MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_008435	CGT	2	6	1190731	1190736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523076
31002	NC_008435	CAC	2	6	1190789	1190794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523076
31003	NC_008435	CCA	2	6	1190848	1190853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115523076
31004	NC_008435	TCCA	2	8	1190862	1190869	25 %	25 %	0 %	50 %	115523076
31005	NC_008435	TCC	2	6	1190884	1190889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31006	NC_008435	GTC	2	6	1190917	1190922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31007	NC_008435	CG	3	6	1191122	1191127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31008	NC_008435	GGC	2	6	1191161	1191166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31009	NC_008435	GCG	2	6	1191175	1191180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31010	NC_008435	AAGG	2	8	1191219	1191226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31011	NC_008435	GCT	3	9	1191236	1191244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31012	NC_008435	CAA	2	6	1191359	1191364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31013	NC_008435	GTG	2	6	1191381	1191386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31014	NC_008435	CGGC	2	8	1191425	1191432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31015	NC_008435	CTCGAC	2	12	1191548	1191559	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31016	NC_008435	CCG	2	6	1191573	1191578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31017	NC_008435	GC	4	8	1191616	1191623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31018	NC_008435	GGC	2	6	1191626	1191631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31019	NC_008435	CGG	2	6	1191675	1191680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31020	NC_008435	GCT	2	6	1191687	1191692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31021	NC_008435	GGC	2	6	1191701	1191706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31022	NC_008435	CGC	2	6	1191749	1191754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31023	NC_008435	CGA	3	9	1191796	1191804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31024	NC_008435	CGC	2	6	1191845	1191850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31025	NC_008435	GCC	2	6	1191863	1191868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31026	NC_008435	ACC	2	6	1191871	1191876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31027	NC_008435	GCT	2	6	1191922	1191927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31028	NC_008435	GC	4	8	1191937	1191944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31029	NC_008435	CGT	2	6	1191982	1191987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31030	NC_008435	GCA	2	6	1192002	1192007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31031	NC_008435	CGA	2	6	1192084	1192089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31032	NC_008435	TGA	2	6	1192140	1192145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31033	NC_008435	CAT	2	6	1192147	1192152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31034	NC_008435	GCCCT	2	10	1192168	1192177	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31035	NC_008435	GGCG	2	8	1192193	1192200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31036	NC_008435	CGG	2	6	1192201	1192206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31037	NC_008435	CAA	2	6	1192224	1192229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31038	NC_008435	GGCC	2	8	1192245	1192252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31039	NC_008435	CCG	2	6	1192297	1192302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31040	NC_008435	TGGG	2	8	1192311	1192318	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_008435	AACC	2	8	1192333	1192340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31042	NC_008435	GC	3	6	1192354	1192359	0 %	0 %	50 %	50 %	115523077
31043	NC_008435	GGC	2	6	1192461	1192466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523077
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31046	NC_008435	GTC	2	6	1192600	1192605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523077
31047	NC_008435	TCG	2	6	1192606	1192611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523077
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31049	NC_008435	GC	3	6	1192688	1192693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31050	NC_008435	AAG	2	6	1192723	1192728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523078
31051	NC_008435	CCTCGA	2	12	1192740	1192751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115523078
31052	NC_008435	CTG	2	6	1192818	1192823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523078
31053	NC_008435	CTT	2	6	1192829	1192834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115523078
31054	NC_008435	ATGCCG	2	12	1192855	1192866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115523078
31055	NC_008435	GCA	2	6	1192877	1192882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523078
31056	NC_008435	TTC	2	6	1192887	1192892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115523078
31057	NC_008435	GCG	2	6	1192895	1192900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523078
31058	NC_008435	CG	3	6	1192916	1192921	0 %	0 %	50 %	50 %	115523078
31059	NC_008435	TGG	2	6	1192922	1192927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523078
31060	NC_008435	GCA	2	6	1192964	1192969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523078
31061	NC_008435	TCG	2	6	1193014	1193019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523078
31062	NC_008435	CTC	2	6	1193109	1193114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523078
