428	GGC	2	6	512754	512759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276564
13096	NC_009428	TGG	2	6	512765	512770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276564
13097	NC_009428	TGA	2	6	512813	512818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276564
13098	NC_009428	CGCC	2	8	512937	512944	0 %	0 %	25 %	75 %	146276564
13099	NC_009428	CGG	2	6	512970	512975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276564
13100	NC_009428	GAT	2	6	513004	513009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276564
13101	NC_009428	GC	3	6	513026	513031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_009428	GGC	2	6	513047	513052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_009428	GATGC	2	10	513076	513085	20 %	20 %	40 %	20 %	146276565
13104	NC_009428	CGG	2	6	513104	513109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276565
13105	NC_009428	GGCTGC	2	12	513149	513160	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146276565
13106	NC_009428	CTGT	2	8	513166	513173	0 %	50 %	25 %	25 %	146276565
13107	NC_009428	GTG	2	6	513187	513192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276565
13108	NC_009428	TCCGT	2	10	513222	513231	0 %	40 %	20 %	40 %	146276565
13109	NC_009428	CGG	3	9	513240	513248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276565
13110	NC_009428	CTGG	2	8	513258	513265	0 %	25 %	50 %	25 %	146276565
13111	NC_009428	CGG	2	6	513270	513275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276565
13112	NC_009428	GCG	3	9	513321	513329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276565
13113	NC_009428	CG	5	10	513328	513337	0 %	0 %	50 %	50 %	146276565
13114	NC_009428	CGCC	2	8	513393	513400	0 %	0 %	25 %	75 %	146276565
13115	NC_009428	CAT	2	6	513402	513407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276565
13116	NC_009428	GGTG	2	8	513417	513424	0 %	25 %	75 %	0 %	146276565
13117	NC_009428	AGG	2	6	513446	513451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276565
13118	NC_009428	CG	3	6	513452	513457	0 %	0 %	50 %	50 %	146276565
13119	NC_009428	CGG	2	6	513474	513479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276565
13120	NC_009428	GCT	2	6	513495	513500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276565
13121	NC_009428	GGC	3	9	513507	513515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276565
13122	NC_009428	CGG	2	6	513623	513628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276565
13123	NC_009428	GC	4	8	513639	513646	0 %	0 %	50 %	50 %	146276565
13124	NC_009428	TCG	2	6	513656	513661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276565
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13129	NC_009428	GC	3	6	513856	513861	0 %	0 %	50 %	50 %	146276565
13130	NC_009428	CGGC	2	8	513895	513902	0 %	0 %	50 %	50 %	146276565
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13133	NC_009428	GCT	2	6	514029	514034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276565
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13138	NC_009428	GCT	2	6	514208	514213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276566
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13217	NC_009428	AGG	2	6	516884	516889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13219	NC_009428	GCC	2	6	516972	516977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13220	NC_009428	GCC	2	6	517033	517038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13221	NC_009428	CAT	2	6	517062	517067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276568
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13223	NC_009428	CCT	2	6	517148	517153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276568
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13225	NC_009428	GTGATC	2	12	517174	517185	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146276568
13226	NC_009428	CCT	2	6	517223	517228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276568
13227	NC_009428	CG	3	6	517235	517240	0 %	0 %	50 %	50 %	146276568
13228	NC_009428	TCC	3	9	517255	517263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276568
13229	NC_009428	CG	3	6	517305	517310	0 %	0 %	50 %	50 %	146276568
13230	NC_009428	CGG	2	6	517332	517337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276568
13231	NC_009428	CTT	2	6	517359	517364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276568
13232	NC_009428	CGC	2	6	517420	517425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276568
13233	NC_009428	GGCC	2	8	517455	517462	0 %	0 %	50 %	50 %	146276568
13234	NC_009428	TGC	2	6	517492	517497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276568
13235	NC_009428	CGCC	2	8	517601	517608	0 %	0 %	25 %	75 %	146276568
13236	NC_009428	ACA	2	6	517838	517843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276569
13237	NC_009428	CT	3	6	517847	517852	0 %	50 %	0 %	50 %	146276569
13238	NC_009428	CAA	2	6	517956	517961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276569
13239	NC_009428	GCTGAA	2	12	518013	518024	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146276569
