MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid A

Total Repeats: 3086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009007	GA	3	6	32	37	50 %	0 %	50 %	0 %	125654606
2	NC_009007	TTC	2	6	188	193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654606
3	NC_009007	CCG	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
4	NC_009007	CGC	2	6	281	286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
5	NC_009007	CCG	3	9	291	299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
6	NC_009007	C	8	8	315	322	0 %	0 %	0 %	100 %	125654606
7	NC_009007	CCCGGC	2	12	355	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
8	NC_009007	GCG	2	6	367	372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
9	NC_009007	GCG	2	6	395	400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
10	NC_009007	CGC	2	6	408	413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
11	NC_009007	CG	3	6	437	442	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
12	NC_009007	CG	3	6	462	467	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
13	NC_009007	CG	3	6	477	482	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
14	NC_009007	CGGGC	2	10	518	527	0 %	0 %	60 %	40 %	125654606
15	NC_009007	GCG	2	6	530	535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
16	NC_009007	GC	3	6	571	576	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
17	NC_009007	CCGG	2	8	595	602	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
18	NC_009007	GGCG	2	8	606	613	0 %	0 %	75 %	25 %	125654606
19	NC_009007	CGG	4	12	627	638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
20	NC_009007	AGGC	2	8	641	648	25 %	0 %	50 %	25 %	125654606
21	NC_009007	CTC	2	6	687	692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654606
22	NC_009007	GCCG	2	8	702	709	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
23	NC_009007	C	6	6	713	718	0 %	0 %	0 %	100 %	125654606
24	NC_009007	CGCGG	2	10	723	732	0 %	0 %	60 %	40 %	125654606
25	NC_009007	CCA	2	6	738	743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654606
26	NC_009007	GAG	2	6	862	867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654606
27	NC_009007	TCT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654606
28	NC_009007	GGGC	2	8	891	898	0 %	0 %	75 %	25 %	125654606
29	NC_009007	AGC	2	6	901	906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
30	NC_009007	CGG	3	9	918	926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
31	NC_009007	GC	3	6	1008	1013	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
32	NC_009007	CGG	2	6	1062	1067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
33	NC_009007	TGG	2	6	1079	1084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654606
34	NC_009007	CAC	2	6	1122	1127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654606
35	NC_009007	CGA	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
36	NC_009007	GAT	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654606
37	NC_009007	GC	3	6	1261	1266	0 %	0 %	50 %	50 %	125654606
38	NC_009007	GAG	2	6	1267	1272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654606
39	NC_009007	TCG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654606
40	NC_009007	CCT	2	6	1380	1385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654606
41	NC_009007	CAG	3	9	1396	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
42	NC_009007	CTG	2	6	1432	1437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654606
43	NC_009007	ACC	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654606
44	NC_009007	GAAC	2	8	1476	1483	50 %	0 %	25 %	25 %	125654606
45	NC_009007	GAG	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654606
46	NC_009007	GCG	2	6	1541	1546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
47	NC_009007	GCACCG	2	12	1547	1558	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	125654606
48	NC_009007	CCA	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654606
49	NC_009007	CGC	2	6	1638	1643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654606
50	NC_009007	ACG	2	6	1655	1660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
51	NC_009007	CAG	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654606
52	NC_009007	TGA	2	6	1763	1768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654606
53	NC_009007	CGG	2	6	1770	1775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654606
54	NC_009007	GGT	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654607
55	NC_009007	GC	3	6	1916	1921	0 %	0 %	50 %	50 %	125654607
56	NC_009007	GGGC	2	8	1977	1984	0 %	0 %	75 %	25 %	125654607
57	NC_009007	TGC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654607
58	NC_009007	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654607
59	NC_009007	CGA	2	6	2293	2298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654607
60	NC_009007	CGG	2	6	2304	2309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654607
61	NC_009007	GC	4	8	2350	2357	0 %	0 %	50 %	50 %	125654607
62	NC_009007	GGA	2	6	2362	2367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654607
63	NC_009007	GAGCG	2	10	2368	2377	20 %	0 %	60 %	20 %	125654607
64	NC_009007	GAA	2	6	2407	2412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654607
65	NC_009007	ACG	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654607
66	NC_009007	CCA	2	6	2485	2490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654607
67	NC_009007	ATG	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654607
68	NC_009007	CGA	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654607
69	NC_009007	GGGCGA	2	12	2545	2556	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	125654607
70	NC_009007	GCC	3	9	2567	2575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654607
71	NC_009007	GCG	2	6	2606	2611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654607
72	NC_009007	GCGG	2	8	2622	2629	0 %	0 %	75 %	25 %	125654607
73	NC_009007	GGCCC	2	10	2637	2646	0 %	0 %	40 %	60 %	125654607
74	NC_009007	CGAG	2	8	2658	2665	25 %	0 %	50 %	25 %	125654607
75	NC_009007	CGC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_009007	GCCTC	2	10	2713	2722	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_009007	CGC	2	6	2779	2784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009007	CGCT	2	8	2810	2817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009007	ACC	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009007	CGT	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009007	GGA	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009007	TCGC	2	8	2983	2990	0 %	25 %	25 %	50 %	125654608
