MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_008435	CG	3	6	654592	654597	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
17002	NC_008435	ATTC	2	8	654607	654614	25 %	50 %	0 %	25 %	115522617
17003	NC_008435	GCA	2	6	654625	654630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522617
17004	NC_008435	CGA	2	6	654670	654675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522617
17005	NC_008435	CGAGCG	2	12	654682	654693	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522617
17006	NC_008435	GC	3	6	654791	654796	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
17007	NC_008435	GCCC	2	8	654850	654857	0 %	0 %	25 %	75 %	115522617
17008	NC_008435	GCC	2	6	654896	654901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522618
17009	NC_008435	CAA	2	6	655000	655005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522618
17010	NC_008435	CTG	2	6	655075	655080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522618
17011	NC_008435	CAA	2	6	655149	655154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522618
17012	NC_008435	ACGGC	2	10	655167	655176	20 %	0 %	40 %	40 %	115522618
17013	NC_008435	CGC	2	6	655212	655217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522618
17014	NC_008435	CGA	2	6	655248	655253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522618
17015	NC_008435	TC	3	6	655256	655261	0 %	50 %	0 %	50 %	115522618
17016	NC_008435	CAT	2	6	655276	655281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522618
17017	NC_008435	GC	3	6	655431	655436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17018	NC_008435	AGG	2	6	655477	655482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_008435	GCA	2	6	655485	655490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17020	NC_008435	GCG	2	6	655554	655559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522619
17021	NC_008435	GCG	3	9	655656	655664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522619
17022	NC_008435	GGTC	2	8	655667	655674	0 %	25 %	50 %	25 %	115522619
17023	NC_008435	TGC	2	6	655723	655728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522619
17024	NC_008435	TTCTG	2	10	655750	655759	0 %	60 %	20 %	20 %	115522619
17025	NC_008435	GTT	2	6	655779	655784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522619
17026	NC_008435	TGC	2	6	655789	655794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522619
17027	NC_008435	CTG	2	6	655830	655835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522619
17028	NC_008435	CGAC	2	8	655867	655874	25 %	0 %	25 %	50 %	115522619
17029	NC_008435	CTG	2	6	655875	655880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522619
17030	NC_008435	GAG	2	6	655890	655895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522619
17031	NC_008435	TCT	2	6	655973	655978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522619
17032	NC_008435	GGC	2	6	655995	656000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522619
17033	NC_008435	GC	3	6	655999	656004	0 %	0 %	50 %	50 %	115522619
17034	NC_008435	CGA	2	6	656021	656026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522619
17035	NC_008435	TCG	2	6	656046	656051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522619
17036	NC_008435	GAC	2	6	656054	656059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522619
17037	NC_008435	TC	3	6	656105	656110	0 %	50 %	0 %	50 %	115522619
17038	NC_008435	GCGT	2	8	656122	656129	0 %	25 %	50 %	25 %	115522619
17039	NC_008435	CGG	2	6	656164	656169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522619
17040	NC_008435	TGGG	2	8	656220	656227	0 %	25 %	75 %	0 %	115522619
17041	NC_008435	CCG	2	6	656348	656353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522619
17042	NC_008435	CGG	2	6	656376	656381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522619
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17044	NC_008435	TGG	2	6	656572	656577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522619
17045	NC_008435	CGA	3	9	656600	656608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522619
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17047	NC_008435	CGA	2	6	656762	656767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522619
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17050	NC_008435	GTC	2	6	656853	656858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522619
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17052	NC_008435	GTT	2	6	656939	656944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522619
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17054	NC_008435	TCG	2	6	657131	657136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17055	NC_008435	GAAT	2	8	657144	657151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_008435	GTA	2	6	657177	657182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_008435	AACA	2	8	657221	657228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17058	NC_008435	GAT	2	6	657244	657249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522620