13240	NC_009428	CGC	2	6	518034	518039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276569
13241	NC_009428	GAG	2	6	518047	518052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276569
13242	NC_009428	CGC	2	6	518075	518080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276569
13243	NC_009428	CCGG	2	8	518097	518104	0 %	0 %	50 %	50 %	146276569
13244	NC_009428	CAC	2	6	518172	518177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276569
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13248	NC_009428	GGC	2	6	518298	518303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276569
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13250	NC_009428	GCC	2	6	518314	518319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276569
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13260	NC_009428	GCC	2	6	518705	518710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13261	NC_009428	GACC	2	8	518743	518750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13262	NC_009428	CCA	2	6	518887	518892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276570
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13287	NC_009428	CCGT	2	8	519990	519997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13348	NC_009428	CCTT	2	8	522126	522133	0 %	50 %	0 %	50 %	146276573
13349	NC_009428	ATC	2	6	522159	522164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276573
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13357	NC_009428	CG	3	6	522365	522370	0 %	0 %	50 %	50 %	146276573
13358	NC_009428	GAT	2	6	522386	522391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276573
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13360	NC_009428	CCG	2	6	522510	522515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276573
13361	NC_009428	GAT	2	6	522551	522556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276573
13362	NC_009428	CG	3	6	522558	522563	0 %	0 %	50 %	50 %	146276573
13363	NC_009428	GTG	2	6	522564	522569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276573
13364	NC_009428	TCA	2	6	522595	522600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276573
13365	NC_009428	TTC	2	6	522636	522641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276573
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13367	NC_009428	CGG	2	6	522750	522755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13368	NC_009428	GCC	2	6	522906	522911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13369	NC_009428	TGT	2	6	522924	522929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13370	NC_009428	GCT	2	6	522986	522991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13371	NC_009428	GGCCG	2	10	523055	523064	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13372	NC_009428	GCT	2	6	523119	523124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13373	NC_009428	CGG	2	6	523129	523134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13374	NC_009428	CGGG	2	8	523167	523174	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13375	NC_009428	GGC	2	6	523283	523288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276574
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13393	NC_009428	AGCC	2	8	523960	523967	25 %	0 %	25 %	50 %	146276574
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13403	NC_009428	CTG	2	6	524452	524457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276575
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13483	NC_009428	CCG	2	6	528021	528026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276578
13484	NC_009428	ATG	2	6	528044	528049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276578
13485	NC_009428	CGG	2	6	528063	528068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276578
13486	NC_009428	GAT	2	6	528076	528081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276578
13487	NC_009428	GGC	2	6	528094	528099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276578
13488	NC_009428	TGC	2	6	528147	528152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276578
13489	NC_009428	GCCA	2	8	528188	528195	25 %	0 %	25 %	50 %	146276578
13490	NC_009428	TGG	2	6	528269	528274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276578
13491	NC_009428	GC	3	6	528301	528306	0 %	0 %	50 %	50 %	146276578
13492	NC_009428	GGCG	2	8	528307	528314	0 %	0 %	75 %	25 %	146276578
13493	NC_009428	TCC	2	6	528357	528362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276579
13494	NC_009428	TGC	2	6	528369	528374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276579
13495	NC_009428	CAT	2	6	528397	528402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276579
13496	NC_009428	TCA	2	6	528405	528410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276579
13497	NC_009428	CGG	2	6	528436	528441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276579
13498	NC_009428	CG	3	6	528460	528465	0 %	0 %	50 %	50 %	146276579
13499	NC_009428	AGGGC	2	10	528472	528481	20 %	0 %	60 %	20 %	146276579
13500	NC_009428	CGG	3	9	528502	528510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276579

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