MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_008435	CG	3	6	1282150	1282155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33002	NC_008435	GCGACG	2	12	1282196	1282207	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33003	NC_008435	CGGTC	2	10	1282232	1282241	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33004	NC_008435	CGC	2	6	1282283	1282288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33005	NC_008435	TGC	2	6	1282298	1282303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33006	NC_008435	TCC	2	6	1282332	1282337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33007	NC_008435	CAA	2	6	1282340	1282345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33008	NC_008435	GGC	2	6	1282351	1282356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33009	NC_008435	TAACC	2	10	1282476	1282485	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33010	NC_008435	CGG	2	6	1282560	1282565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33011	NC_008435	ATG	2	6	1282568	1282573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33012	NC_008435	TCAT	2	8	1282610	1282617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33013	NC_008435	GC	3	6	1282660	1282665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33014	NC_008435	CAC	2	6	1282666	1282671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33015	NC_008435	TCT	2	6	1282739	1282744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33016	NC_008435	TGTGAT	2	12	1282771	1282782	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33017	NC_008435	GAA	2	6	1282830	1282835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33018	NC_008435	GCC	2	6	1282837	1282842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33019	NC_008435	CAA	3	9	1282876	1282884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33020	NC_008435	GCC	2	6	1282971	1282976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33021	NC_008435	ATG	2	6	1283002	1283007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33022	NC_008435	GTC	2	6	1283016	1283021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33023	NC_008435	TGA	2	6	1283053	1283058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33024	NC_008435	CGTT	2	8	1283187	1283194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33025	NC_008435	TCG	2	6	1283229	1283234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33026	NC_008435	GGA	2	6	1283264	1283269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33027	NC_008435	TCT	2	6	1283463	1283468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33028	NC_008435	GAT	2	6	1283554	1283559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523146
33029	NC_008435	GCG	2	6	1283594	1283599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523146
33030	NC_008435	CGC	2	6	1283649	1283654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523146
33031	NC_008435	CGG	2	6	1283658	1283663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523146
33032	NC_008435	CGA	2	6	1283752	1283757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33033	NC_008435	CG	3	6	1283843	1283848	0 %	0 %	50 %	50 %	115523146
33034	NC_008435	CAG	2	6	1283863	1283868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33035	NC_008435	GCAG	2	8	1283874	1283881	25 %	0 %	50 %	25 %	115523146
33036	NC_008435	TCG	2	6	1283927	1283932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33037	NC_008435	AGT	2	6	1283975	1283980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523146
33038	NC_008435	GCC	3	9	1284112	1284120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523146
33039	NC_008435	CAG	3	9	1284133	1284141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33040	NC_008435	GAC	2	6	1284162	1284167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33041	NC_008435	CGA	2	6	1284192	1284197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33042	NC_008435	CGG	2	6	1284219	1284224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523146
33043	NC_008435	ACG	2	6	1284347	1284352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33044	NC_008435	ATG	2	6	1284355	1284360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523146
33045	NC_008435	TGG	2	6	1284396	1284401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523146
33046	NC_008435	GCC	2	6	1284431	1284436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523146
33047	NC_008435	TGC	2	6	1284443	1284448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33048	NC_008435	GCC	2	6	1284488	1284493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523146
33049	NC_008435	GCG	2	6	1284530	1284535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523146
33050	NC_008435	GGCC	2	8	1284544	1284551	0 %	0 %	50 %	50 %	115523146
33051	NC_008435	GCGG	2	8	1284556	1284563	0 %	0 %	75 %	25 %	115523146
33052	NC_008435	TTCG	2	8	1284612	1284619	0 %	50 %	25 %	25 %	115523146
33053	NC_008435	TCG	3	9	1284635	1284643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33054	NC_008435	GCG	2	6	1284771	1284776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523146
33055	NC_008435	GCG	2	6	1284812	1284817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523146
33056	NC_008435	CG	3	6	1284842	1284847	0 %	0 %	50 %	50 %	115523146
33057	NC_008435	GCC	2	6	1284848	1284853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523146
33058	NC_008435	GGC	2	6	1284856	1284861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523146
33059	NC_008435	GCA	2	6	1284957	1284962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33060	NC_008435	CCG	2	6	1285008	1285013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523146