17059	NC_008435	CGT	2	6	657257	657262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522620
17060	NC_008435	GCG	2	6	657278	657283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522620
17061	NC_008435	GCTC	2	8	657339	657346	0 %	25 %	25 %	50 %	115522620
17062	NC_008435	GCT	3	9	657355	657363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522620
17063	NC_008435	CG	3	6	657405	657410	0 %	0 %	50 %	50 %	115522620
17064	NC_008435	GGC	2	6	657437	657442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522620
17065	NC_008435	GCA	2	6	657456	657461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522620
17066	NC_008435	TCGT	2	8	657464	657471	0 %	50 %	25 %	25 %	115522620
17067	NC_008435	CGA	3	9	657478	657486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522620
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17071	NC_008435	CG	3	6	657598	657603	0 %	0 %	50 %	50 %	115522620
17072	NC_008435	CAT	2	6	657646	657651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522620
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17074	NC_008435	CGT	2	6	657687	657692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522620
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17078	NC_008435	GTCGC	2	10	657899	657908	0 %	20 %	40 %	40 %	115522620
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17082	NC_008435	GCC	3	9	658034	658042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522620
17083	NC_008435	CCGG	2	8	658046	658053	0 %	0 %	50 %	50 %	115522620
17084	NC_008435	TGC	2	6	658071	658076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522620
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17088	NC_008435	GGC	2	6	658349	658354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522620
17089	NC_008435	CGC	3	9	658375	658383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522620
17090	NC_008435	CGA	2	6	658393	658398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522620
17091	NC_008435	TCA	2	6	658429	658434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17093	NC_008435	GCC	2	6	658464	658469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17094	NC_008435	CGC	2	6	658582	658587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522621
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17099	NC_008435	TGC	2	6	658806	658811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522621
17100	NC_008435	CTAT	2	8	658894	658901	25 %	50 %	0 %	25 %	115522621
17101	NC_008435	CGT	2	6	658969	658974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522621
17102	NC_008435	AGA	2	6	659004	659009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522621
17103	NC_008435	GCC	2	6	659019	659024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522621
17104	NC_008435	GCG	2	6	659033	659038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522621
17105	NC_008435	GGC	2	6	659122	659127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522621
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17107	NC_008435	GGC	2	6	659143	659148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522621
17108	NC_008435	CCT	2	6	659196	659201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522621
17109	NC_008435	TCG	2	6	659202	659207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522621
17110	NC_008435	TGG	2	6	659208	659213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522621
17111	NC_008435	CGG	2	6	659218	659223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522621
17112	NC_008435	GCG	2	6	659238	659243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522621
17113	NC_008435	CAT	3	9	659314	659322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522621
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17115	NC_008435	CCG	2	6	659358	659363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522621
17116	NC_008435	CGGG	2	8	659371	659378	0 %	0 %	75 %	25 %	115522621
17117	NC_008435	GTG	3	9	659409	659417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522622
17118	NC_008435	TTC	2	6	659418	659423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522622
17119	NC_008435	CTG	2	6	659430	659435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17120	NC_008435	TCG	2	6	659443	659448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17121	NC_008435	TTC	2	6	659457	659462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522622
17122	NC_008435	TTC	2	6	659577	659582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522622
17123	NC_008435	GCG	2	6	659587	659592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522622
17124	NC_008435	GGCG	2	8	659666	659673	0 %	0 %	75 %	25 %	115522622
17125	NC_008435	TCG	3	9	659686	659694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17126	NC_008435	TCA	2	6	659728	659733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522622
17127	NC_008435	GGC	2	6	659744	659749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522622
17128	NC_008435	ACATCA	2	12	659812	659823	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	115522622
