MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32001	NC_008435	GCC	2	6	1229997	1230002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523107
32002	NC_008435	CG	3	6	1230019	1230024	0 %	0 %	50 %	50 %	115523107
32003	NC_008435	TCA	2	6	1230054	1230059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523107
32004	NC_008435	GC	3	6	1230132	1230137	0 %	0 %	50 %	50 %	115523107
32005	NC_008435	CGG	2	6	1230156	1230161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523107
32006	NC_008435	GGT	2	6	1230187	1230192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523107
32007	NC_008435	ACG	2	6	1230194	1230199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523107
32008	NC_008435	GCG	2	6	1230322	1230327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523107
32009	NC_008435	CCT	2	6	1230345	1230350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523107
32010	NC_008435	TCG	2	6	1230359	1230364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523107
32011	NC_008435	CAA	2	6	1230415	1230420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115523107
32012	NC_008435	CGGT	2	8	1230480	1230487	0 %	25 %	50 %	25 %	115523107
32013	NC_008435	AGCCA	2	10	1230638	1230647	40 %	0 %	20 %	40 %	115523107
32014	NC_008435	AGC	2	6	1230648	1230653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523107
32015	NC_008435	GTG	2	6	1230663	1230668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523107
32016	NC_008435	CCGG	2	8	1230746	1230753	0 %	0 %	50 %	50 %	115523107
32017	NC_008435	GT	3	6	1230843	1230848	0 %	50 %	50 %	0 %	115523107
32018	NC_008435	TGAT	2	8	1230849	1230856	25 %	50 %	25 %	0 %	115523107
32019	NC_008435	GAT	2	6	1231060	1231065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523107
32020	NC_008435	GCG	2	6	1231074	1231079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523107
32021	NC_008435	CG	3	6	1231121	1231126	0 %	0 %	50 %	50 %	115523107
32022	NC_008435	ATC	2	6	1231196	1231201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523107
32023	NC_008435	ATC	2	6	1231310	1231315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523107
32024	NC_008435	GCG	2	6	1231347	1231352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523107
32025	NC_008435	ATTCA	2	10	1231371	1231380	40 %	40 %	0 %	20 %	115523107
32026	NC_008435	CGG	2	6	1231487	1231492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523108
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32028	NC_008435	GGTT	2	8	1231557	1231564	0 %	50 %	50 %	0 %	115523108
32029	NC_008435	TTGG	2	8	1231574	1231581	0 %	50 %	50 %	0 %	115523108
32030	NC_008435	CGCA	2	8	1231642	1231649	25 %	0 %	25 %	50 %	115523108
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32032	NC_008435	GGGC	2	8	1231715	1231722	0 %	0 %	75 %	25 %	115523108
32033	NC_008435	CG	3	6	1231771	1231776	0 %	0 %	50 %	50 %	115523108
32034	NC_008435	AAG	2	6	1231777	1231782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523108
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32036	NC_008435	CGA	2	6	1231803	1231808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523108
32037	NC_008435	CTG	2	6	1231825	1231830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523108
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32039	NC_008435	AGCGC	2	10	1231962	1231971	20 %	0 %	40 %	40 %	115523108
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32041	NC_008435	CG	3	6	1232041	1232046	0 %	0 %	50 %	50 %	115523108
32042	NC_008435	CG	3	6	1232091	1232096	0 %	0 %	50 %	50 %	115523108
32043	NC_008435	CAA	2	6	1232107	1232112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115523108
32044	NC_008435	GC	4	8	1232125	1232132	0 %	0 %	50 %	50 %	115523108
32045	NC_008435	GC	3	6	1232262	1232267	0 %	0 %	50 %	50 %	115523108
32046	NC_008435	CGG	2	6	1232270	1232275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523108
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32048	NC_008435	CGGTT	2	10	1232340	1232349	0 %	40 %	40 %	20 %	115523108
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32051	NC_008435	GC	3	6	1232613	1232618	0 %	0 %	50 %	50 %	115523108
32052	NC_008435	TGC	2	6	1232723	1232728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523108
32053	NC_008435	CGATG	2	10	1232814	1232823	20 %	20 %	40 %	20 %	115523108
32054	NC_008435	CTG	2	6	1232878	1232883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32055	NC_008435	CGA	2	6	1233030	1233035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32056	NC_008435	GCT	2	6	1233109	1233114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32057	NC_008435	TGT	2	6	1233120	1233125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32058	NC_008435	C	6	6	1233132	1233137	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32059	NC_008435	TGC	2	6	1233161	1233166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32060	NC_008435	TGG	2	6	1233315	1233320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32061	NC_008435	GCA	2	6	1233382	1233387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32062	NC_008435	GGC	2	6	1233416	1233421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32063	NC_008435	TTA	2	6	1233617	1233622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32064	NC_008435	AGT	2	6	1233742	1233747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523109
32065	NC_008435	GGT	2	6	1233756	1233761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523109
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32067	NC_008435	GTTTT	2	10	1233852	1233861	0 %	80 %	20 %	0 %	115523109
32068	NC_008435	GCT	2	6	1233890	1233895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523109
32069	NC_008435	CG	3	6	1233924	1233929	0 %	0 %	50 %	50 %	115523109
32070	NC_008435	CGG	2	6	1233963	1233968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523109