33061	NC_008435	ACG	2	6	1285025	1285030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33062	NC_008435	ACG	2	6	1285056	1285061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523146
33063	NC_008435	CGTCAT	2	12	1285071	1285082	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115523146
33064	NC_008435	ATC	2	6	1285116	1285121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523147
33065	NC_008435	CGG	2	6	1285169	1285174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523147
33066	NC_008435	CG	3	6	1285177	1285182	0 %	0 %	50 %	50 %	115523147
33067	NC_008435	CCA	2	6	1285233	1285238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523147
33068	NC_008435	TGA	2	6	1285250	1285255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523147
33069	NC_008435	TGC	2	6	1285279	1285284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523147
33070	NC_008435	CCAA	2	8	1285294	1285301	50 %	0 %	0 %	50 %	115523147
33071	NC_008435	G	6	6	1285313	1285318	0 %	0 %	100 %	0 %	115523147
33072	NC_008435	CAG	2	6	1285320	1285325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523147
33073	NC_008435	GCG	2	6	1285396	1285401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523147
33074	NC_008435	GGA	2	6	1285551	1285556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33075	NC_008435	CGGC	2	8	1285583	1285590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33076	NC_008435	GTG	3	9	1285623	1285631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33077	NC_008435	GCT	2	6	1285727	1285732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33078	NC_008435	GAT	2	6	1285737	1285742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33079	NC_008435	TGC	2	6	1285777	1285782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33080	NC_008435	GCG	2	6	1285822	1285827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33081	NC_008435	GTC	2	6	1285843	1285848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33082	NC_008435	TCG	2	6	1285849	1285854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33083	NC_008435	CGG	3	9	1285875	1285883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33084	NC_008435	ATCCCG	2	12	1285892	1285903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33085	NC_008435	GCT	2	6	1285917	1285922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33086	NC_008435	CGG	2	6	1285956	1285961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33087	NC_008435	CCAA	2	8	1286047	1286054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33088	NC_008435	AAGG	2	8	1286082	1286089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33089	NC_008435	TCC	2	6	1286117	1286122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523148
33090	NC_008435	AGG	2	6	1286225	1286230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115523148
33091	NC_008435	TCG	2	6	1286246	1286251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523148
33092	NC_008435	CCG	2	6	1286277	1286282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523148
33093	NC_008435	GCA	2	6	1286292	1286297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523148
33094	NC_008435	GCTC	2	8	1286354	1286361	0 %	25 %	25 %	50 %	115523148
33095	NC_008435	GCA	2	6	1286539	1286544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523148
33096	NC_008435	CCA	2	6	1286550	1286555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523148
33097	NC_008435	GC	3	6	1286677	1286682	0 %	0 %	50 %	50 %	115523148
33098	NC_008435	GCA	2	6	1286685	1286690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523148
33099	NC_008435	GCA	2	6	1286698	1286703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523148
33100	NC_008435	CGT	2	6	1286716	1286721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523148
33101	NC_008435	CGT	2	6	1286751	1286756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523148
33102	NC_008435	GC	3	6	1286782	1286787	0 %	0 %	50 %	50 %	115523148
33103	NC_008435	CCG	2	6	1286814	1286819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523148
33104	NC_008435	GCC	2	6	1286839	1286844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523148
33105	NC_008435	CGA	2	6	1286856	1286861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523148
33106	NC_008435	GAC	2	6	1286902	1286907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523149
33107	NC_008435	CGC	2	6	1286930	1286935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523149
33108	NC_008435	CGC	2	6	1286954	1286959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523149
33109	NC_008435	TCG	2	6	1286968	1286973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523149
33110	NC_008435	TCC	2	6	1287033	1287038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523149
33111	NC_008435	CTC	2	6	1287047	1287052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523149
33112	NC_008435	GAT	2	6	1287068	1287073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523149
33113	NC_008435	CGG	2	6	1287085	1287090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523149
33114	NC_008435	GCG	2	6	1287147	1287152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523149
33115	NC_008435	CGG	2	6	1287231	1287236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523149
33116	NC_008435	TCG	2	6	1287265	1287270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523149
33117	NC_008435	GCCG	2	8	1287405	1287412	0 %	0 %	50 %	50 %	115523149
33118	NC_008435	ATG	2	6	1287420	1287425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523149