17129	NC_008435	CGG	2	6	659871	659876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522622
17130	NC_008435	CTA	2	6	659882	659887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522622
17131	NC_008435	TGG	2	6	659905	659910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522622
17132	NC_008435	CTG	2	6	659922	659927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17133	NC_008435	CGGG	2	8	659951	659958	0 %	0 %	75 %	25 %	115522622
17134	NC_008435	TGC	2	6	659959	659964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17135	NC_008435	TCGA	2	8	660084	660091	25 %	25 %	25 %	25 %	115522622
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17140	NC_008435	CTCG	2	8	660209	660216	0 %	25 %	25 %	50 %	115522622
17141	NC_008435	TCG	2	6	660241	660246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
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17143	NC_008435	TCG	2	6	660295	660300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17144	NC_008435	TCT	2	6	660332	660337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522622
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17146	NC_008435	CGT	2	6	660386	660391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17147	NC_008435	CAT	2	6	660515	660520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522622
17148	NC_008435	ACC	2	6	660543	660548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522622
17149	NC_008435	CTG	2	6	660558	660563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17150	NC_008435	GC	3	6	660568	660573	0 %	0 %	50 %	50 %	115522622
17151	NC_008435	CGGC	2	8	660583	660590	0 %	0 %	50 %	50 %	115522622
17152	NC_008435	CGA	2	6	660602	660607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17153	NC_008435	GC	3	6	660712	660717	0 %	0 %	50 %	50 %	115522622
17154	NC_008435	GCC	2	6	660783	660788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522622
17155	NC_008435	GGCC	2	8	660812	660819	0 %	0 %	50 %	50 %	115522622
17156	NC_008435	CGGA	2	8	660845	660852	25 %	0 %	50 %	25 %	115522622
17157	NC_008435	GCG	2	6	660901	660906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522622
17158	NC_008435	CTG	2	6	660912	660917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17159	NC_008435	GAA	2	6	660951	660956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522622
17160	NC_008435	GTG	2	6	660966	660971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522622
17161	NC_008435	GCT	2	6	660974	660979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
17162	NC_008435	CGTCAT	2	12	661004	661015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115522622
17163	NC_008435	CGC	2	6	661040	661045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522622
17164	NC_008435	CCG	2	6	661176	661181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522623
17165	NC_008435	GCG	2	6	661245	661250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522623
17166	NC_008435	GTCG	2	8	661262	661269	0 %	25 %	50 %	25 %	115522623
17167	NC_008435	CTG	2	6	661286	661291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522623
17168	NC_008435	GCT	2	6	661318	661323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522623
17169	NC_008435	GCCC	2	8	661394	661401	0 %	0 %	25 %	75 %	115522623
17170	NC_008435	GAG	2	6	661472	661477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522623
17171	NC_008435	CTG	2	6	661481	661486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522623
17172	NC_008435	CGG	2	6	661597	661602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522623
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17175	NC_008435	CGA	2	6	661699	661704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522623
17176	NC_008435	ATCGTC	2	12	661748	661759	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115522623
17177	NC_008435	CGA	2	6	661771	661776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522623
17178	NC_008435	GTG	2	6	661823	661828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522623
17179	NC_008435	TCCG	2	8	661961	661968	0 %	25 %	25 %	50 %	115522624
17180	NC_008435	TGC	2	6	661970	661975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522624
17181	NC_008435	GATC	2	8	662001	662008	25 %	25 %	25 %	25 %	115522624
17182	NC_008435	ACA	2	6	662012	662017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522624
17183	NC_008435	CGC	2	6	662029	662034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522624
17184	NC_008435	CTT	2	6	662037	662042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522624
17185	NC_008435	GGC	2	6	662055	662060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522624
17186	NC_008435	GAGC	2	8	662067	662074	25 %	0 %	50 %	25 %	115522624
17187	NC_008435	CGCT	2	8	662090	662097	0 %	25 %	25 %	50 %	115522624
17188	NC_008435	CGG	2	6	662157	662162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522624
17189	NC_008435	CGA	2	6	662174	662179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522624