83	NC_009007	CG	4	8	3007	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
84	NC_009007	TCG	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654608
85	NC_009007	CCG	2	6	3029	3034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
86	NC_009007	GCC	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
87	NC_009007	CGG	2	6	3108	3113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654608
88	NC_009007	GGAGCG	2	12	3148	3159	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	125654608
89	NC_009007	CGGA	2	8	3191	3198	25 %	0 %	50 %	25 %	125654608
90	NC_009007	GCC	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
91	NC_009007	CCG	2	6	3227	3232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
92	NC_009007	CTCGGC	2	12	3264	3275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	125654608
93	NC_009007	CGGCG	2	10	3282	3291	0 %	0 %	60 %	40 %	125654608
94	NC_009007	GCC	2	6	3301	3306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
95	NC_009007	TCC	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
96	NC_009007	GCC	2	6	3341	3346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
97	NC_009007	CCAGCC	2	12	3356	3367	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	125654608
98	NC_009007	AGCGC	2	10	3389	3398	20 %	0 %	40 %	40 %	125654608
99	NC_009007	GC	3	6	3407	3412	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
100	NC_009007	GCT	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654608
101	NC_009007	GC	5	10	3534	3543	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
102	NC_009007	GGCC	2	8	3557	3564	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
103	NC_009007	GGCCGC	2	12	3597	3608	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
104	NC_009007	CCGG	2	8	3614	3621	0 %	0 %	50 %	50 %	125654608
105	NC_009007	CTC	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
106	NC_009007	CGC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
107	NC_009007	TCA	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654608
108	NC_009007	CTC	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
109	NC_009007	AGCC	2	8	3832	3839	25 %	0 %	25 %	50 %	125654608
110	NC_009007	CTC	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
111	NC_009007	TCGAGC	2	12	3853	3864	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	125654608
112	NC_009007	GCA	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654608
113	NC_009007	GCC	2	6	3875	3880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
114	NC_009007	GCGG	2	8	3888	3895	0 %	0 %	75 %	25 %	125654608
115	NC_009007	CTC	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654608
116	NC_009007	GCC	2	6	3925	3930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
117	NC_009007	GCC	3	9	3934	3942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
118	NC_009007	GGCCG	2	10	4032	4041	0 %	0 %	60 %	40 %	125654608
119	NC_009007	GCC	2	6	4050	4055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654608
120	NC_009007	G	7	7	4058	4064	0 %	0 %	100 %	0 %	125654608
121	NC_009007	CGCTTG	2	12	4075	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654608
122	NC_009007	TC	3	6	4099	4104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009007	GGA	2	6	4118	4123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009007	CG	4	8	4131	4138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009007	GCC	2	6	4159	4164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009007	C	6	6	4172	4177	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_009007	CG	4	8	4187	4194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009007	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009007	GCC	3	9	4232	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654609
130	NC_009007	CTC	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654609
131	NC_009007	GCC	2	6	4251	4256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654609
132	NC_009007	CCA	2	6	4263	4268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654609
133	NC_009007	GGC	2	6	4282	4287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654609
134	NC_009007	GCC	2	6	4454	4459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654609
135	NC_009007	CTG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654609
136	NC_009007	CGT	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654609
137	NC_009007	GC	3	6	4499	4504	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
138	NC_009007	CTC	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654609
139	NC_009007	GC	3	6	4542	4547	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
140	NC_009007	GCG	2	6	4550	4555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654609
141	NC_009007	CTC	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654609
142	NC_009007	GCA	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654609
143	NC_009007	GAA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654609
144	NC_009007	TCGAA	2	10	4617	4626	40 %	20 %	20 %	20 %	125654609
145	NC_009007	AGGA	2	8	4631	4638	50 %	0 %	50 %	0 %	125654609
146	NC_009007	CAG	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654609
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149	NC_009007	CGT	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654609
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151	NC_009007	CG	3	6	4903	4908	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
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163	NC_009007	GC	3	6	5267	5272	0 %	0 %	50 %	50 %	125654609
164	NC_009007	GCA	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654609
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172	NC_009007	GGC	2	6	5576	5581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654609
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175	NC_009007	GCCT	2	8	5834	5841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_009007	AGTT	2	8	5847	5854	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009007	TA	4	8	5861	5868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_009007	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_009007	GAG	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