31063	NC_008435	TTG	2	6	1193170	1193175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115523078
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31065	NC_008435	TCA	2	6	1193315	1193320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523078
31066	NC_008435	T	6	6	1193376	1193381	0 %	100 %	0 %	0 %	115523078
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31069	NC_008435	GA	3	6	1193514	1193519	50 %	0 %	50 %	0 %	115523078
31070	NC_008435	TTC	2	6	1193572	1193577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115523078
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31091	NC_008435	CG	3	6	1194374	1194379	0 %	0 %	50 %	50 %	115523078
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31102	NC_008435	ATC	2	6	1194694	1194699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523078
31103	NC_008435	CAG	2	6	1194746	1194751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523078
31104	NC_008435	CTTC	2	8	1194752	1194759	0 %	50 %	0 %	50 %	115523078
31105	NC_008435	GTC	2	6	1194780	1194785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523078
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31108	NC_008435	GCG	2	6	1194907	1194912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31109	NC_008435	CCG	2	6	1194967	1194972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31110	NC_008435	CTA	2	6	1194986	1194991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31111	NC_008435	GCG	2	6	1195072	1195077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31112	NC_008435	CATT	2	8	1195082	1195089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31113	NC_008435	CCGG	2	8	1195111	1195118	0 %	0 %	50 %	50 %	115523079
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31115	NC_008435	GCTCG	2	10	1195210	1195219	0 %	20 %	40 %	40 %	115523079
31116	NC_008435	CT	3	6	1195249	1195254	0 %	50 %	0 %	50 %	115523079
31117	NC_008435	TGC	2	6	1195292	1195297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523079
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31119	NC_008435	GCC	2	6	1195319	1195324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523079
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31121	NC_008435	GC	3	6	1195415	1195420	0 %	0 %	50 %	50 %	115523079
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31123	NC_008435	CGT	2	6	1195443	1195448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523079
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31200	NC_008435	GCCG	2	8	1198016	1198023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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31219	NC_008435	TGG	2	6	1198779	1198784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523082
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31223	NC_008435	TCGA	2	8	1198952	1198959	25 %	25 %	25 %	25 %	115523082
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31225	NC_008435	GC	5	10	1198969	1198978	0 %	0 %	50 %	50 %	115523082
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31227	NC_008435	GC	4	8	1199040	1199047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31228	NC_008435	GC	3	6	1199056	1199061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31229	NC_008435	GC	3	6	1199146	1199151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31230	NC_008435	GTG	2	6	1199165	1199170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31231	NC_008435	GC	3	6	1199177	1199182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31232	NC_008435	GAAG	2	8	1199213	1199220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31233	NC_008435	CTC	2	6	1199339	1199344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523083
31234	NC_008435	GGT	2	6	1199351	1199356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523083
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31236	NC_008435	CGGC	2	8	1199382	1199389	0 %	0 %	50 %	50 %	115523083
31237	NC_008435	CGC	2	6	1199452	1199457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523083
31238	NC_008435	ATC	2	6	1199472	1199477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523083
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31241	NC_008435	GTC	2	6	1199552	1199557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523083
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31246	NC_008435	GC	3	6	1199731	1199736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31247	NC_008435	GC	4	8	1199798	1199805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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31272	NC_008435	CGCAG	2	10	1200737	1200746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31273	NC_008435	CGC	2	6	1200749	1200754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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31276	NC_008435	GCA	2	6	1200825	1200830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31349	NC_008435	GCA	2	6	1203102	1203107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523086
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31470	NC_008435	CCG	2	6	1207589	1207594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523090
31471	NC_008435	TCG	2	6	1207631	1207636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523090
31472	NC_008435	CTG	2	6	1207642	1207647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523090
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31480	NC_008435	TGTC	2	8	1208055	1208062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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31482	NC_008435	GCG	2	6	1208157	1208162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31483	NC_008435	CTC	2	6	1208166	1208171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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