MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 3260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009040	AGG	2	6	15311	15316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464815
502	NC_009040	CCG	2	6	15337	15342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464815
503	NC_009040	CG	3	6	15345	15350	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
504	NC_009040	GTCG	2	8	15453	15460	0 %	25 %	50 %	25 %	126464815
505	NC_009040	GCG	2	6	15487	15492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464815
506	NC_009040	CAC	2	6	15528	15533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464815
507	NC_009040	CCT	4	12	15545	15556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464815
508	NC_009040	CGG	2	6	15569	15574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464815
509	NC_009040	GGC	3	9	15579	15587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464815
510	NC_009040	CGC	2	6	15594	15599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464815
511	NC_009040	CG	3	6	15621	15626	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
512	NC_009040	TCG	2	6	15658	15663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464815
513	NC_009040	CG	3	6	15704	15709	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
514	NC_009040	GC	4	8	15787	15794	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
515	NC_009040	TCG	2	6	15843	15848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464816
516	NC_009040	GCC	2	6	15862	15867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464816
517	NC_009040	CGGT	2	8	15927	15934	0 %	25 %	50 %	25 %	126464816
518	NC_009040	CGATGT	2	12	16009	16020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126464816
519	NC_009040	CGC	2	6	16036	16041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464816
520	NC_009040	GGT	2	6	16057	16062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464816
521	NC_009040	CAG	2	6	16085	16090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464816
522	NC_009040	CAC	2	6	16184	16189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464816
523	NC_009040	GC	3	6	16278	16283	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
524	NC_009040	GGC	2	6	16298	16303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464816
525	NC_009040	TCG	2	6	16386	16391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464816
526	NC_009040	TGG	2	6	16401	16406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464816
527	NC_009040	CCCA	2	8	16434	16441	25 %	0 %	0 %	75 %	126464816
528	NC_009040	GCGG	2	8	16448	16455	0 %	0 %	75 %	25 %	126464816
529	NC_009040	GAG	2	6	16460	16465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464816
530	NC_009040	GCCCG	2	10	16502	16511	0 %	0 %	40 %	60 %	126464816
531	NC_009040	TCGA	2	8	16512	16519	25 %	25 %	25 %	25 %	126464816
532	NC_009040	CTG	2	6	16537	16542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464816
533	NC_009040	GGTG	2	8	16567	16574	0 %	25 %	75 %	0 %	126464816
534	NC_009040	GC	3	6	16636	16641	0 %	0 %	50 %	50 %	126464816
535	NC_009040	AGGC	2	8	16665	16672	25 %	0 %	50 %	25 %	126464816
536	NC_009040	GAC	2	6	16697	16702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464816
537	NC_009040	TGG	2	6	16704	16709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464816
538	NC_009040	CAC	2	6	16730	16735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464816
539	NC_009040	GCCGA	2	10	16737	16746	20 %	0 %	40 %	40 %	126464816
540	NC_009040	CTC	2	6	16756	16761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464816
541	NC_009040	GCGCG	2	10	16823	16832	0 %	0 %	60 %	40 %	126464817
542	NC_009040	CG	4	8	16829	16836	0 %	0 %	50 %	50 %	126464817
543	NC_009040	GGT	2	6	16943	16948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464817
544	NC_009040	GAC	2	6	16958	16963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464817
545	NC_009040	CT	3	6	16973	16978	0 %	50 %	0 %	50 %	126464817
546	NC_009040	GGCG	2	8	17020	17027	0 %	0 %	75 %	25 %	126464817
547	NC_009040	CCACCC	2	12	17044	17055	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	126464817
548	NC_009040	GCG	2	6	17149	17154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464817
549	NC_009040	GATC	2	8	17224	17231	25 %	25 %	25 %	25 %	126464817
550	NC_009040	TCAGGA	2	12	17305	17316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126464817
551	NC_009040	TTC	2	6	17333	17338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464817
552	NC_009040	GCCA	2	8	17433	17440	25 %	0 %	25 %	50 %	126464818
553	NC_009040	GCC	2	6	17449	17454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464818
554	NC_009040	GCC	2	6	17500	17505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464818
555	NC_009040	CGGCG	2	10	17515	17524	0 %	0 %	60 %	40 %	126464818
556	NC_009040	CGG	2	6	17550	17555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464818
557	NC_009040	GC	3	6	17590	17595	0 %	0 %	50 %	50 %	126464818
558	NC_009040	GCC	2	6	17624	17629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464818
559	NC_009040	CAG	2	6	17633	17638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464818
560	NC_009040	GCC	2	6	17647	17652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464818
561	NC_009040	CGT	2	6	17671	17676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464818
562	NC_009040	GCC	2	6	17693	17698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464818
563	NC_009040	CCCG	3	12	17740	17751	0 %	0 %	25 %	75 %	126464818
564	NC_009040	CCA	2	6	17774	17779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464818
565	NC_009040	GAC	2	6	17786	17791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464818
566	NC_009040	GGC	3	9	17813	17821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464818
567	NC_009040	AGC	2	6	17823	17828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464818
568	NC_009040	CAT	2	6	17849	17854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464818
569	NC_009040	GCC	2	6	17861	17866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464818
570	NC_009040	CGG	2	6	17900	17905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464818
571	NC_009040	CGG	2	6	17928	17933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464818
572	NC_009040	GCC	2	6	17966	17971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464818
