MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 82302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_009428	ACC	2	6	2227192	2227197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146278231
57002	NC_009428	CGG	2	6	2227249	2227254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57003	NC_009428	CCCG	2	8	2227259	2227266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57004	NC_009428	CGCGGG	2	12	2227390	2227401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278232
57005	NC_009428	CG	3	6	2227433	2227438	0 %	0 %	50 %	50 %	146278232
57006	NC_009428	C	6	6	2227459	2227464	0 %	0 %	0 %	100 %	146278232
57007	NC_009428	TGA	2	6	2227472	2227477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146278232
57008	NC_009428	CG	4	8	2227578	2227585	0 %	0 %	50 %	50 %	146278232
57009	NC_009428	CTG	2	6	2227723	2227728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278232
57010	NC_009428	GCC	2	6	2227801	2227806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278232
57011	NC_009428	TGC	2	6	2227841	2227846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278232
57012	NC_009428	CGA	2	6	2228124	2228129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278232
57013	NC_009428	GATG	2	8	2228151	2228158	25 %	25 %	50 %	0 %	146278232
57014	NC_009428	GC	3	6	2228165	2228170	0 %	0 %	50 %	50 %	146278232
57015	NC_009428	TCG	2	6	2228183	2228188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278232
57016	NC_009428	GC	3	6	2228211	2228216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57017	NC_009428	GC	3	6	2228219	2228224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57018	NC_009428	GCG	2	6	2228230	2228235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57019	NC_009428	CG	4	8	2228257	2228264	0 %	0 %	50 %	50 %	146278233
57020	NC_009428	CGCC	2	8	2228297	2228304	0 %	0 %	25 %	75 %	146278233
57021	NC_009428	TGC	2	6	2228338	2228343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278233
57022	NC_009428	GCT	2	6	2228426	2228431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278233
57023	NC_009428	CCG	2	6	2228445	2228450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278233
57024	NC_009428	GCT	2	6	2228535	2228540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278233
57025	NC_009428	CTG	2	6	2228575	2228580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278233
57026	NC_009428	TCGAGG	2	12	2228645	2228656	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146278233
57027	NC_009428	AGG	3	9	2228654	2228662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146278233
57028	NC_009428	CAT	2	6	2228676	2228681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146278233
57029	NC_009428	GGC	2	6	2228753	2228758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278234
57030	NC_009428	CGG	2	6	2228800	2228805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278234
57031	NC_009428	CCGAGG	2	12	2228842	2228853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146278234
57032	NC_009428	GCC	2	6	2228877	2228882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278234
57033	NC_009428	GCCC	2	8	2228908	2228915	0 %	0 %	25 %	75 %	146278234
57034	NC_009428	TCT	2	6	2228926	2228931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146278234
57035	NC_009428	GAG	2	6	2228937	2228942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146278234
57036	NC_009428	CGC	2	6	2228969	2228974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278234
57037	NC_009428	TTC	2	6	2228979	2228984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146278234
57038	NC_009428	GCTC	2	8	2229029	2229036	0 %	25 %	25 %	50 %	146278234
57039	NC_009428	GCC	2	6	2229048	2229053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278234
57040	NC_009428	CGC	2	6	2229098	2229103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278234
57041	NC_009428	CCG	2	6	2229169	2229174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278234
57042	NC_009428	GC	3	6	2229213	2229218	0 %	0 %	50 %	50 %	146278234
57043	NC_009428	TGG	2	6	2229232	2229237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278234
57044	NC_009428	GGCG	2	8	2229268	2229275	0 %	0 %	75 %	25 %	146278234
57045	NC_009428	GGT	3	9	2229332	2229340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278234
57046	NC_009428	CGA	2	6	2229359	2229364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278234
57047	NC_009428	CGCC	2	8	2229467	2229474	0 %	0 %	25 %	75 %	146278234
57048	NC_009428	GCG	3	9	2229483	2229491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278234
57049	NC_009428	GGC	2	6	2229512	2229517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278234
57050	NC_009428	CCGCGC	2	12	2229593	2229604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278234
57051	NC_009428	CGGTG	2	10	2229608	2229617	0 %	20 %	60 %	20 %	146278234
57052	NC_009428	GTGCGG	2	12	2229648	2229659	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146278234
57053	NC_009428	TCG	2	6	2229703	2229708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278234
57054	NC_009428	G	7	7	2229811	2229817	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57055	NC_009428	CCT	2	6	2229845	2229850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57056	NC_009428	GCCA	2	8	2229866	2229873	25 %	0 %	25 %	50 %	146278235
57057	NC_009428	CG	3	6	2229929	2229934	0 %	0 %	50 %	50 %	146278235
57058	NC_009428	TCG	2	6	2230012	2230017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278235
57059	NC_009428	ATGT	2	8	2230047	2230054	25 %	50 %	25 %	0 %	146278235
57060	NC_009428	GCT	2	6	2230097	2230102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278235
57061	NC_009428	ATC	2	6	2230104	2230109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146278235
57062	NC_009428	GTCG	2	8	2230123	2230130	0 %	25 %	50 %	25 %	146278235
57063	NC_009428	CGG	2	6	2230132	2230137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278235
57064	NC_009428	CCG	2	6	2230184	2230189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278235
57065	NC_009428	TGG	2	6	2230222	2230227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278235
57066	NC_009428	TCG	2	6	2230237	2230242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278235
