MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_008435	GCTC	2	8	1208954	1208961	0 %	25 %	25 %	50 %	115523092
31502	NC_008435	GT	3	6	1208994	1208999	0 %	50 %	50 %	0 %	115523092
31503	NC_008435	A	6	6	1209029	1209034	100 %	0 %	0 %	0 %	115523092
31504	NC_008435	TGCCGT	2	12	1209044	1209055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523092
31505	NC_008435	CGA	2	6	1209071	1209076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523092
31506	NC_008435	GC	3	6	1209114	1209119	0 %	0 %	50 %	50 %	115523092
31507	NC_008435	TGC	2	6	1209126	1209131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523092
31508	NC_008435	GAA	2	6	1209138	1209143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523092
31509	NC_008435	ATG	2	6	1209174	1209179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523092
31510	NC_008435	CGGG	3	12	1209182	1209193	0 %	0 %	75 %	25 %	115523092
31511	NC_008435	TCA	2	6	1209224	1209229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523092
31512	NC_008435	GTCG	2	8	1209234	1209241	0 %	25 %	50 %	25 %	115523092
31513	NC_008435	GGT	2	6	1209243	1209248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523092
31514	NC_008435	CCG	2	6	1209253	1209258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523092
31515	NC_008435	CGA	2	6	1209311	1209316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523092
31516	NC_008435	CGA	2	6	1209353	1209358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523092
31517	NC_008435	TGA	2	6	1209361	1209366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523092
31518	NC_008435	CGC	2	6	1209413	1209418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523092
31519	NC_008435	GCAGC	2	10	1209422	1209431	20 %	0 %	40 %	40 %	115523092
31520	NC_008435	GC	3	6	1209435	1209440	0 %	0 %	50 %	50 %	115523092
31521	NC_008435	CG	3	6	1209462	1209467	0 %	0 %	50 %	50 %	115523092
31522	NC_008435	GC	3	6	1209478	1209483	0 %	0 %	50 %	50 %	115523092
31523	NC_008435	GA	3	6	1209529	1209534	50 %	0 %	50 %	0 %	115523092
31524	NC_008435	GCC	2	6	1209648	1209653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31525	NC_008435	GCG	2	6	1209666	1209671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523093
31526	NC_008435	CGT	2	6	1209720	1209725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31527	NC_008435	GCC	2	6	1209727	1209732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31528	NC_008435	CGC	2	6	1209774	1209779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31529	NC_008435	CG	3	6	1209912	1209917	0 %	0 %	50 %	50 %	115523093
31530	NC_008435	GCA	2	6	1209924	1209929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31531	NC_008435	CG	3	6	1209930	1209935	0 %	0 %	50 %	50 %	115523093
31532	NC_008435	GC	3	6	1209937	1209942	0 %	0 %	50 %	50 %	115523093
31533	NC_008435	TGC	2	6	1209956	1209961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31534	NC_008435	GC	3	6	1209981	1209986	0 %	0 %	50 %	50 %	115523093
31535	NC_008435	GTGACG	2	12	1209995	1210006	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115523093
31536	NC_008435	GGCT	2	8	1210022	1210029	0 %	25 %	50 %	25 %	115523093
31537	NC_008435	GCC	2	6	1210090	1210095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31538	NC_008435	CGC	2	6	1210119	1210124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31539	NC_008435	GCG	2	6	1210130	1210135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523093
31540	NC_008435	CGC	2	6	1210144	1210149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31541	NC_008435	CGA	2	6	1210164	1210169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31542	NC_008435	GATC	2	8	1210225	1210232	25 %	25 %	25 %	25 %	115523093
31543	NC_008435	GCCGC	2	10	1210239	1210248	0 %	0 %	40 %	60 %	115523093
31544	NC_008435	GAC	2	6	1210321	1210326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31545	NC_008435	ACG	2	6	1210349	1210354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31546	NC_008435	CG	3	6	1210356	1210361	0 %	0 %	50 %	50 %	115523093
31547	NC_008435	GGC	2	6	1210428	1210433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523093
31548	NC_008435	CG	3	6	1210489	1210494	0 %	0 %	50 %	50 %	115523093
31549	NC_008435	CGA	2	6	1210506	1210511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31550	NC_008435	CGA	2	6	1210515	1210520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31551	NC_008435	GCC	2	6	1210552	1210557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31552	NC_008435	GCC	2	6	1210567	1210572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31553	NC_008435	CAC	2	6	1210585	1210590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523093
31554	NC_008435	CGC	2	6	1210602	1210607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31555	NC_008435	GC	3	6	1210606	1210611	0 %	0 %	50 %	50 %	115523093
31556	NC_008435	TCG	2	6	1210649	1210654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31557	NC_008435	GCG	2	6	1210680	1210685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523093
31558	NC_008435	GCC	2	6	1210873	1210878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31559	NC_008435	GCA	2	6	1210890	1210895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31560	NC_008435	TCG	2	6	1210910	1210915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31561	NC_008435	CAT	2	6	1210951	1210956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523093
31562	NC_008435	CGATT	2	10	1210963	1210972	20 %	40 %	20 %	20 %	115523093
31563	NC_008435	TCG	2	6	1210979	1210984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31564	NC_008435	CGG	2	6	1211028	1211033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523093
31565	NC_008435	CGA	2	6	1211034	1211039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31566	NC_008435	TGC	2	6	1211114	1211119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523093
31567	NC_008435	GCC	2	6	1211155	1211160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523093
31568	NC_008435	GCG	2	6	1211163	1211168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523093