573	NC_009040	CGC	3	9	18008	18016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464818
574	NC_009040	GGC	2	6	18065	18070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464818
575	NC_009040	GGC	2	6	18084	18089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464818
576	NC_009040	CAG	2	6	18098	18103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464818
577	NC_009040	GGA	2	6	18106	18111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464818
578	NC_009040	CGA	2	6	18142	18147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464818
579	NC_009040	GGCG	2	8	18169	18176	0 %	0 %	75 %	25 %	126464818
580	NC_009040	GAG	2	6	18188	18193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464818
581	NC_009040	CGT	2	6	18217	18222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464818
582	NC_009040	CAC	2	6	18227	18232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464818
583	NC_009040	CGC	2	6	18363	18368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_009040	G	6	6	18384	18389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009040	CGG	2	6	18445	18450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464819
586	NC_009040	CCA	2	6	18499	18504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464819
587	NC_009040	GTG	2	6	18552	18557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464819
588	NC_009040	CCG	2	6	18592	18597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464819
589	NC_009040	CG	3	6	18596	18601	0 %	0 %	50 %	50 %	126464819
590	NC_009040	CTC	2	6	18629	18634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464819
591	NC_009040	ATC	2	6	18681	18686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464819
592	NC_009040	GCG	2	6	18703	18708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464819
593	NC_009040	CTT	2	6	18722	18727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464819
594	NC_009040	GCT	2	6	18760	18765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464819
595	NC_009040	CCG	2	6	18797	18802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464819
596	NC_009040	CGC	2	6	18916	18921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464819
597	NC_009040	GCG	2	6	18926	18931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464819
598	NC_009040	GTG	2	6	18966	18971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464819
599	NC_009040	CGCC	2	8	18978	18985	0 %	0 %	25 %	75 %	126464819
600	NC_009040	TGG	2	6	18997	19002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464819
601	NC_009040	CGC	2	6	19057	19062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464819
602	NC_009040	GGTG	2	8	19072	19079	0 %	25 %	75 %	0 %	126464819
603	NC_009040	TCA	2	6	19084	19089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464819
604	NC_009040	GC	3	6	19125	19130	0 %	0 %	50 %	50 %	126464819
605	NC_009040	CGAG	2	8	19279	19286	25 %	0 %	50 %	25 %	126464819
606	NC_009040	GTC	2	6	19313	19318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464819
607	NC_009040	GGGCA	2	10	19322	19331	20 %	0 %	60 %	20 %	126464819
608	NC_009040	GAA	2	6	19349	19354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464819
609	NC_009040	CCG	2	6	19378	19383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_009040	CG	3	6	19417	19422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_009040	CCGC	2	8	19430	19437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
612	NC_009040	CTG	3	9	19471	19479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_009040	CCGG	2	8	19491	19498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_009040	GC	3	6	19524	19529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_009040	GGC	2	6	19550	19555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_009040	CCG	2	6	19559	19564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_009040	TGCCTG	2	12	19588	19599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009040	C	6	6	19613	19618	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
619	NC_009040	GC	4	8	19637	19644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_009040	CGTC	2	8	19687	19694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
621	NC_009040	GC	3	6	19704	19709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_009040	GA	3	6	19787	19792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009040	CCG	2	6	19842	19847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_009040	TA	4	8	19859	19866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009040	GCAG	2	8	19884	19891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_009040	GCCCCC	2	12	19909	19920	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
627	NC_009040	GCCC	2	8	20115	20122	0 %	0 %	25 %	75 %	126464820
628	NC_009040	GC	3	6	20123	20128	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
629	NC_009040	GCC	2	6	20146	20151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464820
630	NC_009040	TC	3	6	20163	20168	0 %	50 %	0 %	50 %	126464820
631	NC_009040	GC	3	6	20238	20243	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
632	NC_009040	GGC	2	6	20260	20265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464820
633	NC_009040	GC	3	6	20264	20269	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
634	NC_009040	CCG	2	6	20359	20364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464820
635	NC_009040	CGA	2	6	20437	20442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464820
636	NC_009040	TGC	2	6	20445	20450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464820
637	NC_009040	GC	3	6	20455	20460	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
638	NC_009040	GTGGCG	2	12	20534	20545	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	126464820
639	NC_009040	CCG	2	6	20577	20582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464820
640	NC_009040	CGG	2	6	20598	20603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464820
641	NC_009040	GATC	2	8	20629	20636	25 %	25 %	25 %	25 %	126464820
642	NC_009040	CGG	2	6	20668	20673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464820
643	NC_009040	CGA	2	6	20683	20688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464820
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645	NC_009040	CCG	2	6	20774	20779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464820
646	NC_009040	AGA	2	6	20811	20816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464820
