MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 chromosome 2

Total Repeats: 31663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_009050	GAG	2	6	1213500	1213505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464799
31502	NC_009050	CAT	2	6	1213521	1213526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464799
31503	NC_009050	CAC	2	6	1213542	1213547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464799
31504	NC_009050	AGC	2	6	1213603	1213608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464799
31505	NC_009050	GCG	2	6	1213616	1213621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464799
31506	NC_009050	C	6	6	1213631	1213636	0 %	0 %	0 %	100 %	126464799
31507	NC_009050	GAT	2	6	1213701	1213706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464799
31508	NC_009050	TCACGA	2	12	1213952	1213963	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	126464799
31509	NC_009050	TCA	2	6	1213964	1213969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464799
31510	NC_009050	GCC	2	6	1213990	1213995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464799
31511	NC_009050	GCG	2	6	1214009	1214014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464799
31512	NC_009050	AGCC	2	8	1214023	1214030	25 %	0 %	25 %	50 %	126464799
31513	NC_009050	TCC	2	6	1214067	1214072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31514	NC_009050	GGCG	2	8	1214077	1214084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31515	NC_009050	GGCA	2	8	1214175	1214182	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31516	NC_009050	AGCCGC	2	12	1214241	1214252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31517	NC_009050	GCG	2	6	1214269	1214274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31518	NC_009050	CAG	2	6	1214361	1214366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464800
31519	NC_009050	CTC	2	6	1214384	1214389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464800
31520	NC_009050	GCC	2	6	1214396	1214401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464800
31521	NC_009050	CGCC	2	8	1214413	1214420	0 %	0 %	25 %	75 %	126464800
31522	NC_009050	AGT	2	6	1214536	1214541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464800
31523	NC_009050	GCC	2	6	1214561	1214566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464800
31524	NC_009050	GA	3	6	1214577	1214582	50 %	0 %	50 %	0 %	126464800
31525	NC_009050	AT	3	6	1214592	1214597	50 %	50 %	0 %	0 %	126464800
31526	NC_009050	GCC	3	9	1214648	1214656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464800
31527	NC_009050	CCTT	2	8	1214670	1214677	0 %	50 %	0 %	50 %	126464800
31528	NC_009050	CG	3	6	1214704	1214709	0 %	0 %	50 %	50 %	126464800
31529	NC_009050	CCG	2	6	1214716	1214721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464800
31530	NC_009050	GGCG	2	8	1214726	1214733	0 %	0 %	75 %	25 %	126464800
31531	NC_009050	CAC	2	6	1214750	1214755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464800
31532	NC_009050	TCG	2	6	1214784	1214789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464800
31533	NC_009050	CTT	2	6	1214822	1214827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464800
31534	NC_009050	ATG	2	6	1214934	1214939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464800
31535	NC_009050	GAG	2	6	1214946	1214951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464800
31536	NC_009050	GGC	2	6	1215016	1215021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464800
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31538	NC_009050	GTGCG	2	10	1215143	1215152	0 %	20 %	60 %	20 %	126464800
31539	NC_009050	CTT	2	6	1215272	1215277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464800
31540	NC_009050	CGC	2	6	1215326	1215331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464800
31541	NC_009050	GC	3	6	1215330	1215335	0 %	0 %	50 %	50 %	126464800
31542	NC_009050	TCC	2	6	1215387	1215392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464800
31543	NC_009050	ATC	2	6	1215477	1215482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464800
31544	NC_009050	AGGCC	2	10	1215499	1215508	20 %	0 %	40 %	40 %	126464800
31545	NC_009050	GCC	2	6	1215513	1215518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464800
31546	NC_009050	AGC	2	6	1215528	1215533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464800
31547	NC_009050	CGG	2	6	1215537	1215542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464800
31548	NC_009050	TTC	3	9	1215552	1215560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464800
31549	NC_009050	ATC	2	6	1215566	1215571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31550	NC_009050	GAA	2	6	1215663	1215668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464801
31551	NC_009050	CGG	2	6	1215707	1215712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464801
31552	NC_009050	GC	3	6	1215734	1215739	0 %	0 %	50 %	50 %	126464801
31553	NC_009050	CAC	2	6	1215759	1215764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464801
31554	NC_009050	CCT	2	6	1215767	1215772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464801
31555	NC_009050	CCGG	2	8	1215775	1215782	0 %	0 %	50 %	50 %	126464801
31556	NC_009050	TCG	2	6	1215796	1215801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464801
31557	NC_009050	CAGCG	2	10	1215802	1215811	20 %	0 %	40 %	40 %	126464801
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31559	NC_009050	GCCC	2	8	1215845	1215852	0 %	0 %	25 %	75 %	126464801
31560	NC_009050	CG	4	8	1215896	1215903	0 %	0 %	50 %	50 %	126464801
31561	NC_009050	GTT	2	6	1215927	1215932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464801
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31563	NC_009050	TCG	2	6	1215946	1215951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464801
31564	NC_009050	GC	3	6	1216033	1216038	0 %	0 %	50 %	50 %	126464801
31565	NC_009050	GGA	2	6	1216049	1216054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464801
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31567	NC_009050	AGC	3	9	1216084	1216092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464801
31568	NC_009050	TGA	2	6	1216106	1216111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464801
31569	NC_009050	GC	5	10	1216112	1216121	0 %	0 %	50 %	50 %	126464801
31570	NC_009050	GCT	3	9	1216133	1216141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464801
31571	NC_009050	GCC	2	6	1216143	1216148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464801
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31577	NC_009050	GGC	2	6	1216339	1216344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464801
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31584	NC_009050	GTCCG	2	10	1216553	1216562	0 %	20 %	40 %	40 %	126464801
31585	NC_009050	GCT	2	6	1216578	1216583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31586	NC_009050	GCC	2	6	1216606	1216611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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31588	NC_009050	CGC	2	6	1216678	1216683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31589	NC_009050	AGC	2	6	1216728	1216733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31590	NC_009050	CTC	2	6	1216745	1216750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31591	NC_009050	GCA	2	6	1216790	1216795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464802
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31593	NC_009050	GCGG	2	8	1216819	1216826	0 %	0 %	75 %	25 %	126464802
31594	NC_009050	CCGGC	2	10	1216881	1216890	0 %	0 %	40 %	60 %	126464802
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31598	NC_009050	CCGC	2	8	1217081	1217088	0 %	0 %	25 %	75 %	126464802
31599	NC_009050	CGG	2	6	1217108	1217113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464802
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31601	NC_009050	GC	3	6	1217181	1217186	0 %	0 %	50 %	50 %	126464802
31602	NC_009050	TCG	2	6	1217267	1217272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464802
31603	NC_009050	CG	3	6	1217271	1217276	0 %	0 %	50 %	50 %	126464802
31604	NC_009050	TCA	2	6	1217285	1217290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464802
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31607	NC_009050	GC	4	8	1217377	1217384	0 %	0 %	50 %	50 %	126464802
31608	NC_009050	GAG	2	6	1217386	1217391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464802
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31613	NC_009050	GCCC	2	8	1217510	1217517	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31614	NC_009050	GCC	2	6	1217521	1217526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31615	NC_009050	GCCCG	2	10	1217541	1217550	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31616	NC_009050	GCC	2	6	1217552	1217557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31617	NC_009050	GCCCG	2	10	1217571	1217580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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31619	NC_009050	TGCC	2	8	1217625	1217632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.