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33120	NC_008435	TTG	2	6	1287535	1287540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33122	NC_008435	CGC	2	6	1287635	1287640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33123	NC_008435	TGG	2	6	1287672	1287677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33128	NC_008435	CCG	2	6	1288205	1288210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33129	NC_008435	TCCGC	2	10	1288285	1288294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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33148	NC_008435	GCC	2	6	1289332	1289337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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33218	NC_008435	GCGTG	2	10	1292121	1292130	0 %	20 %	60 %	20 %	115523155
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33224	NC_008435	CCAA	2	8	1292324	1292331	50 %	0 %	0 %	50 %	115523155
33225	NC_008435	AGC	2	6	1292338	1292343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523155
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33227	NC_008435	CGG	2	6	1292364	1292369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33228	NC_008435	AAG	2	6	1292422	1292427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33229	NC_008435	CGG	2	6	1292474	1292479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33230	NC_008435	ATCCA	2	10	1292650	1292659	40 %	20 %	0 %	40 %	115523156
33231	NC_008435	TCGG	2	8	1292694	1292701	0 %	25 %	50 %	25 %	115523156
33232	NC_008435	ATCG	2	8	1292763	1292770	25 %	25 %	25 %	25 %	115523156
33233	NC_008435	TTG	2	6	1292795	1292800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115523156
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33343	NC_008435	GGC	2	6	1297350	1297355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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33347	NC_008435	ACT	2	6	1297633	1297638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33349	NC_008435	GTT	2	6	1297744	1297749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33351	NC_008435	TCA	2	6	1297949	1297954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33352	NC_008435	GC	3	6	1298154	1298159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33353	NC_008435	CG	3	6	1298244	1298249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33354	NC_008435	AAC	2	6	1298274	1298279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33357	NC_008435	GGC	2	6	1298395	1298400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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33461	NC_008435	CG	3	6	1303486	1303491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33462	NC_008435	CCGT	2	8	1303513	1303520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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33473	NC_008435	TGA	2	6	1304060	1304065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523166
33474	NC_008435	CGCC	2	8	1304070	1304077	0 %	0 %	25 %	75 %	115523166
33475	NC_008435	TTG	2	6	1304122	1304127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115523166
33476	NC_008435	GCG	2	6	1304152	1304157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523166
33477	NC_008435	TCA	2	6	1304237	1304242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523166
33478	NC_008435	CGATC	2	10	1304253	1304262	20 %	20 %	20 %	40 %	115523166
33479	NC_008435	TGC	2	6	1304273	1304278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523166
33480	NC_008435	TCG	2	6	1304338	1304343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33481	NC_008435	CTG	2	6	1304440	1304445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523167
33482	NC_008435	GCC	2	6	1304515	1304520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523167
33483	NC_008435	GC	3	6	1304564	1304569	0 %	0 %	50 %	50 %	115523167
33484	NC_008435	CGA	2	6	1304629	1304634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523167
33485	NC_008435	TGC	2	6	1304706	1304711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523167
33486	NC_008435	TCG	2	6	1304741	1304746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523167
33487	NC_008435	GATC	2	8	1304776	1304783	25 %	25 %	25 %	25 %	115523167
33488	NC_008435	CAG	2	6	1304815	1304820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523167
33489	NC_008435	CG	4	8	1304856	1304863	0 %	0 %	50 %	50 %	115523167
33490	NC_008435	GCG	2	6	1304900	1304905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523167
33491	NC_008435	CGA	2	6	1304928	1304933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523167
33492	NC_008435	CAG	2	6	1304935	1304940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523167
33493	NC_008435	CGC	2	6	1304949	1304954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523167
33494	NC_008435	GCC	2	6	1304993	1304998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523167
33495	NC_008435	CAT	2	6	1305007	1305012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523167
33496	NC_008435	TCG	2	6	1305020	1305025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523167
33497	NC_008435	TGG	2	6	1305027	1305032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523167
33498	NC_008435	CG	3	6	1305046	1305051	0 %	0 %	50 %	50 %	115523167
33499	NC_008435	CCT	2	6	1305072	1305077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523167
33500	NC_008435	CAC	2	6	1305124	1305129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523167

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