180	NC_009007	GC	5	10	6014	6023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
181	NC_009007	GGAC	2	8	6032	6039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
182	NC_009007	GC	4	8	6083	6090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
183	NC_009007	G	6	6	6109	6114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009007	CAGGCA	2	12	6128	6139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_009007	GGACC	2	10	6208	6217	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
189	NC_009007	CCGG	2	8	6229	6236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
190	NC_009007	GCA	2	6	6247	6252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_009007	CG	3	6	6302	6307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_009007	CGG	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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252	NC_009007	CGCC	2	8	8696	8703	0 %	0 %	25 %	75 %	125654612
253	NC_009007	GA	3	6	8744	8749	50 %	0 %	50 %	0 %	125654612
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256	NC_009007	GC	5	10	8886	8895	0 %	0 %	50 %	50 %	125654612
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258	NC_009007	TCGGC	2	10	8977	8986	0 %	20 %	40 %	40 %	125654613
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260	NC_009007	CCA	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654613
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263	NC_009007	GC	3	6	9082	9087	0 %	0 %	50 %	50 %	125654613
264	NC_009007	CCAC	2	8	9148	9155	25 %	0 %	0 %	75 %	125654613
265	NC_009007	GGC	2	6	9179	9184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654613
266	NC_009007	TCGA	2	8	9204	9211	25 %	25 %	25 %	25 %	125654613
267	NC_009007	CGGGC	2	10	9212	9221	0 %	0 %	60 %	40 %	125654613
268	NC_009007	CTC	2	6	9258	9263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654613
269	NC_009007	GCC	2	6	9267	9272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654613
270	NC_009007	TGGG	2	8	9282	9289	0 %	25 %	75 %	0 %	125654613
271	NC_009007	GCTTCC	2	12	9307	9318	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	125654613
272	NC_009007	CGAC	2	8	9328	9335	25 %	0 %	25 %	50 %	125654613
273	NC_009007	GCC	2	6	9420	9425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654613
274	NC_009007	GC	3	6	9440	9445	0 %	0 %	50 %	50 %	125654613
275	NC_009007	GGT	2	6	9533	9538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654613
276	NC_009007	GCT	2	6	9632	9637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654613
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282	NC_009007	CGA	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654613
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286	NC_009007	CGA	2	6	10060	10065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654614
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288	NC_009007	GCC	3	9	10136	10144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654614
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303	NC_009007	GC	3	6	10553	10558	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
304	NC_009007	CGGCC	2	10	10566	10575	0 %	0 %	40 %	60 %	125654614
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307	NC_009007	CCGG	2	8	10714	10721	0 %	0 %	50 %	50 %	125654614
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395	NC_009007	CG	4	8	13723	13730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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402	NC_009007	GAG	2	6	14030	14035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654618
403	NC_009007	GCC	2	6	14087	14092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654618
404	NC_009007	TGC	2	6	14106	14111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654618
405	NC_009007	GACC	2	8	14137	14144	25 %	0 %	25 %	50 %	125654618
406	NC_009007	CGG	2	6	14154	14159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654618
407	NC_009007	CGTCAA	2	12	14176	14187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125654618
408	NC_009007	GAA	2	6	14218	14223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654618
409	NC_009007	CGG	2	6	14255	14260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654618
410	NC_009007	CCT	2	6	14283	14288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654618
411	NC_009007	ACA	2	6	14295	14300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125654618
412	NC_009007	GTG	2	6	14354	14359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654618
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415	NC_009007	CGG	2	6	14398	14403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654618
416	NC_009007	CTC	2	6	14404	14409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654618
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422	NC_009007	CGG	2	6	14608	14613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_009007	G	6	6	14620	14625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
424	NC_009007	GC	3	6	14673	14678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
425	NC_009007	GGCC	2	8	14741	14748	0 %	0 %	50 %	50 %	125654619
426	NC_009007	CGTC	2	8	14775	14782	0 %	25 %	25 %	50 %	125654619
427	NC_009007	GGCG	2	8	14824	14831	0 %	0 %	75 %	25 %	125654619
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431	NC_009007	GAG	2	6	14978	14983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654619
432	NC_009007	GCC	2	6	15023	15028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654619
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435	NC_009007	GCCGC	2	10	15255	15264	0 %	0 %	40 %	60 %	125654619
436	NC_009007	GGA	2	6	15274	15279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654619
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447	NC_009007	CGC	2	6	15695	15700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654620
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464	NC_009007	CGA	2	6	16022	16027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654620
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498	NC_009007	CGCTGG	2	12	16941	16952	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	125654621
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