57067	NC_009428	CTT	2	6	2230298	2230303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146278235
57068	NC_009428	TGG	2	6	2230390	2230395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278235
57069	NC_009428	CGG	2	6	2230409	2230414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278235
57070	NC_009428	CG	5	10	2230422	2230431	0 %	0 %	50 %	50 %	146278235
57071	NC_009428	CAT	2	6	2230541	2230546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146278235
57072	NC_009428	CGGC	2	8	2230567	2230574	0 %	0 %	50 %	50 %	146278235
57073	NC_009428	GGC	2	6	2230586	2230591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278235
57074	NC_009428	TCA	2	6	2230702	2230707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146278235
57075	NC_009428	TCGA	2	8	2230713	2230720	25 %	25 %	25 %	25 %	146278235
57076	NC_009428	GCC	2	6	2230728	2230733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278235
57077	NC_009428	CGAGAC	2	12	2230832	2230843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278235
57078	NC_009428	GCG	2	6	2230894	2230899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57079	NC_009428	TCC	3	9	2230932	2230940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57080	NC_009428	TGTCCT	2	12	2231118	2231129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	146278236
57081	NC_009428	TCG	2	6	2231174	2231179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278236
57082	NC_009428	CCG	2	6	2231261	2231266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278236
57083	NC_009428	GTG	2	6	2231327	2231332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278236
57084	NC_009428	TGG	2	6	2231334	2231339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278236
57085	NC_009428	AGG	2	6	2231406	2231411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146278236
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57087	NC_009428	GGC	2	6	2231539	2231544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278237
57088	NC_009428	GGT	2	6	2231553	2231558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278237
57089	NC_009428	CAC	2	6	2231572	2231577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146278237
57090	NC_009428	AGG	2	6	2231586	2231591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146278237
57091	NC_009428	GAT	2	6	2231743	2231748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146278237
57092	NC_009428	GGA	2	6	2231772	2231777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146278237
57093	NC_009428	GC	4	8	2231789	2231796	0 %	0 %	50 %	50 %	146278237
57094	NC_009428	CGA	2	6	2231817	2231822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278237
57095	NC_009428	GTCGA	2	10	2231846	2231855	20 %	20 %	40 %	20 %	146278237
57096	NC_009428	GTC	2	6	2231959	2231964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278237
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57098	NC_009428	GC	3	6	2232033	2232038	0 %	0 %	50 %	50 %	146278237
57099	NC_009428	AAG	2	6	2232091	2232096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146278237
57100	NC_009428	TGT	2	6	2232135	2232140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146278237
57101	NC_009428	GAA	2	6	2232145	2232150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146278237
57102	NC_009428	ATC	2	6	2232308	2232313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146278237
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57104	NC_009428	GCC	2	6	2232439	2232444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278237
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57107	NC_009428	TGG	2	6	2232557	2232562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278237
57108	NC_009428	TCG	2	6	2232599	2232604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278237
57109	NC_009428	GCC	2	6	2232670	2232675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278237
57110	NC_009428	GGTC	2	8	2232678	2232685	0 %	25 %	50 %	25 %	146278237
57111	NC_009428	GTT	2	6	2232787	2232792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146278237
57112	NC_009428	GCC	2	6	2232826	2232831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278237
57113	NC_009428	ACG	2	6	2232848	2232853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278237
57114	NC_009428	CCTTG	2	10	2232873	2232882	0 %	40 %	20 %	40 %	146278237
57115	NC_009428	GAT	2	6	2232936	2232941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146278238
57116	NC_009428	AGG	2	6	2233120	2233125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146278238
57117	NC_009428	TCGTAG	2	12	2233153	2233164	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	146278238
57118	NC_009428	CGG	2	6	2233196	2233201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278238
57119	NC_009428	CTG	2	6	2233209	2233214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278238
57120	NC_009428	AGA	2	6	2233256	2233261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146278238
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57122	NC_009428	GCT	2	6	2233400	2233405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278238
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57200	NC_009428	CGG	2	6	2236009	2236014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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57220	NC_009428	GTA	2	6	2236961	2236966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146278241
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57222	NC_009428	GAA	2	6	2237054	2237059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57223	NC_009428	ATG	2	6	2237121	2237126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146278242
57224	NC_009428	GA	3	6	2237136	2237141	50 %	0 %	50 %	0 %	146278242
57225	NC_009428	CCG	2	6	2237142	2237147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278242
57226	NC_009428	GGCCG	2	10	2237164	2237173	0 %	0 %	60 %	40 %	146278242
57227	NC_009428	GGC	2	6	2237179	2237184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278242
57228	NC_009428	TCC	2	6	2237217	2237222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146278242
57229	NC_009428	CACC	2	8	2237224	2237231	25 %	0 %	0 %	75 %	146278242
57230	NC_009428	GGC	2	6	2237257	2237262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278242