32071	NC_008435	ATGTG	2	10	1234091	1234100	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32072	NC_008435	GCG	2	6	1234109	1234114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32073	NC_008435	CATG	2	8	1234139	1234146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32074	NC_008435	CT	3	6	1234203	1234208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32075	NC_008435	ACA	2	6	1234233	1234238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32076	NC_008435	TAA	2	6	1234247	1234252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115523110
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32082	NC_008435	GCCG	2	8	1234634	1234641	0 %	0 %	50 %	50 %	115523110
32083	NC_008435	AGGTCG	2	12	1234676	1234687	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115523110
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32085	NC_008435	GAA	2	6	1234818	1234823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523110
32086	NC_008435	TGCG	2	8	1234826	1234833	0 %	25 %	50 %	25 %	115523110
32087	NC_008435	CGT	2	6	1234869	1234874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523110
32088	NC_008435	ACG	2	6	1234880	1234885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523110
32089	NC_008435	CG	3	6	1234884	1234889	0 %	0 %	50 %	50 %	115523110
32090	NC_008435	TGG	2	6	1234919	1234924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523110
32091	NC_008435	AGT	2	6	1234942	1234947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523110
32092	NC_008435	GCTC	2	8	1234958	1234965	0 %	25 %	25 %	50 %	115523110
32093	NC_008435	AAG	2	6	1235152	1235157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523111
32094	NC_008435	GAC	2	6	1235169	1235174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523111
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32096	NC_008435	CGTCC	2	10	1235322	1235331	0 %	20 %	20 %	60 %	115523111
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32099	NC_008435	GCC	2	6	1235377	1235382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523111
32100	NC_008435	CTT	2	6	1235424	1235429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115523111
32101	NC_008435	GCT	2	6	1235441	1235446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523111
32102	NC_008435	CCGCT	2	10	1235460	1235469	0 %	20 %	20 %	60 %	115523111
32103	NC_008435	GTC	2	6	1235524	1235529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523111
32104	NC_008435	CGA	2	6	1235685	1235690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523111
32105	NC_008435	CG	3	6	1235722	1235727	0 %	0 %	50 %	50 %	115523111
32106	NC_008435	GATT	2	8	1235738	1235745	25 %	50 %	25 %	0 %	115523111
32107	NC_008435	TGG	2	6	1235852	1235857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523111
32108	NC_008435	GGTCC	2	10	1236033	1236042	0 %	20 %	40 %	40 %	115523111
32109	NC_008435	GTC	2	6	1236091	1236096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523111
32110	NC_008435	TCGG	2	8	1236205	1236212	0 %	25 %	50 %	25 %	115523111
32111	NC_008435	CTG	2	6	1236216	1236221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523111
32112	NC_008435	AGGT	2	8	1236250	1236257	25 %	25 %	50 %	0 %	115523111
32113	NC_008435	GAC	2	6	1236273	1236278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523111
32114	NC_008435	CGAT	2	8	1236287	1236294	25 %	25 %	25 %	25 %	115523111
32115	NC_008435	GAC	2	6	1236312	1236317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523111
32116	NC_008435	CAC	2	6	1236339	1236344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523111
32117	NC_008435	ATG	2	6	1236392	1236397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523111
32118	NC_008435	TTC	2	6	1236403	1236408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115523111
32119	NC_008435	TTG	2	6	1236481	1236486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32120	NC_008435	GCT	2	6	1236522	1236527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32121	NC_008435	CAG	2	6	1236528	1236533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32122	NC_008435	C	6	6	1236534	1236539	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32123	NC_008435	CAG	2	6	1236617	1236622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32124	NC_008435	GTC	2	6	1236675	1236680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32125	NC_008435	GGT	2	6	1236872	1236877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32126	NC_008435	AC	3	6	1236925	1236930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32127	NC_008435	GTA	2	6	1237008	1237013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32128	NC_008435	ATCGGA	2	12	1237026	1237037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32129	NC_008435	C	7	7	1237048	1237054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32130	NC_008435	TGC	2	6	1237076	1237081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32131	NC_008435	CAA	2	6	1237087	1237092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32132	NC_008435	CAA	2	6	1237133	1237138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32133	NC_008435	ATTC	2	8	1237139	1237146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32134	NC_008435	CGC	2	6	1237147	1237152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32135	NC_008435	TCA	2	6	1237219	1237224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32136	NC_008435	TGG	2	6	1237237	1237242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32137	NC_008435	CG	3	6	1237252	1237257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32138	NC_008435	TAC	2	6	1237357	1237362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32139	NC_008435	CTGCGC	2	12	1237401	1237412	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32140	NC_008435	ATG	2	6	1237442	1237447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523112
32141	NC_008435	TGA	2	6	1237693	1237698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523112
32142	NC_008435	TGC	2	6	1237755	1237760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523112
32143	NC_008435	CA	3	6	1237808	1237813	50 %	0 %	0 %	50 %	115523112
32144	NC_008435	ATC	2	6	1237820	1237825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523112