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649	NC_009040	CGG	2	6	21054	21059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464820
650	NC_009040	CTG	2	6	21068	21073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464820
651	NC_009040	CCT	2	6	21087	21092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464820
652	NC_009040	TTCGA	2	10	21101	21110	20 %	40 %	20 %	20 %	126464820
653	NC_009040	CTT	2	6	21118	21123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464820
654	NC_009040	TGC	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464820
655	NC_009040	TCGA	2	8	21149	21156	25 %	25 %	25 %	25 %	126464820
656	NC_009040	CGC	2	6	21172	21177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464820
657	NC_009040	GC	5	10	21176	21185	0 %	0 %	50 %	50 %	126464820
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663	NC_009040	GCC	2	6	21440	21445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464820
664	NC_009040	TGG	2	6	21459	21464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464820
665	NC_009040	GGC	2	6	21471	21476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464820
666	NC_009040	GGC	2	6	21487	21492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464820
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668	NC_009040	GTT	2	6	21526	21531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
669	NC_009040	CG	4	8	21533	21540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
670	NC_009040	G	6	6	21550	21555	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
671	NC_009040	CGG	2	6	21570	21575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
672	NC_009040	CG	4	8	21589	21596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
673	NC_009040	TCC	2	6	21604	21609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
674	NC_009040	GA	3	6	21623	21628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
675	NC_009040	CAAGCG	2	12	21641	21652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464821
676	NC_009040	C	7	7	21663	21669	0 %	0 %	0 %	100 %	126464821
677	NC_009040	CGG	2	6	21671	21676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464821
678	NC_009040	CGGCC	2	10	21686	21695	0 %	0 %	40 %	60 %	126464821
679	NC_009040	GCCC	2	8	21755	21762	0 %	0 %	25 %	75 %	126464821
680	NC_009040	GGC	3	9	21785	21793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464821
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707	NC_009040	GCCCCT	2	12	22557	22568	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126464821
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712	NC_009040	CGC	3	9	22775	22783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
713	NC_009040	TCC	2	6	22791	22796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
714	NC_009040	GGT	2	6	22888	22893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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716	NC_009040	GCG	2	6	22934	22939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
717	NC_009040	CG	3	6	23027	23032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
718	NC_009040	GCTC	2	8	23053	23060	0 %	25 %	25 %	50 %	126464822
719	NC_009040	GCCGG	2	10	23070	23079	0 %	0 %	60 %	40 %	126464822
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730	NC_009040	CTC	2	6	23339	23344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464822
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732	NC_009040	CCG	2	6	23398	23403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464822
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734	NC_009040	ATC	2	6	23544	23549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464822
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738	NC_009040	CG	3	6	23785	23790	0 %	0 %	50 %	50 %	126464822
739	NC_009040	CCA	2	6	23791	23796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464822
740	NC_009040	GGC	2	6	23853	23858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
741	NC_009040	ATC	2	6	23938	23943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464823
742	NC_009040	CTG	2	6	23976	23981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464823
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744	NC_009040	TGG	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464823
745	NC_009040	CGGTGC	2	12	24149	24160	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126464823
746	NC_009040	CGC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464823
747	NC_009040	CTC	2	6	24201	24206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464823
748	NC_009040	CGTT	2	8	24223	24230	0 %	50 %	25 %	25 %	126464823
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750	NC_009040	GCA	2	6	24269	24274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464823
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754	NC_009040	CTC	2	6	24435	24440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464823
755	NC_009040	GC	3	6	24441	24446	0 %	0 %	50 %	50 %	126464823
756	NC_009040	ATC	2	6	24490	24495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464823
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891	NC_009040	CTG	2	6	30162	30167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464827
892	NC_009040	CTG	2	6	30234	30239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464827
893	NC_009040	GCT	2	6	30245	30250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464827
894	NC_009040	TGC	2	6	30289	30294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464827
895	NC_009040	TCT	2	6	30296	30301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464827
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897	NC_009040	TGGAGC	2	12	30367	30378	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126464827
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899	NC_009040	CTG	2	6	30417	30422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464827
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929	NC_009040	GGGC	2	8	31429	31436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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993	NC_009040	GC	3	6	33405	33410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1000	NC_009040	GGC	2	6	33624	33629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464829

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