MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_008435	GCC	2	6	1127250	1127255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523032
29502	NC_008435	GAT	2	6	1127258	1127263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523032
29503	NC_008435	CGT	2	6	1127285	1127290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29504	NC_008435	GCT	2	6	1127312	1127317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29505	NC_008435	CGC	2	6	1127396	1127401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523032
29506	NC_008435	CCCA	2	8	1127469	1127476	25 %	0 %	0 %	75 %	115523032
29507	NC_008435	CCT	2	6	1127541	1127546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523032
29508	NC_008435	CGC	2	6	1127554	1127559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523032
29509	NC_008435	GCA	2	6	1127573	1127578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29510	NC_008435	CAT	2	6	1127591	1127596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523032
29511	NC_008435	CGG	2	6	1127597	1127602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29512	NC_008435	CAGC	2	8	1127609	1127616	25 %	0 %	25 %	50 %	115523032
29513	NC_008435	CGG	2	6	1127617	1127622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29514	NC_008435	TCG	2	6	1127641	1127646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29515	NC_008435	CG	4	8	1127702	1127709	0 %	0 %	50 %	50 %	115523032
29516	NC_008435	GCC	2	6	1127757	1127762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523032
29517	NC_008435	CGG	2	6	1127801	1127806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29518	NC_008435	GGA	2	6	1127831	1127836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115523032
29519	NC_008435	CAG	2	6	1127841	1127846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29520	NC_008435	GCT	2	6	1127910	1127915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29521	NC_008435	CGC	2	6	1127924	1127929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523032
29522	NC_008435	CGG	2	6	1128020	1128025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29523	NC_008435	AGC	2	6	1128034	1128039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29524	NC_008435	GGC	2	6	1128048	1128053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29525	NC_008435	CTA	2	6	1128122	1128127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523032
29526	NC_008435	CAT	2	6	1128191	1128196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523032
29527	NC_008435	CCGAT	2	10	1128244	1128253	20 %	20 %	20 %	40 %	115523032
29528	NC_008435	AAC	2	6	1128264	1128269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115523032
29529	NC_008435	CGA	2	6	1128278	1128283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29530	NC_008435	CGA	2	6	1128293	1128298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29531	NC_008435	CGA	3	9	1128323	1128331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29532	NC_008435	CGA	2	6	1128335	1128340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29533	NC_008435	GAC	2	6	1128345	1128350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29534	NC_008435	GCG	3	9	1128364	1128372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29535	NC_008435	CGGC	2	8	1128394	1128401	0 %	0 %	50 %	50 %	115523032
29536	NC_008435	CGATGA	3	18	1128404	1128421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115523032
29537	NC_008435	GGC	2	6	1128429	1128434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29538	NC_008435	GAC	3	9	1128441	1128449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29539	NC_008435	CGG	2	6	1128461	1128466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29540	NC_008435	CGC	3	9	1128481	1128489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523032
29541	NC_008435	CGC	2	6	1128520	1128525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523032
29542	NC_008435	CGA	2	6	1128554	1128559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29543	NC_008435	TCG	2	6	1128565	1128570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29544	NC_008435	TCA	2	6	1128589	1128594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523032
29545	NC_008435	CGGC	2	8	1128622	1128629	0 %	0 %	50 %	50 %	115523032
29546	NC_008435	GTG	2	6	1128669	1128674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523032
29547	NC_008435	CGA	2	6	1128689	1128694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29548	NC_008435	CGG	2	6	1128704	1128709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29549	NC_008435	TGCCGG	2	12	1128785	1128796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115523032
29550	NC_008435	CGG	2	6	1128812	1128817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29551	NC_008435	CTG	2	6	1128831	1128836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29552	NC_008435	ACG	2	6	1128859	1128864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29553	NC_008435	GAC	2	6	1128876	1128881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29554	NC_008435	GGC	2	6	1128888	1128893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29555	NC_008435	GGGGGC	2	12	1128950	1128961	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	115523032
29556	NC_008435	TGC	2	6	1128964	1128969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29557	NC_008435	CGA	2	6	1129097	1129102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523032
29558	NC_008435	GCG	3	9	1129207	1129215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523032
29559	NC_008435	TCA	2	6	1129364	1129369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523032
29560	NC_008435	CGG	2	6	1129412	1129417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29561	NC_008435	CCG	2	6	1129439	1129444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29562	NC_008435	GTC	2	6	1129451	1129456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29563	NC_008435	CGT	2	6	1129466	1129471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29564	NC_008435	CGCC	2	8	1129516	1129523	0 %	0 %	25 %	75 %	115523033
29565	NC_008435	AGC	2	6	1129525	1129530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523033
29566	NC_008435	TCCTGT	2	12	1129570	1129581	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	115523033
29567	NC_008435	ATG	2	6	1129632	1129637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523033