32145	NC_008435	TTG	2	6	1237920	1237925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115523112
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32148	NC_008435	GTT	2	6	1238207	1238212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115523112
32149	NC_008435	CCA	2	6	1238292	1238297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32150	NC_008435	GT	3	6	1238298	1238303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32151	NC_008435	TCT	2	6	1238328	1238333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32152	NC_008435	CGT	2	6	1238606	1238611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523113
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32154	NC_008435	GCGG	2	8	1238787	1238794	0 %	0 %	75 %	25 %	115523113
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32159	NC_008435	TCG	2	6	1239110	1239115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523114
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32197	NC_008435	AAG	2	6	1241396	1241401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32198	NC_008435	GAAA	2	8	1241408	1241415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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32202	NC_008435	GCTG	2	8	1241654	1241661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32203	NC_008435	TCG	2	6	1241726	1241731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32209	NC_008435	CGG	2	6	1241913	1241918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32210	NC_008435	GCCAA	2	10	1241951	1241960	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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32225	NC_008435	ATC	2	6	1242616	1242621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523116
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32227	NC_008435	CG	3	6	1242663	1242668	0 %	0 %	50 %	50 %	115523116
32228	NC_008435	CTG	2	6	1242721	1242726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523116
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32230	NC_008435	GAC	2	6	1242771	1242776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523116
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32232	NC_008435	CAG	2	6	1242804	1242809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523116
32233	NC_008435	A	6	6	1242944	1242949	100 %	0 %	0 %	0 %	115523116
32234	NC_008435	GGC	2	6	1242973	1242978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523116
32235	NC_008435	AACC	2	8	1242991	1242998	50 %	0 %	0 %	50 %	115523116
32236	NC_008435	TCG	2	6	1243061	1243066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523116
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32264	NC_008435	CTT	2	6	1244509	1244514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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32331	NC_008435	GC	3	6	1247599	1247604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32332	NC_008435	GAT	2	6	1247636	1247641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32335	NC_008435	GT	3	6	1247708	1247713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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32353	NC_008435	CGGT	2	8	1248609	1248616	0 %	25 %	50 %	25 %	115523119
32354	NC_008435	CCGA	2	8	1248617	1248624	25 %	0 %	25 %	50 %	115523119
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32357	NC_008435	CAA	2	6	1249062	1249067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115523119
32358	NC_008435	CAAC	2	8	1249152	1249159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32359	NC_008435	GGT	2	6	1249229	1249234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32360	NC_008435	AGG	2	6	1249251	1249256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32361	NC_008435	CAAG	2	8	1249263	1249270	50 %	0 %	25 %	25 %	115523120
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32384	NC_008435	CGG	2	6	1250567	1250572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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32401	NC_008435	TTGA	2	8	1251612	1251619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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32454	NC_008435	AATCG	2	10	1254330	1254339	40 %	20 %	20 %	20 %	115523124
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32461	NC_008435	CGA	2	6	1254671	1254676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523124
32462	NC_008435	CCGCG	2	10	1254680	1254689	0 %	0 %	40 %	60 %	115523124
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32472	NC_008435	AG	3	6	1255194	1255199	50 %	0 %	50 %	0 %	115523125
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32474	NC_008435	AGA	2	6	1255273	1255278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523125
32475	NC_008435	CGTC	2	8	1255314	1255321	0 %	25 %	25 %	50 %	115523125
32476	NC_008435	TTG	2	6	1255358	1255363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115523125
32477	NC_008435	GCA	2	6	1255480	1255485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523125
32478	NC_008435	GTA	2	6	1255507	1255512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523125
32479	NC_008435	TTG	2	6	1255565	1255570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115523125
32480	NC_008435	GCG	2	6	1255611	1255616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523125
32481	NC_008435	GCG	2	6	1255639	1255644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523125
32482	NC_008435	CGT	2	6	1255686	1255691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523125
32483	NC_008435	GCCGG	2	10	1255696	1255705	0 %	0 %	60 %	40 %	115523125
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32494	NC_008435	GT	3	6	1256174	1256179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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32499	NC_008435	GTTT	2	8	1256349	1256356	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32500	NC_008435	CAA	2	6	1256446	1256451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115523126

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