31569	NC_008435	GC	4	8	1211237	1211244	0 %	0 %	50 %	50 %	115523093
31570	NC_008435	CGG	2	6	1211245	1211250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523093
31571	NC_008435	CAGCGC	2	12	1211266	1211277	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115523093
31572	NC_008435	CCA	2	6	1211280	1211285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523093
31573	NC_008435	GCCG	2	8	1211339	1211346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31574	NC_008435	GTC	2	6	1211400	1211405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31575	NC_008435	CCGATC	2	12	1211410	1211421	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31576	NC_008435	TCGCAA	2	12	1211501	1211512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115523094
31577	NC_008435	TGGCGC	2	12	1211525	1211536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115523094
31578	NC_008435	CAG	2	6	1211556	1211561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523094
31579	NC_008435	GC	3	6	1211594	1211599	0 %	0 %	50 %	50 %	115523094
31580	NC_008435	GCCG	2	8	1211626	1211633	0 %	0 %	50 %	50 %	115523094
31581	NC_008435	GCC	2	6	1211653	1211658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523094
31582	NC_008435	GGC	3	9	1211694	1211702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523094
31583	NC_008435	TC	3	6	1211730	1211735	0 %	50 %	0 %	50 %	115523094
31584	NC_008435	CGA	2	6	1211811	1211816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523094
31585	NC_008435	CCA	2	6	1211841	1211846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523094
31586	NC_008435	CAA	2	6	1211850	1211855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115523094
31587	NC_008435	GAA	2	6	1211922	1211927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523094
31588	NC_008435	GCG	2	6	1211931	1211936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523094
31589	NC_008435	GGC	2	6	1211980	1211985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31590	NC_008435	ATC	2	6	1212005	1212010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31591	NC_008435	GGA	2	6	1212026	1212031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31592	NC_008435	TGG	2	6	1212069	1212074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523095
31593	NC_008435	GCG	2	6	1212096	1212101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523095
31594	NC_008435	GCCG	2	8	1212112	1212119	0 %	0 %	50 %	50 %	115523095
31595	NC_008435	CGAGAC	2	12	1212133	1212144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523095
31596	NC_008435	CGCGG	2	10	1212155	1212164	0 %	0 %	60 %	40 %	115523095
31597	NC_008435	TCA	2	6	1212177	1212182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523095
31598	NC_008435	GCC	2	6	1212208	1212213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523095
31599	NC_008435	TGGCGC	2	12	1212224	1212235	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115523095
31600	NC_008435	CCA	2	6	1212276	1212281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523095
31601	NC_008435	ATGC	2	8	1212295	1212302	25 %	25 %	25 %	25 %	115523095
31602	NC_008435	GGC	2	6	1212351	1212356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523095
31603	NC_008435	CGT	2	6	1212360	1212365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523095
31604	NC_008435	GCCGC	2	10	1212371	1212380	0 %	0 %	40 %	60 %	115523095
31605	NC_008435	GGC	2	6	1212404	1212409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523095
31606	NC_008435	GC	3	6	1212408	1212413	0 %	0 %	50 %	50 %	115523095
31607	NC_008435	CGG	2	6	1212441	1212446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523095
31608	NC_008435	CGGCT	2	10	1212500	1212509	0 %	20 %	40 %	40 %	115523095
31609	NC_008435	GC	3	6	1212580	1212585	0 %	0 %	50 %	50 %	115523095
31610	NC_008435	CGG	2	6	1212622	1212627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523095
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31612	NC_008435	CGC	2	6	1212753	1212758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523095
31613	NC_008435	GC	4	8	1212818	1212825	0 %	0 %	50 %	50 %	115523095
31614	NC_008435	CGA	2	6	1212838	1212843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523095
31615	NC_008435	GCG	3	9	1212848	1212856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523095
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31617	NC_008435	CGC	2	6	1212880	1212885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523095
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31854	NC_008435	GGCC	2	8	1222678	1222685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31855	NC_008435	GAT	2	6	1222715	1222720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31856	NC_008435	CGG	2	6	1222732	1222737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31857	NC_008435	TGT	2	6	1222759	1222764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31858	NC_008435	CCGGC	2	10	1222784	1222793	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31859	NC_008435	GCC	2	6	1222794	1222799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31860	NC_008435	GA	3	6	1222811	1222816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31861	NC_008435	TCC	2	6	1222828	1222833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31862	NC_008435	CAT	2	6	1222844	1222849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31863	NC_008435	G	8	8	1222866	1222873	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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31866	NC_008435	CAAT	2	8	1222979	1222986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31867	NC_008435	CTG	2	6	1222997	1223002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31883	NC_008435	CCGC	2	8	1223840	1223847	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31884	NC_008435	CG	3	6	1223919	1223924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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31973	NC_008435	TCG	2	6	1228097	1228102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523106
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