17190	NC_008435	CTT	2	6	662325	662330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522624
17191	NC_008435	AGCG	2	8	662395	662402	25 %	0 %	50 %	25 %	115522624
17192	NC_008435	AGC	2	6	662405	662410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522624
17193	NC_008435	GGATC	2	10	662451	662460	20 %	20 %	40 %	20 %	115522624
17194	NC_008435	CTA	2	6	662541	662546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522624
17195	NC_008435	CCG	2	6	662621	662626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522624
17196	NC_008435	GTCGG	2	10	662728	662737	0 %	20 %	60 %	20 %	115522624
17197	NC_008435	TGC	2	6	662738	662743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522624
17198	NC_008435	CTT	2	6	662829	662834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522624
17199	NC_008435	CGT	2	6	662865	662870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522624
17200	NC_008435	GTG	2	6	662931	662936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522625
17201	NC_008435	GCC	2	6	662984	662989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522625
17202	NC_008435	CGA	2	6	663022	663027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522625
17203	NC_008435	GAAGC	2	10	663041	663050	40 %	0 %	40 %	20 %	115522625
17204	NC_008435	GCG	2	6	663129	663134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522625
17205	NC_008435	GTC	2	6	663137	663142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522625
17206	NC_008435	CTT	2	6	663343	663348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522625
17207	NC_008435	CGA	2	6	663500	663505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522626
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17209	NC_008435	CAG	2	6	663550	663555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522626
17210	NC_008435	CCG	2	6	663560	663565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522626
17211	NC_008435	ATC	2	6	663599	663604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522626
17212	NC_008435	TGC	2	6	663614	663619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522626
17213	NC_008435	GC	3	6	663630	663635	0 %	0 %	50 %	50 %	115522626
17214	NC_008435	CGG	2	6	663663	663668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522626
17215	NC_008435	GCT	2	6	663705	663710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522626
17216	NC_008435	ATC	2	6	663715	663720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522626
17217	NC_008435	GGC	2	6	663756	663761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522626
17218	NC_008435	AG	3	6	663777	663782	50 %	0 %	50 %	0 %	115522626
17219	NC_008435	CG	3	6	663784	663789	0 %	0 %	50 %	50 %	115522626
17220	NC_008435	TGC	2	6	663800	663805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522626
17221	NC_008435	CGA	2	6	663813	663818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522626
17222	NC_008435	GAC	2	6	663828	663833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522626
17223	NC_008435	CGGT	2	8	663838	663845	0 %	25 %	50 %	25 %	115522626
17224	NC_008435	GAAC	2	8	663891	663898	50 %	0 %	25 %	25 %	115522626
17225	NC_008435	GC	3	6	663921	663926	0 %	0 %	50 %	50 %	115522626
17226	NC_008435	CCG	2	6	663959	663964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17227	NC_008435	CGG	2	6	663981	663986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522627
17228	NC_008435	GGTC	2	8	664013	664020	0 %	25 %	50 %	25 %	115522627
17229	NC_008435	CGG	2	6	664070	664075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522627
17230	NC_008435	GGC	2	6	664092	664097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522627
17231	NC_008435	CGC	3	9	664113	664121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522627
17232	NC_008435	CG	3	6	664146	664151	0 %	0 %	50 %	50 %	115522627
17233	NC_008435	GC	3	6	664164	664169	0 %	0 %	50 %	50 %	115522627
17234	NC_008435	GCG	2	6	664187	664192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522627
17235	NC_008435	TCA	2	6	664193	664198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522627
17236	NC_008435	TCG	2	6	664210	664215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522627
17237	NC_008435	GGT	2	6	664221	664226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522627
17238	NC_008435	GCC	2	6	664269	664274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522627
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17357	NC_008435	TCA	2	6	669072	669077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17358	NC_008435	GGC	2	6	669127	669132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522632
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17363	NC_008435	TGA	2	6	669423	669428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522632
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17365	NC_008435	GC	3	6	669529	669534	0 %	0 %	50 %	50 %	115522632
17366	NC_008435	CTGG	2	8	669571	669578	0 %	25 %	50 %	25 %	115522632
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