29568	NC_008435	CG	3	6	1129650	1129655	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29569	NC_008435	GCA	2	6	1129666	1129671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523033
29570	NC_008435	GGT	2	6	1129725	1129730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523033
29571	NC_008435	GC	4	8	1129768	1129775	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29572	NC_008435	ATCT	2	8	1129941	1129948	25 %	50 %	0 %	25 %	115523033
29573	NC_008435	GC	3	6	1129981	1129986	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29574	NC_008435	CGT	2	6	1130024	1130029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523033
29575	NC_008435	GC	3	6	1130082	1130087	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29576	NC_008435	CG	3	6	1130108	1130113	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29577	NC_008435	CGC	2	6	1130231	1130236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115523033
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29579	NC_008435	CGGC	2	8	1130317	1130324	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
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29582	NC_008435	GTG	2	6	1130442	1130447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523033
29583	NC_008435	CGA	2	6	1130462	1130467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523033
29584	NC_008435	CGG	2	6	1130612	1130617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523033
29585	NC_008435	GC	4	8	1130633	1130640	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29586	NC_008435	GCT	2	6	1130657	1130662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523033
29587	NC_008435	GATG	2	8	1130759	1130766	25 %	25 %	50 %	0 %	115523033
29588	NC_008435	GTC	2	6	1130820	1130825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523033
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29592	NC_008435	CGGC	2	8	1130917	1130924	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29593	NC_008435	CG	3	6	1130949	1130954	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29594	NC_008435	GTG	2	6	1130976	1130981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115523033
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29596	NC_008435	GC	4	8	1131052	1131059	0 %	0 %	50 %	50 %	115523033
29597	NC_008435	GGC	2	6	1131060	1131065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523033
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29599	NC_008435	GGC	2	6	1131132	1131137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523033
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29601	NC_008435	CAT	2	6	1131167	1131172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523033
29602	NC_008435	GAA	2	6	1131210	1131215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523033
29603	NC_008435	GCG	2	6	1131371	1131376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523034
29604	NC_008435	CG	3	6	1131432	1131437	0 %	0 %	50 %	50 %	115523034
29605	NC_008435	TCG	2	6	1131480	1131485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523034
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29609	NC_008435	GCGG	2	8	1131719	1131726	0 %	0 %	75 %	25 %	115523034
29610	NC_008435	GCG	3	9	1131735	1131743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523034
29611	NC_008435	GGC	2	6	1131746	1131751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523034
29612	NC_008435	CGGA	2	8	1131840	1131847	25 %	0 %	50 %	25 %	115523034
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29615	NC_008435	CG	3	6	1132038	1132043	0 %	0 %	50 %	50 %	115523034
29616	NC_008435	CAG	2	6	1132106	1132111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523034
29617	NC_008435	CGT	2	6	1132126	1132131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523034
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29645	NC_008435	ATC	2	6	1133036	1133041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115523034
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29690	NC_008435	GTCC	2	8	1135021	1135028	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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29692	NC_008435	TC	4	8	1135110	1135117	0 %	50 %	0 %	50 %	115523036
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29710	NC_008435	GGCG	2	8	1135872	1135879	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29711	NC_008435	GCCG	2	8	1135931	1135938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29712	NC_008435	GA	3	6	1135963	1135968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29713	NC_008435	GCC	2	6	1135985	1135990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29714	NC_008435	CGA	2	6	1136021	1136026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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29718	NC_008435	CCG	2	6	1136126	1136131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29719	NC_008435	GC	3	6	1136179	1136184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29720	NC_008435	GGTGCA	2	12	1136236	1136247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29721	NC_008435	ACG	2	6	1136418	1136423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115523038
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29725	NC_008435	ATCG	2	8	1136653	1136660	25 %	25 %	25 %	25 %	115523038
29726	NC_008435	GAGC	2	8	1136704	1136711	25 %	0 %	50 %	25 %	115523038
29727	NC_008435	TGA	2	6	1136759	1136764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115523038
29728	NC_008435	AG	3	6	1136807	1136812	50 %	0 %	50 %	0 %	115523038
29729	NC_008435	GAA	2	6	1136850	1136855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115523038
29730	NC_008435	CCT	2	6	1136949	1136954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115523038
29731	NC_008435	CGT	2	6	1136957	1136962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523038
29732	NC_008435	CGG	3	9	1136988	1136996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523038
29733	NC_008435	GGC	2	6	1137019	1137024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115523038
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29848	NC_008435	TCG	2	6	1142504	1142509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115523042
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29992	NC_008435	CG	3	6	1149485	1149490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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