57231	NC_009428	GCG	2	6	2237297	2237302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278242
57232	NC_009428	GCC	2	6	2237320	2237325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278242
57233	NC_009428	GCCTT	2	10	2237442	2237451	0 %	40 %	20 %	40 %	146278242
57234	NC_009428	GCGG	2	8	2237481	2237488	0 %	0 %	75 %	25 %	146278242
57235	NC_009428	GAT	2	6	2237509	2237514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146278242
57236	NC_009428	CCG	2	6	2237547	2237552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278242
57237	NC_009428	GTC	2	6	2237676	2237681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146278242
57238	NC_009428	CTTC	2	8	2237725	2237732	0 %	50 %	0 %	50 %	146278242
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57242	NC_009428	GAG	2	6	2237951	2237956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57243	NC_009428	CAGGA	2	10	2237976	2237985	40 %	0 %	40 %	20 %	146278243
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57262	NC_009428	GCGAA	2	10	2238507	2238516	40 %	0 %	40 %	20 %	146278243
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57279	NC_009428	CGA	2	6	2239228	2239233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278243
57280	NC_009428	GGCG	2	8	2239234	2239241	0 %	0 %	75 %	25 %	146278243
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57312	NC_009428	CTC	2	6	2240386	2240391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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57314	NC_009428	GA	3	6	2240415	2240420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57315	NC_009428	TCAGCT	2	12	2240436	2240447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146278244
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57334	NC_009428	GCG	2	6	2241161	2241166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278244
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57339	NC_009428	GCC	2	6	2241227	2241232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278244
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57342	NC_009428	CCAGCG	2	12	2241273	2241284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146278244
57343	NC_009428	CGGCCG	2	12	2241336	2241347	0 %	0 %	50 %	50 %	146278244
57344	NC_009428	GGC	2	6	2241361	2241366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278244
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57348	NC_009428	CGC	2	6	2241463	2241468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278244
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57350	NC_009428	CCT	2	6	2241522	2241527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146278244
57351	NC_009428	GGC	2	6	2241541	2241546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278244
57352	NC_009428	CGC	2	6	2241550	2241555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278244
57353	NC_009428	GGC	2	6	2241664	2241669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278244
57354	NC_009428	TGG	2	6	2241717	2241722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146278244
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57357	NC_009428	AGC	2	6	2241926	2241931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278244
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57363	NC_009428	GCCG	3	12	2242095	2242106	0 %	0 %	50 %	50 %	146278245
57364	NC_009428	TCGA	2	8	2242139	2242146	25 %	25 %	25 %	25 %	146278245
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57366	NC_009428	CGA	2	6	2242329	2242334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278245
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57385	NC_009428	CCGG	2	8	2242920	2242927	0 %	0 %	50 %	50 %	146278245
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57424	NC_009428	CG	3	6	2244708	2244713	0 %	0 %	50 %	50 %	146278248
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57452	NC_009428	CGG	2	6	2245650	2245655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278249
57453	NC_009428	GCAG	2	8	2245684	2245691	25 %	0 %	50 %	25 %	146278249
57454	NC_009428	CGC	2	6	2245716	2245721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278249
57455	NC_009428	GGCCTC	2	12	2245757	2245768	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146278249
57456	NC_009428	GC	3	6	2245784	2245789	0 %	0 %	50 %	50 %	146278249
57457	NC_009428	GCCA	2	8	2245848	2245855	25 %	0 %	25 %	50 %	146278249
57458	NC_009428	GAT	2	6	2245982	2245987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146278249
57459	NC_009428	GAC	2	6	2246060	2246065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278249
57460	NC_009428	GCG	2	6	2246152	2246157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278249
57461	NC_009428	ATC	2	6	2246196	2246201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146278249
57462	NC_009428	GTT	2	6	2246213	2246218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146278249
57463	NC_009428	GGC	2	6	2246258	2246263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146278249
57464	NC_009428	CGTC	2	8	2246278	2246285	0 %	25 %	25 %	50 %	146278249
57465	NC_009428	GCGCTC	2	12	2246288	2246299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146278249
57466	NC_009428	TGA	2	6	2246416	2246421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146278249
57467	NC_009428	CGC	2	6	2246437	2246442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278249
57468	NC_009428	CTTC	2	8	2246551	2246558	0 %	50 %	0 %	50 %	146278249
57469	NC_009428	CGA	2	6	2246591	2246596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146278249
57470	NC_009428	TGCC	2	8	2246617	2246624	0 %	25 %	25 %	50 %	146278249
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57472	NC_009428	GAA	2	6	2246831	2246836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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57492	NC_009428	CGGCC	2	10	2248058	2248067	0 %	0 %	40 %	60 %	146278251
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57497	NC_009428	GCCCG	2	10	2248177	2248186	0 %	0 %	40 %	60 %	146278251
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57499	NC_009428	CGC	2	6	2248200	2248205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146278251
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